Protein–RNA interactions for Protein: Q99KU6

Bombesin receptor-activated protein C6orf89 homolog, mousemouse

Predictions only

Length 348 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Q99KU6 Cap2-205ENSMUST00000225824 1634 ntBASIC20.16■□□□□ 0.82
Q99KU6 Slc30a1-201ENSMUST00000044954 5244 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.16■□□□□ 0.82
Q99KU6 Ache-209ENSMUST00000196208 1911 ntTSL 5 BASIC20.15■□□□□ 0.82
Q99KU6 Rasgef1a-201ENSMUST00000164960 3284 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC20.15■□□□□ 0.82
Q99KU6 Dynll1-201ENSMUST00000009157 2030 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.15■□□□□ 0.82
Q99KU6 Lpcat2-205ENSMUST00000210099 2179 ntTSL 1 (best) BASIC20.15■□□□□ 0.82
Q99KU6 Tmem185a-201ENSMUST00000101506 2429 ntTSL 1 (best) BASIC20.15■□□□□ 0.82
Q99KU6 Chtf8-201ENSMUST00000169312 2730 ntTSL 1 (best) BASIC20.15■□□□□ 0.82
Q99KU6 Ppia-202ENSMUST00000132846 1170 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.15■□□□□ 0.82
Q99KU6 Tmem150a-201ENSMUST00000069695 1546 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.15■□□□□ 0.82
Q99KU6 Trim33-202ENSMUST00000106860 5025 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.15■□□□□ 0.82
Q99KU6 Thap4-206ENSMUST00000190116 5558 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.15■□□□□ 0.82
Q99KU6 Cbln2-202ENSMUST00000122079 2549 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.14■□□□□ 0.82
Q99KU6 Usf2-201ENSMUST00000058860 2419 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.14■□□□□ 0.82
Q99KU6 Tbxa2r-201ENSMUST00000105325 1765 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.14■□□□□ 0.81
Q99KU6 Lefty1-201ENSMUST00000037361 1620 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.14■□□□□ 0.81
Q99KU6 Foxe3-201ENSMUST00000050940 867 ntAPPRIS P1 BASIC20.14■□□□□ 0.81
Q99KU6 St3gal3-201ENSMUST00000030263 2549 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.14■□□□□ 0.81
Q99KU6 Cep78-201ENSMUST00000047704 2548 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.14■□□□□ 0.81
Q99KU6 Adpgk-201ENSMUST00000026266 2464 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC20.14■□□□□ 0.81
Q99KU6 Sstr1-201ENSMUST00000044299 2014 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.14■□□□□ 0.81
Q99KU6 Clint1-201ENSMUST00000109260 3311 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC20.14■□□□□ 0.81
Q99KU6 Nkx2-5-201ENSMUST00000015723 1525 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.13■□□□□ 0.81
Q99KU6 Mettl24-201ENSMUST00000058747 1529 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.13■□□□□ 0.81
Q99KU6 Def6-201ENSMUST00000002327 2277 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.13■□□□□ 0.81
Q99KU6 Gm15645-201ENSMUST00000131504 2208 ntTSL 5 BASIC20.13■□□□□ 0.81
Q99KU6 Dgcr6-207ENSMUST00000151266 1086 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC20.13■□□□□ 0.81
Q99KU6 Gm45051-201ENSMUST00000206838 963 ntTSL 1 (best) BASIC20.13■□□□□ 0.81
Q99KU6 Hoxc11-201ENSMUST00000001701 2021 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.13■□□□□ 0.81
Q99KU6 Macrod2-206ENSMUST00000110064 4883 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC20.13■□□□□ 0.81
Q99KU6 Cd248-201ENSMUST00000070630 2560 ntAPPRIS P1 BASIC20.13■□□□□ 0.81
Q99KU6 Dhx33-204ENSMUST00000124464 1835 ntTSL 5 BASIC20.13■□□□□ 0.81
