Protein–RNA interactions for Protein: Q99MN9

Pccb, Propionyl-CoA carboxylase beta chain, mitochondrial, mousemouse

Predictions only

Length 541 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
PccbQ99MN9 Prrt2-206ENSMUST00000202045 429 ntTSL 5 BASIC17.81■□□□□ 0.44
PccbQ99MN9 Clec3b-201ENSMUST00000026890 992 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.81■□□□□ 0.44
PccbQ99MN9 4930524J08Rik-201ENSMUST00000046721 603 ntAPPRIS P1 BASIC17.81■□□□□ 0.44
PccbQ99MN9 Adamts18-201ENSMUST00000093113 5642 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.81■□□□□ 0.44
PccbQ99MN9 Setd4-202ENSMUST00000113951 1826 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.81■□□□□ 0.44
PccbQ99MN9 P2ry2-202ENSMUST00000178340 2137 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.81■□□□□ 0.44
PccbQ99MN9 Hoxb6-202ENSMUST00000173432 1964 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.8■□□□□ 0.44
PccbQ99MN9 Sac3d1-201ENSMUST00000113533 1374 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.8■□□□□ 0.44
PccbQ99MN9 Uqcrfs1-201ENSMUST00000042834 1363 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.8■□□□□ 0.44
PccbQ99MN9 Gm37035-201ENSMUST00000194809 2148 ntBASIC17.8■□□□□ 0.44
PccbQ99MN9 Wtap-204ENSMUST00000159986 3187 ntTSL 1 (best) BASIC17.8■□□□□ 0.44
PccbQ99MN9 Ccnd3-218ENSMUST00000183177 2060 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.8■□□□□ 0.44
PccbQ99MN9 Gm6217-201ENSMUST00000222182 829 ntAPPRIS P1 BASIC17.8■□□□□ 0.44
PccbQ99MN9 Bloc1s5-202ENSMUST00000224115 1020 ntBASIC17.8■□□□□ 0.44
PccbQ99MN9 Slc9a7-201ENSMUST00000072451 2512 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC17.8■□□□□ 0.44
PccbQ99MN9 Klc3-201ENSMUST00000047170 1901 ntTSL 1 (best) BASIC17.8■□□□□ 0.44
PccbQ99MN9 Rasgrp2-206ENSMUST00000113472 2124 ntTSL 1 (best) BASIC17.8■□□□□ 0.44
PccbQ99MN9 Kifc3-201ENSMUST00000034240 3277 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC17.8■□□□□ 0.44
PccbQ99MN9 Celf6-202ENSMUST00000118164 1583 ntTSL 1 (best) BASIC17.79■□□□□ 0.44
PccbQ99MN9 Ube2h-202ENSMUST00000102993 4657 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.79■□□□□ 0.44
PccbQ99MN9 Mrgbp-201ENSMUST00000029085 1510 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.79■□□□□ 0.44
PccbQ99MN9 Gm13238-201ENSMUST00000117655 780 ntBASIC17.79■□□□□ 0.44
PccbQ99MN9 Tfpt-204ENSMUST00000155592 1091 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.79■□□□□ 0.44
PccbQ99MN9 Gm10399-202ENSMUST00000202768 748 ntBASIC17.79■□□□□ 0.44
PccbQ99MN9 Iglon5-201ENSMUST00000107974 2622 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.79■□□□□ 0.44
PccbQ99MN9 Kansl1-204ENSMUST00000106972 5427 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC17.78■□□□□ 0.44
PccbQ99MN9 Tpm1-212ENSMUST00000113696 1714 ntTSL 2 BASIC17.78■□□□□ 0.44
PccbQ99MN9 Neurl4-213ENSMUST00000177476 4952 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.78■□□□□ 0.44
PccbQ99MN9 Sema6d-202ENSMUST00000076335 6276 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.78■□□□□ 0.44
PccbQ99MN9 Ptger3-202ENSMUST00000173533 2097 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.78■□□□□ 0.44
PccbQ99MN9 Prss50-201ENSMUST00000051097 1456 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.78■□□□□ 0.44
PccbQ99MN9 Dleu2-209ENSMUST00000182957 352 ntTSL 2 BASIC17.78■□□□□ 0.44
PccbQ99MN9 Gm5921-201ENSMUST00000075898 882 ntBASIC17.78■□□□□ 0.44
PccbQ99MN9 Zbed3-202ENSMUST00000221807 1945 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.78■□□□□ 0.44
