Protein–RNA interactions for Protein: Q99MW3

Pramel1, Preferentially expressed antigen in melanoma-like protein 1, mousemouse

Predictions only

Length 458 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Pramel1Q99MW3 Dcaf15-201ENSMUST00000041367 2312 ntTSL 1 (best) BASIC21.46■■□□□ 1.03
Pramel1Q99MW3 Gimap1-201ENSMUST00000054368 1493 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.46■■□□□ 1.03
Pramel1Q99MW3 Susd6-203ENSMUST00000220238 2127 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.46■■□□□ 1.03
Pramel1Q99MW3 Tekt5-201ENSMUST00000043415 1803 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.46■■□□□ 1.03
Pramel1Q99MW3 Mfsd4a-202ENSMUST00000112365 1536 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC21.46■■□□□ 1.03
Pramel1Q99MW3 AC165080.2-201ENSMUST00000217491 1530 ntBASIC21.46■■□□□ 1.03
Pramel1Q99MW3 Smox-207ENSMUST00000110186 2170 ntTSL 1 (best) BASIC21.46■■□□□ 1.03
Pramel1Q99MW3 Tomm40-202ENSMUST00000093552 1577 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.46■■□□□ 1.03
Pramel1Q99MW3 Dtymk-202ENSMUST00000112890 1055 ntTSL 1 (best) BASIC21.46■■□□□ 1.03
Pramel1Q99MW3 Pianp-204ENSMUST00000160704 1116 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC21.46■■□□□ 1.03
Pramel1Q99MW3 Rell2-204ENSMUST00000163591 1057 ntTSL 5 BASIC21.46■■□□□ 1.03
Pramel1Q99MW3 Ntsr2-202ENSMUST00000220892 846 ntTSL 3 BASIC21.46■■□□□ 1.03
Pramel1Q99MW3 Fam58b-201ENSMUST00000059468 1224 ntAPPRIS P1 BASIC21.46■■□□□ 1.03
Pramel1Q99MW3 Deptor-203ENSMUST00000100660 1377 ntTSL 1 (best) BASIC21.46■■□□□ 1.03
Pramel1Q99MW3 St6galnac6-205ENSMUST00000113290 2402 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC21.46■■□□□ 1.03
Pramel1Q99MW3 Arhgef25-205ENSMUST00000218654 2475 ntTSL 5 BASIC21.46■■□□□ 1.03
Pramel1Q99MW3 Rnf149-201ENSMUST00000062525 2492 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.46■■□□□ 1.03
Pramel1Q99MW3 Nisch-201ENSMUST00000022469 5559 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC21.45■■□□□ 1.03
Pramel1Q99MW3 Nrl-203ENSMUST00000178694 1928 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.45■■□□□ 1.02
Pramel1Q99MW3 Mpig6b-202ENSMUST00000174190 729 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.45■■□□□ 1.02
Pramel1Q99MW3 Jsrp1-203ENSMUST00000181039 1108 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC21.45■■□□□ 1.02
Pramel1Q99MW3 Gm18671-201ENSMUST00000214826 683 ntBASIC21.45■■□□□ 1.02
Pramel1Q99MW3 Hes3-202ENSMUST00000218045 962 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC21.45■■□□□ 1.02
Pramel1Q99MW3 Cmc4-201ENSMUST00000033543 992 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.45■■□□□ 1.02
Pramel1Q99MW3 Phf23-202ENSMUST00000101526 1706 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.45■■□□□ 1.02
Pramel1Q99MW3 Rce1-201ENSMUST00000025823 1402 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.45■■□□□ 1.02
Pramel1Q99MW3 March11-201ENSMUST00000126304 2146 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.44■■□□□ 1.02
Pramel1Q99MW3 Fkbp8-201ENSMUST00000075491 1698 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC21.44■■□□□ 1.02
Pramel1Q99MW3 Bag5-202ENSMUST00000160576 1852 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.44■■□□□ 1.02
Pramel1Q99MW3 1700016H13Rik-203ENSMUST00000120108 797 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC21.44■■□□□ 1.02
Pramel1Q99MW3 Gm37179-201ENSMUST00000194862 823 ntBASIC21.44■■□□□ 1.02
Pramel1Q99MW3 Mrpl40-201ENSMUST00000023391 1185 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.44■■□□□ 1.02
