Protein–RNA interactions for Protein: Q9CQF4

Uncharacterized protein C6orf203 homolog, mousemouse

Predictions only

Length 240 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Q9CQF4 Gtf2e2-202ENSMUST00000170705 1634 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.63■□□□□ 0.57
Q9CQF4 Hnrnpa3-204ENSMUST00000111964 1654 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.63■□□□□ 0.57
Q9CQF4 Rps6ka2-201ENSMUST00000024575 5404 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.63■□□□□ 0.57
Q9CQF4 Ntf5-201ENSMUST00000058879 1963 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.62■□□□□ 0.57
Q9CQF4 3110053B16Rik-202ENSMUST00000140360 2004 ntTSL 1 (best) BASIC18.62■□□□□ 0.57
Q9CQF4 Gab2-202ENSMUST00000206791 2065 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.62■□□□□ 0.57
Q9CQF4 Snhg20-203ENSMUST00000182811 2153 ntBASIC18.62■□□□□ 0.57
Q9CQF4 Wnt10b-203ENSMUST00000226610 2217 ntAPPRIS P1 BASIC18.62■□□□□ 0.57
Q9CQF4 Wnt10b-201ENSMUST00000023732 2226 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.62■□□□□ 0.57
Q9CQF4 Sorcs2-201ENSMUST00000037370 5707 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.62■□□□□ 0.57
Q9CQF4 Zswim8-208ENSMUST00000224751 5951 ntAPPRIS ALT2 BASIC18.62■□□□□ 0.57
Q9CQF4 Asap2-203ENSMUST00000090834 5097 ntTSL 5 BASIC18.62■□□□□ 0.57
Q9CQF4 Tcea2-201ENSMUST00000103042 1183 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.62■□□□□ 0.57
Q9CQF4 Krt79-201ENSMUST00000023799 2097 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.62■□□□□ 0.57
Q9CQF4 Retreg2-201ENSMUST00000097694 2561 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.62■□□□□ 0.57
Q9CQF4 Sirt1-201ENSMUST00000020257 3905 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.62■□□□□ 0.57
Q9CQF4 Slc30a9-204ENSMUST00000162372 5711 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.62■□□□□ 0.57
Q9CQF4 2810474O19Rik-201ENSMUST00000046689 6066 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC18.62■□□□□ 0.57
Q9CQF4 Zmiz2-201ENSMUST00000012612 4199 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC18.61■□□□□ 0.57
Q9CQF4 Cxadr-201ENSMUST00000023572 5734 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.61■□□□□ 0.57
Q9CQF4 Avl9-203ENSMUST00000177249 1614 ntTSL 1 (best) BASIC18.61■□□□□ 0.57
Q9CQF4 Pdzd8-201ENSMUST00000099274 7076 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.61■□□□□ 0.57
Q9CQF4 Coprs-201ENSMUST00000033839 793 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.61■□□□□ 0.57
Q9CQF4 Otud1-201ENSMUST00000052168 2832 ntAPPRIS P1 BASIC18.61■□□□□ 0.57
Q9CQF4 Dpf1-201ENSMUST00000049977 2309 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC18.61■□□□□ 0.57
Q9CQF4 Trak1-208ENSMUST00000210636 2197 ntTSL 1 (best) BASIC18.61■□□□□ 0.57
Q9CQF4 Ankrd13d-201ENSMUST00000056888 2139 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.61■□□□□ 0.57
Q9CQF4 Fah-201ENSMUST00000032865 1585 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.6■□□□□ 0.57
Q9CQF4 Galnt11-201ENSMUST00000045737 2552 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.6■□□□□ 0.57
Q9CQF4 Phf14-202ENSMUST00000115510 3353 ntTSL 1 (best) BASIC18.6■□□□□ 0.57
Q9CQF4 Fbxw2-203ENSMUST00000113075 2260 ntTSL 1 (best) BASIC18.6■□□□□ 0.57
Q9CQF4 Zfp644-204ENSMUST00000112696 5785 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC18.6■□□□□ 0.57
