Protein–RNA interactions for Protein: Q99P88

Nup155, Nuclear pore complex protein Nup155, mousemouse

Known RBP Predictions only

Length 1,391 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Nup155Q99P88 1700001C19Rik-201ENSMUST00000061885 1622 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC29.42■■■□□ 2.3
Nup155Q99P88 Lrp2-202ENSMUST00000092551 2228 ntTSL 1 (best) BASIC29.42■■■□□ 2.3
Nup155Q99P88 Bcl3-201ENSMUST00000120537 1850 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.42■■■□□ 2.3
Nup155Q99P88 Celf6-202ENSMUST00000118164 1583 ntTSL 1 (best) BASIC29.42■■■□□ 2.3
Nup155Q99P88 Ndrg2-202ENSMUST00000111632 2103 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC29.41■■■□□ 2.3
Nup155Q99P88 Dnajb11-205ENSMUST00000178320 1628 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC29.41■■■□□ 2.3
Nup155Q99P88 Cnpy3-202ENSMUST00000121671 561 ntTSL 2 BASIC29.41■■■□□ 2.3
Nup155Q99P88 Art5-201ENSMUST00000094128 1518 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC29.41■■■□□ 2.3
Nup155Q99P88 Gm15270-201ENSMUST00000125158 870 ntTSL 3 BASIC29.4■■■□□ 2.3
Nup155Q99P88 Cmc4-201ENSMUST00000033543 992 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.4■■■□□ 2.3
Nup155Q99P88 Cisd1-201ENSMUST00000045887 1084 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.4■■■□□ 2.3
Nup155Q99P88 Dedd-203ENSMUST00000111299 2322 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.4■■■□□ 2.3
Nup155Q99P88 Utp11-201ENSMUST00000030738 1603 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.4■■■□□ 2.3
Nup155Q99P88 Ankrd54-201ENSMUST00000040676 1904 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.4■■■□□ 2.3
Nup155Q99P88 Tusc3-203ENSMUST00000209440 1535 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.4■■■□□ 2.3
Nup155Q99P88 Dtymk-202ENSMUST00000112890 1055 ntTSL 1 (best) BASIC29.39■■■□□ 2.3
Nup155Q99P88 Rnf39-202ENSMUST00000173072 631 ntTSL 2 BASIC29.39■■■□□ 2.3
Nup155Q99P88 Gm26571-201ENSMUST00000181399 666 ntBASIC29.39■■■□□ 2.3
Nup155Q99P88 AC114678.1-201ENSMUST00000219640 622 ntTSL 3 BASIC29.39■■■□□ 2.3
Nup155Q99P88 Ltb-201ENSMUST00000025262 1160 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC29.39■■■□□ 2.3
Nup155Q99P88 Tlk2-202ENSMUST00000092537 2743 ntTSL 1 (best) BASIC29.39■■■□□ 2.3
Nup155Q99P88 Crh-201ENSMUST00000061294 1320 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.38■■■□□ 2.29
Nup155Q99P88 Gm12524-201ENSMUST00000143109 1583 ntTSL 1 (best) BASIC29.38■■■□□ 2.29
Nup155Q99P88 Cebpa-202ENSMUST00000205391 2161 ntTSL 5 BASIC29.38■■■□□ 2.29
Nup155Q99P88 Gm20421-201ENSMUST00000153344 672 ntTSL 3 BASIC29.38■■■□□ 2.29
Nup155Q99P88 Morf4l1-211ENSMUST00000191189 1223 ntTSL 5 BASIC29.38■■■□□ 2.29
Nup155Q99P88 8430422M14Rik-201ENSMUST00000199608 822 ntBASIC29.38■■■□□ 2.29
Nup155Q99P88 Trim3-203ENSMUST00000106791 2466 ntTSL 1 (best) BASIC29.37■■■□□ 2.29
Nup155Q99P88 Gamt-201ENSMUST00000020359 979 ntTSL 1 (best) BASIC29.37■■■□□ 2.29
Nup155Q99P88 AC122828.1-201ENSMUST00000220785 489 ntTSL 3 BASIC29.37■■■□□ 2.29
Nup155Q99P88 Agpat5-201ENSMUST00000033847 2841 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC29.37■■■□□ 2.29
Nup155Q99P88 P2rx2-203ENSMUST00000195985 2096 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC29.37■■■□□ 2.29
Nup155Q99P88 Gm10129-202ENSMUST00000193100 1316 ntBASIC29.37■■■□□ 2.29
