Protein–RNA interactions for Protein: Q9CQ07

Lrrc18, Leucine-rich repeat-containing protein 18, mousemouse

Predictions only

Length 262 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Lrrc18Q9CQ07 Rab3il1-201ENSMUST00000113161 2225 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC18.78■□□□□ 0.6
Lrrc18Q9CQ07 Catsper2-201ENSMUST00000038073 2247 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.78■□□□□ 0.6
Lrrc18Q9CQ07 Wdr41-202ENSMUST00000159647 2289 ntTSL 5 BASIC18.77■□□□□ 0.6
Lrrc18Q9CQ07 Wdr41-206ENSMUST00000167155 2289 ntTSL 1 (best) BASIC18.77■□□□□ 0.6
Lrrc18Q9CQ07 Inhbb-201ENSMUST00000038765 4255 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.77■□□□□ 0.6
Lrrc18Q9CQ07 Rhbdf1-201ENSMUST00000020524 2946 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.77■□□□□ 0.6
Lrrc18Q9CQ07 Ascl1-201ENSMUST00000020243 2481 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.77■□□□□ 0.6
Lrrc18Q9CQ07 Pou2f2-210ENSMUST00000176408 1697 ntTSL 5 BASIC18.77■□□□□ 0.6
Lrrc18Q9CQ07 Gm16599-201ENSMUST00000148082 1182 ntTSL 1 (best) BASIC18.77■□□□□ 0.6
Lrrc18Q9CQ07 Rin3-207ENSMUST00000150795 937 ntTSL 1 (best) BASIC18.77■□□□□ 0.6
Lrrc18Q9CQ07 Tmem123-201ENSMUST00000052865 2907 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.77■□□□□ 0.6
Lrrc18Q9CQ07 Fastk-201ENSMUST00000030800 1893 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC18.77■□□□□ 0.6
Lrrc18Q9CQ07 Rnf26-201ENSMUST00000056328 2724 ntAPPRIS P2 BASIC18.77■□□□□ 0.59
Lrrc18Q9CQ07 Stk3-201ENSMUST00000018476 2914 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC18.77■□□□□ 0.59
Lrrc18Q9CQ07 Anapc5-203ENSMUST00000196640 2422 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.76■□□□□ 0.59
Lrrc18Q9CQ07 Hmg20b-203ENSMUST00000105324 1540 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.76■□□□□ 0.59
Lrrc18Q9CQ07 Pdss1-207ENSMUST00000152170 1538 ntTSL 1 (best) BASIC18.76■□□□□ 0.59
Lrrc18Q9CQ07 Prdm11-205ENSMUST00000178666 1870 ntTSL 5 BASIC18.76■□□□□ 0.59
Lrrc18Q9CQ07 Rab5c-201ENSMUST00000019317 1967 ntTSL 1 (best) BASIC18.76■□□□□ 0.59
Lrrc18Q9CQ07 AC102554.1-201ENSMUST00000216236 537 ntTSL 5 BASIC18.76■□□□□ 0.59
Lrrc18Q9CQ07 Gramd1a-202ENSMUST00000085636 2543 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC18.76■□□□□ 0.59
Lrrc18Q9CQ07 Rab3ip-203ENSMUST00000219109 1844 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.76■□□□□ 0.59
Lrrc18Q9CQ07 Ube2h-202ENSMUST00000102993 4657 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.76■□□□□ 0.59
Lrrc18Q9CQ07 Bcl10-201ENSMUST00000029842 1949 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.76■□□□□ 0.59
Lrrc18Q9CQ07 Vgf-204ENSMUST00000190827 2834 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.76■□□□□ 0.59
Lrrc18Q9CQ07 Mgat5b-201ENSMUST00000103027 4258 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.76■□□□□ 0.59
Lrrc18Q9CQ07 Stbd1-201ENSMUST00000050952 1985 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.75■□□□□ 0.59
Lrrc18Q9CQ07 Bend7-204ENSMUST00000184139 2251 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.75■□□□□ 0.59
Lrrc18Q9CQ07 Pdcd2-205ENSMUST00000154293 1924 ntTSL 1 (best) BASIC18.75■□□□□ 0.59
Lrrc18Q9CQ07 Pdgfa-204ENSMUST00000110897 1287 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.75■□□□□ 0.59
Lrrc18Q9CQ07 Fam98c-209ENSMUST00000164589 1293 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.75■□□□□ 0.59
Lrrc18Q9CQ07 Fzd2-201ENSMUST00000057893 3663 ntAPPRIS P1 BASIC18.75■□□□□ 0.59
Lrrc18Q9CQ07 Gm5602-201ENSMUST00000146366 1763 ntTSL 1 (best) BASIC18.75■□□□□ 0.59
