Protein–RNA interactions for Protein: Q99NF2

Nsmf, NMDA receptor synaptonuclear signaling and neuronal migration factor, mousemouse

Predictions only

Length 532 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
NsmfQ99NF2 4930519A11Rik-202ENSMUST00000221053 667 ntTSL 3 BASIC24.2■■□□□ 1.46
NsmfQ99NF2 Cryzl1-203ENSMUST00000117644 1727 ntTSL 1 (best) BASIC24.2■■□□□ 1.46
NsmfQ99NF2 Gm20431-201ENSMUST00000125544 2367 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC24.2■■□□□ 1.46
NsmfQ99NF2 Fez1-201ENSMUST00000034630 1794 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.19■■□□□ 1.46
NsmfQ99NF2 Gabpb1-203ENSMUST00000103226 1338 ntTSL 1 (best) BASIC24.19■■□□□ 1.46
NsmfQ99NF2 Pim3-201ENSMUST00000042818 2419 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.19■■□□□ 1.46
NsmfQ99NF2 Gm10209-201ENSMUST00000203397 1607 ntBASIC24.19■■□□□ 1.46
NsmfQ99NF2 Gabbr2-201ENSMUST00000107749 5750 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC24.19■■□□□ 1.46
NsmfQ99NF2 Hoxd4-202ENSMUST00000111980 1494 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.19■■□□□ 1.46
NsmfQ99NF2 Slc35a2-201ENSMUST00000096514 1757 ntTSL 5 BASIC24.19■■□□□ 1.46
NsmfQ99NF2 Dedd2-202ENSMUST00000205271 1942 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC24.18■■□□□ 1.46
NsmfQ99NF2 Gm26775-201ENSMUST00000180684 2197 ntTSL 5 BASIC24.18■■□□□ 1.46
NsmfQ99NF2 Srsf1-202ENSMUST00000107920 1209 ntTSL 5 BASIC24.18■■□□□ 1.46
NsmfQ99NF2 Bax-205ENSMUST00000211365 801 ntTSL 3 BASIC24.18■■□□□ 1.46
NsmfQ99NF2 Iars2-202ENSMUST00000110974 2431 ntTSL 1 (best) BASIC24.18■■□□□ 1.46
NsmfQ99NF2 Slc17a7-201ENSMUST00000085374 2915 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.17■■□□□ 1.46
NsmfQ99NF2 Nisch-201ENSMUST00000022469 5559 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC24.17■■□□□ 1.46
NsmfQ99NF2 Exosc4-201ENSMUST00000059045 1796 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.17■■□□□ 1.46
NsmfQ99NF2 Gm26833-201ENSMUST00000180899 440 ntBASIC24.17■■□□□ 1.46
NsmfQ99NF2 Gm37564-201ENSMUST00000195000 330 ntTSL 5 BASIC24.17■■□□□ 1.46
NsmfQ99NF2 Map3k15-201ENSMUST00000033665 4348 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC24.16■■□□□ 1.46
NsmfQ99NF2 Arglu1-201ENSMUST00000048545 3197 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC24.16■■□□□ 1.46
NsmfQ99NF2 Wdfy1-202ENSMUST00000113510 704 ntTSL 1 (best) BASIC24.16■■□□□ 1.46
NsmfQ99NF2 Wdfy1-203ENSMUST00000113511 704 ntTSL 5 BASIC24.16■■□□□ 1.46
NsmfQ99NF2 Cdc34b-202ENSMUST00000188741 1252 ntBASIC24.16■■□□□ 1.46
NsmfQ99NF2 Cdc34-201ENSMUST00000020550 1266 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.16■■□□□ 1.46
NsmfQ99NF2 Cdc34b-201ENSMUST00000021240 1233 ntAPPRIS P1 BASIC24.16■■□□□ 1.46
NsmfQ99NF2 Wdfy1-201ENSMUST00000048820 717 ntTSL 1 (best) BASIC24.16■■□□□ 1.46
NsmfQ99NF2 Acbd6-202ENSMUST00000080138 993 ntTSL 1 (best) BASIC24.16■■□□□ 1.46
NsmfQ99NF2 Lrp2-202ENSMUST00000092551 2228 ntTSL 1 (best) BASIC24.16■■□□□ 1.46
NsmfQ99NF2 Dedd2-201ENSMUST00000058702 1828 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.16■■□□□ 1.46
NsmfQ99NF2 Pold2-201ENSMUST00000102922 1646 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.16■■□□□ 1.46
NsmfQ99NF2 Dbnl-201ENSMUST00000020769 1638 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.16■■□□□ 1.46
NsmfQ99NF2 P2rx2-203ENSMUST00000195985 2096 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC24.15■■□□□ 1.46
