Protein–RNA interactions for Protein: Q99LJ5

Cmtm3, CKLF-like MARVEL transmembrane domain-containing protein 3, mousemouse

Predictions only

Length 184 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Cmtm3Q99LJ5 Rps6ka2-201ENSMUST00000024575 5404 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.46■□□□□ 0.38
Cmtm3Q99LJ5 Nus1-201ENSMUST00000023830 4605 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.45■□□□□ 0.38
Cmtm3Q99LJ5 Xrcc6-202ENSMUST00000100399 3296 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.45■□□□□ 0.38
Cmtm3Q99LJ5 Syt17-203ENSMUST00000203485 1932 ntTSL 1 (best) BASIC17.45■□□□□ 0.38
Cmtm3Q99LJ5 Gm10125-205ENSMUST00000161921 1463 ntTSL 1 (best) BASIC17.45■□□□□ 0.38
Cmtm3Q99LJ5 Luc7l2-201ENSMUST00000057692 2702 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.45■□□□□ 0.38
Cmtm3Q99LJ5 Gfra4-203ENSMUST00000110234 600 ntTSL 1 (best) BASIC17.45■□□□□ 0.38
Cmtm3Q99LJ5 Gfra4-204ENSMUST00000110235 573 ntTSL 1 (best) BASIC17.45■□□□□ 0.38
Cmtm3Q99LJ5 Gm44428-201ENSMUST00000204474 874 ntBASIC17.45■□□□□ 0.38
Cmtm3Q99LJ5 Trappc6b-201ENSMUST00000021380 1255 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.45■□□□□ 0.38
Cmtm3Q99LJ5 Srarp-201ENSMUST00000094544 905 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.45■□□□□ 0.38
Cmtm3Q99LJ5 Kcnt1-203ENSMUST00000114172 5219 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.45■□□□□ 0.38
Cmtm3Q99LJ5 Hcn2-202ENSMUST00000099513 3195 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.45■□□□□ 0.38
Cmtm3Q99LJ5 Iars2-203ENSMUST00000110975 2801 ntTSL 5 BASIC17.45■□□□□ 0.38
Cmtm3Q99LJ5 Tnrc18-201ENSMUST00000151477 6487 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.45■□□□□ 0.38
Cmtm3Q99LJ5 Dennd6a-201ENSMUST00000037585 6638 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.45■□□□□ 0.38
Cmtm3Q99LJ5 Ahsa2-201ENSMUST00000020529 3023 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.45■□□□□ 0.38
Cmtm3Q99LJ5 Tmem123-201ENSMUST00000052865 2907 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.44■□□□□ 0.38
Cmtm3Q99LJ5 Rhbdf1-201ENSMUST00000020524 2946 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.44■□□□□ 0.38
Cmtm3Q99LJ5 1700016H13Rik-204ENSMUST00000120688 612 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC17.44■□□□□ 0.38
Cmtm3Q99LJ5 Rexo2-210ENSMUST00000217037 609 ntTSL 3 BASIC17.44■□□□□ 0.38
Cmtm3Q99LJ5 Meg3-207ENSMUST00000143836 1896 ntTSL 1 (best) BASIC17.44■□□□□ 0.38
Cmtm3Q99LJ5 Pknox2-201ENSMUST00000039674 3632 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.44■□□□□ 0.38
Cmtm3Q99LJ5 Tsen34-201ENSMUST00000038521 1365 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.43■□□□□ 0.38
Cmtm3Q99LJ5 9230116N13Rik-201ENSMUST00000181746 2097 ntTSL 1 (best) BASIC17.43■□□□□ 0.38
Cmtm3Q99LJ5 Hook1-202ENSMUST00000107083 1506 ntTSL 1 (best) BASIC17.43■□□□□ 0.38
Cmtm3Q99LJ5 Uqcrc1-201ENSMUST00000026743 1653 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.43■□□□□ 0.38
Cmtm3Q99LJ5 Ehmt2-203ENSMUST00000097342 3934 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.43■□□□□ 0.38
Cmtm3Q99LJ5 4932443I19Rik-201ENSMUST00000166277 799 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC17.43■□□□□ 0.38
Cmtm3Q99LJ5 AC117769.4-201ENSMUST00000225679 685 ntBASIC17.43■□□□□ 0.38
Cmtm3Q99LJ5 Pkd1-207ENSMUST00000228550 1050 ntBASIC17.43■□□□□ 0.38
Cmtm3Q99LJ5 Brsk2-201ENSMUST00000018971 4049 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.43■□□□□ 0.38
Cmtm3Q99LJ5 Spsb4-201ENSMUST00000055433 2720 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.42■□□□□ 0.38
