Protein–RNA interactions for Protein: Q9CQ10

Chmp3, Charged multivesicular body protein 3, mousemouse

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Length 224 aa.

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Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Chmp3Q9CQ10 Dedd-203ENSMUST00000111299 2322 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.92■■□□□ 1.58
Chmp3Q9CQ10 Col23a1-201ENSMUST00000102765 5658 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC24.92■■□□□ 1.58
Chmp3Q9CQ10 Taf3-203ENSMUST00000114907 695 ntTSL 1 (best) BASIC24.92■■□□□ 1.58
Chmp3Q9CQ10 Gm6139-201ENSMUST00000079261 882 ntBASIC24.92■■□□□ 1.58
Chmp3Q9CQ10 Fip1l1-202ENSMUST00000113534 2140 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.92■■□□□ 1.58
Chmp3Q9CQ10 D830036C21Rik-202ENSMUST00000208263 1548 ntBASIC24.91■■□□□ 1.58
Chmp3Q9CQ10 Rnf111-204ENSMUST00000213647 4961 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.91■■□□□ 1.58
Chmp3Q9CQ10 Stn1-201ENSMUST00000049369 1992 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.91■■□□□ 1.58
Chmp3Q9CQ10 Mau2-206ENSMUST00000212451 1931 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.91■■□□□ 1.58
Chmp3Q9CQ10 Prr3-204ENSMUST00000172900 439 ntTSL 2 BASIC24.91■■□□□ 1.58
Chmp3Q9CQ10 Fam168b-208ENSMUST00000191307 844 ntTSL 2 BASIC24.91■■□□□ 1.58
Chmp3Q9CQ10 AC158777.2-201ENSMUST00000228787 398 ntAPPRIS P1 BASIC24.91■■□□□ 1.58
Chmp3Q9CQ10 Slc35b3-209ENSMUST00000225432 2216 ntAPPRIS P3 BASIC24.91■■□□□ 1.58
Chmp3Q9CQ10 Slc1a5-201ENSMUST00000108496 2764 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.91■■□□□ 1.58
Chmp3Q9CQ10 Snrpa-201ENSMUST00000080356 1365 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.91■■□□□ 1.58
Chmp3Q9CQ10 Dmtn-209ENSMUST00000228295 2572 ntBASIC24.91■■□□□ 1.58
Chmp3Q9CQ10 Gm14207-203ENSMUST00000156538 988 ntTSL 2 BASIC24.9■■□□□ 1.58
Chmp3Q9CQ10 Lmo2-208ENSMUST00000170926 1529 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC24.9■■□□□ 1.58
Chmp3Q9CQ10 Rell2-212ENSMUST00000177058 1762 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC24.9■■□□□ 1.58
Chmp3Q9CQ10 Map4k3-201ENSMUST00000025089 4225 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC24.9■■□□□ 1.58
Chmp3Q9CQ10 1700001C19Rik-201ENSMUST00000061885 1622 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC24.9■■□□□ 1.58
Chmp3Q9CQ10 Ccr10-201ENSMUST00000062759 1726 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.89■■□□□ 1.58
Chmp3Q9CQ10 Gm10941-201ENSMUST00000105408 708 ntTSL 1 (best) BASIC24.89■■□□□ 1.58
Chmp3Q9CQ10 Cdkn2a-202ENSMUST00000107131 895 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.89■■□□□ 1.58
Chmp3Q9CQ10 Rbp4-202ENSMUST00000112335 930 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.89■■□□□ 1.58
Chmp3Q9CQ10 Gng5-203ENSMUST00000119130 593 ntTSL 2 BASIC24.89■■□□□ 1.58
Chmp3Q9CQ10 Gm14486-201ENSMUST00000144704 644 ntTSL 3 BASIC24.89■■□□□ 1.58
Chmp3Q9CQ10 Nol7-205ENSMUST00000222499 756 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.89■■□□□ 1.58
Chmp3Q9CQ10 Gnl1-201ENSMUST00000087200 2848 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.89■■□□□ 1.57
Chmp3Q9CQ10 Nr0b1-201ENSMUST00000026036 1808 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.89■■□□□ 1.57
Chmp3Q9CQ10 Lrrc1-205ENSMUST00000183873 3121 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.88■■□□□ 1.57
Chmp3Q9CQ10 Fam20b-201ENSMUST00000086153 4414 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.88■■□□□ 1.57