PccbQ99MN9 Htra2-201ENSMUST00000089645 1725 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC17.78■□□□□ 0.44
PccbQ99MN9 Fam216a-201ENSMUST00000031419 1388 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.78■□□□□ 0.44
PccbQ99MN9 Desi2-204ENSMUST00000161075 2590 ntTSL 1 (best) BASIC17.78■□□□□ 0.44
PccbQ99MN9 Exoc3l2-201ENSMUST00000011407 2200 ntTSL 5 BASIC17.78■□□□□ 0.44
PccbQ99MN9 Ovol2-201ENSMUST00000037423 1539 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC17.77■□□□□ 0.44
PccbQ99MN9 Irx2-201ENSMUST00000074372 2625 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.77■□□□□ 0.44
PccbQ99MN9 Cradd-205ENSMUST00000220279 1613 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.77■□□□□ 0.44
PccbQ99MN9 Ntn5-202ENSMUST00000182750 1758 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.77■□□□□ 0.44
PccbQ99MN9 Rapgef1-203ENSMUST00000102872 6402 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.77■□□□□ 0.44
PccbQ99MN9 Bloc1s2-201ENSMUST00000079033 878 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.77■□□□□ 0.44
PccbQ99MN9 Smim19-202ENSMUST00000163774 1435 ntTSL 1 (best) BASIC17.77■□□□□ 0.44
PccbQ99MN9 Gab1-201ENSMUST00000034150 4870 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.77■□□□□ 0.44
PccbQ99MN9 Trp73-204ENSMUST00000105644 5042 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.77■□□□□ 0.44
PccbQ99MN9 Hras-201ENSMUST00000026572 2828 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.77■□□□□ 0.44
PccbQ99MN9 Dmrta2-201ENSMUST00000061187 2922 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.77■□□□□ 0.43
PccbQ99MN9 Ndel1-201ENSMUST00000018880 2382 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.76■□□□□ 0.43
PccbQ99MN9 Znrf1-204ENSMUST00000171182 5466 ntTSL 3 BASIC17.76■□□□□ 0.43
PccbQ99MN9 Barhl1-203ENSMUST00000113849 2102 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.76■□□□□ 0.43
PccbQ99MN9 Gm14207-203ENSMUST00000156538 988 ntTSL 2 BASIC17.76■□□□□ 0.43
PccbQ99MN9 Vegfa-211ENSMUST00000167860 975 ntTSL 1 (best) BASIC17.76■□□□□ 0.43
PccbQ99MN9 Vegfa-213ENSMUST00000217017 1179 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC17.76■□□□□ 0.43
PccbQ99MN9 Cited4-201ENSMUST00000094814 1249 ntAPPRIS P1 BASIC17.76■□□□□ 0.43
PccbQ99MN9 Pde7a-202ENSMUST00000099195 6298 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC17.76■□□□□ 0.43
PccbQ99MN9 Gm15043-201ENSMUST00000118843 1543 ntBASIC17.76■□□□□ 0.43
PccbQ99MN9 Ccdc34-201ENSMUST00000028580 2070 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.76■□□□□ 0.43
PccbQ99MN9 Cdkl3-204ENSMUST00000109077 2605 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC17.76■□□□□ 0.43
PccbQ99MN9 Tmem41a-201ENSMUST00000023562 1359 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.76■□□□□ 0.43
PccbQ99MN9 Tedc1-201ENSMUST00000049271 2441 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.76■□□□□ 0.43
PccbQ99MN9 Gm26660-201ENSMUST00000181582 2543 ntTSL 1 (best) BASIC17.75■□□□□ 0.43
PccbQ99MN9 Rab5c-201ENSMUST00000019317 1967 ntTSL 1 (best) BASIC17.75■□□□□ 0.43
PccbQ99MN9 Gm15441-202ENSMUST00000107095 1653 ntTSL 1 (best) BASIC17.75■□□□□ 0.43
PccbQ99MN9 Uqcrc1-201ENSMUST00000026743 1653 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.75■□□□□ 0.43
PccbQ99MN9 Slc25a38-201ENSMUST00000035106 1791 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.75■□□□□ 0.43