Nup155Q99P88 St6galnac6-205ENSMUST00000113290 2402 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC29.36■■■□□ 2.29
Nup155Q99P88 Rce1-201ENSMUST00000025823 1402 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.36■■■□□ 2.29
Nup155Q99P88 Wbp1-201ENSMUST00000032111 1419 ntTSL 1 (best) BASIC29.36■■■□□ 2.29
Nup155Q99P88 Arhgap9-204ENSMUST00000219511 2217 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC29.36■■■□□ 2.29
Nup155Q99P88 Anapc1-202ENSMUST00000110332 1214 ntTSL 1 (best) BASIC29.36■■■□□ 2.29
Nup155Q99P88 Rfc5-202ENSMUST00000111953 772 ntTSL 1 (best) BASIC29.36■■■□□ 2.29
Nup155Q99P88 Mrpl40-201ENSMUST00000023391 1185 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.36■■■□□ 2.29
Nup155Q99P88 Cox14-201ENSMUST00000023761 723 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.36■■■□□ 2.29
Nup155Q99P88 Hlx-201ENSMUST00000048572 2278 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.36■■■□□ 2.29
Nup155Q99P88 Ntn5-202ENSMUST00000182750 1758 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.35■■■□□ 2.29
Nup155Q99P88 Tmbim6-202ENSMUST00000159209 944 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC29.35■■■□□ 2.29
Nup155Q99P88 Fam58b-201ENSMUST00000059468 1224 ntAPPRIS P1 BASIC29.35■■■□□ 2.29
Nup155Q99P88 Ankrd9-201ENSMUST00000043459 1706 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC29.35■■■□□ 2.29
Nup155Q99P88 Mcub-201ENSMUST00000029624 1318 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.35■■■□□ 2.29
Nup155Q99P88 Gsx1-201ENSMUST00000065382 1773 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.35■■■□□ 2.29
Nup155Q99P88 Nkx2-2-201ENSMUST00000067075 2120 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.34■■■□□ 2.29
Nup155Q99P88 Trim3-202ENSMUST00000106789 2841 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.34■■■□□ 2.29
Nup155Q99P88 Wnt11-205ENSMUST00000167303 1792 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.34■■■□□ 2.29
Nup155Q99P88 Ccdc9-201ENSMUST00000041010 2379 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC29.34■■■□□ 2.29
Nup155Q99P88 AC122428.2-201ENSMUST00000216321 1832 ntBASIC29.34■■■□□ 2.29
Nup155Q99P88 Plac9b-203ENSMUST00000184142 1040 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.34■■■□□ 2.29
Nup155Q99P88 Mir6236-201ENSMUST00000184437 123 ntBASIC29.34■■■□□ 2.29
Nup155Q99P88 Nabp2-201ENSMUST00000026439 1130 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.34■■■□□ 2.29
Nup155Q99P88 Gm6899-201ENSMUST00000089614 622 ntAPPRIS P1 BASIC29.34■■■□□ 2.29
Nup155Q99P88 Trip10-207ENSMUST00000224947 2016 ntAPPRIS P2 BASIC29.34■■■□□ 2.29
Nup155Q99P88 4430402I18Rik-201ENSMUST00000025872 2152 ntTSL 1 (best) BASIC29.34■■■□□ 2.29
Nup155Q99P88 Tmem222-201ENSMUST00000105907 1484 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.34■■■□□ 2.29
Nup155Q99P88 Bicdl2-201ENSMUST00000062967 1913 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.33■■■□□ 2.29
Nup155Q99P88 Rnf8-201ENSMUST00000024817 2077 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.33■■■□□ 2.29
Nup155Q99P88 Gm20431-201ENSMUST00000125544 2367 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC29.33■■■□□ 2.29
Nup155Q99P88 Gm13067-201ENSMUST00000134236 404 ntTSL 5 BASIC29.33■■■□□ 2.29
Nup155Q99P88 Wnt16-203ENSMUST00000148639 1168 ntTSL 1 (best) BASIC29.33■■■□□ 2.29
Nup155Q99P88 AC099934.2-201ENSMUST00000196389 70 ntBASIC29.33■■■□□ 2.29
Nup155Q99P88 AC156953.1-201ENSMUST00000196953 70 ntBASIC29.33■■■□□ 2.29