Pramel1Q99MW3 Fcrlb-201ENSMUST00000094337 1284 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.44■■□□□ 1.02
Pramel1Q99MW3 Lrrc4b-201ENSMUST00000058667 2728 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.44■■□□□ 1.02
Pramel1Q99MW3 A230087F16Rik-201ENSMUST00000181055 2098 ntTSL 1 (best) BASIC21.44■■□□□ 1.02
Pramel1Q99MW3 Ctage5-203ENSMUST00000170992 2785 ntTSL 1 (best) BASIC21.44■■□□□ 1.02
Pramel1Q99MW3 Wbp1-201ENSMUST00000032111 1419 ntTSL 1 (best) BASIC21.44■■□□□ 1.02
Pramel1Q99MW3 Antxr1-204ENSMUST00000204805 2156 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC21.44■■□□□ 1.02
Pramel1Q99MW3 Terf2-204ENSMUST00000133925 2666 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC21.43■■□□□ 1.02
Pramel1Q99MW3 AC153962.1-201ENSMUST00000218530 1948 ntBASIC21.43■■□□□ 1.02
Pramel1Q99MW3 Uap1-201ENSMUST00000027981 2283 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC21.43■■□□□ 1.02
Pramel1Q99MW3 Rnf19b-206ENSMUST00000168461 2532 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC21.43■■□□□ 1.02
Pramel1Q99MW3 Gm20621-202ENSMUST00000176618 1234 ntTSL 1 (best) BASIC21.43■■□□□ 1.02
Pramel1Q99MW3 Arl10-201ENSMUST00000026988 1046 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.43■■□□□ 1.02
Pramel1Q99MW3 Crh-201ENSMUST00000061294 1320 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.43■■□□□ 1.02
Pramel1Q99MW3 Zbtb11os1-201ENSMUST00000186480 1350 ntBASIC21.43■■□□□ 1.02
Pramel1Q99MW3 Nckap1-201ENSMUST00000028386 4469 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.43■■□□□ 1.02
Pramel1Q99MW3 H2afj-201ENSMUST00000074556 1831 ntAPPRIS P2 BASIC21.43■■□□□ 1.02
Pramel1Q99MW3 Spats2-201ENSMUST00000063517 3065 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.42■■□□□ 1.02
Pramel1Q99MW3 Phactr2-202ENSMUST00000105543 2735 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC21.42■■□□□ 1.02
Pramel1Q99MW3 Syt6-205ENSMUST00000121834 1710 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.42■■□□□ 1.02
Pramel1Q99MW3 Plac9b-203ENSMUST00000184142 1040 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.42■■□□□ 1.02
Pramel1Q99MW3 Bsg-201ENSMUST00000067036 1526 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.42■■□□□ 1.02
Pramel1Q99MW3 Triobp-201ENSMUST00000109687 2570 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.42■■□□□ 1.02
Pramel1Q99MW3 Rasl11b-201ENSMUST00000051937 1812 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.41■■□□□ 1.02
Pramel1Q99MW3 Prmt1-202ENSMUST00000107843 1508 ntTSL 1 (best) BASIC21.41■■□□□ 1.02
Pramel1Q99MW3 Gm11421-201ENSMUST00000122124 294 ntBASIC21.41■■□□□ 1.02
Pramel1Q99MW3 Neurl1b-203ENSMUST00000183077 1084 ntTSL 5 BASIC21.41■■□□□ 1.02
Pramel1Q99MW3 Hoxc13-201ENSMUST00000001700 2461 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.41■■□□□ 1.02
Pramel1Q99MW3 Ppp1cc-202ENSMUST00000102528 2384 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.41■■□□□ 1.02
Pramel1Q99MW3 Arrdc2-201ENSMUST00000002989 2355 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.41■■□□□ 1.02
Pramel1Q99MW3 Ube2e3-201ENSMUST00000028398 2249 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.41■■□□□ 1.02
Pramel1Q99MW3 Zcchc2-202ENSMUST00000119166 6368 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.41■■□□□ 1.02
Pramel1Q99MW3 Gm43653-201ENSMUST00000198136 1608 ntTSL 3 BASIC21.4■■□□□ 1.02
Pramel1Q99MW3 Wdsub1-202ENSMUST00000102751 1526 ntTSL 1 (best) BASIC21.4■■□□□ 1.02
Pramel1Q99MW3 Evi5l-209ENSMUST00000177053 1542 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC21.4■■□□□ 1.02