Q99KU6 Hpdl-201ENSMUST00000055436 1804 ntAPPRIS P1 BASIC20.13■□□□□ 0.81
Q99KU6 Dact3-201ENSMUST00000108493 2989 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.13■□□□□ 0.81
Q99KU6 Utp11-201ENSMUST00000030738 1603 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.13■□□□□ 0.81
Q99KU6 D130058E05Rik-201ENSMUST00000173856 1372 ntTSL 2 BASIC20.12■□□□□ 0.81
Q99KU6 Erf-202ENSMUST00000116343 690 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC20.12■□□□□ 0.81
Q99KU6 Hpf1-204ENSMUST00000146863 531 ntTSL 2 BASIC20.12■□□□□ 0.81
Q99KU6 Tmcc1-202ENSMUST00000088896 5838 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC20.12■□□□□ 0.81
Q99KU6 Kirrel-201ENSMUST00000041732 2160 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.12■□□□□ 0.81
Q99KU6 Tpm1-211ENSMUST00000113695 1607 ntTSL 3 BASIC20.12■□□□□ 0.81
Q99KU6 Hexa-201ENSMUST00000026262 1996 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.12■□□□□ 0.81
Q99KU6 Hs3st4-201ENSMUST00000106437 3189 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC20.11■□□□□ 0.81
Q99KU6 Mark2-206ENSMUST00000164205 3104 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.11■□□□□ 0.81
Q99KU6 Dgcr6-209ENSMUST00000155387 1415 ntTSL 3 BASIC20.11■□□□□ 0.81
Q99KU6 Tmem123-201ENSMUST00000052865 2907 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.11■□□□□ 0.81
Q99KU6 Baiap2l2-201ENSMUST00000165408 2100 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.11■□□□□ 0.81
Q99KU6 Trim33-201ENSMUST00000029444 8875 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC20.11■□□□□ 0.81
Q99KU6 Cracr2b-201ENSMUST00000053670 1698 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC20.11■□□□□ 0.81
Q99KU6 Gm10420-201ENSMUST00000121713 882 ntBASIC20.11■□□□□ 0.81
Q99KU6 Gm27253-201ENSMUST00000183670 367 ntTSL 1 (best) BASIC20.11■□□□□ 0.81
Q99KU6 Rhbdf1-201ENSMUST00000020524 2946 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.11■□□□□ 0.81
Q99KU6 Agtpbp1-222ENSMUST00000171606 3037 ntTSL 1 (best) BASIC20.1■□□□□ 0.81
Q99KU6 Fam96b-203ENSMUST00000164884 918 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.1■□□□□ 0.81
Q99KU6 Aldoa-214ENSMUST00000207534 741 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC20.1■□□□□ 0.81
Q99KU6 Rasl11b-201ENSMUST00000051937 1812 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.1■□□□□ 0.81
Q99KU6 Tnpo2-207ENSMUST00000211601 2941 ntTSL 1 (best) BASIC20.1■□□□□ 0.81
Q99KU6 Tarbp2-201ENSMUST00000023813 1523 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.1■□□□□ 0.81
Q99KU6 Rnf8-201ENSMUST00000024817 2077 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.1■□□□□ 0.81
Q99KU6 Cacnb1-205ENSMUST00000107562 1745 ntTSL 1 (best) BASIC20.1■□□□□ 0.81
Q99KU6 Slc35f4-202ENSMUST00000123534 2748 ntTSL 1 (best) BASIC20.1■□□□□ 0.81
Q99KU6 Pou2f2-205ENSMUST00000108417 1937 ntTSL 1 (best) BASIC20.1■□□□□ 0.81
Q99KU6 Azi2-205ENSMUST00000133580 2156 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.1■□□□□ 0.81
Q99KU6 Jdp2-201ENSMUST00000050687 1643 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.09■□□□□ 0.81
Q99KU6 Exosc8-201ENSMUST00000029316 1300 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.09■□□□□ 0.81
Q99KU6 Fbxl17-201ENSMUST00000024761 4925 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.09■□□□□ 0.81
