Protein–RNA interactions for Protein: Q9CW03

Smc3, Structural maintenance of chromosomes protein 3, mousemouse

Known RBP Predictions only

Length 1,217 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Smc3Q9CW03 H2afj-202ENSMUST00000203982 577 ntAPPRIS ALT1 TSL 3 BASIC23.78■■□□□ 1.4
Smc3Q9CW03 Pcf11-204ENSMUST00000208058 461 ntTSL 5 BASIC23.78■■□□□ 1.4
Smc3Q9CW03 Tex264-202ENSMUST00000163441 1896 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.78■■□□□ 1.4
Smc3Q9CW03 Zbed3-201ENSMUST00000045909 1894 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.78■■□□□ 1.4
Smc3Q9CW03 Tpm1-212ENSMUST00000113696 1714 ntTSL 2 BASIC23.78■■□□□ 1.4
Smc3Q9CW03 Htra3-201ENSMUST00000087629 2750 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.78■■□□□ 1.4
Smc3Q9CW03 Socs2-213ENSMUST00000170690 2195 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC23.78■■□□□ 1.4
Smc3Q9CW03 C1qtnf5-204ENSMUST00000114821 1365 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC23.78■■□□□ 1.4
Smc3Q9CW03 Cacna2d2-201ENSMUST00000010210 5783 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.77■■□□□ 1.4
Smc3Q9CW03 Gm10399-202ENSMUST00000202768 748 ntBASIC23.77■■□□□ 1.4
Smc3Q9CW03 Cep78-201ENSMUST00000047704 2548 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.77■■□□□ 1.4
Smc3Q9CW03 Sh3bp1-204ENSMUST00000109698 1923 ntTSL 1 (best) BASIC23.76■■□□□ 1.39
Smc3Q9CW03 Gm26660-201ENSMUST00000181582 2543 ntTSL 1 (best) BASIC23.76■■□□□ 1.39
Smc3Q9CW03 Rora-202ENSMUST00000113624 2591 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.76■■□□□ 1.39
Smc3Q9CW03 Slc25a38-201ENSMUST00000035106 1791 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.76■■□□□ 1.39
Smc3Q9CW03 Stac-201ENSMUST00000035083 2644 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.76■■□□□ 1.39
Smc3Q9CW03 Sp5-201ENSMUST00000100043 2100 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.76■■□□□ 1.39
Smc3Q9CW03 Psmg1-202ENSMUST00000117044 807 ntTSL 5 BASIC23.76■■□□□ 1.39
Smc3Q9CW03 Celf6-202ENSMUST00000118164 1583 ntTSL 1 (best) BASIC23.76■■□□□ 1.39
Smc3Q9CW03 Uqcrfs1-201ENSMUST00000042834 1363 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.76■■□□□ 1.39
Smc3Q9CW03 Tmem64-201ENSMUST00000062684 4670 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.75■■□□□ 1.39
Smc3Q9CW03 Ntn5-202ENSMUST00000182750 1758 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.75■■□□□ 1.39
Smc3Q9CW03 Paip1-201ENSMUST00000026520 2551 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC23.75■■□□□ 1.39
Smc3Q9CW03 Map3k21-201ENSMUST00000034316 5693 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.75■■□□□ 1.39
Smc3Q9CW03 Rcor1-201ENSMUST00000084968 5684 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.75■■□□□ 1.39
Smc3Q9CW03 Slc35a3-201ENSMUST00000029569 5725 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.75■■□□□ 1.39
Smc3Q9CW03 Magi2-202ENSMUST00000101558 6530 ntTSL 1 (best) BASIC23.75■■□□□ 1.39
Smc3Q9CW03 Tead1-204ENSMUST00000106638 3047 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC23.75■■□□□ 1.39
Smc3Q9CW03 Bola3-207ENSMUST00000136501 2312 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.75■■□□□ 1.39
Smc3Q9CW03 Cited4-201ENSMUST00000094814 1249 ntAPPRIS P1 BASIC23.75■■□□□ 1.39
Smc3Q9CW03 Vgf-202ENSMUST00000186451 2277 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC23.75■■□□□ 1.39
Smc3Q9CW03 Ovol2-201ENSMUST00000037423 1539 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC23.74■■□□□ 1.39
