Protein–RNA interactions for Protein: Q99LZ3

Gins4, DNA replication complex GINS protein SLD5, mousemouse

Predictions only

Length 223 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Gins4Q99LZ3 Dennd3-201ENSMUST00000043414 5299 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.07■□□□□ 0.64
Gins4Q99LZ3 Exoc3l2-201ENSMUST00000011407 2200 ntTSL 5 BASIC19.07■□□□□ 0.64
Gins4Q99LZ3 Dynlrb1-204ENSMUST00000150602 788 ntTSL 2 BASIC19.07■□□□□ 0.64
Gins4Q99LZ3 Gm27253-201ENSMUST00000183670 367 ntTSL 1 (best) BASIC19.07■□□□□ 0.64
Gins4Q99LZ3 Whrn-204ENSMUST00000095037 2419 ntTSL 1 (best) BASIC19.07■□□□□ 0.64
Gins4Q99LZ3 Actr3b-201ENSMUST00000088244 1712 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.07■□□□□ 0.64
Gins4Q99LZ3 Gm16933-201ENSMUST00000141741 2169 ntTSL 1 (best) BASIC19.07■□□□□ 0.64
Gins4Q99LZ3 Mpnd-208ENSMUST00000159996 1444 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC19.07■□□□□ 0.64
Gins4Q99LZ3 Jdp2-201ENSMUST00000050687 1643 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.07■□□□□ 0.64
Gins4Q99LZ3 Ankrd40-203ENSMUST00000107818 3487 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC19.06■□□□□ 0.64
Gins4Q99LZ3 Syt5-201ENSMUST00000065957 1750 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.06■□□□□ 0.64
Gins4Q99LZ3 Fbxo24-201ENSMUST00000031732 2161 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.06■□□□□ 0.64
Gins4Q99LZ3 Magi2-203ENSMUST00000115267 4478 ntTSL 1 (best) BASIC19.06■□□□□ 0.64
Gins4Q99LZ3 Ccdc149-202ENSMUST00000198008 2470 ntTSL 5 BASIC19.06■□□□□ 0.64
Gins4Q99LZ3 Uqcrc1-201ENSMUST00000026743 1653 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.06■□□□□ 0.64
Gins4Q99LZ3 Pradc1-201ENSMUST00000032080 1038 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.06■□□□□ 0.64
Gins4Q99LZ3 Larp1-203ENSMUST00000178636 6617 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC19.06■□□□□ 0.64
Gins4Q99LZ3 Spry1-202ENSMUST00000108107 2773 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.05■□□□□ 0.64
Gins4Q99LZ3 Stau2-201ENSMUST00000027052 2763 ntTSL 1 (best) BASIC19.05■□□□□ 0.64
Gins4Q99LZ3 Podxl-201ENSMUST00000026698 5379 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.05■□□□□ 0.64
Gins4Q99LZ3 Ercc6l2-208ENSMUST00000144763 1820 ntTSL 1 (best) BASIC19.05■□□□□ 0.64
Gins4Q99LZ3 Shisa5-201ENSMUST00000026737 1834 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC19.05■□□□□ 0.64
Gins4Q99LZ3 Cog1-202ENSMUST00000063776 1476 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC19.05■□□□□ 0.64
Gins4Q99LZ3 Pelo-201ENSMUST00000109226 1600 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.05■□□□□ 0.64
Gins4Q99LZ3 Pdlim4-201ENSMUST00000018755 1182 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.05■□□□□ 0.64
Gins4Q99LZ3 Asf1a-205ENSMUST00000219282 1150 ntTSL 5 BASIC19.05■□□□□ 0.64
Gins4Q99LZ3 Gm7276-201ENSMUST00000097520 1252 ntAPPRIS P1 BASIC19.05■□□□□ 0.64
Gins4Q99LZ3 Mgat2-201ENSMUST00000060579 2614 ntAPPRIS P1 BASIC19.05■□□□□ 0.64
Gins4Q99LZ3 Ttc9b-201ENSMUST00000008088 2052 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.05■□□□□ 0.64
Gins4Q99LZ3 4930524B15Rik-201ENSMUST00000102829 2000 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.05■□□□□ 0.64
Gins4Q99LZ3 Rnpep-201ENSMUST00000074357 2171 ntTSL 1 (best) BASIC19.05■□□□□ 0.64
Gins4Q99LZ3 Mreg-201ENSMUST00000048860 2284 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.04■□□□□ 0.64
Gins4Q99LZ3 Stradb-202ENSMUST00000114296 1348 ntTSL 1 (best) BASIC19.04■□□□□ 0.64