Q99KU6 Gpatch3-201ENSMUST00000030662 2004 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.09■□□□□ 0.81
Q99KU6 Sirt1-201ENSMUST00000020257 3905 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC20.09■□□□□ 0.81
Q99KU6 Mbd3-203ENSMUST00000105348 1222 ntTSL 5 BASIC20.09■□□□□ 0.81
Q99KU6 Gm43592-201ENSMUST00000196922 1165 ntBASIC20.09■□□□□ 0.81
Q99KU6 Tmem250-ps-201ENSMUST00000133808 2483 ntTSL 2 BASIC20.09■□□□□ 0.81
Q99KU6 Gprc5c-201ENSMUST00000021071 2200 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC20.08■□□□□ 0.81
Q99KU6 Vmn1r17-205ENSMUST00000228342 2230 ntAPPRIS P2 BASIC20.08■□□□□ 0.81
Q99KU6 B4galt6-201ENSMUST00000070080 5808 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.08■□□□□ 0.81
Q99KU6 Sft2d1-210ENSMUST00000154553 1049 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.08■□□□□ 0.81
Q99KU6 1700095J03Rik-201ENSMUST00000143715 1808 ntTSL 1 (best) BASIC20.08■□□□□ 0.8
Q99KU6 Gdf11-201ENSMUST00000026408 4062 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.08■□□□□ 0.8
Q99KU6 Mgat5b-201ENSMUST00000103027 4258 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC20.07■□□□□ 0.8
Q99KU6 Sept7-202ENSMUST00000165594 2516 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC20.07■□□□□ 0.8
Q99KU6 Zc3h6-201ENSMUST00000110319 1484 ntTSL 1 (best) BASIC20.07■□□□□ 0.8
Q99KU6 Dirc2-201ENSMUST00000023554 5395 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.07■□□□□ 0.8
Q99KU6 Mtm1-204ENSMUST00000101501 770 ntTSL 1 (best) BASIC20.07■□□□□ 0.8
Q99KU6 Gm45095-201ENSMUST00000206736 254 ntTSL 5 BASIC20.07■□□□□ 0.8
Q99KU6 Mrpl23-201ENSMUST00000038675 692 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC20.07■□□□□ 0.8
Q99KU6 Srsf4-202ENSMUST00000053819 2257 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.07■□□□□ 0.8
Q99KU6 Chtop-204ENSMUST00000107342 2411 ntTSL 1 (best) BASIC20.07■□□□□ 0.8
Q99KU6 Creb3l1-201ENSMUST00000028663 2603 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.06■□□□□ 0.8
Q99KU6 Dus1l-203ENSMUST00000106135 1863 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC20.06■□□□□ 0.8
Q99KU6 Gfi1-203ENSMUST00000159164 2648 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC20.06■□□□□ 0.8
Q99KU6 Uck1-201ENSMUST00000002625 2005 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.06■□□□□ 0.8
Q99KU6 H1fx-201ENSMUST00000056403 1217 ntAPPRIS P1 BASIC20.06■□□□□ 0.8
Q99KU6 Bdh1-201ENSMUST00000089759 1711 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.06■□□□□ 0.8
Q99KU6 Tbc1d2b-201ENSMUST00000041767 5956 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.06■□□□□ 0.8
Q99KU6 Spg7-209ENSMUST00000149248 2896 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC20.06■□□□□ 0.8
Q99KU6 AW047730-202ENSMUST00000181406 2579 ntTSL 1 (best) BASIC20.06■□□□□ 0.8
Q99KU6 Hook2-203ENSMUST00000209764 2516 ntTSL 5 BASIC20.06■□□□□ 0.8
Q99KU6 Sumf1-201ENSMUST00000032191 2593 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC20.05■□□□□ 0.8
Q99KU6 Zbtb7a-203ENSMUST00000119606 1841 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.05■□□□□ 0.8
Q99KU6 Dll3-201ENSMUST00000108315 2618 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.05■□□□□ 0.8
Q99KU6 Auh-203ENSMUST00000119311 2627 ntTSL 1 (best) BASIC20.05■□□□□ 0.8
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 59.6 ms