Protein–RNA interactions for Protein: Q9CQE7

Ergic3, Endoplasmic reticulum-Golgi intermediate compartment protein 3, mousemouse

Predictions only

Length 383 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Ergic3Q9CQE7 Syt17-203ENSMUST00000203485 1932 ntTSL 1 (best) BASIC18.68■□□□□ 0.58
Ergic3Q9CQE7 Kctd20-204ENSMUST00000122163 2423 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.68■□□□□ 0.58
Ergic3Q9CQE7 Dbf4-201ENSMUST00000002368 2401 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.68■□□□□ 0.58
Ergic3Q9CQE7 Kirrel3-202ENSMUST00000115148 2851 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC18.67■□□□□ 0.58
Ergic3Q9CQE7 Pnrc1-201ENSMUST00000049357 1648 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.67■□□□□ 0.58
Ergic3Q9CQE7 Ptger3-202ENSMUST00000173533 2097 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.67■□□□□ 0.58
Ergic3Q9CQE7 Dda1-202ENSMUST00000124745 1933 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.67■□□□□ 0.58
Ergic3Q9CQE7 Map4k4-201ENSMUST00000163854 5782 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC18.67■□□□□ 0.58
Ergic3Q9CQE7 D11Wsu47e-201ENSMUST00000042227 2196 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.67■□□□□ 0.58
Ergic3Q9CQE7 Dact3-201ENSMUST00000108493 2989 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.67■□□□□ 0.58
Ergic3Q9CQE7 Gramd1a-202ENSMUST00000085636 2543 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC18.67■□□□□ 0.58
Ergic3Q9CQE7 Tmem86a-201ENSMUST00000010451 1831 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.67■□□□□ 0.58
Ergic3Q9CQE7 Dlg3-204ENSMUST00000113736 4940 ntTSL 1 (best) BASIC18.67■□□□□ 0.58
Ergic3Q9CQE7 Uba5-201ENSMUST00000035166 2404 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.66■□□□□ 0.58
Ergic3Q9CQE7 Nrl-203ENSMUST00000178694 1928 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.66■□□□□ 0.58
Ergic3Q9CQE7 Cd248-201ENSMUST00000070630 2560 ntAPPRIS P1 BASIC18.66■□□□□ 0.58
Ergic3Q9CQE7 Cacul1-202ENSMUST00000111460 5561 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.66■□□□□ 0.58
Ergic3Q9CQE7 Spg7-209ENSMUST00000149248 2896 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC18.66■□□□□ 0.58
Ergic3Q9CQE7 Ebf3-201ENSMUST00000033378 4838 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.66■□□□□ 0.58
Ergic3Q9CQE7 Nipsnap2-201ENSMUST00000086046 2112 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.66■□□□□ 0.58
Ergic3Q9CQE7 Dusp2-201ENSMUST00000028846 1617 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.66■□□□□ 0.58
Ergic3Q9CQE7 Ubp1-201ENSMUST00000009885 3742 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC18.66■□□□□ 0.58
Ergic3Q9CQE7 Rexo5-201ENSMUST00000033218 1966 ntTSL 1 (best) BASIC18.66■□□□□ 0.58
Ergic3Q9CQE7 Shisa8-201ENSMUST00000179269 1804 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.65■□□□□ 0.58
Ergic3Q9CQE7 AC122428.2-201ENSMUST00000216321 1832 ntBASIC18.65■□□□□ 0.58
Ergic3Q9CQE7 Mcu-202ENSMUST00000020312 2872 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.65■□□□□ 0.58
Ergic3Q9CQE7 Meg3-207ENSMUST00000143836 1896 ntTSL 1 (best) BASIC18.65■□□□□ 0.58
Ergic3Q9CQE7 Rab3il1-201ENSMUST00000113161 2225 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC18.65■□□□□ 0.58
Ergic3Q9CQE7 Catsper2-201ENSMUST00000038073 2247 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.65■□□□□ 0.58
Ergic3Q9CQE7 Wdr41-202ENSMUST00000159647 2289 ntTSL 5 BASIC18.65■□□□□ 0.58
Ergic3Q9CQE7 Wdr41-206ENSMUST00000167155 2289 ntTSL 1 (best) BASIC18.65■□□□□ 0.58