Gins4Q99LZ3 Hrh3-201ENSMUST00000056480 2706 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC19.04■□□□□ 0.64
Gins4Q99LZ3 Spg7-211ENSMUST00000153285 2481 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC19.04■□□□□ 0.64
Gins4Q99LZ3 Tex264-202ENSMUST00000163441 1896 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.04■□□□□ 0.64
Gins4Q99LZ3 Dok6-201ENSMUST00000097495 1441 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.04■□□□□ 0.64
Gins4Q99LZ3 Sugct-201ENSMUST00000068545 1701 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.03■□□□□ 0.64
Gins4Q99LZ3 Psmd7-201ENSMUST00000044106 1581 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.03■□□□□ 0.64
Gins4Q99LZ3 Cacul1-203ENSMUST00000166712 5700 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC19.03■□□□□ 0.64
Gins4Q99LZ3 Tceal6-201ENSMUST00000033783 1114 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.03■□□□□ 0.64
Gins4Q99LZ3 Kiss1-201ENSMUST00000007433 779 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC19.03■□□□□ 0.64
Gins4Q99LZ3 Schip1-205ENSMUST00000182532 2059 ntTSL 1 (best) BASIC19.03■□□□□ 0.64
Gins4Q99LZ3 Man2c1os-201ENSMUST00000125333 1910 ntTSL 1 (best) BASIC19.03■□□□□ 0.64
Gins4Q99LZ3 Tpm1-211ENSMUST00000113695 1607 ntTSL 3 BASIC19.03■□□□□ 0.64
Gins4Q99LZ3 Adgrl1-207ENSMUST00000141158 8181 ntTSL 1 (best) BASIC19.03■□□□□ 0.64
Gins4Q99LZ3 Abhd8-201ENSMUST00000008094 1978 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.02■□□□□ 0.64
Gins4Q99LZ3 Smim10l2a-201ENSMUST00000068106 2393 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.02■□□□□ 0.64
Gins4Q99LZ3 Gm11614-201ENSMUST00000137598 736 ntTSL 5 BASIC19.02■□□□□ 0.64
Gins4Q99LZ3 Il17re-205ENSMUST00000203661 2118 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC19.02■□□□□ 0.64
Gins4Q99LZ3 Gm9725-202ENSMUST00000166229 2326 ntTSL 5 BASIC19.02■□□□□ 0.64
Gins4Q99LZ3 Kctd20-204ENSMUST00000122163 2423 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC19.02■□□□□ 0.63
Gins4Q99LZ3 Snx21-204ENSMUST00000172577 1825 ntTSL 2 BASIC19.02■□□□□ 0.63
Gins4Q99LZ3 Tusc2-201ENSMUST00000010198 1665 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.01■□□□□ 0.63
Gins4Q99LZ3 Serbp1-207ENSMUST00000203436 1667 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC19.01■□□□□ 0.63
Gins4Q99LZ3 Exosc8-201ENSMUST00000029316 1300 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.01■□□□□ 0.63
Gins4Q99LZ3 Gtpbp2-217ENSMUST00000172170 2587 ntTSL 5 BASIC19.01■□□□□ 0.63
Gins4Q99LZ3 Itsn2-201ENSMUST00000062580 5987 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC19.01■□□□□ 0.63
Gins4Q99LZ3 Tmem164-204ENSMUST00000112889 1742 ntTSL 1 (best) BASIC19.01■□□□□ 0.63
Gins4Q99LZ3 Trappc6b-207ENSMUST00000218686 785 ntTSL 3 BASIC19.01■□□□□ 0.63
Gins4Q99LZ3 Lsm4-201ENSMUST00000034311 925 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.01■□□□□ 0.63
Gins4Q99LZ3 Dact2-201ENSMUST00000053218 2808 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.01■□□□□ 0.63
Gins4Q99LZ3 Ung-202ENSMUST00000102584 2136 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC19.01■□□□□ 0.63
Gins4Q99LZ3 Plpp1-201ENSMUST00000016144 1598 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC19.01■□□□□ 0.63
Gins4Q99LZ3 Stk35-201ENSMUST00000165413 2882 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.01■□□□□ 0.63
Gins4Q99LZ3 Pou2f2-210ENSMUST00000176408 1697 ntTSL 5 BASIC19.01■□□□□ 0.63