Smc3Q9CW03 Ptger3-202ENSMUST00000173533 2097 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.74■■□□□ 1.39
Smc3Q9CW03 Pelo-201ENSMUST00000109226 1600 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.74■■□□□ 1.39
Smc3Q9CW03 Rasgrp2-206ENSMUST00000113472 2124 ntTSL 1 (best) BASIC23.74■■□□□ 1.39
Smc3Q9CW03 Gm17324-201ENSMUST00000165499 922 ntAPPRIS P1 BASIC23.74■■□□□ 1.39
Smc3Q9CW03 Gm18190-203ENSMUST00000209944 389 ntTSL 2 BASIC23.74■■□□□ 1.39
Smc3Q9CW03 Sox12-202ENSMUST00000182625 4453 ntAPPRIS P1 BASIC23.74■■□□□ 1.39
Smc3Q9CW03 Exoc3l2-201ENSMUST00000011407 2200 ntTSL 5 BASIC23.74■■□□□ 1.39
Smc3Q9CW03 Cbfb-204ENSMUST00000109395 2709 ntTSL 1 (best) BASIC23.73■■□□□ 1.39
Smc3Q9CW03 Ccnd3-218ENSMUST00000183177 2060 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC23.73■■□□□ 1.39
Smc3Q9CW03 Barhl1-203ENSMUST00000113849 2102 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.73■■□□□ 1.39
Smc3Q9CW03 Tmem41a-201ENSMUST00000023562 1359 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.73■■□□□ 1.39
Smc3Q9CW03 Eif2ak4-207ENSMUST00000110877 2134 ntTSL 1 (best) BASIC23.72■■□□□ 1.39
Smc3Q9CW03 Doc2a-201ENSMUST00000064110 2538 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.72■■□□□ 1.39
Smc3Q9CW03 Med25-201ENSMUST00000003049 2619 ntTSL 1 (best) BASIC23.72■■□□□ 1.39
Smc3Q9CW03 Trpc1-201ENSMUST00000053785 2912 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.72■■□□□ 1.39
Smc3Q9CW03 Nrg3-203ENSMUST00000173780 2137 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC23.72■■□□□ 1.39
Smc3Q9CW03 Ooep-201ENSMUST00000034900 2138 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.71■■□□□ 1.39
Smc3Q9CW03 Prkar2b-201ENSMUST00000003079 1657 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.71■■□□□ 1.39
Smc3Q9CW03 March2-203ENSMUST00000172767 1381 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.71■■□□□ 1.39
Smc3Q9CW03 Chml-203ENSMUST00000210367 1324 ntTSL 5 BASIC23.71■■□□□ 1.39
Smc3Q9CW03 Clta-206ENSMUST00000170241 1079 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.71■■□□□ 1.39
Smc3Q9CW03 Galnt11-201ENSMUST00000045737 2552 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.71■■□□□ 1.39
Smc3Q9CW03 Zfp653-202ENSMUST00000179605 1888 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.7■■□□□ 1.39
Smc3Q9CW03 Ccdc149-202ENSMUST00000198008 2470 ntTSL 5 BASIC23.7■■□□□ 1.38
Smc3Q9CW03 Tmem238-201ENSMUST00000168578 1375 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.7■■□□□ 1.38
Smc3Q9CW03 Gdf7-202ENSMUST00000220073 1399 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.7■■□□□ 1.38
Smc3Q9CW03 Vwc2-201ENSMUST00000056344 1350 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.7■■□□□ 1.38
Smc3Q9CW03 Fbxw8-201ENSMUST00000049474 5000 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.7■■□□□ 1.38
Smc3Q9CW03 Gm10232-201ENSMUST00000089221 720 ntBASIC23.7■■□□□ 1.38
Smc3Q9CW03 Sys1-202ENSMUST00000109352 2001 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC23.7■■□□□ 1.38
Smc3Q9CW03 Zbed3-202ENSMUST00000221807 1945 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.7■■□□□ 1.38
Smc3Q9CW03 Ccdc34-201ENSMUST00000028580 2070 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.69■■□□□ 1.38
Smc3Q9CW03 Ssbp1-205ENSMUST00000121360 1188 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.69■■□□□ 1.38
Smc3Q9CW03 Elavl1-201ENSMUST00000098950 5743 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.69■■□□□ 1.38
Smc3Q9CW03 Tedc1-201ENSMUST00000049271 2441 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.69■■□□□ 1.38