Chmp3Q9CQ10 Trim9-208ENSMUST00000221370 2393 ntTSL 1 (best) BASIC24.88■■□□□ 1.57
Chmp3Q9CQ10 Ypel1-201ENSMUST00000035682 3322 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.88■■□□□ 1.57
Chmp3Q9CQ10 Drd4-201ENSMUST00000026569 2799 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.88■■□□□ 1.57
Chmp3Q9CQ10 1110004F10Rik-201ENSMUST00000032899 1479 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.88■■□□□ 1.57
Chmp3Q9CQ10 Mbnl3-203ENSMUST00000114876 2243 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC24.88■■□□□ 1.57
Chmp3Q9CQ10 Arhgap9-204ENSMUST00000219511 2217 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.88■■□□□ 1.57
Chmp3Q9CQ10 Psme4-201ENSMUST00000041231 6491 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.87■■□□□ 1.57
Chmp3Q9CQ10 Coq10a-201ENSMUST00000043211 1421 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC24.87■■□□□ 1.57
Chmp3Q9CQ10 Eif2ak4-207ENSMUST00000110877 2134 ntTSL 1 (best) BASIC24.87■■□□□ 1.57
Chmp3Q9CQ10 Pdcd5-201ENSMUST00000118501 684 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.87■■□□□ 1.57
Chmp3Q9CQ10 Ppa1-201ENSMUST00000020286 1364 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.87■■□□□ 1.57
Chmp3Q9CQ10 Prmt1-202ENSMUST00000107843 1508 ntTSL 1 (best) BASIC24.86■■□□□ 1.57
Chmp3Q9CQ10 Krt8-201ENSMUST00000023952 1805 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.86■■□□□ 1.57
Chmp3Q9CQ10 Adad2-201ENSMUST00000098361 1926 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.86■■□□□ 1.57
Chmp3Q9CQ10 Ankrd9-204ENSMUST00000140788 1451 ntAPPRIS P2 TSL 3 BASIC24.86■■□□□ 1.57
Chmp3Q9CQ10 Gm27151-202ENSMUST00000185015 1145 ntTSL 5 BASIC24.86■■□□□ 1.57
Chmp3Q9CQ10 Gm8493-201ENSMUST00000196881 489 ntBASIC24.86■■□□□ 1.57
Chmp3Q9CQ10 Gm1673-201ENSMUST00000094869 477 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC24.86■■□□□ 1.57
Chmp3Q9CQ10 Ccdc61-201ENSMUST00000098780 2022 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.86■■□□□ 1.57
Chmp3Q9CQ10 Arpc2-202ENSMUST00000113819 1313 ntTSL 5 BASIC24.86■■□□□ 1.57
Chmp3Q9CQ10 4430402I18Rik-201ENSMUST00000025872 2152 ntTSL 1 (best) BASIC24.86■■□□□ 1.57
Chmp3Q9CQ10 Bola1-202ENSMUST00000107099 995 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC24.85■■□□□ 1.57
Chmp3Q9CQ10 Knstrn-202ENSMUST00000110842 925 ntAPPRIS ALT2 TSL 3 BASIC24.85■■□□□ 1.57
Chmp3Q9CQ10 Bola1-201ENSMUST00000016087 729 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.85■■□□□ 1.57
Chmp3Q9CQ10 Bola1-203ENSMUST00000177442 692 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC24.85■■□□□ 1.57
Chmp3Q9CQ10 Tusc2-203ENSMUST00000193418 410 ntTSL 3 BASIC24.85■■□□□ 1.57
Chmp3Q9CQ10 Rabgap1l-216ENSMUST00000195442 1877 ntTSL 1 (best) BASIC24.85■■□□□ 1.57
Chmp3Q9CQ10 Acss2-203ENSMUST00000103142 2145 ntTSL 5 BASIC24.85■■□□□ 1.57
Chmp3Q9CQ10 Prkar1b-201ENSMUST00000026973 2637 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.84■■□□□ 1.57
Chmp3Q9CQ10 Gpr160-202ENSMUST00000108258 2139 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.84■■□□□ 1.57
Chmp3Q9CQ10 2810001G20Rik-202ENSMUST00000146333 959 ntTSL 3 BASIC24.84■■□□□ 1.57
Chmp3Q9CQ10 Pigx-210ENSMUST00000155966 963 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC24.84■■□□□ 1.57
Chmp3Q9CQ10 Gclm-206ENSMUST00000178826 1002 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC24.84■■□□□ 1.57
Chmp3Q9CQ10 8430422M14Rik-201ENSMUST00000199608 822 ntBASIC24.84■■□□□ 1.57
Chmp3Q9CQ10 Slc10a3-201ENSMUST00000037967 2023 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC24.84■■□□□ 1.57
