Protein–RNA interactions for Protein: Q99N08

Ms4a6c, Membrane-spanning 4-domains subfamily A member 6C, mousemouse

Predictions only

Length 217 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Ms4a6cQ99N08 Panx1-202ENSMUST00000164273 5732 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.4■□□□□ 0.22
Ms4a6cQ99N08 Prmt8-201ENSMUST00000032500 2724 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.4■□□□□ 0.22
Ms4a6cQ99N08 Mettl24-201ENSMUST00000058747 1529 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.4■□□□□ 0.22
Ms4a6cQ99N08 Ubl7-208ENSMUST00000216841 1426 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.4■□□□□ 0.22
Ms4a6cQ99N08 Dok6-201ENSMUST00000097495 1441 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.4■□□□□ 0.22
Ms4a6cQ99N08 Sft2d1-210ENSMUST00000154553 1049 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.4■□□□□ 0.22
Ms4a6cQ99N08 Pou3f1-201ENSMUST00000053491 3849 ntAPPRIS P1 BASIC16.4■□□□□ 0.22
Ms4a6cQ99N08 Serp2-201ENSMUST00000064517 748 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.4■□□□□ 0.22
Ms4a6cQ99N08 Hoxa2-201ENSMUST00000014848 1775 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.4■□□□□ 0.22
Ms4a6cQ99N08 Vgf-202ENSMUST00000186451 2277 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.4■□□□□ 0.22
Ms4a6cQ99N08 Rexo5-201ENSMUST00000033218 1966 ntTSL 1 (best) BASIC16.4■□□□□ 0.22
Ms4a6cQ99N08 Erc1-202ENSMUST00000079582 2304 ntTSL 1 (best) BASIC16.4■□□□□ 0.22
Ms4a6cQ99N08 Iqsec1-210ENSMUST00000212100 3500 ntTSL 5 BASIC16.39■□□□□ 0.21
Ms4a6cQ99N08 Ankrd13d-201ENSMUST00000056888 2139 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.39■□□□□ 0.21
Ms4a6cQ99N08 Hoxb6-202ENSMUST00000173432 1964 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.39■□□□□ 0.21
Ms4a6cQ99N08 Rab5c-201ENSMUST00000019317 1967 ntTSL 1 (best) BASIC16.39■□□□□ 0.21
Ms4a6cQ99N08 Igfbp7-201ENSMUST00000046746 1116 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.39■□□□□ 0.21
Ms4a6cQ99N08 Arhgap21-201ENSMUST00000114594 7351 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.39■□□□□ 0.21
Ms4a6cQ99N08 Oxsr1-201ENSMUST00000040853 4647 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.39■□□□□ 0.21
Ms4a6cQ99N08 En2-201ENSMUST00000036177 3539 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.39■□□□□ 0.21
Ms4a6cQ99N08 Clasp2-211ENSMUST00000216817 2234 ntTSL 1 (best) BASIC16.38■□□□□ 0.21
Ms4a6cQ99N08 Sys1-202ENSMUST00000109352 2001 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.38■□□□□ 0.21
Ms4a6cQ99N08 Tmem86a-201ENSMUST00000010451 1831 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.38■□□□□ 0.21
Ms4a6cQ99N08 Tmem79-202ENSMUST00000107552 2063 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.38■□□□□ 0.21
Ms4a6cQ99N08 Meg3-207ENSMUST00000143836 1896 ntTSL 1 (best) BASIC16.38■□□□□ 0.21
Ms4a6cQ99N08 Gm10612-201ENSMUST00000162198 1681 ntTSL 1 (best) BASIC16.38■□□□□ 0.21
Ms4a6cQ99N08 Cbfb-204ENSMUST00000109395 2709 ntTSL 1 (best) BASIC16.38■□□□□ 0.21
Ms4a6cQ99N08 Trappc6b-207ENSMUST00000218686 785 ntTSL 3 BASIC16.38■□□□□ 0.21
Ms4a6cQ99N08 Lin7b-201ENSMUST00000003971 735 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.38■□□□□ 0.21
Ms4a6cQ99N08 Nipsnap2-201ENSMUST00000086046 2112 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.38■□□□□ 0.21
Ms4a6cQ99N08 Amdhd1-201ENSMUST00000016034 2421 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.38■□□□□ 0.21
Ms4a6cQ99N08 Fam92a-208ENSMUST00000177837 1325 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.38■□□□□ 0.21
Ms4a6cQ99N08 Fez1-201ENSMUST00000034630 1794 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.38■□□□□ 0.21