Smc3Q9CW03 Zbtb7a-203ENSMUST00000119606 1841 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.68■■□□□ 1.38
Smc3Q9CW03 N4bp1-201ENSMUST00000034074 6469 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.68■■□□□ 1.38
Smc3Q9CW03 Cited1-202ENSMUST00000101336 1090 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.68■■□□□ 1.38
Smc3Q9CW03 Gm14207-203ENSMUST00000156538 988 ntTSL 2 BASIC23.68■■□□□ 1.38
Smc3Q9CW03 Gm9748-202ENSMUST00000194881 783 ntTSL 2 BASIC23.68■■□□□ 1.38
Smc3Q9CW03 Qsox2-201ENSMUST00000036187 2559 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC23.68■■□□□ 1.38
Smc3Q9CW03 Ltk-202ENSMUST00000082130 2767 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.68■■□□□ 1.38
Smc3Q9CW03 2210011C24Rik-204ENSMUST00000190457 1351 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.67■■□□□ 1.38
Smc3Q9CW03 Rab5c-201ENSMUST00000019317 1967 ntTSL 1 (best) BASIC23.67■■□□□ 1.38
Smc3Q9CW03 A730035I17Rik-205ENSMUST00000205851 684 ntBASIC23.67■■□□□ 1.38
Smc3Q9CW03 Akt1s1-204ENSMUST00000107885 1812 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.67■■□□□ 1.38
Smc3Q9CW03 Sephs1-202ENSMUST00000115019 2933 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.67■■□□□ 1.38
Smc3Q9CW03 Usp2-202ENSMUST00000065461 2057 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC23.67■■□□□ 1.38
Smc3Q9CW03 Mgat1-213ENSMUST00000167400 3151 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC23.66■■□□□ 1.38
Smc3Q9CW03 Ube2h-202ENSMUST00000102993 4657 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.66■■□□□ 1.38
Smc3Q9CW03 Gm572-201ENSMUST00000105698 1385 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC23.66■■□□□ 1.38
Smc3Q9CW03 Pink1-201ENSMUST00000030536 2375 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC23.66■■□□□ 1.38
Smc3Q9CW03 Ddrgk1-201ENSMUST00000089559 1238 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.66■■□□□ 1.38
Smc3Q9CW03 Brd1-201ENSMUST00000088911 4702 ntTSL 1 (best) BASIC23.66■■□□□ 1.38
Smc3Q9CW03 Chkb-201ENSMUST00000023289 1707 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.66■■□□□ 1.38
Smc3Q9CW03 D11Wsu47e-201ENSMUST00000042227 2196 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.66■■□□□ 1.38
Smc3Q9CW03 Uap1-202ENSMUST00000111350 2311 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC23.66■■□□□ 1.38
Smc3Q9CW03 Neurl4-213ENSMUST00000177476 4952 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.66■■□□□ 1.38
Smc3Q9CW03 Pus1-203ENSMUST00000086643 1868 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC23.66■■□□□ 1.38
Smc3Q9CW03 Sft2d3-201ENSMUST00000054984 2810 ntAPPRIS P1 BASIC23.65■■□□□ 1.38
Smc3Q9CW03 Suz12-201ENSMUST00000017692 4373 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC23.65■■□□□ 1.38
Smc3Q9CW03 Hras-202ENSMUST00000097957 1199 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC23.65■■□□□ 1.38
Smc3Q9CW03 Cacnb1-203ENSMUST00000103144 2236 ntTSL 5 BASIC23.65■■□□□ 1.38
Smc3Q9CW03 Baiap2-203ENSMUST00000103021 3398 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.65■■□□□ 1.38
Smc3Q9CW03 Gab1-201ENSMUST00000034150 4870 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.65■■□□□ 1.38
Smc3Q9CW03 Gtpbp2-217ENSMUST00000172170 2587 ntTSL 5 BASIC23.65■■□□□ 1.38
Smc3Q9CW03 Kdm3b-201ENSMUST00000043775 6363 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.65■■□□□ 1.38
Smc3Q9CW03 Bag5-201ENSMUST00000054636 2139 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.65■■□□□ 1.38
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 14.8 ms