Protein–RNA interactions for Protein: Q99N20

Brms1, Breast cancer metastasis-suppressor 1 homolog, mousemouse

Predictions only

Length 246 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Brms1Q99N20 Gsx2-201ENSMUST00000040477 1665 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.72■■□□□ 1.23
Brms1Q99N20 Nectin1-201ENSMUST00000034510 5653 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.72■■□□□ 1.23
Brms1Q99N20 Cacna2d2-201ENSMUST00000010210 5783 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.72■■□□□ 1.23
Brms1Q99N20 Ube2e3-202ENSMUST00000121433 1235 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.72■■□□□ 1.23
Brms1Q99N20 Zfp629-208ENSMUST00000151107 583 ntTSL 3 BASIC22.72■■□□□ 1.23
Brms1Q99N20 Gm35161-201ENSMUST00000221765 941 ntTSL 5 BASIC22.72■■□□□ 1.23
Brms1Q99N20 Setd4-202ENSMUST00000113951 1826 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.72■■□□□ 1.23
Brms1Q99N20 Pdcd2-205ENSMUST00000154293 1924 ntTSL 1 (best) BASIC22.72■■□□□ 1.23
Brms1Q99N20 Thra-201ENSMUST00000064187 2452 ntTSL 1 (best) BASIC22.72■■□□□ 1.23
Brms1Q99N20 Lsr-205ENSMUST00000205961 2021 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.72■■□□□ 1.23
Brms1Q99N20 Tfap2e-201ENSMUST00000048194 2085 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.72■■□□□ 1.23
Brms1Q99N20 Ksr1-202ENSMUST00000108264 2748 ntTSL 5 BASIC22.72■■□□□ 1.23
Brms1Q99N20 Erc1-202ENSMUST00000079582 2304 ntTSL 1 (best) BASIC22.71■■□□□ 1.23
Brms1Q99N20 Tmem86a-201ENSMUST00000010451 1831 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.71■■□□□ 1.23
Brms1Q99N20 Sh3bp1-204ENSMUST00000109698 1923 ntTSL 1 (best) BASIC22.71■■□□□ 1.23
Brms1Q99N20 Mpz-201ENSMUST00000070758 2002 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.71■■□□□ 1.23
Brms1Q99N20 Gadd45a-207ENSMUST00000204369 716 ntTSL 5 BASIC22.71■■□□□ 1.23
Brms1Q99N20 Dusp22-203ENSMUST00000110310 2319 ntTSL 2 BASIC22.71■■□□□ 1.23
Brms1Q99N20 Ghitm-201ENSMUST00000042564 2573 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.71■■□□□ 1.23
Brms1Q99N20 Ercc6l2-208ENSMUST00000144763 1820 ntTSL 1 (best) BASIC22.71■■□□□ 1.23
Brms1Q99N20 Pdgfa-204ENSMUST00000110897 1287 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.7■■□□□ 1.22
Brms1Q99N20 Txnrd2-201ENSMUST00000115604 1235 ntTSL 1 (best) BASIC22.7■■□□□ 1.22
Brms1Q99N20 Rabac1-201ENSMUST00000076961 899 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.7■■□□□ 1.22
Brms1Q99N20 Barx1-201ENSMUST00000021813 1399 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.7■■□□□ 1.22
Brms1Q99N20 Ntn5-202ENSMUST00000182750 1758 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.7■■□□□ 1.22
Brms1Q99N20 Ptov1-201ENSMUST00000046575 1883 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.7■■□□□ 1.22
Brms1Q99N20 Cltb-202ENSMUST00000091609 2186 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.7■■□□□ 1.22
Brms1Q99N20 Slc30a4-201ENSMUST00000005952 5458 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.69■■□□□ 1.22
Brms1Q99N20 Bhlhe23-201ENSMUST00000108878 2520 ntAPPRIS P1 BASIC22.69■■□□□ 1.22
Brms1Q99N20 Msl3l2-201ENSMUST00000063138 2140 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.69■■□□□ 1.22
Brms1Q99N20 Foxj3-206ENSMUST00000138845 1530 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.69■■□□□ 1.22
Brms1Q99N20 Becn1-217ENSMUST00000172233 1493 ntTSL 5 BASIC22.69■■□□□ 1.22
