Protein–RNA interactions for Protein: Q9CQ26

Stambp, STAM-binding protein, mousemouse

Predictions only

Length 424 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
StambpQ9CQ26 Rpl34-201ENSMUST00000062601 624 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.69■□□□□ 0.9
StambpQ9CQ26 Rab4b-201ENSMUST00000093040 1192 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.69■□□□□ 0.9
StambpQ9CQ26 Gorasp2-201ENSMUST00000028509 2238 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC20.69■□□□□ 0.9
StambpQ9CQ26 Rp9-203ENSMUST00000215715 1499 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.69■□□□□ 0.9
StambpQ9CQ26 Cblc-202ENSMUST00000108449 1514 ntTSL 1 (best) BASIC20.68■□□□□ 0.9
StambpQ9CQ26 Shisa6-201ENSMUST00000066679 1578 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.68■□□□□ 0.9
StambpQ9CQ26 Smad6-201ENSMUST00000041029 2971 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.68■□□□□ 0.9
StambpQ9CQ26 Bfsp1-202ENSMUST00000099296 2160 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.68■□□□□ 0.9
StambpQ9CQ26 Kcnip2-201ENSMUST00000026247 1203 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC20.68■□□□□ 0.9
StambpQ9CQ26 Gm10232-201ENSMUST00000089221 720 ntBASIC20.68■□□□□ 0.9
StambpQ9CQ26 Cops7a-201ENSMUST00000032220 1817 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.68■□□□□ 0.9
StambpQ9CQ26 Wasf3-201ENSMUST00000016143 5196 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.68■□□□□ 0.9
StambpQ9CQ26 Ccnd3-201ENSMUST00000037333 1999 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.68■□□□□ 0.9
StambpQ9CQ26 Rxrb-201ENSMUST00000044858 2623 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC20.68■□□□□ 0.9
StambpQ9CQ26 Prss50-201ENSMUST00000051097 1456 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.68■□□□□ 0.9
StambpQ9CQ26 Nphp1-202ENSMUST00000110357 2296 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.67■□□□□ 0.9
StambpQ9CQ26 Uchl5-206ENSMUST00000189936 1696 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC20.67■□□□□ 0.9
StambpQ9CQ26 Olfm1-204ENSMUST00000113920 2513 ntTSL 1 (best) BASIC20.67■□□□□ 0.9
StambpQ9CQ26 Ghitm-201ENSMUST00000042564 2573 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.67■□□□□ 0.9
StambpQ9CQ26 Psmg1-202ENSMUST00000117044 807 ntTSL 5 BASIC20.67■□□□□ 0.9
StambpQ9CQ26 Prrt2-206ENSMUST00000202045 429 ntTSL 5 BASIC20.67■□□□□ 0.9
StambpQ9CQ26 Trim47-201ENSMUST00000021120 2204 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC20.67■□□□□ 0.9
StambpQ9CQ26 Slc27a3-201ENSMUST00000029541 2259 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.67■□□□□ 0.9
StambpQ9CQ26 Usp36-202ENSMUST00000106296 5655 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC20.67■□□□□ 0.9
StambpQ9CQ26 Baiap2-203ENSMUST00000103021 3398 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.66■□□□□ 0.9
StambpQ9CQ26 Fbxw2-201ENSMUST00000028220 2030 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.66■□□□□ 0.9
StambpQ9CQ26 Ppm1h-201ENSMUST00000067918 6369 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.66■□□□□ 0.9
StambpQ9CQ26 Hrh3-205ENSMUST00000165762 1368 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC20.66■□□□□ 0.9
StambpQ9CQ26 Mgea5-201ENSMUST00000026243 5024 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.66■□□□□ 0.9
StambpQ9CQ26 Cacng7-201ENSMUST00000092891 2212 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.66■□□□□ 0.9
StambpQ9CQ26 Zdhhc14-201ENSMUST00000089185 3115 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.65■□□□□ 0.9
StambpQ9CQ26 Zfp105-201ENSMUST00000051667 2010 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.65■□□□□ 0.9
