Protein–RNA interactions for Protein: Q9CQ40

Mrpl49, 39S ribosomal protein L49, mitochondrial, mousemouse

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Length 166 aa.

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Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Mrpl49Q9CQ40 Klhl22-201ENSMUST00000117192 2754 ntTSL 5 BASIC18.37■□□□□ 0.53
Mrpl49Q9CQ40 Ube2q1-201ENSMUST00000038356 3077 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.37■□□□□ 0.53
Mrpl49Q9CQ40 Crocc-202ENSMUST00000097816 6273 ntTSL 5 BASIC18.37■□□□□ 0.53
Mrpl49Q9CQ40 Actr3b-201ENSMUST00000088244 1712 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.37■□□□□ 0.53
Mrpl49Q9CQ40 Cops7a-201ENSMUST00000032220 1817 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.37■□□□□ 0.53
Mrpl49Q9CQ40 Slc10a3-201ENSMUST00000037967 2023 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC18.37■□□□□ 0.53
Mrpl49Q9CQ40 Cerk-201ENSMUST00000044332 4518 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.37■□□□□ 0.53
Mrpl49Q9CQ40 Impdh1-201ENSMUST00000078155 2437 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.37■□□□□ 0.53
Mrpl49Q9CQ40 Gabbr1-201ENSMUST00000025338 5248 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.36■□□□□ 0.53
Mrpl49Q9CQ40 Slc17a7-201ENSMUST00000085374 2915 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.36■□□□□ 0.53
Mrpl49Q9CQ40 Phax-202ENSMUST00000130163 1386 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.36■□□□□ 0.53
Mrpl49Q9CQ40 Pigx-211ENSMUST00000189013 982 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC18.36■□□□□ 0.53
Mrpl49Q9CQ40 A630072M18Rik-201ENSMUST00000190567 5410 ntBASIC18.36■□□□□ 0.53
Mrpl49Q9CQ40 Serbp1-216ENSMUST00000205106 1288 ntTSL 5 BASIC18.36■□□□□ 0.53
Mrpl49Q9CQ40 Pigx-201ENSMUST00000096109 993 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.36■□□□□ 0.53
Mrpl49Q9CQ40 Mal2-201ENSMUST00000025356 2950 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.36■□□□□ 0.53
Mrpl49Q9CQ40 Mfsd4b2-201ENSMUST00000045526 2285 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.35■□□□□ 0.53
Mrpl49Q9CQ40 Brpf3-201ENSMUST00000004985 5766 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.35■□□□□ 0.53
Mrpl49Q9CQ40 Nova2-202ENSMUST00000220302 8372 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.35■□□□□ 0.53
Mrpl49Q9CQ40 Nova2-201ENSMUST00000032571 8372 ntTSL 5 BASIC18.35■□□□□ 0.53
Mrpl49Q9CQ40 Paip2-204ENSMUST00000115736 857 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC18.35■□□□□ 0.53
Mrpl49Q9CQ40 Gm3448-203ENSMUST00000179539 787 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.35■□□□□ 0.53
Mrpl49Q9CQ40 Rbp4-201ENSMUST00000025951 1243 ntTSL 1 (best) BASIC18.35■□□□□ 0.53
Mrpl49Q9CQ40 Ypel1-202ENSMUST00000090199 631 ntTSL 1 (best) BASIC18.35■□□□□ 0.53
Mrpl49Q9CQ40 Gm3448-201ENSMUST00000097399 787 ntAPPRIS P5 TSL 1 (best) BASIC18.35■□□□□ 0.53
Mrpl49Q9CQ40 Krtap5-5-201ENSMUST00000097942 1177 ntAPPRIS P1 BASIC18.35■□□□□ 0.53
Mrpl49Q9CQ40 Hand2-201ENSMUST00000040104 2351 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.35■□□□□ 0.53
Mrpl49Q9CQ40 Carm1-203ENSMUST00000115395 3152 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.34■□□□□ 0.53
Mrpl49Q9CQ40 Gm12524-201ENSMUST00000143109 1583 ntTSL 1 (best) BASIC18.34■□□□□ 0.53
Mrpl49Q9CQ40 Ubr5-201ENSMUST00000110336 9242 ntTSL 5 BASIC18.34■□□□□ 0.53
Mrpl49Q9CQ40 Vamp4-204ENSMUST00000135241 1461 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.34■□□□□ 0.53
