Protein–RNA interactions for Protein: Q9CWW6

Pin4, Peptidyl-prolyl cis-trans isomerase NIMA-interacting 4, mousemouse

Predictions only

Length 131 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Pin4Q9CWW6 Kat2b-201ENSMUST00000000724 4653 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.21■□□□□ 0.99
Pin4Q9CWW6 Hist1h2bp-201ENSMUST00000102982 469 ntAPPRIS P1 BASIC21.21■□□□□ 0.99
Pin4Q9CWW6 Gm20163-202ENSMUST00000212288 989 ntTSL 1 (best) BASIC21.21■□□□□ 0.99
Pin4Q9CWW6 Cryzl1-203ENSMUST00000117644 1727 ntTSL 1 (best) BASIC21.21■□□□□ 0.99
Pin4Q9CWW6 Txnl4a-204ENSMUST00000145963 1756 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.2■□□□□ 0.99
Pin4Q9CWW6 Fgfbp3-201ENSMUST00000057337 1772 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.2■□□□□ 0.99
Pin4Q9CWW6 Agpat5-201ENSMUST00000033847 2841 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.2■□□□□ 0.98
Pin4Q9CWW6 Dbnl-201ENSMUST00000020769 1638 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.2■□□□□ 0.98
Pin4Q9CWW6 Tomm40-201ENSMUST00000032555 1646 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.2■□□□□ 0.98
Pin4Q9CWW6 Wdr41-208ENSMUST00000222995 1112 ntTSL 5 BASIC21.2■□□□□ 0.98
Pin4Q9CWW6 Gm5874-201ENSMUST00000096101 508 ntBASIC21.2■□□□□ 0.98
Pin4Q9CWW6 Apcdd1-201ENSMUST00000096554 2799 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.2■□□□□ 0.98
Pin4Q9CWW6 Fbxo24-201ENSMUST00000031732 2161 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.19■□□□□ 0.98
Pin4Q9CWW6 Fabp3-201ENSMUST00000070532 823 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.19■□□□□ 0.98
Pin4Q9CWW6 Dedd2-201ENSMUST00000058702 1828 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.19■□□□□ 0.98
Pin4Q9CWW6 P3h3-201ENSMUST00000023958 2850 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.19■□□□□ 0.98
Pin4Q9CWW6 Apoe-206ENSMUST00000174064 1408 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.19■□□□□ 0.98
Pin4Q9CWW6 Rragc-201ENSMUST00000030399 2593 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.19■□□□□ 0.98
Pin4Q9CWW6 Pgbd5-204ENSMUST00000140012 3222 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC21.19■□□□□ 0.98
Pin4Q9CWW6 6330403K07Rik-201ENSMUST00000156068 1494 ntTSL 1 (best) BASIC21.19■□□□□ 0.98
Pin4Q9CWW6 Mfsd4a-202ENSMUST00000112365 1536 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC21.19■□□□□ 0.98
Pin4Q9CWW6 Gm26766-202ENSMUST00000227544 2347 ntBASIC21.18■□□□□ 0.98
Pin4Q9CWW6 Hnrnpab-201ENSMUST00000074669 2370 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC21.18■□□□□ 0.98
Pin4Q9CWW6 Trim3-202ENSMUST00000106789 2841 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.18■□□□□ 0.98
Pin4Q9CWW6 Eif2ak4-207ENSMUST00000110877 2134 ntTSL 1 (best) BASIC21.18■□□□□ 0.98
Pin4Q9CWW6 Jtb-202ENSMUST00000119304 878 ntTSL 3 BASIC21.18■□□□□ 0.98
Pin4Q9CWW6 Gm43060-201ENSMUST00000200621 289 ntBASIC21.18■□□□□ 0.98
Pin4Q9CWW6 Gm40848-201ENSMUST00000221998 324 ntBASIC21.18■□□□□ 0.98
Pin4Q9CWW6 Parl-201ENSMUST00000048642 1348 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.18■□□□□ 0.98
Pin4Q9CWW6 Tada1-201ENSMUST00000027846 2215 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.18■□□□□ 0.98
Pin4Q9CWW6 Dusp14-202ENSMUST00000100705 1447 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.18■□□□□ 0.98
Pin4Q9CWW6 Krtap5-2-202ENSMUST00000190456 1471 ntAPPRIS P2 BASIC21.18■□□□□ 0.98
