Protein–RNA interactions for Protein: Q9CQE1

Nipsnap3b, Protein NipSnap homolog 3B, mousemouse

Predictions only

Length 247 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Nipsnap3bQ9CQE1 Calml3-201ENSMUST00000077698 1421 ntAPPRIS P1 BASIC19.93■□□□□ 0.78
Nipsnap3bQ9CQE1 Pde7a-202ENSMUST00000099195 6298 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC19.93■□□□□ 0.78
Nipsnap3bQ9CQE1 Mpz-201ENSMUST00000070758 2002 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.93■□□□□ 0.78
Nipsnap3bQ9CQE1 Pou3f1-201ENSMUST00000053491 3849 ntAPPRIS P1 BASIC19.93■□□□□ 0.78
Nipsnap3bQ9CQE1 Trp73-204ENSMUST00000105644 5042 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC19.93■□□□□ 0.78
Nipsnap3bQ9CQE1 Rnf8-201ENSMUST00000024817 2077 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.93■□□□□ 0.78
Nipsnap3bQ9CQE1 Gm26660-201ENSMUST00000181582 2543 ntTSL 1 (best) BASIC19.93■□□□□ 0.78
Nipsnap3bQ9CQE1 Fgf8-206ENSMUST00000111928 1056 ntTSL 1 (best) BASIC19.93■□□□□ 0.78
Nipsnap3bQ9CQE1 Gng12-203ENSMUST00000114224 680 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC19.93■□□□□ 0.78
Nipsnap3bQ9CQE1 Gng12-206ENSMUST00000114227 1125 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.93■□□□□ 0.78
Nipsnap3bQ9CQE1 Igfbp7-201ENSMUST00000046746 1116 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC19.93■□□□□ 0.78
Nipsnap3bQ9CQE1 Rora-202ENSMUST00000113624 2591 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.93■□□□□ 0.78
Nipsnap3bQ9CQE1 Galnt11-201ENSMUST00000045737 2552 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.92■□□□□ 0.78
Nipsnap3bQ9CQE1 Zbtb7a-202ENSMUST00000117956 1863 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.92■□□□□ 0.78
Nipsnap3bQ9CQE1 Pdcd2-205ENSMUST00000154293 1924 ntTSL 1 (best) BASIC19.92■□□□□ 0.78
Nipsnap3bQ9CQE1 Baiap2-203ENSMUST00000103021 3398 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC19.92■□□□□ 0.78
Nipsnap3bQ9CQE1 Runx2-207ENSMUST00000160673 1791 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC19.92■□□□□ 0.78
Nipsnap3bQ9CQE1 1700105P06Rik-201ENSMUST00000186160 1772 ntBASIC19.92■□□□□ 0.78
Nipsnap3bQ9CQE1 Med25-201ENSMUST00000003049 2619 ntTSL 1 (best) BASIC19.91■□□□□ 0.78
Nipsnap3bQ9CQE1 Cacnb1-205ENSMUST00000107562 1745 ntTSL 1 (best) BASIC19.91■□□□□ 0.78
Nipsnap3bQ9CQE1 Trp53rka-201ENSMUST00000039007 1880 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.91■□□□□ 0.78
Nipsnap3bQ9CQE1 Slc39a13-203ENSMUST00000111436 1291 ntTSL 1 (best) BASIC19.91■□□□□ 0.78
Nipsnap3bQ9CQE1 Clec3b-201ENSMUST00000026890 992 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.91■□□□□ 0.78
Nipsnap3bQ9CQE1 Rims1-209ENSMUST00000218140 1434 ntTSL 5 BASIC19.91■□□□□ 0.78
Nipsnap3bQ9CQE1 Prss50-201ENSMUST00000051097 1456 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.91■□□□□ 0.78
Nipsnap3bQ9CQE1 Serbp1-207ENSMUST00000203436 1667 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC19.91■□□□□ 0.78
Nipsnap3bQ9CQE1 Ift57-201ENSMUST00000046777 2601 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.9■□□□□ 0.78
Nipsnap3bQ9CQE1 3830408C21Rik-205ENSMUST00000225426 1898 ntBASIC19.9■□□□□ 0.78
Nipsnap3bQ9CQE1 Ptov1-201ENSMUST00000046575 1883 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.9■□□□□ 0.78
Nipsnap3bQ9CQE1 Tsen54-201ENSMUST00000021134 1979 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC19.9■□□□□ 0.78
Nipsnap3bQ9CQE1 Rell2-202ENSMUST00000091932 1995 ntTSL 2 BASIC19.9■□□□□ 0.78
Nipsnap3bQ9CQE1 Ube4b-202ENSMUST00000103212 5626 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.9■□□□□ 0.78
