Protein–RNA interactions for Protein: Q9CQU3

Rer1, Protein RER1, mousemouse

Known RBP Predictions only

Length 196 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Rer1Q9CQU3 Gab2-201ENSMUST00000004622 6168 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.52■□□□□ 0.23
Rer1Q9CQU3 Smim19-202ENSMUST00000163774 1435 ntTSL 1 (best) BASIC16.52■□□□□ 0.23
Rer1Q9CQU3 Tmem41a-201ENSMUST00000023562 1359 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.51■□□□□ 0.23
Rer1Q9CQU3 Stac-201ENSMUST00000035083 2644 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.51■□□□□ 0.23
Rer1Q9CQU3 AC152827.1-201ENSMUST00000221143 2189 ntBASIC16.51■□□□□ 0.23
Rer1Q9CQU3 Ctdsp1-201ENSMUST00000027367 2876 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.51■□□□□ 0.23
Rer1Q9CQU3 Hras-202ENSMUST00000097957 1199 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.51■□□□□ 0.23
Rer1Q9CQU3 Wrnip1-201ENSMUST00000021832 2633 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.51■□□□□ 0.23
Rer1Q9CQU3 Arhgap23-201ENSMUST00000093940 2409 ntTSL 1 (best) BASIC16.51■□□□□ 0.23
Rer1Q9CQU3 Pde7a-202ENSMUST00000099195 6298 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC16.51■□□□□ 0.23
Rer1Q9CQU3 Zfp105-201ENSMUST00000051667 2010 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.51■□□□□ 0.23
Rer1Q9CQU3 Calml3-201ENSMUST00000077698 1421 ntAPPRIS P1 BASIC16.51■□□□□ 0.23
Rer1Q9CQU3 Cav2-201ENSMUST00000000058 2733 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.51■□□□□ 0.23
Rer1Q9CQU3 Slc25a38-201ENSMUST00000035106 1791 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.51■□□□□ 0.23
Rer1Q9CQU3 Prrt1-201ENSMUST00000015620 1940 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.51■□□□□ 0.23
Rer1Q9CQU3 Vav3-201ENSMUST00000046864 5019 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.51■□□□□ 0.23
Rer1Q9CQU3 Ppm1b-201ENSMUST00000080217 2753 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.5■□□□□ 0.23
Rer1Q9CQU3 Aktip-202ENSMUST00000120213 2200 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.5■□□□□ 0.23
Rer1Q9CQU3 AC123857.1-201ENSMUST00000181053 2312 ntTSL 1 (best) BASIC16.5■□□□□ 0.23
Rer1Q9CQU3 Utp11-201ENSMUST00000030738 1603 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.5■□□□□ 0.23
Rer1Q9CQU3 Kcnip2-208ENSMUST00000161886 693 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.5■□□□□ 0.23
Rer1Q9CQU3 Eif5a-213ENSMUST00000164359 1281 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.5■□□□□ 0.23
Rer1Q9CQU3 Gm17324-201ENSMUST00000165499 922 ntAPPRIS P1 BASIC16.5■□□□□ 0.23
Rer1Q9CQU3 Trim71-201ENSMUST00000111816 9332 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.5■□□□□ 0.23
Rer1Q9CQU3 Hrh3-205ENSMUST00000165762 1368 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.5■□□□□ 0.23
Rer1Q9CQU3 Fndc4-201ENSMUST00000041266 1375 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.5■□□□□ 0.23
Rer1Q9CQU3 Vwc2-201ENSMUST00000056344 1350 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.5■□□□□ 0.23
Rer1Q9CQU3 Mprip-201ENSMUST00000066330 7765 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.5■□□□□ 0.23
Rer1Q9CQU3 Clta-206ENSMUST00000170241 1079 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.49■□□□□ 0.23
Rer1Q9CQU3 Noc2l-201ENSMUST00000179543 2785 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.49■□□□□ 0.23
Rer1Q9CQU3 Gm9748-202ENSMUST00000194881 783 ntTSL 2 BASIC16.49■□□□□ 0.23
Rer1Q9CQU3 Celf6-201ENSMUST00000034840 2765 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.49■□□□□ 0.23