PccbQ99MN9 Gdf7-202ENSMUST00000220073 1399 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.75■□□□□ 0.43
PccbQ99MN9 Pus1-203ENSMUST00000086643 1868 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC17.75■□□□□ 0.43
PccbQ99MN9 Adrb1-201ENSMUST00000038949 2491 ntAPPRIS P1 BASIC17.75■□□□□ 0.43
PccbQ99MN9 Gga2-201ENSMUST00000033160 4915 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.75■□□□□ 0.43
PccbQ99MN9 Rora-202ENSMUST00000113624 2591 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.75■□□□□ 0.43
PccbQ99MN9 Gramd1a-202ENSMUST00000085636 2543 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC17.74■□□□□ 0.43
PccbQ99MN9 Sys1-202ENSMUST00000109352 2001 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.74■□□□□ 0.43
PccbQ99MN9 Sp5-201ENSMUST00000100043 2100 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.74■□□□□ 0.43
PccbQ99MN9 Eif2ak4-207ENSMUST00000110877 2134 ntTSL 1 (best) BASIC17.74■□□□□ 0.43
PccbQ99MN9 Slc39a13-203ENSMUST00000111436 1291 ntTSL 1 (best) BASIC17.74■□□□□ 0.43
PccbQ99MN9 Psmg1-202ENSMUST00000117044 807 ntTSL 5 BASIC17.74■□□□□ 0.43
PccbQ99MN9 Ssbp1-205ENSMUST00000121360 1188 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.74■□□□□ 0.43
PccbQ99MN9 Vwc2-201ENSMUST00000056344 1350 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.74■□□□□ 0.43
PccbQ99MN9 Atmin-201ENSMUST00000109099 4877 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.74■□□□□ 0.43
PccbQ99MN9 Prkar2b-201ENSMUST00000003079 1657 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.74■□□□□ 0.43
PccbQ99MN9 Ltk-202ENSMUST00000082130 2767 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.73■□□□□ 0.43
PccbQ99MN9 Gm17324-201ENSMUST00000165499 922 ntAPPRIS P1 BASIC17.73■□□□□ 0.43
PccbQ99MN9 Pcf11-204ENSMUST00000208058 461 ntTSL 5 BASIC17.73■□□□□ 0.43
PccbQ99MN9 Gm18190-203ENSMUST00000209944 389 ntTSL 2 BASIC17.73■□□□□ 0.43
PccbQ99MN9 Cacnb1-203ENSMUST00000103144 2236 ntTSL 5 BASIC17.73■□□□□ 0.43
PccbQ99MN9 C1qtnf5-204ENSMUST00000114821 1365 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC17.73■□□□□ 0.43
PccbQ99MN9 Tmprss5-205ENSMUST00000170246 1491 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.73■□□□□ 0.43
PccbQ99MN9 Shox2-201ENSMUST00000029422 3079 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.73■□□□□ 0.43
PccbQ99MN9 Zbtb7a-203ENSMUST00000119606 1841 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.72■□□□□ 0.43
PccbQ99MN9 Uap1-202ENSMUST00000111350 2311 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC17.72■□□□□ 0.43
PccbQ99MN9 Prkar1b-201ENSMUST00000026973 2637 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.72■□□□□ 0.43
PccbQ99MN9 Lgr4-201ENSMUST00000046548 5060 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC17.72■□□□□ 0.43
PccbQ99MN9 Mal2-201ENSMUST00000025356 2950 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.72■□□□□ 0.43
PccbQ99MN9 Qsox2-201ENSMUST00000036187 2559 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.72■□□□□ 0.43
PccbQ99MN9 Vgf-202ENSMUST00000186451 2277 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.72■□□□□ 0.43
PccbQ99MN9 Sephs1-202ENSMUST00000115019 2933 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.72■□□□□ 0.43
PccbQ99MN9 Chkb-201ENSMUST00000023289 1707 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.72■□□□□ 0.43
PccbQ99MN9 Fpgs-201ENSMUST00000028148 2273 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.72■□□□□ 0.43
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 21 ms