Pin4Q9CWW6 Pold2-201ENSMUST00000102922 1646 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.18■□□□□ 0.98
Pin4Q9CWW6 Syt6-205ENSMUST00000121834 1710 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.18■□□□□ 0.98
Pin4Q9CWW6 Syde2-201ENSMUST00000039517 5495 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC21.18■□□□□ 0.98
Pin4Q9CWW6 Stmn4-201ENSMUST00000074523 1303 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.17■□□□□ 0.98
Pin4Q9CWW6 Gm27045-201ENSMUST00000182145 1402 ntBASIC21.17■□□□□ 0.98
Pin4Q9CWW6 Paip2-203ENSMUST00000115735 1521 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC21.17■□□□□ 0.98
Pin4Q9CWW6 Magi2-201ENSMUST00000088516 4843 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC21.17■□□□□ 0.98
Pin4Q9CWW6 Slc18a3-201ENSMUST00000191501 2413 ntAPPRIS P1 BASIC21.17■□□□□ 0.98
Pin4Q9CWW6 Dapk1-202ENSMUST00000077453 5491 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.16■□□□□ 0.98
Pin4Q9CWW6 Msto1-201ENSMUST00000107494 2093 ntTSL 1 (best) BASIC21.16■□□□□ 0.98
Pin4Q9CWW6 Hmbox1-204ENSMUST00000175905 1715 ntTSL 5 BASIC21.16■□□□□ 0.98
Pin4Q9CWW6 Gtsf1-201ENSMUST00000023129 819 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.16■□□□□ 0.98
Pin4Q9CWW6 Ninj1-201ENSMUST00000049022 1187 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.16■□□□□ 0.98
Pin4Q9CWW6 Akt1s1-204ENSMUST00000107885 1812 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.15■□□□□ 0.98
Pin4Q9CWW6 Lig3-204ENSMUST00000131537 1782 ntTSL 1 (best) BASIC21.15■□□□□ 0.98
Pin4Q9CWW6 Lig3-209ENSMUST00000173009 1785 ntTSL 1 (best) BASIC21.15■□□□□ 0.98
Pin4Q9CWW6 1700001C19Rik-201ENSMUST00000061885 1622 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC21.15■□□□□ 0.98
Pin4Q9CWW6 Arhgap27-202ENSMUST00000092557 1504 ntTSL 2 BASIC21.15■□□□□ 0.98
Pin4Q9CWW6 Tmem234-201ENSMUST00000102591 1437 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.15■□□□□ 0.98
Pin4Q9CWW6 Agmat-201ENSMUST00000038161 1407 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.15■□□□□ 0.98
Pin4Q9CWW6 Fbxl17-201ENSMUST00000024761 4925 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.15■□□□□ 0.98
Pin4Q9CWW6 Usp21-203ENSMUST00000111306 2185 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC21.15■□□□□ 0.98
Pin4Q9CWW6 Med31-201ENSMUST00000021157 1161 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.15■□□□□ 0.98
Pin4Q9CWW6 Gpr3-201ENSMUST00000052090 1116 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.15■□□□□ 0.98
Pin4Q9CWW6 Krtap5-3-201ENSMUST00000084414 1074 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC21.15■□□□□ 0.98
Pin4Q9CWW6 Tekt5-201ENSMUST00000043415 1803 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.15■□□□□ 0.98
Pin4Q9CWW6 Carm1-203ENSMUST00000115395 3152 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.15■□□□□ 0.98
Pin4Q9CWW6 Brd1-203ENSMUST00000109381 4886 ntTSL 5 BASIC21.15■□□□□ 0.98
Pin4Q9CWW6 Snapin-203ENSMUST00000149884 1928 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.14■□□□□ 0.98
Pin4Q9CWW6 Dedd2-202ENSMUST00000205271 1942 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC21.14■□□□□ 0.98
Pin4Q9CWW6 St6galnac6-205ENSMUST00000113290 2402 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC21.14■□□□□ 0.97
Pin4Q9CWW6 Mgll-202ENSMUST00000113581 1308 ntTSL 5 BASIC21.14■□□□□ 0.97