StambpQ9CQ26 Kazald1-202ENSMUST00000111948 1625 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.65■□□□□ 0.9
StambpQ9CQ26 Gtf2e2-202ENSMUST00000170705 1634 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.65■□□□□ 0.9
StambpQ9CQ26 Mrgbp-201ENSMUST00000029085 1510 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.65■□□□□ 0.9
StambpQ9CQ26 Gm10399-202ENSMUST00000202768 748 ntBASIC20.65■□□□□ 0.9
StambpQ9CQ26 Gm10616-201ENSMUST00000205285 2127 ntBASIC20.65■□□□□ 0.9
StambpQ9CQ26 E530011L22Rik-202ENSMUST00000216791 2007 ntTSL 1 (best) BASIC20.65■□□□□ 0.9
StambpQ9CQ26 Lats2-201ENSMUST00000022531 5191 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.64■□□□□ 0.9
StambpQ9CQ26 Inppl1-202ENSMUST00000165052 4730 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.64■□□□□ 0.9
StambpQ9CQ26 Retreg2-201ENSMUST00000097694 2561 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC20.64■□□□□ 0.9
StambpQ9CQ26 Raph1-202ENSMUST00000090293 2409 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC20.64■□□□□ 0.89
StambpQ9CQ26 Gdf7-202ENSMUST00000220073 1399 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.64■□□□□ 0.89
StambpQ9CQ26 Tmem41a-201ENSMUST00000023562 1359 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.64■□□□□ 0.89
StambpQ9CQ26 Ago4-201ENSMUST00000084289 6537 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.64■□□□□ 0.89
StambpQ9CQ26 Fam98c-209ENSMUST00000164589 1293 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC20.64■□□□□ 0.89
StambpQ9CQ26 Gsr-201ENSMUST00000033992 2673 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.64■□□□□ 0.89
StambpQ9CQ26 Porcn-203ENSMUST00000089402 1839 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC20.64■□□□□ 0.89
StambpQ9CQ26 Dapk1-207ENSMUST00000226059 5009 ntBASIC20.64■□□□□ 0.89
StambpQ9CQ26 Kdm3b-204ENSMUST00000224715 2032 ntBASIC20.63■□□□□ 0.89
StambpQ9CQ26 Slc39a10-201ENSMUST00000027131 5498 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.63■□□□□ 0.89
StambpQ9CQ26 Gm26660-201ENSMUST00000181582 2543 ntTSL 1 (best) BASIC20.63■□□□□ 0.89
StambpQ9CQ26 Eif5a-213ENSMUST00000164359 1281 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC20.63■□□□□ 0.89
StambpQ9CQ26 Dleu2-209ENSMUST00000182957 352 ntTSL 2 BASIC20.63■□□□□ 0.89
StambpQ9CQ26 Srcap-202ENSMUST00000098025 1257 ntTSL 5 BASIC20.63■□□□□ 0.89
StambpQ9CQ26 Jph1-201ENSMUST00000038382 4809 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.63■□□□□ 0.89
StambpQ9CQ26 1700001C19Rik-201ENSMUST00000061885 1622 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC20.63■□□□□ 0.89
StambpQ9CQ26 Oaf-201ENSMUST00000034512 2526 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.63■□□□□ 0.89
StambpQ9CQ26 Hes7-201ENSMUST00000024543 1809 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.62■□□□□ 0.89
StambpQ9CQ26 Pou3f1-201ENSMUST00000053491 3849 ntAPPRIS P1 BASIC20.62■□□□□ 0.89
StambpQ9CQ26 Tmem238-201ENSMUST00000168578 1375 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.62■□□□□ 0.89
StambpQ9CQ26 Clec3b-201ENSMUST00000026890 992 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.62■□□□□ 0.89
StambpQ9CQ26 Gm9767-201ENSMUST00000041011 1193 ntAPPRIS P1 BASIC20.62■□□□□ 0.89
StambpQ9CQ26 Trak1-208ENSMUST00000210636 2197 ntTSL 1 (best) BASIC20.62■□□□□ 0.89
StambpQ9CQ26 Lrrfip2-205ENSMUST00000196981 1839 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC20.62■□□□□ 0.89
StambpQ9CQ26 Adgra2-201ENSMUST00000033876 5760 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.61■□□□□ 0.89
