Protein–RNA interactions for Protein: Q99M87

Dnaja3, DnaJ homolog subfamily A member 3, mitochondrial, mousemouse

Predictions only

Length 480 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Dnaja3Q99M87 H2-Q2-201ENSMUST00000074806 1262 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.76■□□□□ 0.43
Dnaja3Q99M87 Cdc42ep5-201ENSMUST00000076831 1025 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.76■□□□□ 0.43
Dnaja3Q99M87 Eml2-202ENSMUST00000117338 2765 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC17.76■□□□□ 0.43
Dnaja3Q99M87 Gab2-202ENSMUST00000206791 2065 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.76■□□□□ 0.43
Dnaja3Q99M87 Six5-201ENSMUST00000049454 3007 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.76■□□□□ 0.43
Dnaja3Q99M87 Zc3h8-201ENSMUST00000028866 1624 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.76■□□□□ 0.43
Dnaja3Q99M87 E530011L22Rik-202ENSMUST00000216791 2007 ntTSL 1 (best) BASIC17.76■□□□□ 0.43
Dnaja3Q99M87 Gm10125-201ENSMUST00000074702 2286 ntTSL 1 (best) BASIC17.75■□□□□ 0.43
Dnaja3Q99M87 Ntf5-201ENSMUST00000058879 1963 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.75■□□□□ 0.43
Dnaja3Q99M87 Snx21-204ENSMUST00000172577 1825 ntTSL 2 BASIC17.75■□□□□ 0.43
Dnaja3Q99M87 4930507D05Rik-201ENSMUST00000181110 1834 ntAPPRIS P1 BASIC17.75■□□□□ 0.43
Dnaja3Q99M87 Dynll2-201ENSMUST00000020775 2476 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.75■□□□□ 0.43
Dnaja3Q99M87 Cbln2-201ENSMUST00000068423 2475 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.75■□□□□ 0.43
Dnaja3Q99M87 Hnrnpd-211ENSMUST00000172361 6811 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC17.75■□□□□ 0.43
Dnaja3Q99M87 Pdcd7-201ENSMUST00000048184 2419 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC17.75■□□□□ 0.43
Dnaja3Q99M87 Gm28417-201ENSMUST00000185218 785 ntTSL 3 BASIC17.75■□□□□ 0.43
Dnaja3Q99M87 4930426I24Rik-202ENSMUST00000217797 1232 ntBASIC17.75■□□□□ 0.43
Dnaja3Q99M87 Chadl-201ENSMUST00000072910 2548 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.75■□□□□ 0.43
Dnaja3Q99M87 Camk2b-201ENSMUST00000002817 1872 ntTSL 5 BASIC17.75■□□□□ 0.43
Dnaja3Q99M87 Galr2-201ENSMUST00000055872 1940 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.74■□□□□ 0.43
Dnaja3Q99M87 Ube4b-202ENSMUST00000103212 5626 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.74■□□□□ 0.43
Dnaja3Q99M87 Timm8a1-201ENSMUST00000054213 1421 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.74■□□□□ 0.43
Dnaja3Q99M87 Shox2-201ENSMUST00000029422 3079 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.74■□□□□ 0.43
Dnaja3Q99M87 Tsc22d1-203ENSMUST00000101618 1043 ntTSL 1 (best) BASIC17.74■□□□□ 0.43
Dnaja3Q99M87 Map1lc3a-201ENSMUST00000029128 1112 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.74■□□□□ 0.43
Dnaja3Q99M87 Gab1-201ENSMUST00000034150 4870 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.74■□□□□ 0.43
Dnaja3Q99M87 Mapk11-201ENSMUST00000088823 2440 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.73■□□□□ 0.43
Dnaja3Q99M87 Hdgfl3-202ENSMUST00000107305 5887 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC17.73■□□□□ 0.43
Dnaja3Q99M87 Stk3-202ENSMUST00000067033 2471 ntTSL 1 (best) BASIC17.73■□□□□ 0.43
Dnaja3Q99M87 Fbxw2-202ENSMUST00000091020 1838 ntTSL 1 (best) BASIC17.73■□□□□ 0.43
Dnaja3Q99M87 Rufy1-201ENSMUST00000020643 2688 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.73■□□□□ 0.43
Dnaja3Q99M87 Rem2-201ENSMUST00000164697 1194 ntTSL 5 BASIC17.73■□□□□ 0.43
Dnaja3Q99M87 Slc39a7-203ENSMUST00000169397 2107 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.73■□□□□ 0.43
