Protein–RNA interactions for Protein: Q9CQW1

Ykt6, Synaptobrevin homolog YKT6, mousemouse

Predictions only

Length 198 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Ykt6Q9CQW1 Pkig-204ENSMUST00000126182 762 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC17.88■□□□□ 0.45
Ykt6Q9CQW1 Psmg4-202ENSMUST00000147632 555 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.88■□□□□ 0.45
Ykt6Q9CQW1 Gm43137-201ENSMUST00000198052 594 ntBASIC17.88■□□□□ 0.45
Ykt6Q9CQW1 Fbxl14-201ENSMUST00000032094 2963 ntAPPRIS P1 BASIC17.88■□□□□ 0.45
Ykt6Q9CQW1 Sirt1-203ENSMUST00000120239 4430 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC17.88■□□□□ 0.45
Ykt6Q9CQW1 Tmem45b-201ENSMUST00000048050 1799 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.88■□□□□ 0.45
Ykt6Q9CQW1 Junb-201ENSMUST00000064922 1809 ntAPPRIS P1 BASIC17.88■□□□□ 0.45
Ykt6Q9CQW1 Magi2-202ENSMUST00000101558 6530 ntTSL 1 (best) BASIC17.88■□□□□ 0.45
Ykt6Q9CQW1 AC166356.1-201ENSMUST00000228236 1426 ntBASIC17.88■□□□□ 0.45
Ykt6Q9CQW1 Cnpy3-201ENSMUST00000059844 1908 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.88■□□□□ 0.45
Ykt6Q9CQW1 Ugp2-201ENSMUST00000060895 2044 ntTSL 1 (best) BASIC17.88■□□□□ 0.45
Ykt6Q9CQW1 Nipa1-201ENSMUST00000052204 3183 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.87■□□□□ 0.45
Ykt6Q9CQW1 Tor2a-208ENSMUST00000177382 396 ntTSL 5 BASIC17.87■□□□□ 0.45
Ykt6Q9CQW1 Carm1-201ENSMUST00000034703 3220 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.87■□□□□ 0.45
Ykt6Q9CQW1 Msx3-202ENSMUST00000172775 2070 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.87■□□□□ 0.45
Ykt6Q9CQW1 Set-201ENSMUST00000067996 2834 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.87■□□□□ 0.45
Ykt6Q9CQW1 Gm37415-201ENSMUST00000192265 2054 ntBASIC17.86■□□□□ 0.45
Ykt6Q9CQW1 Trp73-204ENSMUST00000105644 5042 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.86■□□□□ 0.45
Ykt6Q9CQW1 Jak2-202ENSMUST00000065796 5030 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.86■□□□□ 0.45
Ykt6Q9CQW1 Bag1-202ENSMUST00000108089 1336 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.86■□□□□ 0.45
Ykt6Q9CQW1 Slc15a4-201ENSMUST00000031367 2732 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.86■□□□□ 0.45
Ykt6Q9CQW1 Mir155hg-202ENSMUST00000185662 1362 ntTSL 5 BASIC17.86■□□□□ 0.45
Ykt6Q9CQW1 Eml2-202ENSMUST00000117338 2765 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC17.86■□□□□ 0.45
Ykt6Q9CQW1 Tnks2-201ENSMUST00000025729 6481 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.86■□□□□ 0.45
Ykt6Q9CQW1 Prkar2b-201ENSMUST00000003079 1657 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.86■□□□□ 0.45
Ykt6Q9CQW1 Lgr4-201ENSMUST00000046548 5060 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC17.86■□□□□ 0.45
Ykt6Q9CQW1 Mfsd4b2-201ENSMUST00000045526 2285 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.86■□□□□ 0.45
Ykt6Q9CQW1 Taf3-203ENSMUST00000114907 695 ntTSL 1 (best) BASIC17.85■□□□□ 0.45
Ykt6Q9CQW1 Gm11586-201ENSMUST00000123060 566 ntTSL 2 BASIC17.85■□□□□ 0.45
Ykt6Q9CQW1 Ubxn1-202ENSMUST00000166407 1032 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.85■□□□□ 0.45
Ykt6Q9CQW1 Gclm-206ENSMUST00000178826 1002 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.85■□□□□ 0.45
Ykt6Q9CQW1 Snx16-203ENSMUST00000195822 1084 ntTSL 1 (best) BASIC17.85■□□□□ 0.45
Ykt6Q9CQW1 8430422M14Rik-201ENSMUST00000199608 822 ntBASIC17.85■□□□□ 0.45
