Protein–RNA interactions for Protein: Q9CQJ4

Rnf2, E3 ubiquitin-protein ligase RING2, mousemouse

Predictions only

Length 336 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Rnf2Q9CQJ4 Eif5a-208ENSMUST00000108611 1353 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.13■□□□□ 0.17
Rnf2Q9CQJ4 Zbed3-201ENSMUST00000045909 1894 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.12■□□□□ 0.17
Rnf2Q9CQJ4 Mcmbp-202ENSMUST00000119081 2347 ntTSL 1 (best) BASIC16.12■□□□□ 0.17
Rnf2Q9CQJ4 Fmnl2-201ENSMUST00000049483 5461 ntTSL 5 BASIC16.12■□□□□ 0.17
Rnf2Q9CQJ4 Tpbgl-201ENSMUST00000178124 3022 ntAPPRIS P1 BASIC16.12■□□□□ 0.17
Rnf2Q9CQJ4 Tmem55b-209ENSMUST00000162957 1465 ntTSL 1 (best) BASIC16.12■□□□□ 0.17
Rnf2Q9CQJ4 Cdc14b-201ENSMUST00000039318 5859 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.12■□□□□ 0.17
Rnf2Q9CQJ4 Vegfa-211ENSMUST00000167860 975 ntTSL 1 (best) BASIC16.12■□□□□ 0.17
Rnf2Q9CQJ4 Vegfa-213ENSMUST00000217017 1179 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC16.12■□□□□ 0.17
Rnf2Q9CQJ4 Ddrgk1-201ENSMUST00000089559 1238 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.12■□□□□ 0.17
Rnf2Q9CQJ4 Lrch3-201ENSMUST00000023491 5536 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.12■□□□□ 0.17
Rnf2Q9CQJ4 Htra2-203ENSMUST00000113963 1629 ntTSL 5 BASIC16.12■□□□□ 0.17
Rnf2Q9CQJ4 Ubxn2a-203ENSMUST00000142867 2146 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.12■□□□□ 0.17
Rnf2Q9CQJ4 Ppp2ca-201ENSMUST00000020608 7102 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.12■□□□□ 0.17
Rnf2Q9CQJ4 Dexi-201ENSMUST00000038281 1389 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.12■□□□□ 0.17
Rnf2Q9CQJ4 Upf1-201ENSMUST00000075666 4618 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.12■□□□□ 0.17
Rnf2Q9CQJ4 Dennd6a-202ENSMUST00000203874 2677 ntTSL 1 (best) BASIC16.12■□□□□ 0.17
Rnf2Q9CQJ4 Gapvd1-201ENSMUST00000028224 5695 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.11■□□□□ 0.17
Rnf2Q9CQJ4 Rps6ka2-201ENSMUST00000024575 5404 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.11■□□□□ 0.17
Rnf2Q9CQJ4 Nrxn2-204ENSMUST00000113461 5505 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.11■□□□□ 0.17
Rnf2Q9CQJ4 Snap91-203ENSMUST00000074501 2577 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.11■□□□□ 0.17
Rnf2Q9CQJ4 Fgfrl1-201ENSMUST00000013633 2329 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.11■□□□□ 0.17
Rnf2Q9CQJ4 Thoc6-201ENSMUST00000047436 1504 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.11■□□□□ 0.17
Rnf2Q9CQJ4 Mettl24-201ENSMUST00000058747 1529 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.11■□□□□ 0.17
Rnf2Q9CQJ4 Tead2-201ENSMUST00000033060 2140 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.11■□□□□ 0.17
Rnf2Q9CQJ4 AC152827.1-201ENSMUST00000221143 2189 ntBASIC16.11■□□□□ 0.17
Rnf2Q9CQJ4 Cltb-202ENSMUST00000091609 2186 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.11■□□□□ 0.17
Rnf2Q9CQJ4 Lpar3-201ENSMUST00000039164 2464 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.11■□□□□ 0.17
Rnf2Q9CQJ4 Cbln2-201ENSMUST00000068423 2475 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.11■□□□□ 0.17
Rnf2Q9CQJ4 C1qtnf5-203ENSMUST00000114818 1337 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.11■□□□□ 0.17
Rnf2Q9CQJ4 Desi2-204ENSMUST00000161075 2590 ntTSL 1 (best) BASIC16.11■□□□□ 0.17
Rnf2Q9CQJ4 Fn1-208ENSMUST00000186940 1350 ntTSL 1 (best) BASIC16.11■□□□□ 0.17