Dnaja3Q99M87 Gm5913-201ENSMUST00000119397 1399 ntBASIC17.73■□□□□ 0.43
Dnaja3Q99M87 Wnk2-205ENSMUST00000110097 6882 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC17.73■□□□□ 0.43
Dnaja3Q99M87 Wnk2-203ENSMUST00000091623 6897 ntAPPRIS P4 TSL 5 BASIC17.73■□□□□ 0.43
Dnaja3Q99M87 Letm2-209ENSMUST00000210810 1538 ntTSL 1 (best) BASIC17.72■□□□□ 0.43
Dnaja3Q99M87 Slbp-201ENSMUST00000057551 1906 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.72■□□□□ 0.43
Dnaja3Q99M87 Hck-202ENSMUST00000109799 2092 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.72■□□□□ 0.43
Dnaja3Q99M87 Hck-203ENSMUST00000189688 2090 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.72■□□□□ 0.43
Dnaja3Q99M87 Hck-201ENSMUST00000003370 2092 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.72■□□□□ 0.43
Dnaja3Q99M87 Cerk-201ENSMUST00000044332 4518 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.72■□□□□ 0.43
Dnaja3Q99M87 Gm46212-201ENSMUST00000220256 1003 ntTSL 5 BASIC17.72■□□□□ 0.43
Dnaja3Q99M87 Ptms-201ENSMUST00000032216 1149 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.72■□□□□ 0.43
Dnaja3Q99M87 Fam89b-201ENSMUST00000099955 1197 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.72■□□□□ 0.43
Dnaja3Q99M87 L3mbtl4-201ENSMUST00000093007 2445 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.72■□□□□ 0.43
Dnaja3Q99M87 Tpst2-201ENSMUST00000031287 1835 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.72■□□□□ 0.43
Dnaja3Q99M87 Kazald1-202ENSMUST00000111948 1625 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.72■□□□□ 0.43
Dnaja3Q99M87 Gm43653-201ENSMUST00000198136 1608 ntTSL 3 BASIC17.72■□□□□ 0.43
Dnaja3Q99M87 Gtpbp2-217ENSMUST00000172170 2587 ntTSL 5 BASIC17.72■□□□□ 0.43
Dnaja3Q99M87 Dmrta2-201ENSMUST00000061187 2922 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.71■□□□□ 0.43
Dnaja3Q99M87 Cav2-201ENSMUST00000000058 2733 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.71■□□□□ 0.43
Dnaja3Q99M87 Kansl1-204ENSMUST00000106972 5427 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC17.71■□□□□ 0.43
Dnaja3Q99M87 A030005L19Rik-201ENSMUST00000220768 806 ntAPPRIS P1 BASIC17.71■□□□□ 0.43
Dnaja3Q99M87 Plekhj1-201ENSMUST00000036805 1260 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.71■□□□□ 0.43
Dnaja3Q99M87 Tcte2-201ENSMUST00000053376 1105 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.71■□□□□ 0.43
Dnaja3Q99M87 Pbx1-201ENSMUST00000064438 1020 ntTSL 1 (best) BASIC17.71■□□□□ 0.43
Dnaja3Q99M87 Tpm1-212ENSMUST00000113696 1714 ntTSL 2 BASIC17.71■□□□□ 0.43
Dnaja3Q99M87 Ahcyl1-201ENSMUST00000029490 3863 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.71■□□□□ 0.43
Dnaja3Q99M87 Efr3a-203ENSMUST00000172756 1411 ntTSL 1 (best) BASIC17.71■□□□□ 0.43
Dnaja3Q99M87 Rims1-209ENSMUST00000218140 1434 ntTSL 5 BASIC17.71■□□□□ 0.43
Dnaja3Q99M87 Hnrnpa3-204ENSMUST00000111964 1654 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.71■□□□□ 0.42
Dnaja3Q99M87 Bfsp1-201ENSMUST00000028907 2372 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.71■□□□□ 0.42
Dnaja3Q99M87 Stim2-201ENSMUST00000117661 4934 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC17.71■□□□□ 0.42
Dnaja3Q99M87 Rasl11b-201ENSMUST00000051937 1812 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.7■□□□□ 0.42
Dnaja3Q99M87 Gm9934-201ENSMUST00000098303 2077 ntTSL 1 (best) BASIC17.7■□□□□ 0.42
Dnaja3Q99M87 Cntfr-203ENSMUST00000102961 1995 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.7■□□□□ 0.42