Ykt6Q9CQW1 Tpst2-201ENSMUST00000031287 1835 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.85■□□□□ 0.45
Ykt6Q9CQW1 Gp1bb-201ENSMUST00000051160 645 ntAPPRIS P3 BASIC17.85■□□□□ 0.45
Ykt6Q9CQW1 Slc16a10-201ENSMUST00000092566 5397 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.85■□□□□ 0.45
Ykt6Q9CQW1 Ndrg2-202ENSMUST00000111632 2103 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC17.84■□□□□ 0.45
Ykt6Q9CQW1 Gm43653-201ENSMUST00000198136 1608 ntTSL 3 BASIC17.84■□□□□ 0.45
Ykt6Q9CQW1 Spint2-201ENSMUST00000098604 1384 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.84■□□□□ 0.45
Ykt6Q9CQW1 Hotairm1-201ENSMUST00000129546 409 ntTSL 1 (best) BASIC17.84■□□□□ 0.45
Ykt6Q9CQW1 Gm14207-203ENSMUST00000156538 988 ntTSL 2 BASIC17.84■□□□□ 0.45
Ykt6Q9CQW1 Tor3a-208ENSMUST00000190607 453 ntTSL 3 BASIC17.84■□□□□ 0.45
Ykt6Q9CQW1 Nab2-202ENSMUST00000099157 2311 ntTSL 1 (best) BASIC17.84■□□□□ 0.45
Ykt6Q9CQW1 Cbx3-201ENSMUST00000031862 1889 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.84■□□□□ 0.45
Ykt6Q9CQW1 Rxrb-203ENSMUST00000173354 1743 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.84■□□□□ 0.45
Ykt6Q9CQW1 Bend6-201ENSMUST00000062289 2487 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.83■□□□□ 0.45
Ykt6Q9CQW1 Mageb3-201ENSMUST00000104936 2341 ntAPPRIS P1 BASIC17.83■□□□□ 0.45
Ykt6Q9CQW1 Ripply3-201ENSMUST00000023660 1531 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.83■□□□□ 0.45
Ykt6Q9CQW1 Arhgap27os2-201ENSMUST00000123812 1390 ntTSL 1 (best) BASIC17.83■□□□□ 0.45
Ykt6Q9CQW1 BC004004-202ENSMUST00000120346 1297 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.83■□□□□ 0.44
Ykt6Q9CQW1 Polr3gl-204ENSMUST00000145001 607 ntTSL 3 BASIC17.83■□□□□ 0.44
Ykt6Q9CQW1 Gm6569-201ENSMUST00000154520 811 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC17.83■□□□□ 0.44
Ykt6Q9CQW1 Usf2-211ENSMUST00000172417 648 ntTSL 5 BASIC17.83■□□□□ 0.44
Ykt6Q9CQW1 Sema6d-202ENSMUST00000076335 6276 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.83■□□□□ 0.44
Ykt6Q9CQW1 Zfp653-202ENSMUST00000179605 1888 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.83■□□□□ 0.44
Ykt6Q9CQW1 Sema6d-204ENSMUST00000078621 6372 ntTSL 5 BASIC17.83■□□□□ 0.44
Ykt6Q9CQW1 Map2k2-202ENSMUST00000105331 1556 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC17.83■□□□□ 0.44
Ykt6Q9CQW1 Suz12-206ENSMUST00000163272 4303 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC17.82■□□□□ 0.44
Ykt6Q9CQW1 Coq10a-201ENSMUST00000043211 1421 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC17.82■□□□□ 0.44
Ykt6Q9CQW1 Camk2b-201ENSMUST00000002817 1872 ntTSL 5 BASIC17.82■□□□□ 0.44
Ykt6Q9CQW1 Gm572-201ENSMUST00000105698 1385 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.82■□□□□ 0.44
Ykt6Q9CQW1 Uap1-201ENSMUST00000027981 2283 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.82■□□□□ 0.44
Ykt6Q9CQW1 Nup153-201ENSMUST00000021803 6109 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.82■□□□□ 0.44
Ykt6Q9CQW1 Slc35e2-203ENSMUST00000118607 2166 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.82■□□□□ 0.44
Ykt6Q9CQW1 Gm10941-201ENSMUST00000105408 708 ntTSL 1 (best) BASIC17.82■□□□□ 0.44
Ykt6Q9CQW1 Pet117-201ENSMUST00000183618 693 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC17.82■□□□□ 0.44
Ykt6Q9CQW1 Actr5-201ENSMUST00000045644 2402 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.82■□□□□ 0.44
Ykt6Q9CQW1 Msantd3-203ENSMUST00000107704 1597 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.82■□□□□ 0.44