Lrrc18Q9CQ07 Pick1-204ENSMUST00000163571 2054 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.75■□□□□ 0.59
Lrrc18Q9CQ07 Gab2-202ENSMUST00000206791 2065 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.75■□□□□ 0.59
Lrrc18Q9CQ07 Atp2b2-208ENSMUST00000205052 5658 ntTSL 1 (best) BASIC18.75■□□□□ 0.59
Lrrc18Q9CQ07 Ctsz-201ENSMUST00000016400 1441 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.74■□□□□ 0.59
Lrrc18Q9CQ07 Mgat4b-201ENSMUST00000041725 2429 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.74■□□□□ 0.59
Lrrc18Q9CQ07 Lrig1-202ENSMUST00000101126 4951 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.74■□□□□ 0.59
Lrrc18Q9CQ07 Sec24d-208ENSMUST00000200333 307 ntTSL 1 (best) BASIC18.74■□□□□ 0.59
Lrrc18Q9CQ07 Tmem192-203ENSMUST00000209852 1193 ntTSL 1 (best) BASIC18.74■□□□□ 0.59
Lrrc18Q9CQ07 Jtb-201ENSMUST00000029546 1101 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.74■□□□□ 0.59
Lrrc18Q9CQ07 4833418N17Rik-201ENSMUST00000064826 615 ntBASIC18.74■□□□□ 0.59
Lrrc18Q9CQ07 Foxd1-201ENSMUST00000105098 5064 ntAPPRIS P1 BASIC18.74■□□□□ 0.59
Lrrc18Q9CQ07 Tmem55b-206ENSMUST00000161166 1445 ntTSL 1 (best) BASIC18.74■□□□□ 0.59
Lrrc18Q9CQ07 Pcmtd1-201ENSMUST00000061280 5232 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.74■□□□□ 0.59
Lrrc18Q9CQ07 Kdm1a-202ENSMUST00000105847 3028 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC18.74■□□□□ 0.59
Lrrc18Q9CQ07 Creb3l1-201ENSMUST00000028663 2603 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.73■□□□□ 0.59
Lrrc18Q9CQ07 Rab40c-207ENSMUST00000167626 2506 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.73■□□□□ 0.59
Lrrc18Q9CQ07 Fance-202ENSMUST00000114801 1751 ntTSL 1 (best) BASIC18.73■□□□□ 0.59
Lrrc18Q9CQ07 Mtfr1l-201ENSMUST00000102550 2025 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.73■□□□□ 0.59
Lrrc18Q9CQ07 Dus1l-209ENSMUST00000167023 1909 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC18.73■□□□□ 0.59
Lrrc18Q9CQ07 Nrl-203ENSMUST00000178694 1928 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.73■□□□□ 0.59
Lrrc18Q9CQ07 Dus1l-201ENSMUST00000026151 1930 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC18.73■□□□□ 0.59
Lrrc18Q9CQ07 Sh2b3-203ENSMUST00000118580 2393 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC18.73■□□□□ 0.59
Lrrc18Q9CQ07 Ccdc84-212ENSMUST00000217351 888 ntTSL 3 BASIC18.73■□□□□ 0.59
Lrrc18Q9CQ07 Anp32b-201ENSMUST00000102926 1716 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.73■□□□□ 0.59
Lrrc18Q9CQ07 Hcn2-201ENSMUST00000020581 3089 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.73■□□□□ 0.59
Lrrc18Q9CQ07 Osbpl1a-203ENSMUST00000118313 2893 ntTSL 1 (best) BASIC18.72■□□□□ 0.59
Lrrc18Q9CQ07 Gm16933-201ENSMUST00000141741 2169 ntTSL 1 (best) BASIC18.72■□□□□ 0.59
Lrrc18Q9CQ07 Gp1bb-202ENSMUST00000167388 1847 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC18.72■□□□□ 0.59
Lrrc18Q9CQ07 Fgfr2-217ENSMUST00000124096 2425 ntTSL 5 BASIC18.72■□□□□ 0.59
Lrrc18Q9CQ07 Uba5-201ENSMUST00000035166 2404 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.72■□□□□ 0.59
Lrrc18Q9CQ07 Ppp3cc-201ENSMUST00000078434 1970 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC18.72■□□□□ 0.59
Lrrc18Q9CQ07 Cradd-205ENSMUST00000220279 1613 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.72■□□□□ 0.59
Lrrc18Q9CQ07 Wnt10a-201ENSMUST00000006718 2468 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.72■□□□□ 0.59
Lrrc18Q9CQ07 Txnrd2-212ENSMUST00000177856 1878 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC18.72■□□□□ 0.59