Ms4a6cQ99N08 Ltbp4-205ENSMUST00000121175 5118 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.38■□□□□ 0.21
Ms4a6cQ99N08 Chst3-202ENSMUST00000135158 6108 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC16.38■□□□□ 0.21
Ms4a6cQ99N08 Sorcs2-201ENSMUST00000037370 5707 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.38■□□□□ 0.21
Ms4a6cQ99N08 Siah2-201ENSMUST00000070368 2511 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.38■□□□□ 0.21
Ms4a6cQ99N08 Zmiz2-201ENSMUST00000012612 4199 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC16.38■□□□□ 0.21
Ms4a6cQ99N08 Gm43653-201ENSMUST00000198136 1608 ntTSL 3 BASIC16.37■□□□□ 0.21
Ms4a6cQ99N08 Whamm-201ENSMUST00000165460 3069 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.37■□□□□ 0.21
Ms4a6cQ99N08 Zfp777-202ENSMUST00000114583 3111 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC16.37■□□□□ 0.21
Ms4a6cQ99N08 L3mbtl4-201ENSMUST00000093007 2445 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.37■□□□□ 0.21
Ms4a6cQ99N08 Astn2-202ENSMUST00000084496 4675 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.37■□□□□ 0.21
Ms4a6cQ99N08 Lpcat3-201ENSMUST00000004381 2281 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.37■□□□□ 0.21
Ms4a6cQ99N08 Fam49b-202ENSMUST00000164532 1770 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.37■□□□□ 0.21
Ms4a6cQ99N08 Fam168b-204ENSMUST00000170092 941 ntTSL 5 BASIC16.37■□□□□ 0.21
Ms4a6cQ99N08 Mknk2-205ENSMUST00000200082 3439 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.37■□□□□ 0.21
Ms4a6cQ99N08 Trmt61a-202ENSMUST00000168338 2131 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.37■□□□□ 0.21
Ms4a6cQ99N08 Nrg3-203ENSMUST00000173780 2137 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.37■□□□□ 0.21
Ms4a6cQ99N08 Dbf4-201ENSMUST00000002368 2401 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.37■□□□□ 0.21
Ms4a6cQ99N08 Itsn2-215ENSMUST00000220311 6080 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.36■□□□□ 0.21
Ms4a6cQ99N08 Crocc-211ENSMUST00000168157 6244 ntTSL 1 (best) BASIC16.36■□□□□ 0.21
Ms4a6cQ99N08 Crocc-201ENSMUST00000040222 6248 ntTSL 5 BASIC16.36■□□□□ 0.21
Ms4a6cQ99N08 Gabra5-201ENSMUST00000068456 2671 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.36■□□□□ 0.21
Ms4a6cQ99N08 Zbtb7a-202ENSMUST00000117956 1863 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.36■□□□□ 0.21
Ms4a6cQ99N08 Tsen54-201ENSMUST00000021134 1979 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.36■□□□□ 0.21
Ms4a6cQ99N08 Mark2-207ENSMUST00000165286 2975 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.36■□□□□ 0.21
Ms4a6cQ99N08 Nt5m-201ENSMUST00000102695 1306 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.36■□□□□ 0.21
Ms4a6cQ99N08 Stau2-217ENSMUST00000162751 3030 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.36■□□□□ 0.21
Ms4a6cQ99N08 Mylip-201ENSMUST00000038275 3065 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.36■□□□□ 0.21
Ms4a6cQ99N08 Wipi1-202ENSMUST00000103060 2050 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.36■□□□□ 0.21
Ms4a6cQ99N08 Ptger3-202ENSMUST00000173533 2097 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.36■□□□□ 0.21
Ms4a6cQ99N08 Spata6-213ENSMUST00000153746 1444 ntTSL 1 (best) BASIC16.36■□□□□ 0.21
Ms4a6cQ99N08 Hhex-201ENSMUST00000025944 1802 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.35■□□□□ 0.21
Ms4a6cQ99N08 Tril-201ENSMUST00000127748 5363 ntAPPRIS P1 BASIC16.35■□□□□ 0.21
Ms4a6cQ99N08 Atp11a-202ENSMUST00000091237 7443 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.35■□□□□ 0.21