Nup155Q99P88 AC157822.2-201ENSMUST00000200291 70 ntBASIC29.33■■■□□ 2.29
Nup155Q99P88 Gm45168-202ENSMUST00000206461 1069 ntTSL 5 BASIC29.33■■■□□ 2.29
Nup155Q99P88 Arv1-201ENSMUST00000034463 1165 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.33■■■□□ 2.29
Nup155Q99P88 Cdkn2a-201ENSMUST00000060501 852 ntTSL 1 (best) BASIC29.33■■■□□ 2.29
Nup155Q99P88 Gm5297-201ENSMUST00000198555 1171 ntBASIC29.32■■■□□ 2.28
Nup155Q99P88 Mau2-206ENSMUST00000212451 1931 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC29.32■■■□□ 2.28
Nup155Q99P88 Zswim5-201ENSMUST00000044823 5582 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.32■■■□□ 2.28
Nup155Q99P88 Fam168b-201ENSMUST00000047534 5030 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.32■■■□□ 2.28
Nup155Q99P88 Ccdc61-201ENSMUST00000098780 2022 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.31■■■□□ 2.28
Nup155Q99P88 Gm10849-201ENSMUST00000100397 618 ntBASIC29.31■■■□□ 2.28
Nup155Q99P88 Bsg-205ENSMUST00000179781 1261 ntTSL 1 (best) BASIC29.31■■■□□ 2.28
Nup155Q99P88 Adad2-201ENSMUST00000098361 1926 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.31■■■□□ 2.28
Nup155Q99P88 Cblc-201ENSMUST00000043822 1662 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.31■■■□□ 2.28
Nup155Q99P88 Ell3-201ENSMUST00000028679 2115 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.3■■■□□ 2.28
Nup155Q99P88 Tfg-201ENSMUST00000065515 1945 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC29.3■■■□□ 2.28
Nup155Q99P88 Yjefn3-203ENSMUST00000180068 629 ntTSL 5 BASIC29.3■■■□□ 2.28
Nup155Q99P88 Gm26775-201ENSMUST00000180684 2197 ntTSL 5 BASIC29.3■■■□□ 2.28
Nup155Q99P88 Sh3bp1-203ENSMUST00000089378 2001 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.3■■■□□ 2.28
Nup155Q99P88 Gnb2-201ENSMUST00000031726 1860 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.3■■■□□ 2.28
Nup155Q99P88 Gm26796-201ENSMUST00000181092 2276 ntTSL 1 (best) BASIC29.29■■■□□ 2.28
Nup155Q99P88 Kcnk1-201ENSMUST00000046765 2235 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.29■■■□□ 2.28
Nup155Q99P88 4930467K11Rik-201ENSMUST00000180831 723 ntTSL 1 (best) BASIC29.29■■■□□ 2.28
Nup155Q99P88 Alx3-201ENSMUST00000014747 1874 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.29■■■□□ 2.28
Nup155Q99P88 Rhou-201ENSMUST00000045487 3371 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.29■■■□□ 2.28
Nup155Q99P88 Jsrp1-203ENSMUST00000181039 1108 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC29.28■■■□□ 2.28
Nup155Q99P88 Ferd3l-201ENSMUST00000061035 886 ntAPPRIS P1 BASIC29.28■■■□□ 2.28
Nup155Q99P88 Krt8-201ENSMUST00000023952 1805 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.28■■■□□ 2.28
Nup155Q99P88 Hhex-201ENSMUST00000025944 1802 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.28■■■□□ 2.28
Nup155Q99P88 Rnaseh2b-201ENSMUST00000022499 1494 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.28■■■□□ 2.28
Nup155Q99P88 P3h3-201ENSMUST00000023958 2850 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.28■■■□□ 2.28
Nup155Q99P88 Gm7291-201ENSMUST00000199147 382 ntBASIC29.27■■■□□ 2.28
Nup155Q99P88 B630019K06Rik-201ENSMUST00000064196 2583 ntAPPRIS P1 BASIC29.27■■■□□ 2.28
Nup155Q99P88 Thoc6-201ENSMUST00000047436 1504 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.27■■■□□ 2.28
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 117 ms