Gins4Q99LZ3 Aplf-201ENSMUST00000032130 1889 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.01■□□□□ 0.63
Gins4Q99LZ3 Setd4-202ENSMUST00000113951 1826 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC19■□□□□ 0.63
Gins4Q99LZ3 Cacnb1-203ENSMUST00000103144 2236 ntTSL 5 BASIC19■□□□□ 0.63
Gins4Q99LZ3 Kiss1-202ENSMUST00000178033 496 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19■□□□□ 0.63
Gins4Q99LZ3 Chpt1-203ENSMUST00000117440 4863 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC19■□□□□ 0.63
Gins4Q99LZ3 Zfp668-202ENSMUST00000106261 2410 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19■□□□□ 0.63
Gins4Q99LZ3 Pkm-201ENSMUST00000034834 2432 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC19■□□□□ 0.63
Gins4Q99LZ3 Sh3bp1-204ENSMUST00000109698 1923 ntTSL 1 (best) BASIC19■□□□□ 0.63
Gins4Q99LZ3 Tarbp2-201ENSMUST00000023813 1523 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19■□□□□ 0.63
Gins4Q99LZ3 Mtx1-202ENSMUST00000118964 1445 ntTSL 5 BASIC19■□□□□ 0.63
Gins4Q99LZ3 Nsmce4a-202ENSMUST00000160289 1435 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19■□□□□ 0.63
Gins4Q99LZ3 Gatad1-201ENSMUST00000007559 2545 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC18.99■□□□□ 0.63
Gins4Q99LZ3 Rab3il1-201ENSMUST00000113161 2225 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC18.99■□□□□ 0.63
Gins4Q99LZ3 Gm45095-201ENSMUST00000206736 254 ntTSL 5 BASIC18.99■□□□□ 0.63
Gins4Q99LZ3 Cdk11b-202ENSMUST00000105598 2673 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.99■□□□□ 0.63
Gins4Q99LZ3 Gp1bb-202ENSMUST00000167388 1847 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC18.99■□□□□ 0.63
Gins4Q99LZ3 Fyn-204ENSMUST00000126486 2495 ntTSL 1 (best) BASIC18.99■□□□□ 0.63
Gins4Q99LZ3 Spata5l1-202ENSMUST00000152813 1526 ntTSL 1 (best) BASIC18.99■□□□□ 0.63
Gins4Q99LZ3 Mfsd6-205ENSMUST00000156876 4932 ntAPPRIS P4 TSL 5 BASIC18.99■□□□□ 0.63
Gins4Q99LZ3 Cep78-201ENSMUST00000047704 2548 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.99■□□□□ 0.63
Gins4Q99LZ3 Crocc-202ENSMUST00000097816 6273 ntTSL 5 BASIC18.99■□□□□ 0.63
Gins4Q99LZ3 Arpc5l-202ENSMUST00000112862 1339 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.99■□□□□ 0.63
Gins4Q99LZ3 Ak2-202ENSMUST00000102604 1781 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC18.98■□□□□ 0.63
Gins4Q99LZ3 Agpat3-201ENSMUST00000001240 5980 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.98■□□□□ 0.63
Gins4Q99LZ3 Atoh8-201ENSMUST00000042646 2355 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.98■□□□□ 0.63
Gins4Q99LZ3 Map4k4-201ENSMUST00000163854 5782 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC18.98■□□□□ 0.63
Gins4Q99LZ3 Alkbh5-201ENSMUST00000044250 5730 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.98■□□□□ 0.63
Gins4Q99LZ3 Patz1-203ENSMUST00000094471 2930 ntTSL 1 (best) BASIC18.98■□□□□ 0.63
Gins4Q99LZ3 Ntsr2-201ENSMUST00000111064 1524 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.98■□□□□ 0.63
Gins4Q99LZ3 Alkal2-201ENSMUST00000067087 1509 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.98■□□□□ 0.63
Gins4Q99LZ3 March8-204ENSMUST00000123405 2102 ntTSL 5 BASIC18.98■□□□□ 0.63
Gins4Q99LZ3 Fmnl2-201ENSMUST00000049483 5461 ntTSL 5 BASIC18.98■□□□□ 0.63
Gins4Q99LZ3 Ipmk-202ENSMUST00000118381 1323 ntTSL 1 (best) BASIC18.98■□□□□ 0.63
Gins4Q99LZ3 5730507C01Rik-201ENSMUST00000063216 2431 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.98■□□□□ 0.63
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 115.3 ms