Lrrc18Q9CQ07 Faim-202ENSMUST00000112911 803 ntAPPRIS ALT1 TSL 2 BASIC18.72■□□□□ 0.59
Lrrc18Q9CQ07 Eif5a-213ENSMUST00000164359 1281 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.72■□□□□ 0.59
Lrrc18Q9CQ07 H2-Q5-202ENSMUST00000172979 998 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.72■□□□□ 0.59
Lrrc18Q9CQ07 H2afj-202ENSMUST00000203982 577 ntAPPRIS ALT1 TSL 3 BASIC18.72■□□□□ 0.59
Lrrc18Q9CQ07 Gm5812-201ENSMUST00000061073 957 ntBASIC18.72■□□□□ 0.59
Lrrc18Q9CQ07 Nkx2-5-201ENSMUST00000015723 1525 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.72■□□□□ 0.59
Lrrc18Q9CQ07 Foxo3-204ENSMUST00000175881 2535 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.72■□□□□ 0.59
Lrrc18Q9CQ07 Krt5-201ENSMUST00000023709 2190 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.72■□□□□ 0.59
Lrrc18Q9CQ07 Bmp6-201ENSMUST00000171970 3593 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.72■□□□□ 0.59
Lrrc18Q9CQ07 4930500M09Rik-202ENSMUST00000194988 1563 ntBASIC18.72■□□□□ 0.59
Lrrc18Q9CQ07 Zfp385b-204ENSMUST00000111831 2734 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.72■□□□□ 0.59
Lrrc18Q9CQ07 Papd7-202ENSMUST00000198607 4750 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.72■□□□□ 0.59
Lrrc18Q9CQ07 Anapc5-218ENSMUST00000200645 2404 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.71■□□□□ 0.59
Lrrc18Q9CQ07 Enah-203ENSMUST00000111025 3385 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC18.71■□□□□ 0.59
Lrrc18Q9CQ07 Tmem150a-201ENSMUST00000069695 1546 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.71■□□□□ 0.59
Lrrc18Q9CQ07 Hs2st1-201ENSMUST00000043325 6177 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.71■□□□□ 0.59
Lrrc18Q9CQ07 Egln1-201ENSMUST00000034469 3594 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.71■□□□□ 0.59
Lrrc18Q9CQ07 Lgals3-201ENSMUST00000142734 1419 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.71■□□□□ 0.59
Lrrc18Q9CQ07 Senp6-201ENSMUST00000037484 5111 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.71■□□□□ 0.59
Lrrc18Q9CQ07 Asph-217ENSMUST00000146441 2576 ntTSL 1 (best) BASIC18.71■□□□□ 0.59
Lrrc18Q9CQ07 Ksr1-202ENSMUST00000108264 2748 ntTSL 5 BASIC18.71■□□□□ 0.59
Lrrc18Q9CQ07 Luc7l2-201ENSMUST00000057692 2702 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.71■□□□□ 0.59
Lrrc18Q9CQ07 Gimap1-201ENSMUST00000054368 1493 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.71■□□□□ 0.59
Lrrc18Q9CQ07 B130046B21Rik-201ENSMUST00000181510 2216 ntTSL 1 (best) BASIC18.7■□□□□ 0.58
Lrrc18Q9CQ07 Gatad2a-202ENSMUST00000116463 3363 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.7■□□□□ 0.58
Lrrc18Q9CQ07 Pink1-201ENSMUST00000030536 2375 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC18.7■□□□□ 0.58
Lrrc18Q9CQ07 Tm9sf3-201ENSMUST00000025989 6144 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.7■□□□□ 0.58
Lrrc18Q9CQ07 Msrb1-201ENSMUST00000101800 1211 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.7■□□□□ 0.58
Lrrc18Q9CQ07 Dusp22-203ENSMUST00000110310 2319 ntTSL 2 BASIC18.7■□□□□ 0.58
Lrrc18Q9CQ07 Pcf11-204ENSMUST00000208058 461 ntTSL 5 BASIC18.7■□□□□ 0.58
Lrrc18Q9CQ07 Trappc6b-207ENSMUST00000218686 785 ntTSL 3 BASIC18.7■□□□□ 0.58
Lrrc18Q9CQ07 Dok6-201ENSMUST00000097495 1441 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.7■□□□□ 0.58
Lrrc18Q9CQ07 Fez1-201ENSMUST00000034630 1794 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.7■□□□□ 0.58
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 16.3 ms