NsmfQ99NF2 Kat2b-201ENSMUST00000000724 4653 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.15■■□□□ 1.46
NsmfQ99NF2 Mob2-205ENSMUST00000211000 1646 ntTSL 5 BASIC24.15■■□□□ 1.46
NsmfQ99NF2 Wdr41-208ENSMUST00000222995 1112 ntTSL 5 BASIC24.15■■□□□ 1.46
NsmfQ99NF2 Slc35b2-207ENSMUST00000226086 850 ntBASIC24.15■■□□□ 1.46
NsmfQ99NF2 Lig3-204ENSMUST00000131537 1782 ntTSL 1 (best) BASIC24.15■■□□□ 1.46
NsmfQ99NF2 Lig3-209ENSMUST00000173009 1785 ntTSL 1 (best) BASIC24.15■■□□□ 1.46
NsmfQ99NF2 Gpatch3-201ENSMUST00000030662 2004 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.15■■□□□ 1.46
NsmfQ99NF2 Akt1s1-204ENSMUST00000107885 1812 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.14■■□□□ 1.46
NsmfQ99NF2 Arl5a-201ENSMUST00000036541 5239 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.14■■□□□ 1.46
NsmfQ99NF2 Tomm40-201ENSMUST00000032555 1646 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.14■■□□□ 1.46
NsmfQ99NF2 Syt6-205ENSMUST00000121834 1710 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.14■■□□□ 1.45
NsmfQ99NF2 Rps7-203ENSMUST00000221871 820 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.14■■□□□ 1.45
NsmfQ99NF2 Abhd17b-201ENSMUST00000052556 2475 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC24.14■■□□□ 1.45
NsmfQ99NF2 Fbxl21-202ENSMUST00000121095 798 ntTSL 1 (best) BASIC24.13■■□□□ 1.45
NsmfQ99NF2 Gpx7-201ENSMUST00000030332 1289 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.13■■□□□ 1.45
NsmfQ99NF2 Ankrd54-201ENSMUST00000040676 1904 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.13■■□□□ 1.45
NsmfQ99NF2 Mfsd4a-202ENSMUST00000112365 1536 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC24.13■■□□□ 1.45
NsmfQ99NF2 Paip2-203ENSMUST00000115735 1521 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC24.13■■□□□ 1.45
NsmfQ99NF2 Arhgap8-207ENSMUST00000172307 1544 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC24.13■■□□□ 1.45
NsmfQ99NF2 Apoe-206ENSMUST00000174064 1408 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.12■■□□□ 1.45
NsmfQ99NF2 Prkar1b-201ENSMUST00000026973 2637 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.12■■□□□ 1.45
NsmfQ99NF2 Hist1h2bp-201ENSMUST00000102982 469 ntAPPRIS P1 BASIC24.12■■□□□ 1.45
NsmfQ99NF2 Gm20163-202ENSMUST00000212288 989 ntTSL 1 (best) BASIC24.12■■□□□ 1.45
NsmfQ99NF2 6330403K07Rik-201ENSMUST00000156068 1494 ntTSL 1 (best) BASIC24.12■■□□□ 1.45
NsmfQ99NF2 Krtap5-2-202ENSMUST00000190456 1471 ntAPPRIS P2 BASIC24.12■■□□□ 1.45
NsmfQ99NF2 Gm27045-201ENSMUST00000182145 1402 ntBASIC24.11■■□□□ 1.45
NsmfQ99NF2 Actr5-201ENSMUST00000045644 2402 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.11■■□□□ 1.45
NsmfQ99NF2 Gm40848-201ENSMUST00000221998 324 ntBASIC24.11■■□□□ 1.45
NsmfQ99NF2 Sh3bp1-203ENSMUST00000089378 2001 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.11■■□□□ 1.45
NsmfQ99NF2 Arhgap9-204ENSMUST00000219511 2217 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.11■■□□□ 1.45
NsmfQ99NF2 Rnf19b-206ENSMUST00000168461 2532 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC24.11■■□□□ 1.45
NsmfQ99NF2 Ccr10-201ENSMUST00000062759 1726 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.1■■□□□ 1.45
NsmfQ99NF2 E130218I03Rik-201ENSMUST00000122952 943 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.1■■□□□ 1.45
NsmfQ99NF2 Dcbld2-201ENSMUST00000046663 6561 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.1■■□□□ 1.45
