Protein–RNA interactions for Protein: Q99KR7

Ppif, Peptidyl-prolyl cis-trans isomerase F, mitochondrial, mousemouse

Known RBP Predictions only

Length 206 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
PpifQ99KR7 Vamp4-206ENSMUST00000150040 901 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.67■□□□□ 0.26
PpifQ99KR7 Stx2-201ENSMUST00000031378 2939 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.67■□□□□ 0.26
PpifQ99KR7 Ndfip2-206ENSMUST00000181969 2532 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.67■□□□□ 0.26
PpifQ99KR7 Gm11549-201ENSMUST00000124606 2829 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.67■□□□□ 0.26
PpifQ99KR7 Srsf2-206ENSMUST00000190993 1326 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.67■□□□□ 0.26
PpifQ99KR7 Kdm3b-201ENSMUST00000043775 6363 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.67■□□□□ 0.26
PpifQ99KR7 Spryd7-202ENSMUST00000100496 1459 ntTSL 1 (best) BASIC16.67■□□□□ 0.26
PpifQ99KR7 Nadk2-201ENSMUST00000067760 3731 ntAPPRIS P5 TSL 5 BASIC16.67■□□□□ 0.26
PpifQ99KR7 Tmem132b-201ENSMUST00000031446 7995 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.67■□□□□ 0.26
PpifQ99KR7 Cacng4-201ENSMUST00000021066 3500 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.66■□□□□ 0.26
PpifQ99KR7 Lmtk3-204ENSMUST00000209617 5051 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.66■□□□□ 0.26
PpifQ99KR7 Fiz1-202ENSMUST00000165320 2653 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.66■□□□□ 0.26
PpifQ99KR7 Pelo-201ENSMUST00000109226 1600 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.66■□□□□ 0.26
PpifQ99KR7 Unc5b-201ENSMUST00000077925 5869 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.66■□□□□ 0.26
PpifQ99KR7 Tmem62-201ENSMUST00000067582 2921 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.66■□□□□ 0.26
PpifQ99KR7 Setd3-201ENSMUST00000071095 2755 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.66■□□□□ 0.26
PpifQ99KR7 Bbc3-201ENSMUST00000002152 1814 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.66■□□□□ 0.26
PpifQ99KR7 Shkbp1-201ENSMUST00000003857 2358 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.65■□□□□ 0.26
PpifQ99KR7 9130213A22Rik-201ENSMUST00000180487 1581 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.65■□□□□ 0.26
PpifQ99KR7 Wdsub1-201ENSMUST00000028368 2072 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.65■□□□□ 0.26
PpifQ99KR7 Cebpa-201ENSMUST00000042985 2626 ntAPPRIS P1 BASIC16.65■□□□□ 0.26
PpifQ99KR7 Nudt3-203ENSMUST00000114886 996 ntTSL 2 BASIC16.65■□□□□ 0.26
PpifQ99KR7 Tmbim4-204ENSMUST00000134797 486 ntTSL 1 (best) BASIC16.65■□□□□ 0.26
PpifQ99KR7 AC117769.4-201ENSMUST00000225679 685 ntBASIC16.65■□□□□ 0.26
PpifQ99KR7 Dnaja4-201ENSMUST00000070070 3003 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.65■□□□□ 0.26
PpifQ99KR7 Aurkb-202ENSMUST00000108666 1831 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.65■□□□□ 0.26
PpifQ99KR7 Tesmin-204ENSMUST00000151341 2013 ntTSL 1 (best) BASIC16.65■□□□□ 0.26
PpifQ99KR7 Lipt2-201ENSMUST00000032967 1663 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.65■□□□□ 0.26
PpifQ99KR7 Nexmif-201ENSMUST00000056502 5211 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.65■□□□□ 0.26
PpifQ99KR7 Pbx1-202ENSMUST00000072863 1709 ntTSL 1 (best) BASIC16.65■□□□□ 0.26
PpifQ99KR7 Sirt1-202ENSMUST00000105442 3740 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.65■□□□□ 0.26
PpifQ99KR7 Rasef-203ENSMUST00000222414 2127 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.64■□□□□ 0.25
PpifQ99KR7 Snrnp40-201ENSMUST00000105994 1584 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.64■□□□□ 0.25
PpifQ99KR7 1700105P06Rik-201ENSMUST00000186160 1772 ntBASIC16.64■□□□□ 0.25
PpifQ99KR7 Cnp-201ENSMUST00000103120 2357 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.64■□□□□ 0.25
PpifQ99KR7 AC151971.4-201ENSMUST00000214717 704 ntBASIC16.64■□□□□ 0.25
PpifQ99KR7 Ipmk-203ENSMUST00000121446 1492 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.64■□□□□ 0.25
PpifQ99KR7 Fam118a-201ENSMUST00000023069 2543 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.64■□□□□ 0.25
PpifQ99KR7 Sp5-201ENSMUST00000100043 2100 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.64■□□□□ 0.25
PpifQ99KR7 Plekhm2-201ENSMUST00000030751 4154 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.64■□□□□ 0.25
PpifQ99KR7 Tada2b-201ENSMUST00000031097 3791 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.64■□□□□ 0.25