Mrpl49Q9CQ40 9230116N13Rik-201ENSMUST00000181746 2097 ntTSL 1 (best) BASIC18.34■□□□□ 0.53
Mrpl49Q9CQ40 Bex4-201ENSMUST00000116527 837 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.34■□□□□ 0.53
Mrpl49Q9CQ40 Gm29394-204ENSMUST00000177504 448 ntAPPRIS ALT2 TSL 3 BASIC18.34■□□□□ 0.53
Mrpl49Q9CQ40 Dleu2-211ENSMUST00000183066 788 ntTSL 3 BASIC18.34■□□□□ 0.53
Mrpl49Q9CQ40 Kiss1-204ENSMUST00000194044 583 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC18.34■□□□□ 0.53
Mrpl49Q9CQ40 Kiss1-205ENSMUST00000195286 656 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.34■□□□□ 0.53
Mrpl49Q9CQ40 Pop7-201ENSMUST00000031728 881 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.34■□□□□ 0.53
Mrpl49Q9CQ40 H2afj-201ENSMUST00000074556 1831 ntAPPRIS P2 BASIC18.34■□□□□ 0.53
Mrpl49Q9CQ40 Trim9-208ENSMUST00000221370 2393 ntTSL 1 (best) BASIC18.34■□□□□ 0.53
Mrpl49Q9CQ40 Wipi1-202ENSMUST00000103060 2050 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.34■□□□□ 0.53
Mrpl49Q9CQ40 Pnck-202ENSMUST00000114472 1532 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.33■□□□□ 0.53
Mrpl49Q9CQ40 Ubtd1-201ENSMUST00000026170 1527 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.33■□□□□ 0.53
Mrpl49Q9CQ40 Prdm11-205ENSMUST00000178666 1870 ntTSL 5 BASIC18.33■□□□□ 0.53
Mrpl49Q9CQ40 Bdh1-201ENSMUST00000089759 1711 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.33■□□□□ 0.52
Mrpl49Q9CQ40 Nfu1-202ENSMUST00000117583 950 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.33■□□□□ 0.52
Mrpl49Q9CQ40 Epb41l4aos-201ENSMUST00000146010 430 ntTSL 1 (best) BASIC18.33■□□□□ 0.52
Mrpl49Q9CQ40 Ypel3-210ENSMUST00000170882 1050 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC18.33■□□□□ 0.52
Mrpl49Q9CQ40 8430422M14Rik-201ENSMUST00000199608 822 ntBASIC18.33■□□□□ 0.52
Mrpl49Q9CQ40 P2rx2-203ENSMUST00000195985 2096 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC18.33■□□□□ 0.52
Mrpl49Q9CQ40 Kdm3b-204ENSMUST00000224715 2032 ntBASIC18.33■□□□□ 0.52
Mrpl49Q9CQ40 Pbx2-201ENSMUST00000038149 3068 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.33■□□□□ 0.52
Mrpl49Q9CQ40 Fance-204ENSMUST00000114804 1842 ntTSL 1 (best) BASIC18.33■□□□□ 0.52
Mrpl49Q9CQ40 1810022K09Rik-201ENSMUST00000108365 559 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.32■□□□□ 0.52
Mrpl49Q9CQ40 Rps2-208ENSMUST00000170715 998 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.32■□□□□ 0.52
Mrpl49Q9CQ40 Gm43137-201ENSMUST00000198052 594 ntBASIC18.32■□□□□ 0.52
Mrpl49Q9CQ40 Oaz1-201ENSMUST00000060987 1071 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC18.32■□□□□ 0.52
Mrpl49Q9CQ40 Fabp3-201ENSMUST00000070532 823 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.32■□□□□ 0.52
Mrpl49Q9CQ40 Cacng7-201ENSMUST00000092891 2212 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.32■□□□□ 0.52
Mrpl49Q9CQ40 Fgfr1-215ENSMUST00000179592 5041 ntTSL 5 BASIC18.32■□□□□ 0.52
Mrpl49Q9CQ40 Tmem64-201ENSMUST00000062684 4670 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.32■□□□□ 0.52
Mrpl49Q9CQ40 Ripply3-201ENSMUST00000023660 1531 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.32■□□□□ 0.52
Mrpl49Q9CQ40 Uap1-201ENSMUST00000027981 2283 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.32■□□□□ 0.52
Mrpl49Q9CQ40 Bcl11b-202ENSMUST00000109887 2522 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.31■□□□□ 0.52
Mrpl49Q9CQ40 Rfx5-205ENSMUST00000107260 2355 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.31■□□□□ 0.52
Mrpl49Q9CQ40 Prcd-201ENSMUST00000106381 724 ntTSL 3 BASIC18.31■□□□□ 0.52