Nipsnap3bQ9CQE1 Vgf-202ENSMUST00000186451 2277 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC19.9■□□□□ 0.78
Nipsnap3bQ9CQE1 Gab1-201ENSMUST00000034150 4870 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.9■□□□□ 0.78
Nipsnap3bQ9CQE1 Lpar3-201ENSMUST00000039164 2464 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.9■□□□□ 0.78
Nipsnap3bQ9CQE1 Prrt2-206ENSMUST00000202045 429 ntTSL 5 BASIC19.9■□□□□ 0.78
Nipsnap3bQ9CQE1 Utp11-201ENSMUST00000030738 1603 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.9■□□□□ 0.78
Nipsnap3bQ9CQE1 Amh-201ENSMUST00000036016 1670 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.9■□□□□ 0.78
Nipsnap3bQ9CQE1 Setd4-202ENSMUST00000113951 1826 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC19.9■□□□□ 0.78
Nipsnap3bQ9CQE1 Ache-209ENSMUST00000196208 1911 ntTSL 5 BASIC19.9■□□□□ 0.78
Nipsnap3bQ9CQE1 Socs2-213ENSMUST00000170690 2195 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC19.9■□□□□ 0.78
Nipsnap3bQ9CQE1 Ksr1-202ENSMUST00000108264 2748 ntTSL 5 BASIC19.89■□□□□ 0.78
Nipsnap3bQ9CQE1 Atp10a-201ENSMUST00000168747 5419 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.89■□□□□ 0.77
Nipsnap3bQ9CQE1 Barhl1-203ENSMUST00000113849 2102 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.89■□□□□ 0.77
Nipsnap3bQ9CQE1 Tfpt-204ENSMUST00000155592 1091 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC19.89■□□□□ 0.77
Nipsnap3bQ9CQE1 P2ry2-202ENSMUST00000178340 2137 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.89■□□□□ 0.77
Nipsnap3bQ9CQE1 Gm37035-201ENSMUST00000194809 2148 ntBASIC19.89■□□□□ 0.77
Nipsnap3bQ9CQE1 Aplf-201ENSMUST00000032130 1889 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.89■□□□□ 0.77
Nipsnap3bQ9CQE1 Fndc4-201ENSMUST00000041266 1375 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.89■□□□□ 0.77
Nipsnap3bQ9CQE1 4930524J08Rik-201ENSMUST00000046721 603 ntAPPRIS P1 BASIC19.89■□□□□ 0.77
Nipsnap3bQ9CQE1 Htra2-201ENSMUST00000089645 1725 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC19.89■□□□□ 0.77
Nipsnap3bQ9CQE1 Stau2-201ENSMUST00000027052 2763 ntTSL 1 (best) BASIC19.89■□□□□ 0.77
Nipsnap3bQ9CQE1 Ccdc149-202ENSMUST00000198008 2470 ntTSL 5 BASIC19.88■□□□□ 0.77
Nipsnap3bQ9CQE1 Nrg3-203ENSMUST00000173780 2137 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC19.88■□□□□ 0.77
Nipsnap3bQ9CQE1 Cdkn2d-203ENSMUST00000215619 1423 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.88■□□□□ 0.77
Nipsnap3bQ9CQE1 Gm5921-201ENSMUST00000075898 882 ntBASIC19.88■□□□□ 0.77
Nipsnap3bQ9CQE1 Dcbld1-201ENSMUST00000069004 3024 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.88■□□□□ 0.77
Nipsnap3bQ9CQE1 Man1a-203ENSMUST00000105470 2847 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC19.88■□□□□ 0.77
Nipsnap3bQ9CQE1 Tmem86a-201ENSMUST00000010451 1831 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.88■□□□□ 0.77
Nipsnap3bQ9CQE1 Fam49b-202ENSMUST00000164532 1770 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.88■□□□□ 0.77
Nipsnap3bQ9CQE1 Gtpbp2-217ENSMUST00000172170 2587 ntTSL 5 BASIC19.88■□□□□ 0.77
Nipsnap3bQ9CQE1 Sirt1-201ENSMUST00000020257 3905 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC19.87■□□□□ 0.77
Nipsnap3bQ9CQE1 Gm43566-201ENSMUST00000196851 808 ntBASIC19.87■□□□□ 0.77
Nipsnap3bQ9CQE1 H2afj-202ENSMUST00000203982 577 ntAPPRIS ALT1 TSL 3 BASIC19.87■□□□□ 0.77
Nipsnap3bQ9CQE1 Gnas-205ENSMUST00000109083 730 ntTSL 2 BASIC19.86■□□□□ 0.77
Nipsnap3bQ9CQE1 H2-Q2-201ENSMUST00000074806 1262 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.86■□□□□ 0.77