Dnaja3Q99M87 E130311K13Rik-201ENSMUST00000061706 1640 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.7■□□□□ 0.42
Dnaja3Q99M87 Bcl3-201ENSMUST00000120537 1850 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.7■□□□□ 0.42
Dnaja3Q99M87 Ubxn2a-203ENSMUST00000142867 2146 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.7■□□□□ 0.42
Dnaja3Q99M87 Snrpa1-206ENSMUST00000153609 1248 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.7■□□□□ 0.42
Dnaja3Q99M87 Rxrb-201ENSMUST00000044858 2623 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC17.7■□□□□ 0.42
Dnaja3Q99M87 Smad2-205ENSMUST00000168423 2857 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.69■□□□□ 0.42
Dnaja3Q99M87 Slc9a3r2-201ENSMUST00000002572 2118 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.69■□□□□ 0.42
Dnaja3Q99M87 Lsm12-201ENSMUST00000021297 2256 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.69■□□□□ 0.42
Dnaja3Q99M87 Rnf8-201ENSMUST00000024817 2077 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.69■□□□□ 0.42
Dnaja3Q99M87 Gm11837-201ENSMUST00000136992 876 ntTSL 2 BASIC17.69■□□□□ 0.42
Dnaja3Q99M87 Kiss1-203ENSMUST00000193888 624 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC17.69■□□□□ 0.42
Dnaja3Q99M87 Alx3-201ENSMUST00000014747 1874 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.69■□□□□ 0.42
Dnaja3Q99M87 Naxd-202ENSMUST00000177955 1307 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.69■□□□□ 0.42
Dnaja3Q99M87 Nol4l-201ENSMUST00000035346 6399 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.69■□□□□ 0.42
Dnaja3Q99M87 Bcas2-201ENSMUST00000005830 1467 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.69■□□□□ 0.42
Dnaja3Q99M87 Fance-202ENSMUST00000114801 1751 ntTSL 1 (best) BASIC17.68■□□□□ 0.42
Dnaja3Q99M87 Itga9-201ENSMUST00000044165 7020 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.68■□□□□ 0.42
Dnaja3Q99M87 Mcam-201ENSMUST00000034650 2989 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC17.68■□□□□ 0.42
Dnaja3Q99M87 Ubtd1-201ENSMUST00000026170 1527 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.68■□□□□ 0.42
Dnaja3Q99M87 Bsg-201ENSMUST00000067036 1526 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.68■□□□□ 0.42
Dnaja3Q99M87 Elavl1-201ENSMUST00000098950 5743 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.68■□□□□ 0.42
Dnaja3Q99M87 Yjefn3-202ENSMUST00000152938 785 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.68■□□□□ 0.42
Dnaja3Q99M87 Gm22238-201ENSMUST00000175222 88 ntBASIC17.68■□□□□ 0.42
Dnaja3Q99M87 Gm10685-201ENSMUST00000196120 433 ntTSL 3 BASIC17.68■□□□□ 0.42
Dnaja3Q99M87 Ncoa7-206ENSMUST00000215725 1445 ntTSL 1 (best) BASIC17.68■□□□□ 0.42
Dnaja3Q99M87 Slc16a11-205ENSMUST00000126388 1938 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.68■□□□□ 0.42
Dnaja3Q99M87 Vamp4-204ENSMUST00000135241 1461 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.68■□□□□ 0.42
Dnaja3Q99M87 Qtrt1-201ENSMUST00000002902 1316 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.68■□□□□ 0.42
Dnaja3Q99M87 Rcan3-201ENSMUST00000030606 5111 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.68■□□□□ 0.42
Dnaja3Q99M87 Socs2-214ENSMUST00000172070 2153 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC17.67■□□□□ 0.42
Dnaja3Q99M87 Hras-201ENSMUST00000026572 2828 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.67■□□□□ 0.42
Dnaja3Q99M87 Kcng2-201ENSMUST00000077962 2813 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.67■□□□□ 0.42
Dnaja3Q99M87 Olfm1-204ENSMUST00000113920 2513 ntTSL 1 (best) BASIC17.67■□□□□ 0.42
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 118.5 ms