Ergic3Q9CQE7 Agtpbp1-222ENSMUST00000171606 3037 ntTSL 1 (best) BASIC18.65■□□□□ 0.58
Ergic3Q9CQE7 Spsb4-201ENSMUST00000055433 2720 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.65■□□□□ 0.58
Ergic3Q9CQE7 L3mbtl4-201ENSMUST00000093007 2445 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.65■□□□□ 0.58
Ergic3Q9CQE7 Hcn2-202ENSMUST00000099513 3195 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.65■□□□□ 0.58
Ergic3Q9CQE7 Epn1-202ENSMUST00000098845 2565 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC18.65■□□□□ 0.58
Ergic3Q9CQE7 Zbtb7a-202ENSMUST00000117956 1863 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.65■□□□□ 0.58
Ergic3Q9CQE7 Ntn5-203ENSMUST00000183120 1491 ntTSL 1 (best) BASIC18.65■□□□□ 0.58
Ergic3Q9CQE7 D17Wsu92e-201ENSMUST00000075076 1470 ntTSL 1 (best) BASIC18.65■□□□□ 0.58
Ergic3Q9CQE7 Tsen54-201ENSMUST00000021134 1979 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC18.64■□□□□ 0.58
Ergic3Q9CQE7 AC158990.1-201ENSMUST00000221450 2016 ntBASIC18.64■□□□□ 0.58
Ergic3Q9CQE7 Auh-204ENSMUST00000120535 1647 ntTSL 1 (best) BASIC18.64■□□□□ 0.57
Ergic3Q9CQE7 Zfp287-205ENSMUST00000150336 1605 ntTSL 1 (best) BASIC18.64■□□□□ 0.57
Ergic3Q9CQE7 Wnk2-205ENSMUST00000110097 6882 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC18.64■□□□□ 0.57
Ergic3Q9CQE7 Wnk2-203ENSMUST00000091623 6897 ntAPPRIS P4 TSL 5 BASIC18.64■□□□□ 0.57
Ergic3Q9CQE7 Setd6-201ENSMUST00000034096 1707 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.64■□□□□ 0.57
Ergic3Q9CQE7 Qrich1-206ENSMUST00000193258 2291 ntTSL 2 BASIC18.64■□□□□ 0.57
Ergic3Q9CQE7 AC116713.1-201ENSMUST00000215074 430 ntBASIC18.64■□□□□ 0.57
Ergic3Q9CQE7 Gxylt1-201ENSMUST00000049484 6611 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.64■□□□□ 0.57
Ergic3Q9CQE7 Bcl3-201ENSMUST00000120537 1850 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.64■□□□□ 0.57
Ergic3Q9CQE7 Fgfr2-217ENSMUST00000124096 2425 ntTSL 5 BASIC18.64■□□□□ 0.57
Ergic3Q9CQE7 Ankle1-201ENSMUST00000119976 2136 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.64■□□□□ 0.57
Ergic3Q9CQE7 Hsf1-204ENSMUST00000226872 2104 ntBASIC18.64■□□□□ 0.57
Ergic3Q9CQE7 E130208F15Rik-201ENSMUST00000098585 1733 ntAPPRIS P1 BASIC18.63■□□□□ 0.57
Ergic3Q9CQE7 Asap2-203ENSMUST00000090834 5097 ntTSL 5 BASIC18.63■□□□□ 0.57
Ergic3Q9CQE7 Kcns3-201ENSMUST00000055673 2933 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.63■□□□□ 0.57
Ergic3Q9CQE7 1700051O22Rik-202ENSMUST00000195451 638 ntBASIC18.63■□□□□ 0.57
Ergic3Q9CQE7 Nsd1-206ENSMUST00000224918 1001 ntBASIC18.63■□□□□ 0.57
Ergic3Q9CQE7 Epdr1-201ENSMUST00000002885 2363 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.63■□□□□ 0.57
Ergic3Q9CQE7 Pdss1-207ENSMUST00000152170 1538 ntTSL 1 (best) BASIC18.63■□□□□ 0.57
Ergic3Q9CQE7 Sh2b3-203ENSMUST00000118580 2393 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC18.62■□□□□ 0.57
Ergic3Q9CQE7 Gm15918-201ENSMUST00000137259 689 ntTSL 3 BASIC18.62■□□□□ 0.57
Ergic3Q9CQE7 Naa20-201ENSMUST00000002805 1172 ntTSL 1 (best) BASIC18.62■□□□□ 0.57
Ergic3Q9CQE7 Pigv-202ENSMUST00000067902 990 ntTSL 1 (best) BASIC18.62■□□□□ 0.57
Ergic3Q9CQE7 1700105P06Rik-201ENSMUST00000186160 1772 ntBASIC18.62■□□□□ 0.57
Ergic3Q9CQE7 Sae1-201ENSMUST00000094815 1875 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.62■□□□□ 0.57
Ergic3Q9CQE7 Sp5-201ENSMUST00000100043 2100 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.62■□□□□ 0.57