Cmtm3Q99LJ5 Rbfox3-204ENSMUST00000106278 1542 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.42■□□□□ 0.38
Cmtm3Q99LJ5 Neto2-205ENSMUST00000216286 2932 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.42■□□□□ 0.38
Cmtm3Q99LJ5 Cbx3-201ENSMUST00000031862 1889 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.42■□□□□ 0.38
Cmtm3Q99LJ5 2510046G10Rik-202ENSMUST00000187458 1052 ntBASIC17.42■□□□□ 0.38
Cmtm3Q99LJ5 Lsm4-204ENSMUST00000210071 575 ntTSL 5 BASIC17.42■□□□□ 0.38
Cmtm3Q99LJ5 Ctxn1-201ENSMUST00000053252 1212 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.42■□□□□ 0.38
Cmtm3Q99LJ5 Arhgef1-204ENSMUST00000117796 3508 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.42■□□□□ 0.38
Cmtm3Q99LJ5 Lsm12-201ENSMUST00000021297 2256 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.42■□□□□ 0.38
Cmtm3Q99LJ5 Kcns3-201ENSMUST00000055673 2933 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.42■□□□□ 0.38
Cmtm3Q99LJ5 Gm37035-201ENSMUST00000194809 2148 ntBASIC17.42■□□□□ 0.38
Cmtm3Q99LJ5 Cdh4-201ENSMUST00000000314 6388 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.42■□□□□ 0.38
Cmtm3Q99LJ5 Zfp746-203ENSMUST00000203609 3648 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC17.42■□□□□ 0.38
Cmtm3Q99LJ5 Mtmr1-202ENSMUST00000114601 4640 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC17.42■□□□□ 0.38
Cmtm3Q99LJ5 4930524B15Rik-201ENSMUST00000102829 2000 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.42■□□□□ 0.38
Cmtm3Q99LJ5 Atxn7-203ENSMUST00000223880 2946 ntAPPRIS P2 BASIC17.41■□□□□ 0.38
Cmtm3Q99LJ5 Map2k2-207ENSMUST00000143517 2405 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.41■□□□□ 0.38
Cmtm3Q99LJ5 Adgrl1-207ENSMUST00000141158 8181 ntTSL 1 (best) BASIC17.41■□□□□ 0.38
Cmtm3Q99LJ5 Ppp1cb-201ENSMUST00000015100 5962 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.41■□□□□ 0.38
Cmtm3Q99LJ5 Tmem132d-201ENSMUST00000044441 6139 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.41■□□□□ 0.38
Cmtm3Q99LJ5 Cyp2r1-202ENSMUST00000119712 917 ntTSL 5 BASIC17.41■□□□□ 0.38
Cmtm3Q99LJ5 Susd3-203ENSMUST00000119721 1249 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.41■□□□□ 0.38
Cmtm3Q99LJ5 Mmp15-201ENSMUST00000034243 5135 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.41■□□□□ 0.38
Cmtm3Q99LJ5 B630019K06Rik-201ENSMUST00000064196 2583 ntAPPRIS P1 BASIC17.41■□□□□ 0.38
Cmtm3Q99LJ5 Spag4-201ENSMUST00000038860 1473 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.41■□□□□ 0.38
Cmtm3Q99LJ5 Anapc5-205ENSMUST00000197074 2413 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.41■□□□□ 0.38
Cmtm3Q99LJ5 Anapc5-212ENSMUST00000199406 2413 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.41■□□□□ 0.38
Cmtm3Q99LJ5 Sh2b3-203ENSMUST00000118580 2393 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC17.4■□□□□ 0.38
Cmtm3Q99LJ5 Creb3l1-201ENSMUST00000028663 2603 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.4■□□□□ 0.38
Cmtm3Q99LJ5 Pnrc1-201ENSMUST00000049357 1648 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.4■□□□□ 0.38
Cmtm3Q99LJ5 Cstf2-202ENSMUST00000113286 2717 ntTSL 1 (best) BASIC17.4■□□□□ 0.38
Cmtm3Q99LJ5 Fam241b-203ENSMUST00000124615 1493 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.4■□□□□ 0.38
Cmtm3Q99LJ5 Gatad2a-202ENSMUST00000116463 3363 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.4■□□□□ 0.38
Cmtm3Q99LJ5 Ung-202ENSMUST00000102584 2136 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.4■□□□□ 0.38
Cmtm3Q99LJ5 Gtf2a2-203ENSMUST00000119413 1034 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.4■□□□□ 0.38