Brms1Q99N20 Gm572-201ENSMUST00000105698 1385 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.69■■□□□ 1.22
Brms1Q99N20 Tmem127-202ENSMUST00000174288 842 ntTSL 2 BASIC22.69■■□□□ 1.22
Brms1Q99N20 Gm40881-201ENSMUST00000223397 166 ntBASIC22.69■■□□□ 1.22
Brms1Q99N20 A930002H24Rik-201ENSMUST00000050753 492 ntAPPRIS P1 BASIC22.69■■□□□ 1.22
Brms1Q99N20 Sema6d-204ENSMUST00000078621 6372 ntTSL 5 BASIC22.69■■□□□ 1.22
Brms1Q99N20 Nrxn2-208ENSMUST00000137166 6314 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC22.69■■□□□ 1.22
Brms1Q99N20 Hccs-202ENSMUST00000112115 2473 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.69■■□□□ 1.22
Brms1Q99N20 Krt5-201ENSMUST00000023709 2190 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.69■■□□□ 1.22
Brms1Q99N20 Letm2-201ENSMUST00000079160 2126 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.69■■□□□ 1.22
Brms1Q99N20 Zbtb7a-202ENSMUST00000117956 1863 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.68■■□□□ 1.22
Brms1Q99N20 Zfp653-202ENSMUST00000179605 1888 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.68■■□□□ 1.22
Brms1Q99N20 Crtc2-201ENSMUST00000029545 2747 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.68■■□□□ 1.22
Brms1Q99N20 Pelo-201ENSMUST00000109226 1600 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.68■■□□□ 1.22
Brms1Q99N20 Gm15043-201ENSMUST00000118843 1543 ntBASIC22.68■■□□□ 1.22
Brms1Q99N20 Tmprss5-205ENSMUST00000170246 1491 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.68■■□□□ 1.22
Brms1Q99N20 Hopx-203ENSMUST00000120827 1217 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.68■■□□□ 1.22
Brms1Q99N20 Zfp346-202ENSMUST00000159147 1146 ntTSL 5 BASIC22.68■■□□□ 1.22
Brms1Q99N20 Gm2464-202ENSMUST00000194841 877 ntTSL 1 (best) BASIC22.68■■□□□ 1.22
Brms1Q99N20 Scube1-202ENSMUST00000043634 5161 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.68■■□□□ 1.22
Brms1Q99N20 Tsen54-201ENSMUST00000021134 1979 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.68■■□□□ 1.22
Brms1Q99N20 4930507D05Rik-201ENSMUST00000181110 1834 ntAPPRIS P1 BASIC22.68■■□□□ 1.22
Brms1Q99N20 Eif2ak4-207ENSMUST00000110877 2134 ntTSL 1 (best) BASIC22.67■■□□□ 1.22
Brms1Q99N20 Slc9a7-201ENSMUST00000072451 2512 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.67■■□□□ 1.22
Brms1Q99N20 Fam207a-201ENSMUST00000045454 2394 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.67■■□□□ 1.22
Brms1Q99N20 Oaf-201ENSMUST00000034512 2526 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.67■■□□□ 1.22
Brms1Q99N20 Dgcr6-209ENSMUST00000155387 1415 ntTSL 3 BASIC22.66■■□□□ 1.22
Brms1Q99N20 Nnat-207ENSMUST00000173041 760 ntTSL 5 BASIC22.66■■□□□ 1.22
Brms1Q99N20 Gpx7-202ENSMUST00000184609 331 ntTSL 3 BASIC22.66■■□□□ 1.22
Brms1Q99N20 Gm18755-201ENSMUST00000218030 1099 ntBASIC22.66■■□□□ 1.22
Brms1Q99N20 Pbx1-201ENSMUST00000064438 1020 ntTSL 1 (best) BASIC22.66■■□□□ 1.22
Brms1Q99N20 Trim47-201ENSMUST00000021120 2204 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC22.66■■□□□ 1.22
Brms1Q99N20 Zbed3-201ENSMUST00000045909 1894 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.66■■□□□ 1.22
Brms1Q99N20 Htr6-201ENSMUST00000068036 1362 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.65■■□□□ 1.22
Brms1Q99N20 Triobp-202ENSMUST00000109688 2553 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.65■■□□□ 1.22
Brms1Q99N20 Jkamp-202ENSMUST00000117449 1874 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.65■■□□□ 1.22