Q9CQF4 Gm16464-201ENSMUST00000117815 1095 ntBASIC18.6■□□□□ 0.57
Q9CQF4 Gm2415-202ENSMUST00000134688 401 ntTSL 2 BASIC18.6■□□□□ 0.57
Q9CQF4 Gm12905-201ENSMUST00000153814 658 ntTSL 2 BASIC18.6■□□□□ 0.57
Q9CQF4 Ccnd3-201ENSMUST00000037333 1999 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.6■□□□□ 0.57
Q9CQF4 Olfm1-204ENSMUST00000113920 2513 ntTSL 1 (best) BASIC18.6■□□□□ 0.57
Q9CQF4 Oaf-201ENSMUST00000034512 2526 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.6■□□□□ 0.57
Q9CQF4 Gm43653-201ENSMUST00000198136 1608 ntTSL 3 BASIC18.6■□□□□ 0.57
Q9CQF4 Plekhm2-201ENSMUST00000030751 4154 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.6■□□□□ 0.57
Q9CQF4 Thap11-201ENSMUST00000040445 1819 ntAPPRIS P1 BASIC18.59■□□□□ 0.57
Q9CQF4 Slc39a13-203ENSMUST00000111436 1291 ntTSL 1 (best) BASIC18.59■□□□□ 0.57
Q9CQF4 March11-201ENSMUST00000126304 2146 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.59■□□□□ 0.57
Q9CQF4 Csnk1a1-201ENSMUST00000115246 1484 ntTSL 5 BASIC18.58■□□□□ 0.57
Q9CQF4 Bspry-201ENSMUST00000030088 1757 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC18.58■□□□□ 0.57
Q9CQF4 Slc39a7-203ENSMUST00000169397 2107 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.58■□□□□ 0.57
Q9CQF4 Tead2-201ENSMUST00000033060 2140 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.58■□□□□ 0.57
Q9CQF4 Cacul1-202ENSMUST00000111460 5561 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.58■□□□□ 0.57
Q9CQF4 Rtl10-201ENSMUST00000146673 865 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.58■□□□□ 0.56
Q9CQF4 Gm5921-201ENSMUST00000075898 882 ntBASIC18.58■□□□□ 0.56
Q9CQF4 2410002F23Rik-201ENSMUST00000055858 1982 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC18.58■□□□□ 0.56
Q9CQF4 Smad6-201ENSMUST00000041029 2971 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.58■□□□□ 0.56
Q9CQF4 Snx21-204ENSMUST00000172577 1825 ntTSL 2 BASIC18.58■□□□□ 0.56
Q9CQF4 Magi2-203ENSMUST00000115267 4478 ntTSL 1 (best) BASIC18.58■□□□□ 0.56
Q9CQF4 Ubxn2a-203ENSMUST00000142867 2146 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.58■□□□□ 0.56
Q9CQF4 Shox2-201ENSMUST00000029422 3079 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.58■□□□□ 0.56
Q9CQF4 Phf14-201ENSMUST00000090632 3985 ntTSL 1 (best) BASIC18.57■□□□□ 0.56
Q9CQF4 Bdh1-201ENSMUST00000089759 1711 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.57■□□□□ 0.56
Q9CQF4 Zfp282-201ENSMUST00000061890 5573 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.57■□□□□ 0.56
Q9CQF4 Cbln2-201ENSMUST00000068423 2475 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.57■□□□□ 0.56
Q9CQF4 Alx3-201ENSMUST00000014747 1874 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.57■□□□□ 0.56
Q9CQF4 Gng12-203ENSMUST00000114224 680 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC18.57■□□□□ 0.56
Q9CQF4 Gng12-206ENSMUST00000114227 1125 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.57■□□□□ 0.56
Q9CQF4 Efna3-203ENSMUST00000200436 742 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC18.57■□□□□ 0.56
Q9CQF4 Pou3f1-201ENSMUST00000053491 3849 ntAPPRIS P1 BASIC18.57■□□□□ 0.56
Q9CQF4 Klc3-204ENSMUST00000108459 1849 ntTSL 1 (best) BASIC18.57■□□□□ 0.56
Q9CQF4 Porcn-203ENSMUST00000089402 1839 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC18.57■□□□□ 0.56