StambpQ9CQ26 Magi2-203ENSMUST00000115267 4478 ntTSL 1 (best) BASIC20.61■□□□□ 0.89
StambpQ9CQ26 Prr7-201ENSMUST00000046533 1359 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.61■□□□□ 0.89
StambpQ9CQ26 Phc2-202ENSMUST00000106079 2535 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.61■□□□□ 0.89
StambpQ9CQ26 Avl9-203ENSMUST00000177249 1614 ntTSL 1 (best) BASIC20.61■□□□□ 0.89
StambpQ9CQ26 Shox2-201ENSMUST00000029422 3079 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.61■□□□□ 0.89
StambpQ9CQ26 Dhx36-201ENSMUST00000029336 5620 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.61■□□□□ 0.89
StambpQ9CQ26 Fam149b-201ENSMUST00000037698 924 ntTSL 1 (best) BASIC20.61■□□□□ 0.89
StambpQ9CQ26 Uap1-201ENSMUST00000027981 2283 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC20.61■□□□□ 0.89
StambpQ9CQ26 Gm4430-201ENSMUST00000192413 1943 ntBASIC20.61■□□□□ 0.89
StambpQ9CQ26 Dmrta2-201ENSMUST00000061187 2922 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.6■□□□□ 0.89
StambpQ9CQ26 Rpf2-201ENSMUST00000045114 1853 ntTSL 1 (best) BASIC20.6■□□□□ 0.89
StambpQ9CQ26 Vwc2-201ENSMUST00000056344 1350 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.6■□□□□ 0.89
StambpQ9CQ26 Gm10620-201ENSMUST00000098379 1332 ntBASIC20.6■□□□□ 0.89
StambpQ9CQ26 Clta-206ENSMUST00000170241 1079 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.6■□□□□ 0.89
StambpQ9CQ26 H2-Q5-202ENSMUST00000172979 998 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC20.6■□□□□ 0.89
StambpQ9CQ26 Tlx2-201ENSMUST00000089641 1236 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.6■□□□□ 0.89
StambpQ9CQ26 Cited4-201ENSMUST00000094814 1249 ntAPPRIS P1 BASIC20.6■□□□□ 0.89
StambpQ9CQ26 Fmnl2-203ENSMUST00000090952 5414 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC20.6■□□□□ 0.89
StambpQ9CQ26 Dgat1-201ENSMUST00000023214 1888 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.6■□□□□ 0.89
StambpQ9CQ26 Cbx3-201ENSMUST00000031862 1889 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.6■□□□□ 0.89
StambpQ9CQ26 Usp36-201ENSMUST00000092382 5609 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC20.6■□□□□ 0.89
StambpQ9CQ26 Pkmyt1-201ENSMUST00000024701 2039 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.6■□□□□ 0.89
StambpQ9CQ26 Krt1-201ENSMUST00000023790 2445 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.59■□□□□ 0.89
StambpQ9CQ26 Timmdc1-201ENSMUST00000002925 1573 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.59■□□□□ 0.89
StambpQ9CQ26 Spns2-201ENSMUST00000045303 3241 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.59■□□□□ 0.89
StambpQ9CQ26 Pi4kb-207ENSMUST00000167008 1962 ntTSL 1 (best) BASIC20.59■□□□□ 0.89
StambpQ9CQ26 Pithd1-201ENSMUST00000105851 1700 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.59■□□□□ 0.89
StambpQ9CQ26 Ube2d2a-202ENSMUST00000170693 2483 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.59■□□□□ 0.89
StambpQ9CQ26 Gm9748-202ENSMUST00000194881 783 ntTSL 2 BASIC20.59■□□□□ 0.89
StambpQ9CQ26 Gm18190-203ENSMUST00000209944 389 ntTSL 2 BASIC20.59■□□□□ 0.89
StambpQ9CQ26 Tmem132d-201ENSMUST00000044441 6139 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.59■□□□□ 0.89
StambpQ9CQ26 Rnf169-201ENSMUST00000080817 7147 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC20.59■□□□□ 0.89
StambpQ9CQ26 Sirt1-201ENSMUST00000020257 3905 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC20.59■□□□□ 0.89
StambpQ9CQ26 Ldb1-202ENSMUST00000056931 2295 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC20.58■□□□□ 0.89
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 17.9 ms