Brms1Q99N20 Ltb-203ENSMUST00000173600 905 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC22.65■■□□□ 1.22
Brms1Q99N20 Gm37035-201ENSMUST00000194809 2148 ntBASIC22.65■■□□□ 1.22
Brms1Q99N20 Akt1s1-204ENSMUST00000107885 1812 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.65■■□□□ 1.22
Brms1Q99N20 Mum1-201ENSMUST00000020365 2640 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.65■■□□□ 1.22
Brms1Q99N20 Lrrc38-201ENSMUST00000052458 2324 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.65■■□□□ 1.22
Brms1Q99N20 1700030C10Rik-203ENSMUST00000189625 1735 ntTSL 1 (best) BASIC22.65■■□□□ 1.22
Brms1Q99N20 Phox2b-201ENSMUST00000012664 3013 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.65■■□□□ 1.22
Brms1Q99N20 Cpne2-202ENSMUST00000109537 2121 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.64■■□□□ 1.22
Brms1Q99N20 Gm26660-201ENSMUST00000181582 2543 ntTSL 1 (best) BASIC22.64■■□□□ 1.22
Brms1Q99N20 Letm2-209ENSMUST00000210810 1538 ntTSL 1 (best) BASIC22.64■■□□□ 1.21
Brms1Q99N20 Rell2-202ENSMUST00000091932 1995 ntTSL 2 BASIC22.64■■□□□ 1.21
Brms1Q99N20 Riox1-201ENSMUST00000053744 2344 ntAPPRIS P1 BASIC22.64■■□□□ 1.21
Brms1Q99N20 Atmin-201ENSMUST00000109099 4877 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.64■■□□□ 1.21
Brms1Q99N20 Ankrd33b-202ENSMUST00000076942 1641 ntTSL 1 (best) BASIC22.64■■□□□ 1.21
Brms1Q99N20 Lsm14a-201ENSMUST00000085585 2944 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.64■■□□□ 1.21
Brms1Q99N20 Wrnip1-201ENSMUST00000021832 2633 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.63■■□□□ 1.21
Brms1Q99N20 Hmg20b-203ENSMUST00000105324 1540 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.63■■□□□ 1.21
Brms1Q99N20 Zfp821-201ENSMUST00000034163 2127 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.63■■□□□ 1.21
Brms1Q99N20 Dgat1-201ENSMUST00000023214 1888 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.63■■□□□ 1.21
Brms1Q99N20 Gm7143-201ENSMUST00000222811 859 ntBASIC22.63■■□□□ 1.21
Brms1Q99N20 Zbtb7a-203ENSMUST00000119606 1841 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.63■■□□□ 1.21
Brms1Q99N20 Cav2-201ENSMUST00000000058 2733 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.63■■□□□ 1.21
Brms1Q99N20 Ube2d2a-202ENSMUST00000170693 2483 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.63■■□□□ 1.21
Brms1Q99N20 6330403K07Rik-201ENSMUST00000156068 1494 ntTSL 1 (best) BASIC22.62■■□□□ 1.21
Brms1Q99N20 Nsmf-213ENSMUST00000140737 862 ntTSL 5 BASIC22.62■■□□□ 1.21
Brms1Q99N20 Dusp26-201ENSMUST00000036631 1938 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.62■■□□□ 1.21
Brms1Q99N20 Gm34220-201ENSMUST00000223001 2709 ntBASIC22.62■■□□□ 1.21
Brms1Q99N20 Exoc3l2-201ENSMUST00000011407 2200 ntTSL 5 BASIC22.62■■□□□ 1.21
Brms1Q99N20 Kdm1a-203ENSMUST00000116273 3008 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.62■■□□□ 1.21
Brms1Q99N20 Hoxb6-202ENSMUST00000173432 1964 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.61■■□□□ 1.21
Brms1Q99N20 Lgr4-201ENSMUST00000046548 5060 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22.61■■□□□ 1.21
Brms1Q99N20 Art5-204ENSMUST00000106937 1713 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.61■■□□□ 1.21
Brms1Q99N20 Gjc2-202ENSMUST00000108793 2187 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.61■■□□□ 1.21
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 17.5 ms