Rer1Q9CQU3 Mpv17l2-201ENSMUST00000038626 980 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.49■□□□□ 0.23
Rer1Q9CQU3 Kremen2-201ENSMUST00000046525 2123 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.49■□□□□ 0.23
Rer1Q9CQU3 Nipsnap2-201ENSMUST00000086046 2112 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.49■□□□□ 0.23
Rer1Q9CQU3 Serbp1-207ENSMUST00000203436 1667 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.49■□□□□ 0.23
Rer1Q9CQU3 Inpp5a-203ENSMUST00000106098 2826 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.49■□□□□ 0.23
Rer1Q9CQU3 Slc9a7-201ENSMUST00000072451 2512 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.49■□□□□ 0.23
Rer1Q9CQU3 Klc3-201ENSMUST00000047170 1901 ntTSL 1 (best) BASIC16.49■□□□□ 0.23
Rer1Q9CQU3 Rxrb-201ENSMUST00000044858 2623 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC16.49■□□□□ 0.23
Rer1Q9CQU3 Tmem51-201ENSMUST00000036572 1875 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.48■□□□□ 0.23
Rer1Q9CQU3 Tpm1-212ENSMUST00000113696 1714 ntTSL 2 BASIC16.48■□□□□ 0.23
Rer1Q9CQU3 A730035I17Rik-205ENSMUST00000205851 684 ntBASIC16.48■□□□□ 0.23
Rer1Q9CQU3 Gm29735-201ENSMUST00000209599 660 ntAPPRIS P1 BASIC16.48■□□□□ 0.23
Rer1Q9CQU3 Rpl34-201ENSMUST00000062601 624 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.48■□□□□ 0.23
Rer1Q9CQU3 Rnf8-201ENSMUST00000024817 2077 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.48■□□□□ 0.23
Rer1Q9CQU3 1700105P06Rik-201ENSMUST00000186160 1772 ntBASIC16.48■□□□□ 0.23
Rer1Q9CQU3 2210011C24Rik-204ENSMUST00000190457 1351 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.48■□□□□ 0.23
Rer1Q9CQU3 Nexmif-201ENSMUST00000056502 5211 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.47■□□□□ 0.23
Rer1Q9CQU3 Lsr-205ENSMUST00000205961 2021 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.47■□□□□ 0.23
Rer1Q9CQU3 Mum1-201ENSMUST00000020365 2640 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.47■□□□□ 0.23
Rer1Q9CQU3 Ovol2-201ENSMUST00000037423 1539 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC16.47■□□□□ 0.23
Rer1Q9CQU3 AC102554.1-201ENSMUST00000216236 537 ntTSL 5 BASIC16.47■□□□□ 0.23
Rer1Q9CQU3 Ooep-201ENSMUST00000034900 2138 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.47■□□□□ 0.23
Rer1Q9CQU3 Msl3l2-201ENSMUST00000063138 2140 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.47■□□□□ 0.23
Rer1Q9CQU3 3830408C21Rik-205ENSMUST00000225426 1898 ntBASIC16.47■□□□□ 0.23
Rer1Q9CQU3 Ube2d2a-202ENSMUST00000170693 2483 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.47■□□□□ 0.23
Rer1Q9CQU3 Wnk2-204ENSMUST00000110096 6534 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.47■□□□□ 0.23
Rer1Q9CQU3 Tmem238-201ENSMUST00000168578 1375 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.47■□□□□ 0.23
Rer1Q9CQU3 Lrrc38-201ENSMUST00000052458 2324 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.47■□□□□ 0.23
Rer1Q9CQU3 Cltb-202ENSMUST00000091609 2186 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.47■□□□□ 0.23
Rer1Q9CQU3 Phc2-202ENSMUST00000106079 2535 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.47■□□□□ 0.23
Rer1Q9CQU3 Chml-203ENSMUST00000210367 1324 ntTSL 5 BASIC16.46■□□□□ 0.23
Rer1Q9CQU3 Letm2-201ENSMUST00000079160 2126 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.46■□□□□ 0.23
Rer1Q9CQU3 Gnas-205ENSMUST00000109083 730 ntTSL 2 BASIC16.46■□□□□ 0.23
Rer1Q9CQU3 Srcap-202ENSMUST00000098025 1257 ntTSL 5 BASIC16.46■□□□□ 0.23
Rer1Q9CQU3 Ache-209ENSMUST00000196208 1911 ntTSL 5 BASIC16.46■□□□□ 0.23