Pramel1Q99MW3 Acot5-202ENSMUST00000072505 1401 ntTSL 1 (best) BASIC21.4■■□□□ 1.02
Pramel1Q99MW3 1700023F06Rik-202ENSMUST00000107026 1127 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.4■■□□□ 1.02
Pramel1Q99MW3 Gm10033-202ENSMUST00000211874 928 ntBASIC21.4■■□□□ 1.02
Pramel1Q99MW3 Zfp428-201ENSMUST00000071361 1182 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC21.4■■□□□ 1.02
Pramel1Q99MW3 Chrac1-201ENSMUST00000089765 871 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC21.4■■□□□ 1.02
Pramel1Q99MW3 Hist1h2ao-201ENSMUST00000091745 480 ntAPPRIS P1 BASIC21.4■■□□□ 1.02
Pramel1Q99MW3 Tshz1-201ENSMUST00000060303 5656 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.4■■□□□ 1.02
Pramel1Q99MW3 Scarb1-202ENSMUST00000111390 2367 ntTSL 1 (best) BASIC21.4■■□□□ 1.02
Pramel1Q99MW3 Prpsap2-204ENSMUST00000168115 1771 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.4■■□□□ 1.02
Pramel1Q99MW3 Insc-208ENSMUST00000169913 2321 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC21.4■■□□□ 1.02
Pramel1Q99MW3 Abhd17b-201ENSMUST00000052556 2475 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC21.39■■□□□ 1.02
Pramel1Q99MW3 Stk3-202ENSMUST00000067033 2471 ntTSL 1 (best) BASIC21.39■■□□□ 1.02
Pramel1Q99MW3 Tmem222-201ENSMUST00000105907 1484 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.39■■□□□ 1.02
Pramel1Q99MW3 Cdc20-201ENSMUST00000006565 1793 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.39■■□□□ 1.01
Pramel1Q99MW3 Foxo6-201ENSMUST00000102656 2615 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.39■■□□□ 1.01
Pramel1Q99MW3 Sdccag3-204ENSMUST00000114102 2193 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC21.39■■□□□ 1.01
Pramel1Q99MW3 Gm4553-201ENSMUST00000168049 714 ntAPPRIS ALT2 BASIC21.39■■□□□ 1.01
Pramel1Q99MW3 Ccdc85b-201ENSMUST00000179549 609 ntAPPRIS P1 BASIC21.39■■□□□ 1.01
Pramel1Q99MW3 Rexo5-201ENSMUST00000033218 1966 ntTSL 1 (best) BASIC21.39■■□□□ 1.01
Pramel1Q99MW3 Stn1-201ENSMUST00000049369 1992 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.39■■□□□ 1.01
Pramel1Q99MW3 Adrm1-201ENSMUST00000061437 1535 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.39■■□□□ 1.01
Pramel1Q99MW3 2010300C02Rik-203ENSMUST00000162875 4634 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.38■■□□□ 1.01
Pramel1Q99MW3 Kcnd3os-201ENSMUST00000130683 1091 ntTSL 1 (best) BASIC21.38■■□□□ 1.01
Pramel1Q99MW3 AV356131-201ENSMUST00000206201 750 ntBASIC21.38■■□□□ 1.01
Pramel1Q99MW3 Rer1-201ENSMUST00000030914 1596 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.38■■□□□ 1.01
Pramel1Q99MW3 Phf14-203ENSMUST00000115511 3336 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC21.38■■□□□ 1.01
Pramel1Q99MW3 Tle1-205ENSMUST00000107337 2067 ntTSL 1 (best) BASIC21.38■■□□□ 1.01
Pramel1Q99MW3 Luc7l3-203ENSMUST00000107821 2050 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC21.38■■□□□ 1.01
Pramel1Q99MW3 Gm5913-201ENSMUST00000119397 1399 ntBASIC21.37■■□□□ 1.01
Pramel1Q99MW3 Htr7-201ENSMUST00000099505 1606 ntTSL 5 BASIC21.37■■□□□ 1.01
Pramel1Q99MW3 Cbx3-201ENSMUST00000031862 1889 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.37■■□□□ 1.01
Pramel1Q99MW3 Gm42778-201ENSMUST00000199644 553 ntBASIC21.37■■□□□ 1.01
Pramel1Q99MW3 Cmtm7-204ENSMUST00000216760 665 ntTSL 1 (best) BASIC21.37■■□□□ 1.01
Pramel1Q99MW3 H2-Ke6-201ENSMUST00000045467 965 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.37■■□□□ 1.01
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 12.6 ms