Cmtm3Q99LJ5 Snrnp40-201ENSMUST00000105994 1584 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.4■□□□□ 0.38
Cmtm3Q99LJ5 9130213A22Rik-201ENSMUST00000180487 1581 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.4■□□□□ 0.38
Cmtm3Q99LJ5 Chd5-202ENSMUST00000030775 9486 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC17.4■□□□□ 0.38
Cmtm3Q99LJ5 Aurkb-202ENSMUST00000108666 1831 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.4■□□□□ 0.38
Cmtm3Q99LJ5 Ttc9b-201ENSMUST00000008088 2052 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.4■□□□□ 0.38
Cmtm3Q99LJ5 Stau2-201ENSMUST00000027052 2763 ntTSL 1 (best) BASIC17.4■□□□□ 0.38
Cmtm3Q99LJ5 Rexo5-201ENSMUST00000033218 1966 ntTSL 1 (best) BASIC17.39■□□□□ 0.37
Cmtm3Q99LJ5 Wnt10a-201ENSMUST00000006718 2468 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.39■□□□□ 0.37
Cmtm3Q99LJ5 Jade1-202ENSMUST00000163764 5584 ntTSL 1 (best) BASIC17.39■□□□□ 0.37
Cmtm3Q99LJ5 Maf1-204ENSMUST00000160172 1537 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC17.39■□□□□ 0.37
Cmtm3Q99LJ5 Dbp-203ENSMUST00000211357 1252 ntTSL 5 BASIC17.39■□□□□ 0.37
Cmtm3Q99LJ5 A530095I07Rik-201ENSMUST00000070942 847 ntTSL 1 (best) BASIC17.39■□□□□ 0.37
Cmtm3Q99LJ5 Runx2os1-201ENSMUST00000097320 792 ntTSL 1 (best) BASIC17.39■□□□□ 0.37
Cmtm3Q99LJ5 AU022751-201ENSMUST00000101698 1838 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.39■□□□□ 0.37
Cmtm3Q99LJ5 6330420H09Rik-201ENSMUST00000211371 1316 ntTSL 1 (best) BASIC17.39■□□□□ 0.37
Cmtm3Q99LJ5 Sirt1-202ENSMUST00000105442 3740 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.39■□□□□ 0.37
Cmtm3Q99LJ5 Qdpr-201ENSMUST00000015950 1380 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.39■□□□□ 0.37
Cmtm3Q99LJ5 Ttyh3-201ENSMUST00000042661 4658 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.39■□□□□ 0.37
Cmtm3Q99LJ5 Srxn1-201ENSMUST00000041500 2812 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.39■□□□□ 0.37
Cmtm3Q99LJ5 Adgra2-202ENSMUST00000178514 5129 ntTSL 5 BASIC17.38■□□□□ 0.37
Cmtm3Q99LJ5 Prrx2-201ENSMUST00000041659 1441 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC17.38■□□□□ 0.37
Cmtm3Q99LJ5 Arfrp1-203ENSMUST00000127988 2447 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.38■□□□□ 0.37
Cmtm3Q99LJ5 Tk2-201ENSMUST00000050211 2406 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.38■□□□□ 0.37
Cmtm3Q99LJ5 Thoc6-201ENSMUST00000047436 1504 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.38■□□□□ 0.37
Cmtm3Q99LJ5 Ccdc149-202ENSMUST00000198008 2470 ntTSL 5 BASIC17.38■□□□□ 0.37
Cmtm3Q99LJ5 Tmem230-202ENSMUST00000110163 1551 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC17.38■□□□□ 0.37
Cmtm3Q99LJ5 Ppp1r14a-201ENSMUST00000048187 950 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.38■□□□□ 0.37
Cmtm3Q99LJ5 Btbd6-204ENSMUST00000221104 2085 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.38■□□□□ 0.37
Cmtm3Q99LJ5 Pex11b-202ENSMUST00000118557 2424 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.38■□□□□ 0.37
Cmtm3Q99LJ5 Fam49b-202ENSMUST00000164532 1770 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.38■□□□□ 0.37
Cmtm3Q99LJ5 Arl4c-203ENSMUST00000187810 2740 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.37■□□□□ 0.37
Cmtm3Q99LJ5 Fam46a-202ENSMUST00000187711 5648 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.37■□□□□ 0.37
Cmtm3Q99LJ5 1700105P06Rik-201ENSMUST00000186160 1772 ntBASIC17.37■□□□□ 0.37
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 16.7 ms