Rer1Q9CQU3 Uqcrfs1-201ENSMUST00000042834 1363 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.46■□□□□ 0.23
Rer1Q9CQU3 Sp5-201ENSMUST00000100043 2100 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.46■□□□□ 0.23
Rer1Q9CQU3 Riox1-201ENSMUST00000053744 2344 ntAPPRIS P1 BASIC16.46■□□□□ 0.23
Rer1Q9CQU3 Fam49b-202ENSMUST00000164532 1770 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.46■□□□□ 0.22
Rer1Q9CQU3 Prkar1b-201ENSMUST00000026973 2637 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.46■□□□□ 0.22
Rer1Q9CQU3 Sft2d3-201ENSMUST00000054984 2810 ntAPPRIS P1 BASIC16.46■□□□□ 0.22
Rer1Q9CQU3 Fam207a-201ENSMUST00000045454 2394 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.45■□□□□ 0.22
Rer1Q9CQU3 Triobp-202ENSMUST00000109688 2553 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.45■□□□□ 0.22
Rer1Q9CQU3 Kcnip2-201ENSMUST00000026247 1203 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC16.45■□□□□ 0.22
Rer1Q9CQU3 Gm9767-201ENSMUST00000041011 1193 ntAPPRIS P1 BASIC16.45■□□□□ 0.22
Rer1Q9CQU3 Tlx2-201ENSMUST00000089641 1236 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.45■□□□□ 0.22
Rer1Q9CQU3 Cog1-202ENSMUST00000063776 1476 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.45■□□□□ 0.22
Rer1Q9CQU3 Tfap2e-201ENSMUST00000048194 2085 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.45■□□□□ 0.22
Rer1Q9CQU3 Krt5-201ENSMUST00000023709 2190 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.45■□□□□ 0.22
Rer1Q9CQU3 Kifc3-201ENSMUST00000034240 3277 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC16.45■□□□□ 0.22
Rer1Q9CQU3 Oxsr1-201ENSMUST00000040853 4647 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.44■□□□□ 0.22
Rer1Q9CQU3 Dusp22-203ENSMUST00000110310 2319 ntTSL 2 BASIC16.44■□□□□ 0.22
Rer1Q9CQU3 Cpne2-202ENSMUST00000109537 2121 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.44■□□□□ 0.22
Rer1Q9CQU3 Ppp1r35-201ENSMUST00000031739 956 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.44■□□□□ 0.22
Rer1Q9CQU3 Setd4-202ENSMUST00000113951 1826 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.44■□□□□ 0.22
Rer1Q9CQU3 Zbtb7a-202ENSMUST00000117956 1863 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.44■□□□□ 0.22
Rer1Q9CQU3 Aplf-201ENSMUST00000032130 1889 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.44■□□□□ 0.22
Rer1Q9CQU3 Trp53rka-201ENSMUST00000039007 1880 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.44■□□□□ 0.22
Rer1Q9CQU3 Fmnl2-204ENSMUST00000127122 5508 ntTSL 5 BASIC16.44■□□□□ 0.22
Rer1Q9CQU3 Prkar2b-201ENSMUST00000003079 1657 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.43■□□□□ 0.22
Rer1Q9CQU3 Lmtk3-201ENSMUST00000072580 4807 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.43■□□□□ 0.22
Rer1Q9CQU3 Celf6-202ENSMUST00000118164 1583 ntTSL 1 (best) BASIC16.43■□□□□ 0.22
Rer1Q9CQU3 Pdcd2-205ENSMUST00000154293 1924 ntTSL 1 (best) BASIC16.43■□□□□ 0.22
Rer1Q9CQU3 Doc2a-201ENSMUST00000064110 2538 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.43■□□□□ 0.22
Rer1Q9CQU3 Ssbp1-205ENSMUST00000121360 1188 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.43■□□□□ 0.22
Rer1Q9CQU3 Rabac1-201ENSMUST00000076961 899 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.43■□□□□ 0.22
Rer1Q9CQU3 Tex264-202ENSMUST00000163441 1896 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.43■□□□□ 0.22
Rer1Q9CQU3 Man1a-203ENSMUST00000105470 2847 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.43■□□□□ 0.22
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 16.9 ms