Nipsnap3bQ9CQE1 Hoxd13-201ENSMUST00000001872 2483 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.86■□□□□ 0.77
Nipsnap3bQ9CQE1 Mark2-202ENSMUST00000032557 4488 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC19.86■□□□□ 0.77
Nipsnap3bQ9CQE1 Ercc6l2-208ENSMUST00000144763 1820 ntTSL 1 (best) BASIC19.86■□□□□ 0.77
Nipsnap3bQ9CQE1 Slc25a38-201ENSMUST00000035106 1791 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.85■□□□□ 0.77
Nipsnap3bQ9CQE1 Sp5-201ENSMUST00000100043 2100 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.85■□□□□ 0.77
Nipsnap3bQ9CQE1 Bola3-207ENSMUST00000136501 2312 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.85■□□□□ 0.77
Nipsnap3bQ9CQE1 Lmtk3-201ENSMUST00000072580 4807 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC19.85■□□□□ 0.77
Nipsnap3bQ9CQE1 Pcf11-204ENSMUST00000208058 461 ntTSL 5 BASIC19.85■□□□□ 0.77
Nipsnap3bQ9CQE1 Jkamp-202ENSMUST00000117449 1874 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC19.85■□□□□ 0.77
Nipsnap3bQ9CQE1 Dgat1-201ENSMUST00000023214 1888 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.85■□□□□ 0.77
Nipsnap3bQ9CQE1 Agfg1-202ENSMUST00000113444 3142 ntTSL 1 (best) BASIC19.85■□□□□ 0.77
Nipsnap3bQ9CQE1 C1qtnf5-204ENSMUST00000114821 1365 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC19.84■□□□□ 0.77
Nipsnap3bQ9CQE1 Psmg1-202ENSMUST00000117044 807 ntTSL 5 BASIC19.84■□□□□ 0.77
Nipsnap3bQ9CQE1 Smim19-202ENSMUST00000163774 1435 ntTSL 1 (best) BASIC19.84■□□□□ 0.77
Nipsnap3bQ9CQE1 Wnk2-211ENSMUST00000162581 6628 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC19.84■□□□□ 0.77
Nipsnap3bQ9CQE1 Ptger3-202ENSMUST00000173533 2097 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC19.83■□□□□ 0.77
Nipsnap3bQ9CQE1 Fam216a-201ENSMUST00000031419 1388 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.83■□□□□ 0.77
Nipsnap3bQ9CQE1 Tpm1-212ENSMUST00000113696 1714 ntTSL 2 BASIC19.83■□□□□ 0.77
Nipsnap3bQ9CQE1 Bloc1s5-202ENSMUST00000224115 1020 ntBASIC19.83■□□□□ 0.77
Nipsnap3bQ9CQE1 Zbed3-201ENSMUST00000045909 1894 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.83■□□□□ 0.76
Nipsnap3bQ9CQE1 Ccnd3-218ENSMUST00000183177 2060 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC19.83■□□□□ 0.76
Nipsnap3bQ9CQE1 Pias2-202ENSMUST00000114777 4968 ntTSL 1 (best) BASIC19.83■□□□□ 0.76
Nipsnap3bQ9CQE1 Gja3-201ENSMUST00000061614 2766 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.83■□□□□ 0.76
Nipsnap3bQ9CQE1 Ntn5-202ENSMUST00000182750 1758 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.83■□□□□ 0.76
Nipsnap3bQ9CQE1 Celf6-202ENSMUST00000118164 1583 ntTSL 1 (best) BASIC19.83■□□□□ 0.76
Nipsnap3bQ9CQE1 D130058E05Rik-201ENSMUST00000173856 1372 ntTSL 2 BASIC19.83■□□□□ 0.76
Nipsnap3bQ9CQE1 Gm17324-201ENSMUST00000165499 922 ntAPPRIS P1 BASIC19.82■□□□□ 0.76
Nipsnap3bQ9CQE1 Rasgrp2-206ENSMUST00000113472 2124 ntTSL 1 (best) BASIC19.82■□□□□ 0.76
Nipsnap3bQ9CQE1 Ooep-201ENSMUST00000034900 2138 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.82■□□□□ 0.76
Nipsnap3bQ9CQE1 Qsox2-201ENSMUST00000036187 2559 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC19.82■□□□□ 0.76
Nipsnap3bQ9CQE1 Exoc3l2-201ENSMUST00000011407 2200 ntTSL 5 BASIC19.82■□□□□ 0.76
Nipsnap3bQ9CQE1 Tex264-202ENSMUST00000163441 1896 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.82■□□□□ 0.76
Nipsnap3bQ9CQE1 Zfp653-202ENSMUST00000179605 1888 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC19.82■□□□□ 0.76
Nipsnap3bQ9CQE1 Golph3-202ENSMUST00000226517 2359 ntBASIC19.81■□□□□ 0.76
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 38.3 ms