Ms4a6cQ99N08 Tmem263-201ENSMUST00000095383 3616 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.35■□□□□ 0.21
Ms4a6cQ99N08 Mtfr1l-201ENSMUST00000102550 2025 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.35■□□□□ 0.21
Ms4a6cQ99N08 Papola-211ENSMUST00000166735 1033 ntTSL 1 (best) BASIC16.35■□□□□ 0.21
Ms4a6cQ99N08 Krtap28-10-201ENSMUST00000188323 957 ntAPPRIS P1 BASIC16.35■□□□□ 0.21
Ms4a6cQ99N08 Actr3b-201ENSMUST00000088244 1712 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.35■□□□□ 0.21
Ms4a6cQ99N08 Klrg2-201ENSMUST00000096030 2276 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.35■□□□□ 0.21
Ms4a6cQ99N08 Shisa5-201ENSMUST00000026737 1834 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.35■□□□□ 0.21
Ms4a6cQ99N08 D11Wsu47e-201ENSMUST00000042227 2196 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.34■□□□□ 0.21
Ms4a6cQ99N08 Donson-203ENSMUST00000117159 2215 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.34■□□□□ 0.21
Ms4a6cQ99N08 Tmem132d-201ENSMUST00000044441 6139 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.34■□□□□ 0.21
Ms4a6cQ99N08 Caskin1-201ENSMUST00000024958 6172 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.34■□□□□ 0.21
Ms4a6cQ99N08 Spint1-203ENSMUST00000110817 2323 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.34■□□□□ 0.21
Ms4a6cQ99N08 1700105P06Rik-201ENSMUST00000186160 1772 ntBASIC16.34■□□□□ 0.21
Ms4a6cQ99N08 Rfk-201ENSMUST00000025617 2482 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.34■□□□□ 0.21
Ms4a6cQ99N08 Dynll1-202ENSMUST00000112090 729 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.34■□□□□ 0.21
Ms4a6cQ99N08 Emc8-208ENSMUST00000181950 747 ntTSL 2 BASIC16.34■□□□□ 0.21
Ms4a6cQ99N08 Sds-204ENSMUST00000201684 1288 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.34■□□□□ 0.21
Ms4a6cQ99N08 Arhgap23-203ENSMUST00000121799 5816 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.34■□□□□ 0.21
Ms4a6cQ99N08 Klhl8-201ENSMUST00000031254 3193 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.34■□□□□ 0.21
Ms4a6cQ99N08 Tpm1-211ENSMUST00000113695 1607 ntTSL 3 BASIC16.34■□□□□ 0.21
Ms4a6cQ99N08 Fgfr1-215ENSMUST00000179592 5041 ntTSL 5 BASIC16.34■□□□□ 0.21
Ms4a6cQ99N08 Zswim8-208ENSMUST00000224751 5951 ntAPPRIS ALT2 BASIC16.33■□□□□ 0.21
Ms4a6cQ99N08 Mmp15-201ENSMUST00000034243 5135 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.33■□□□□ 0.21
Ms4a6cQ99N08 Sirt1-201ENSMUST00000020257 3905 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.33■□□□□ 0.21
Ms4a6cQ99N08 1700065D16Rik-202ENSMUST00000188975 506 ntTSL 3 BASIC16.33■□□□□ 0.2
Ms4a6cQ99N08 Pelo-201ENSMUST00000109226 1600 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.33■□□□□ 0.2
Ms4a6cQ99N08 Notch4-201ENSMUST00000015612 6591 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.33■□□□□ 0.2
Ms4a6cQ99N08 Tmem80-208ENSMUST00000145184 1805 ntTSL 5 BASIC16.33■□□□□ 0.2
Ms4a6cQ99N08 Nrxn2-204ENSMUST00000113461 5505 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.32■□□□□ 0.2
Ms4a6cQ99N08 Paxip1-201ENSMUST00000002291 5850 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.32■□□□□ 0.2
Ms4a6cQ99N08 Acad9-205ENSMUST00000196648 552 ntTSL 3 BASIC16.32■□□□□ 0.2
Ms4a6cQ99N08 Uqcrc1-201ENSMUST00000026743 1653 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.32■□□□□ 0.2
Ms4a6cQ99N08 Cbr3-201ENSMUST00000039620 1170 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.32■□□□□ 0.2
Ms4a6cQ99N08 2410002F23Rik-201ENSMUST00000055858 1982 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.32■□□□□ 0.2
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 17.2 ms