NsmfQ99NF2 Raph1-201ENSMUST00000027168 2241 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC24.1■■□□□ 1.45
NsmfQ99NF2 1700001C19Rik-201ENSMUST00000061885 1622 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC24.1■■□□□ 1.45
NsmfQ99NF2 Agmat-201ENSMUST00000038161 1407 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.1■■□□□ 1.45
NsmfQ99NF2 Parl-201ENSMUST00000048642 1348 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.1■■□□□ 1.45
NsmfQ99NF2 Klhl22-201ENSMUST00000117192 2754 ntTSL 5 BASIC24.09■■□□□ 1.45
NsmfQ99NF2 Map4k3-202ENSMUST00000112389 4231 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC24.09■■□□□ 1.45
NsmfQ99NF2 Gm20621-202ENSMUST00000176618 1234 ntTSL 1 (best) BASIC24.09■■□□□ 1.45
NsmfQ99NF2 Ell3-201ENSMUST00000028679 2115 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.09■■□□□ 1.45
NsmfQ99NF2 Nkx2-2-201ENSMUST00000067075 2120 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.09■■□□□ 1.45
NsmfQ99NF2 Tekt5-201ENSMUST00000043415 1803 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.09■■□□□ 1.45
NsmfQ99NF2 Lrrc4b-201ENSMUST00000058667 2728 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.09■■□□□ 1.45
NsmfQ99NF2 Dusp14-202ENSMUST00000100705 1447 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.09■■□□□ 1.45
NsmfQ99NF2 Fam189a2-201ENSMUST00000096164 2547 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC24.09■■□□□ 1.45
NsmfQ99NF2 Bcl3-201ENSMUST00000120537 1850 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.09■■□□□ 1.45
NsmfQ99NF2 Cdc16-201ENSMUST00000043962 2301 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.09■■□□□ 1.45
NsmfQ99NF2 Kcnk1-201ENSMUST00000046765 2235 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.08■■□□□ 1.45
NsmfQ99NF2 Phf12-202ENSMUST00000108360 3047 ntTSL 1 (best) BASIC24.08■■□□□ 1.45
NsmfQ99NF2 Tomm40-202ENSMUST00000093552 1577 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.08■■□□□ 1.45
NsmfQ99NF2 Impdh1-201ENSMUST00000078155 2437 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.08■■□□□ 1.45
NsmfQ99NF2 Gm43060-201ENSMUST00000200621 289 ntBASIC24.08■■□□□ 1.45
NsmfQ99NF2 Gm5874-201ENSMUST00000096101 508 ntBASIC24.08■■□□□ 1.45
NsmfQ99NF2 Arhgap27-202ENSMUST00000092557 1504 ntTSL 2 BASIC24.08■■□□□ 1.45
NsmfQ99NF2 Dpy19l1-206ENSMUST00000170356 4715 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC24.08■■□□□ 1.45
NsmfQ99NF2 Tmem234-201ENSMUST00000102591 1437 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.08■■□□□ 1.44
NsmfQ99NF2 Adad2-201ENSMUST00000098361 1926 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.08■■□□□ 1.44
NsmfQ99NF2 Mgll-202ENSMUST00000113581 1308 ntTSL 5 BASIC24.08■■□□□ 1.44
NsmfQ99NF2 4430402I18Rik-201ENSMUST00000025872 2152 ntTSL 1 (best) BASIC24.08■■□□□ 1.44
NsmfQ99NF2 Evi5l-209ENSMUST00000177053 1542 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC24.07■■□□□ 1.44
NsmfQ99NF2 1700016H13Rik-203ENSMUST00000120108 797 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC24.07■■□□□ 1.44
NsmfQ99NF2 Gtsf1-201ENSMUST00000023129 819 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.07■■□□□ 1.44
NsmfQ99NF2 Rnf8-201ENSMUST00000024817 2077 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.07■■□□□ 1.44
NsmfQ99NF2 Olig3-201ENSMUST00000053225 2072 ntAPPRIS P1 BASIC24.07■■□□□ 1.44
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 29.1 ms