Ergic3Q9CQE7 Ascl1-201ENSMUST00000020243 2481 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.62■□□□□ 0.57
Ergic3Q9CQE7 Cers1-202ENSMUST00000140239 2711 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.62■□□□□ 0.57
Ergic3Q9CQE7 Fzd5-202ENSMUST00000116133 2895 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.62■□□□□ 0.57
Ergic3Q9CQE7 Fyn-204ENSMUST00000126486 2495 ntTSL 1 (best) BASIC18.61■□□□□ 0.57
Ergic3Q9CQE7 Pink1-201ENSMUST00000030536 2375 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC18.61■□□□□ 0.57
Ergic3Q9CQE7 Mreg-201ENSMUST00000048860 2284 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.61■□□□□ 0.57
Ergic3Q9CQE7 Syt5-201ENSMUST00000065957 1750 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.61■□□□□ 0.57
Ergic3Q9CQE7 Lipt2-201ENSMUST00000032967 1663 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.61■□□□□ 0.57
Ergic3Q9CQE7 Eva1b-203ENSMUST00000106152 1364 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.61■□□□□ 0.57
Ergic3Q9CQE7 Sike1-202ENSMUST00000119450 774 ntTSL 3 BASIC18.61■□□□□ 0.57
Ergic3Q9CQE7 Trappc6b-203ENSMUST00000217863 797 ntTSL 2 BASIC18.61■□□□□ 0.57
Ergic3Q9CQE7 Pard6a-201ENSMUST00000093195 1265 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.61■□□□□ 0.57
Ergic3Q9CQE7 Pstpip1-201ENSMUST00000059206 1863 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.6■□□□□ 0.57
Ergic3Q9CQE7 A630072M18Rik-201ENSMUST00000190567 5410 ntBASIC18.6■□□□□ 0.57
Ergic3Q9CQE7 Fam49b-202ENSMUST00000164532 1770 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.6■□□□□ 0.57
Ergic3Q9CQE7 Siah1b-201ENSMUST00000037928 1783 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.6■□□□□ 0.57
Ergic3Q9CQE7 Nelfe-202ENSMUST00000165953 1381 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.6■□□□□ 0.57
Ergic3Q9CQE7 Rab26-202ENSMUST00000061764 1291 ntTSL 2 BASIC18.6■□□□□ 0.57
Ergic3Q9CQE7 Anapc5-203ENSMUST00000196640 2422 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.6■□□□□ 0.57
Ergic3Q9CQE7 Mgat4b-201ENSMUST00000041725 2429 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.6■□□□□ 0.57
Ergic3Q9CQE7 Uqcrc1-201ENSMUST00000026743 1653 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.6■□□□□ 0.57
Ergic3Q9CQE7 Ankrd13d-201ENSMUST00000056888 2139 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.59■□□□□ 0.57
Ergic3Q9CQE7 Taf4b-201ENSMUST00000169862 5149 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.59■□□□□ 0.57
Ergic3Q9CQE7 1700003E16Rik-201ENSMUST00000032106 2020 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.59■□□□□ 0.57
Ergic3Q9CQE7 Krt82-201ENSMUST00000023713 2087 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.59■□□□□ 0.57
Ergic3Q9CQE7 Panx1-202ENSMUST00000164273 5732 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.59■□□□□ 0.57
Ergic3Q9CQE7 Wnt10a-201ENSMUST00000006718 2468 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.59■□□□□ 0.57
Ergic3Q9CQE7 Crocc-202ENSMUST00000097816 6273 ntTSL 5 BASIC18.59■□□□□ 0.57
Ergic3Q9CQE7 Klf16-201ENSMUST00000038558 2674 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.58■□□□□ 0.57
Ergic3Q9CQE7 Gm16933-201ENSMUST00000141741 2169 ntTSL 1 (best) BASIC18.58■□□□□ 0.57
Ergic3Q9CQE7 Rasgef1a-201ENSMUST00000164960 3284 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC18.58■□□□□ 0.57
Ergic3Q9CQE7 Gm16764-201ENSMUST00000138891 541 ntTSL 5 BASIC18.58■□□□□ 0.56
Ergic3Q9CQE7 Pmpca-202ENSMUST00000114093 1638 ntTSL 1 (best) BASIC18.58■□□□□ 0.56
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 18.3 ms