Q9CQF4 Mrgbp-201ENSMUST00000029085 1510 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.57■□□□□ 0.56
Q9CQF4 Fez1-201ENSMUST00000034630 1794 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.57■□□□□ 0.56
Q9CQF4 Hoxd13-201ENSMUST00000001872 2483 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.57■□□□□ 0.56
Q9CQF4 Paxip1-201ENSMUST00000002291 5850 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.56■□□□□ 0.56
Q9CQF4 Dlg3-204ENSMUST00000113736 4940 ntTSL 1 (best) BASIC18.56■□□□□ 0.56
Q9CQF4 Fbxo24-201ENSMUST00000031732 2161 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.56■□□□□ 0.56
Q9CQF4 Rp9-203ENSMUST00000215715 1499 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.56■□□□□ 0.56
Q9CQF4 Dmrta2-201ENSMUST00000061187 2922 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.56■□□□□ 0.56
Q9CQF4 Antxr1-201ENSMUST00000042025 5253 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC18.56■□□□□ 0.56
Q9CQF4 Socs2-201ENSMUST00000020215 2222 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.55■□□□□ 0.56
Q9CQF4 Ets1-202ENSMUST00000050797 1976 ntTSL 1 (best) BASIC18.55■□□□□ 0.56
Q9CQF4 Scaf11-201ENSMUST00000047835 5766 ntTSL 5 BASIC18.55■□□□□ 0.56
Q9CQF4 Gbx2-201ENSMUST00000036954 2135 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.55■□□□□ 0.56
Q9CQF4 Pcgf6-201ENSMUST00000026032 2098 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.55■□□□□ 0.56
Q9CQF4 Dapk1-207ENSMUST00000226059 5009 ntBASIC18.55■□□□□ 0.56
Q9CQF4 Dleu2-201ENSMUST00000180377 1165 ntTSL 1 (best) BASIC18.55■□□□□ 0.56
Q9CQF4 Pdcd7-201ENSMUST00000048184 2419 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC18.55■□□□□ 0.56
Q9CQF4 AC122428.2-201ENSMUST00000216321 1832 ntBASIC18.55■□□□□ 0.56
Q9CQF4 Fbxw2-202ENSMUST00000091020 1838 ntTSL 1 (best) BASIC18.55■□□□□ 0.56
Q9CQF4 Rora-202ENSMUST00000113624 2591 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.55■□□□□ 0.56
Q9CQF4 Slc2a13-202ENSMUST00000109283 6536 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.55■□□□□ 0.56
Q9CQF4 Gm9817-201ENSMUST00000054395 2531 ntAPPRIS P1 BASIC18.55■□□□□ 0.56
Q9CQF4 Sac3d1-201ENSMUST00000113533 1374 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.55■□□□□ 0.56
Q9CQF4 Acsl3-203ENSMUST00000134566 2492 ntTSL 1 (best) BASIC18.55■□□□□ 0.56
Q9CQF4 Cebpg-202ENSMUST00000130491 4709 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.54■□□□□ 0.56
Q9CQF4 1700034P13Rik-201ENSMUST00000181358 1343 ntTSL 1 (best) BASIC18.54■□□□□ 0.56
Q9CQF4 Glp1r-201ENSMUST00000114574 1480 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.54■□□□□ 0.56
Q9CQF4 Cited1-202ENSMUST00000101336 1090 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.54■□□□□ 0.56
Q9CQF4 Diaph1-205ENSMUST00000115634 5666 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC18.54■□□□□ 0.56
Q9CQF4 Srcin1-201ENSMUST00000107590 5493 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC18.54■□□□□ 0.56
Q9CQF4 Timmdc1-201ENSMUST00000002925 1573 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.54■□□□□ 0.56
Q9CQF4 Pithd1-201ENSMUST00000105851 1700 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.54■□□□□ 0.56
Q9CQF4 Bcl3-201ENSMUST00000120537 1850 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.54■□□□□ 0.56
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 17.6 ms