Pin4Q9CWW6 Dcaf15-201ENSMUST00000041367 2312 ntTSL 1 (best) BASIC21.14■□□□□ 0.97
Pin4Q9CWW6 1700016H13Rik-203ENSMUST00000120108 797 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC21.14■□□□□ 0.97
Pin4Q9CWW6 Gm20621-202ENSMUST00000176618 1234 ntTSL 1 (best) BASIC21.14■□□□□ 0.97
Pin4Q9CWW6 Sap18b-201ENSMUST00000074053 789 ntAPPRIS P1 BASIC21.14■□□□□ 0.97
Pin4Q9CWW6 Ypel1-202ENSMUST00000090199 631 ntTSL 1 (best) BASIC21.14■□□□□ 0.97
Pin4Q9CWW6 Slc35a2-201ENSMUST00000096514 1757 ntTSL 5 BASIC21.14■□□□□ 0.97
Pin4Q9CWW6 Tomm40-202ENSMUST00000093552 1577 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.14■□□□□ 0.97
Pin4Q9CWW6 Nckap1-202ENSMUST00000111760 4597 ntTSL 1 (best) BASIC21.14■□□□□ 0.97
Pin4Q9CWW6 Cebpa-202ENSMUST00000205391 2161 ntTSL 5 BASIC21.13■□□□□ 0.97
Pin4Q9CWW6 Exosc4-201ENSMUST00000059045 1796 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.13■□□□□ 0.97
Pin4Q9CWW6 Nab1-201ENSMUST00000069792 3874 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC21.13■□□□□ 0.97
Pin4Q9CWW6 Smad6-203ENSMUST00000179458 273 ntBASIC21.13■□□□□ 0.97
Pin4Q9CWW6 Gm27027-201ENSMUST00000183110 547 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC21.13■□□□□ 0.97
Pin4Q9CWW6 8430422M14Rik-201ENSMUST00000199608 822 ntBASIC21.13■□□□□ 0.97
Pin4Q9CWW6 Ctf1-204ENSMUST00000206506 784 ntTSL 2 BASIC21.13■□□□□ 0.97
Pin4Q9CWW6 Evi5l-209ENSMUST00000177053 1542 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC21.13■□□□□ 0.97
Pin4Q9CWW6 Abhd17b-201ENSMUST00000052556 2475 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC21.13■□□□□ 0.97
Pin4Q9CWW6 Tlk2-202ENSMUST00000092537 2743 ntTSL 1 (best) BASIC21.13■□□□□ 0.97
Pin4Q9CWW6 Spast-202ENSMUST00000224711 2066 ntAPPRIS ALT2 BASIC21.13■□□□□ 0.97
Pin4Q9CWW6 Gpatch3-201ENSMUST00000030662 2004 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.12■□□□□ 0.97
Pin4Q9CWW6 Lgi2-202ENSMUST00000199942 6273 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.12■□□□□ 0.97
Pin4Q9CWW6 Hacd1-203ENSMUST00000114753 993 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.12■□□□□ 0.97
Pin4Q9CWW6 Gm13063-201ENSMUST00000132247 669 ntTSL 3 BASIC21.12■□□□□ 0.97
Pin4Q9CWW6 Gm11650-201ENSMUST00000141271 1145 ntTSL 1 (best) BASIC21.12■□□□□ 0.97
Pin4Q9CWW6 Sirpa-209ENSMUST00000160276 876 ntTSL 1 (best) BASIC21.12■□□□□ 0.97
Pin4Q9CWW6 Mrgbp-206ENSMUST00000169630 1192 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.12■□□□□ 0.97
Pin4Q9CWW6 Gins3-202ENSMUST00000212434 654 ntTSL 2 BASIC21.12■□□□□ 0.97
Pin4Q9CWW6 Zcchc2-201ENSMUST00000118196 5796 ntAPPRIS P4 TSL 5 BASIC21.12■□□□□ 0.97
Pin4Q9CWW6 Ccr10-201ENSMUST00000062759 1726 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.12■□□□□ 0.97
Pin4Q9CWW6 Prcd-201ENSMUST00000106381 724 ntTSL 3 BASIC21.11■□□□□ 0.97
Pin4Q9CWW6 4930444P10Rik-203ENSMUST00000151004 1001 ntAPPRIS P2 TSL 3 BASIC21.11■□□□□ 0.97
Pin4Q9CWW6 Rnaseh1-201ENSMUST00000020959 1455 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.11■□□□□ 0.97
Pin4Q9CWW6 4930412F12Rik-201ENSMUST00000211700 1471 ntBASIC21.11■□□□□ 0.97
Pin4Q9CWW6 Smox-202ENSMUST00000110179 1320 ntTSL 1 (best) BASIC21.1■□□□□ 0.97
Pin4Q9CWW6 Anapc1-202ENSMUST00000110332 1214 ntTSL 1 (best) BASIC21.1■□□□□ 0.97
Pin4Q9CWW6 Mir6236-201ENSMUST00000184437 123 ntBASIC21.1■□□□□ 0.97
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 17.3 ms