Rnf2Q9CQJ4 Slc35f3-201ENSMUST00000108759 2309 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.11■□□□□ 0.17
Rnf2Q9CQJ4 Lrrc38-201ENSMUST00000052458 2324 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.11■□□□□ 0.17
Rnf2Q9CQJ4 Tmem164-201ENSMUST00000087333 5149 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.11■□□□□ 0.17
Rnf2Q9CQJ4 Btbd17-201ENSMUST00000000206 1717 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.11■□□□□ 0.17
Rnf2Q9CQJ4 Pkm-201ENSMUST00000034834 2432 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.1■□□□□ 0.17
Rnf2Q9CQJ4 Gm2415-201ENSMUST00000128982 1474 ntTSL 1 (best) BASIC16.1■□□□□ 0.17
Rnf2Q9CQJ4 Abhd11-201ENSMUST00000046999 1493 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.1■□□□□ 0.17
Rnf2Q9CQJ4 Alx3-201ENSMUST00000014747 1874 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.1■□□□□ 0.17
Rnf2Q9CQJ4 Smap2-201ENSMUST00000043200 2905 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.1■□□□□ 0.17
Rnf2Q9CQJ4 Zfp287-205ENSMUST00000150336 1605 ntTSL 1 (best) BASIC16.1■□□□□ 0.17
Rnf2Q9CQJ4 Sin3b-202ENSMUST00000109950 1024 ntTSL 1 (best) BASIC16.1■□□□□ 0.17
Rnf2Q9CQJ4 Tmx4-202ENSMUST00000110119 596 ntTSL 2 BASIC16.1■□□□□ 0.17
Rnf2Q9CQJ4 Atp8a1-203ENSMUST00000113651 808 ntTSL 5 BASIC16.1■□□□□ 0.17
Rnf2Q9CQJ4 Zfp346-203ENSMUST00000159278 1253 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.1■□□□□ 0.17
Rnf2Q9CQJ4 Vegfb-201ENSMUST00000025914 1281 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.1■□□□□ 0.17
Rnf2Q9CQJ4 Rab42-201ENSMUST00000040411 761 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.1■□□□□ 0.17
Rnf2Q9CQJ4 Gm5921-201ENSMUST00000075898 882 ntBASIC16.1■□□□□ 0.17
Rnf2Q9CQJ4 Dleu7-201ENSMUST00000063169 1314 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.1■□□□□ 0.17
Rnf2Q9CQJ4 Pou3f1-201ENSMUST00000053491 3849 ntAPPRIS P1 BASIC16.1■□□□□ 0.17
Rnf2Q9CQJ4 Shisa8-201ENSMUST00000179269 1804 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.1■□□□□ 0.17
Rnf2Q9CQJ4 Gm11532-201ENSMUST00000128111 5272 ntTSL 1 (best) BASIC16.1■□□□□ 0.17
Rnf2Q9CQJ4 Rfx8-202ENSMUST00000151913 2008 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.09■□□□□ 0.17
Rnf2Q9CQJ4 Mark2-207ENSMUST00000165286 2975 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.09■□□□□ 0.17
Rnf2Q9CQJ4 Cradd-205ENSMUST00000220279 1613 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.09■□□□□ 0.17
Rnf2Q9CQJ4 Adgrl1-207ENSMUST00000141158 8181 ntTSL 1 (best) BASIC16.09■□□□□ 0.17
Rnf2Q9CQJ4 Phf14-201ENSMUST00000090632 3985 ntTSL 1 (best) BASIC16.09■□□□□ 0.17
Rnf2Q9CQJ4 Trmt61a-202ENSMUST00000168338 2131 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.09■□□□□ 0.17
Rnf2Q9CQJ4 Gm2415-202ENSMUST00000134688 401 ntTSL 2 BASIC16.09■□□□□ 0.17
Rnf2Q9CQJ4 Papola-211ENSMUST00000166735 1033 ntTSL 1 (best) BASIC16.09■□□□□ 0.17
Rnf2Q9CQJ4 Smad2-205ENSMUST00000168423 2857 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.09■□□□□ 0.17
Rnf2Q9CQJ4 Fastk-202ENSMUST00000115041 1399 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.09■□□□□ 0.17
Rnf2Q9CQJ4 Rell2-202ENSMUST00000091932 1995 ntTSL 2 BASIC16.09■□□□□ 0.17
Rnf2Q9CQJ4 Dynll1-201ENSMUST00000009157 2030 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.09■□□□□ 0.17
Rnf2Q9CQJ4 Slc35d3-201ENSMUST00000059805 2630 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.09■□□□□ 0.17
Rnf2Q9CQJ4 Ankrd33b-203ENSMUST00000110410 2070 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.09■□□□□ 0.17