Mrpl49Q9CQ40 BC004004-202ENSMUST00000120346 1297 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.31■□□□□ 0.52
Mrpl49Q9CQ40 Thap8-201ENSMUST00000014072 1182 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC18.31■□□□□ 0.52
Mrpl49Q9CQ40 Cyc1-201ENSMUST00000023210 1194 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.31■□□□□ 0.52
Mrpl49Q9CQ40 Gm16286-205ENSMUST00000127234 1755 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.31■□□□□ 0.52
Mrpl49Q9CQ40 Foxj2-201ENSMUST00000003238 5283 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.31■□□□□ 0.52
Mrpl49Q9CQ40 Becn1-217ENSMUST00000172233 1493 ntTSL 5 BASIC18.31■□□□□ 0.52
Mrpl49Q9CQ40 Hipk1-201ENSMUST00000029438 4185 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.31■□□□□ 0.52
Mrpl49Q9CQ40 Itga9-201ENSMUST00000044165 7020 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.31■□□□□ 0.52
Mrpl49Q9CQ40 Foxe1-201ENSMUST00000095097 2804 ntAPPRIS P1 BASIC18.31■□□□□ 0.52
Mrpl49Q9CQ40 Trim71-201ENSMUST00000111816 9332 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.31■□□□□ 0.52
Mrpl49Q9CQ40 Snx21-204ENSMUST00000172577 1825 ntTSL 2 BASIC18.3■□□□□ 0.52
Mrpl49Q9CQ40 Brd1-201ENSMUST00000088911 4702 ntTSL 1 (best) BASIC18.3■□□□□ 0.52
Mrpl49Q9CQ40 Sh3bp1-203ENSMUST00000089378 2001 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.3■□□□□ 0.52
Mrpl49Q9CQ40 Chkb-201ENSMUST00000023289 1707 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.3■□□□□ 0.52
Mrpl49Q9CQ40 Naa20-202ENSMUST00000110000 1142 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.3■□□□□ 0.52
Mrpl49Q9CQ40 Fip1l1-202ENSMUST00000113534 2140 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.3■□□□□ 0.52
Mrpl49Q9CQ40 Josd2-211ENSMUST00000134398 563 ntTSL 5 BASIC18.3■□□□□ 0.52
Mrpl49Q9CQ40 Hsd17b3-202ENSMUST00000166224 1286 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC18.3■□□□□ 0.52
Mrpl49Q9CQ40 Gm29257-201ENSMUST00000186115 639 ntBASIC18.3■□□□□ 0.52
Mrpl49Q9CQ40 AC164441.1-202ENSMUST00000223430 442 ntTSL 2 BASIC18.3■□□□□ 0.52
Mrpl49Q9CQ40 Mrpl2-201ENSMUST00000002844 1031 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC18.3■□□□□ 0.52
Mrpl49Q9CQ40 Gm3448-202ENSMUST00000097400 747 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC18.3■□□□□ 0.52
Mrpl49Q9CQ40 Rims1-209ENSMUST00000218140 1434 ntTSL 5 BASIC18.3■□□□□ 0.52
Mrpl49Q9CQ40 1700001C19Rik-201ENSMUST00000061885 1622 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.3■□□□□ 0.52
Mrpl49Q9CQ40 Tmem80-208ENSMUST00000145184 1805 ntTSL 5 BASIC18.3■□□□□ 0.52
Mrpl49Q9CQ40 Dact1-202ENSMUST00000150639 2448 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC18.3■□□□□ 0.52
Mrpl49Q9CQ40 Ezh2-203ENSMUST00000114616 2670 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC18.29■□□□□ 0.52
Mrpl49Q9CQ40 Msto1-201ENSMUST00000107494 2093 ntTSL 1 (best) BASIC18.29■□□□□ 0.52
Mrpl49Q9CQ40 Gm10612-201ENSMUST00000162198 1681 ntTSL 1 (best) BASIC18.29■□□□□ 0.52
Mrpl49Q9CQ40 Trip10-207ENSMUST00000224947 2016 ntAPPRIS P2 BASIC18.29■□□□□ 0.52
Mrpl49Q9CQ40 Dap3-201ENSMUST00000090938 4760 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC18.29■□□□□ 0.52
Mrpl49Q9CQ40 4930467K11Rik-201ENSMUST00000180831 723 ntTSL 1 (best) BASIC18.29■□□□□ 0.52
Mrpl49Q9CQ40 Gm9870-201ENSMUST00000063874 645 ntBASIC18.29■□□□□ 0.52
Mrpl49Q9CQ40 Spats2-201ENSMUST00000063517 3065 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.29■□□□□ 0.52
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