Chmp3Q9CQ10 Mras-201ENSMUST00000035045 4701 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.84■■□□□ 1.57
Chmp3Q9CQ10 Gtpbp2-201ENSMUST00000024748 2966 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.84■■□□□ 1.57
Chmp3Q9CQ10 Cryzl1-203ENSMUST00000117644 1727 ntTSL 1 (best) BASIC24.83■■□□□ 1.57
Chmp3Q9CQ10 Snap91-203ENSMUST00000074501 2577 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.83■■□□□ 1.57
Chmp3Q9CQ10 Rsrc1-202ENSMUST00000065047 2736 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.83■■□□□ 1.57
Chmp3Q9CQ10 Grap-201ENSMUST00000004959 1662 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.83■■□□□ 1.57
Chmp3Q9CQ10 D630036H23Rik-201ENSMUST00000171007 940 ntAPPRIS P1 BASIC24.83■■□□□ 1.57
Chmp3Q9CQ10 Gm43017-201ENSMUST00000198296 752 ntBASIC24.83■■□□□ 1.57
Chmp3Q9CQ10 Camk1-201ENSMUST00000032409 1496 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.83■■□□□ 1.56
Chmp3Q9CQ10 Bcl3-201ENSMUST00000120537 1850 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.82■■□□□ 1.56
Chmp3Q9CQ10 Ly6h-206ENSMUST00000156032 752 ntAPPRIS P3 TSL 3 BASIC24.82■■□□□ 1.56
Chmp3Q9CQ10 Ly6h-201ENSMUST00000023241 906 ntAPPRIS ALT1 TSL 2 BASIC24.82■■□□□ 1.56
Chmp3Q9CQ10 Bag1-202ENSMUST00000108089 1336 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.82■■□□□ 1.56
Chmp3Q9CQ10 Akt1s1-204ENSMUST00000107885 1812 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.82■■□□□ 1.56
Chmp3Q9CQ10 Rgs19-201ENSMUST00000002532 1511 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.81■■□□□ 1.56
Chmp3Q9CQ10 C2cd4a-201ENSMUST00000054500 1395 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC24.81■■□□□ 1.56
Chmp3Q9CQ10 Bag5-202ENSMUST00000160576 1852 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.81■■□□□ 1.56
Chmp3Q9CQ10 Tab2-204ENSMUST00000146444 4380 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC24.81■■□□□ 1.56
Chmp3Q9CQ10 Cdc20-201ENSMUST00000006565 1793 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.81■■□□□ 1.56
Chmp3Q9CQ10 Tarbp2-202ENSMUST00000100168 1278 ntTSL 1 (best) BASIC24.81■■□□□ 1.56
Chmp3Q9CQ10 Srp19-202ENSMUST00000119329 613 ntTSL 2 BASIC24.81■■□□□ 1.56
Chmp3Q9CQ10 Hotairm1-201ENSMUST00000129546 409 ntTSL 1 (best) BASIC24.81■■□□□ 1.56
Chmp3Q9CQ10 Rtn4-210ENSMUST00000170731 1272 ntTSL 1 (best) BASIC24.81■■□□□ 1.56
Chmp3Q9CQ10 Sult4a1-201ENSMUST00000082365 2383 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.81■■□□□ 1.56
Chmp3Q9CQ10 Ndrg2-202ENSMUST00000111632 2103 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC24.8■■□□□ 1.56
Chmp3Q9CQ10 Dedd2-201ENSMUST00000058702 1828 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.8■■□□□ 1.56
Chmp3Q9CQ10 Kcnk1-201ENSMUST00000046765 2235 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.8■■□□□ 1.56
Chmp3Q9CQ10 Agap2-202ENSMUST00000217941 5573 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.8■■□□□ 1.56
Chmp3Q9CQ10 Gm4285-201ENSMUST00000131222 902 ntTSL 2 BASIC24.8■■□□□ 1.56
Chmp3Q9CQ10 Thap8-201ENSMUST00000014072 1182 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC24.8■■□□□ 1.56
Chmp3Q9CQ10 Kiss1-204ENSMUST00000194044 583 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC24.8■■□□□ 1.56
Chmp3Q9CQ10 Gm12504-201ENSMUST00000120860 2231 ntBASIC24.8■■□□□ 1.56
Chmp3Q9CQ10 Gorasp2-201ENSMUST00000028509 2238 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC24.8■■□□□ 1.56
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