Rnf2Q9CQJ4 Kcnt1-203ENSMUST00000114172 5219 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.09■□□□□ 0.17
Rnf2Q9CQJ4 Cacng7-201ENSMUST00000092891 2212 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.09■□□□□ 0.17
Rnf2Q9CQJ4 Gm15441-202ENSMUST00000107095 1653 ntTSL 1 (best) BASIC16.08■□□□□ 0.17
Rnf2Q9CQJ4 Zfp644-204ENSMUST00000112696 5785 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.08■□□□□ 0.17
Rnf2Q9CQJ4 Setd6-201ENSMUST00000034096 1707 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.08■□□□□ 0.17
Rnf2Q9CQJ4 Pstpip1-201ENSMUST00000059206 1863 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.08■□□□□ 0.17
Rnf2Q9CQJ4 Cers1-202ENSMUST00000140239 2711 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.08■□□□□ 0.16
Rnf2Q9CQJ4 9230116N13Rik-201ENSMUST00000181746 2097 ntTSL 1 (best) BASIC16.08■□□□□ 0.16
Rnf2Q9CQJ4 Cited1-202ENSMUST00000101336 1090 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.08■□□□□ 0.16
Rnf2Q9CQJ4 Gm27253-201ENSMUST00000183670 367 ntTSL 1 (best) BASIC16.08■□□□□ 0.16
Rnf2Q9CQJ4 Ak2-201ENSMUST00000030583 986 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC16.08■□□□□ 0.16
Rnf2Q9CQJ4 Mast4-205ENSMUST00000166726 5968 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.08■□□□□ 0.16
Rnf2Q9CQJ4 Dok6-201ENSMUST00000097495 1441 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.08■□□□□ 0.16
Rnf2Q9CQJ4 Fbxw2-202ENSMUST00000091020 1838 ntTSL 1 (best) BASIC16.08■□□□□ 0.16
Rnf2Q9CQJ4 Paxip1-201ENSMUST00000002291 5850 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.07■□□□□ 0.16
Rnf2Q9CQJ4 Ubl3-202ENSMUST00000164904 2001 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.07■□□□□ 0.16
Rnf2Q9CQJ4 Ndel1-201ENSMUST00000018880 2382 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.07■□□□□ 0.16
Rnf2Q9CQJ4 Carm1-202ENSMUST00000115394 3320 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.07■□□□□ 0.16
Rnf2Q9CQJ4 Caskin1-201ENSMUST00000024958 6172 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.07■□□□□ 0.16
Rnf2Q9CQJ4 Gm12905-201ENSMUST00000153814 658 ntTSL 2 BASIC16.07■□□□□ 0.16
Rnf2Q9CQJ4 Gm45444-201ENSMUST00000211394 898 ntBASIC16.07■□□□□ 0.16
Rnf2Q9CQJ4 Trappc6b-207ENSMUST00000218686 785 ntTSL 3 BASIC16.07■□□□□ 0.16
Rnf2Q9CQJ4 Gm6217-201ENSMUST00000222182 829 ntAPPRIS P1 BASIC16.07■□□□□ 0.16
Rnf2Q9CQJ4 Jtb-201ENSMUST00000029546 1101 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.07■□□□□ 0.16
Rnf2Q9CQJ4 Coprs-201ENSMUST00000033839 793 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.07■□□□□ 0.16
Rnf2Q9CQJ4 Plpp1-201ENSMUST00000016144 1598 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC16.07■□□□□ 0.16
Rnf2Q9CQJ4 Syap1-201ENSMUST00000033723 2087 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.07■□□□□ 0.16
Rnf2Q9CQJ4 Qsox2-201ENSMUST00000036187 2559 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.07■□□□□ 0.16
Rnf2Q9CQJ4 Mgat1-213ENSMUST00000167400 3151 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.07■□□□□ 0.16
Rnf2Q9CQJ4 Dlg3-204ENSMUST00000113736 4940 ntTSL 1 (best) BASIC16.07■□□□□ 0.16
Rnf2Q9CQJ4 Ppp6r2-202ENSMUST00000226221 2559 ntBASIC16.06■□□□□ 0.16
Rnf2Q9CQJ4 Pbx1-206ENSMUST00000176790 1828 ntTSL 1 (best) BASIC16.06■□□□□ 0.16
Rnf2Q9CQJ4 Pnrc1-201ENSMUST00000049357 1648 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.06■□□□□ 0.16
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 20.7 ms