Ykt6Q9CQW1 Creb1-204ENSMUST00000185594 1569 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.82■□□□□ 0.44
Ykt6Q9CQW1 Pou2f2-206ENSMUST00000108418 1934 ntTSL 1 (best) BASIC17.82■□□□□ 0.44
Ykt6Q9CQW1 H2afj-201ENSMUST00000074556 1831 ntAPPRIS P2 BASIC17.82■□□□□ 0.44
Ykt6Q9CQW1 Doc2a-201ENSMUST00000064110 2538 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.81■□□□□ 0.44
Ykt6Q9CQW1 Hoxa2-201ENSMUST00000014848 1775 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.81■□□□□ 0.44
Ykt6Q9CQW1 Sp5-201ENSMUST00000100043 2100 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.81■□□□□ 0.44
Ykt6Q9CQW1 Bpifb4-202ENSMUST00000109757 2420 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC17.81■□□□□ 0.44
Ykt6Q9CQW1 Rnaset2b-202ENSMUST00000179728 2448 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.81■□□□□ 0.44
Ykt6Q9CQW1 Pim3-201ENSMUST00000042818 2419 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.81■□□□□ 0.44
Ykt6Q9CQW1 Snrpa-201ENSMUST00000080356 1365 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.81■□□□□ 0.44
Ykt6Q9CQW1 Pcmtd1-201ENSMUST00000061280 5232 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.81■□□□□ 0.44
Ykt6Q9CQW1 Kazald1-202ENSMUST00000111948 1625 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.81■□□□□ 0.44
Ykt6Q9CQW1 1700001C19Rik-201ENSMUST00000061885 1622 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.81■□□□□ 0.44
Ykt6Q9CQW1 Pi16-201ENSMUST00000114699 1243 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.81■□□□□ 0.44
Ykt6Q9CQW1 Tmem9-202ENSMUST00000117950 847 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC17.81■□□□□ 0.44
Ykt6Q9CQW1 Gm13620-201ENSMUST00000131198 511 ntTSL 3 BASIC17.81■□□□□ 0.44
Ykt6Q9CQW1 2810001G20Rik-202ENSMUST00000146333 959 ntTSL 3 BASIC17.81■□□□□ 0.44
Ykt6Q9CQW1 Kiss1-205ENSMUST00000195286 656 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.81■□□□□ 0.44
Ykt6Q9CQW1 Trp53rka-201ENSMUST00000039007 1880 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.81■□□□□ 0.44
Ykt6Q9CQW1 Rspo1-201ENSMUST00000030687 1834 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.81■□□□□ 0.44
Ykt6Q9CQW1 Chrna7-201ENSMUST00000032738 2078 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.81■□□□□ 0.44
Ykt6Q9CQW1 Gm16286-205ENSMUST00000127234 1755 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.81■□□□□ 0.44
Ykt6Q9CQW1 Bola3-207ENSMUST00000136501 2312 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.81■□□□□ 0.44
Ykt6Q9CQW1 Cavin3-201ENSMUST00000047040 1662 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.8■□□□□ 0.44
Ykt6Q9CQW1 Prdm11-205ENSMUST00000178666 1870 ntTSL 5 BASIC17.8■□□□□ 0.44
Ykt6Q9CQW1 Carm1-203ENSMUST00000115395 3152 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.8■□□□□ 0.44
Ykt6Q9CQW1 Cacybp-201ENSMUST00000014370 2098 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.8■□□□□ 0.44
Ykt6Q9CQW1 Rbp4-202ENSMUST00000112335 930 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.8■□□□□ 0.44
Ykt6Q9CQW1 Pigx-210ENSMUST00000155966 963 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC17.8■□□□□ 0.44
Ykt6Q9CQW1 Mir7075-201ENSMUST00000184187 82 ntBASIC17.8■□□□□ 0.44
Ykt6Q9CQW1 Serp2-204ENSMUST00000228055 705 ntBASIC17.8■□□□□ 0.44
Ykt6Q9CQW1 Ankrd9-204ENSMUST00000140788 1451 ntAPPRIS P2 TSL 3 BASIC17.8■□□□□ 0.44
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 34.1 ms