PpifQ99KR7 Csnk1e-203ENSMUST00000122044 3174 ntTSL 1 (best) BASIC16.64■□□□□ 0.25
PpifQ99KR7 Gm10300-201ENSMUST00000094662 2296 ntAPPRIS P1 BASIC16.63■□□□□ 0.25
PpifQ99KR7 Rbm38-204ENSMUST00000173393 2071 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.63■□□□□ 0.25
PpifQ99KR7 Adat3-204ENSMUST00000038411 1411 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.63■□□□□ 0.25
PpifQ99KR7 Spag4-201ENSMUST00000038860 1473 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.63■□□□□ 0.25
PpifQ99KR7 Kirrel-201ENSMUST00000041732 2160 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.63■□□□□ 0.25
PpifQ99KR7 Susd3-203ENSMUST00000119721 1249 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.63■□□□□ 0.25
PpifQ99KR7 Slc35a2-211ENSMUST00000208640 486 ntTSL 5 BASIC16.63■□□□□ 0.25
PpifQ99KR7 Fbl-201ENSMUST00000042405 1197 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.63■□□□□ 0.25
PpifQ99KR7 Maf1-204ENSMUST00000160172 1537 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.63■□□□□ 0.25
PpifQ99KR7 Dnaja4-202ENSMUST00000120452 1827 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.63■□□□□ 0.25
PpifQ99KR7 Slc35a3-201ENSMUST00000029569 5725 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.63■□□□□ 0.25
PpifQ99KR7 Cdk4-201ENSMUST00000006911 2053 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.63■□□□□ 0.25
PpifQ99KR7 Fgf16-201ENSMUST00000033581 1645 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.63■□□□□ 0.25
PpifQ99KR7 Gm5784-201ENSMUST00000179344 2478 ntBASIC16.62■□□□□ 0.25
PpifQ99KR7 Cacnb1-203ENSMUST00000103144 2236 ntTSL 5 BASIC16.62■□□□□ 0.25
PpifQ99KR7 Exoc5-206ENSMUST00000161504 2582 ntTSL 5 BASIC16.62■□□□□ 0.25
PpifQ99KR7 Baiap2l2-201ENSMUST00000165408 2100 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.62■□□□□ 0.25
PpifQ99KR7 Ssc4d-203ENSMUST00000111152 2745 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.62■□□□□ 0.25
PpifQ99KR7 Bcl3-201ENSMUST00000120537 1850 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.62■□□□□ 0.25
PpifQ99KR7 Ehmt2-203ENSMUST00000097342 3934 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.62■□□□□ 0.25
PpifQ99KR7 Vps9d1-203ENSMUST00000122363 2952 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.62■□□□□ 0.25
PpifQ99KR7 Mpnd-204ENSMUST00000149441 1701 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.62■□□□□ 0.25
PpifQ99KR7 Rarb-207ENSMUST00000225921 2756 ntBASIC16.61■□□□□ 0.25
PpifQ99KR7 Slc9a5-201ENSMUST00000073149 3499 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.61■□□□□ 0.25
PpifQ99KR7 Pstpip1-201ENSMUST00000059206 1863 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.61■□□□□ 0.25
PpifQ99KR7 Cpne2-201ENSMUST00000048653 2342 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.61■□□□□ 0.25
PpifQ99KR7 Scarna2-201ENSMUST00000157560 414 ntBASIC16.61■□□□□ 0.25
PpifQ99KR7 Psmg1-201ENSMUST00000023630 1044 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.61■□□□□ 0.25
PpifQ99KR7 Gm16437-201ENSMUST00000025669 507 ntBASIC16.61■□□□□ 0.25
PpifQ99KR7 Hnrnpa3-204ENSMUST00000111964 1654 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.61■□□□□ 0.25
PpifQ99KR7 Gm20458-201ENSMUST00000164863 1369 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.61■□□□□ 0.25
PpifQ99KR7 Hoxa2-201ENSMUST00000014848 1775 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.61■□□□□ 0.25
PpifQ99KR7 Rbm7-201ENSMUST00000170000 1773 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.61■□□□□ 0.25
PpifQ99KR7 Mrpl3-205ENSMUST00000149243 2309 ntTSL 1 (best) BASIC16.61■□□□□ 0.25
PpifQ99KR7 Ppp3cc-201ENSMUST00000078434 1970 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.6■□□□□ 0.25
PpifQ99KR7 Gas2l1-203ENSMUST00000109895 2530 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.6■□□□□ 0.25
PpifQ99KR7 Btbd6-204ENSMUST00000221104 2085 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.6■□□□□ 0.25
PpifQ99KR7 Fam105a-203ENSMUST00000226170 3043 ntBASIC16.6■□□□□ 0.25
PpifQ99KR7 Ripk2-201ENSMUST00000037035 2692 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.6■□□□□ 0.25
PpifQ99KR7 Maneal-201ENSMUST00000064444 2727 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC16.6■□□□□ 0.25
PpifQ99KR7 Hirip3-201ENSMUST00000037248 2766 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.6■□□□□ 0.25
PpifQ99KR7 Dbp-204ENSMUST00000211513 1156 ntTSL 5 BASIC16.6■□□□□ 0.25
PpifQ99KR7 Crct1-201ENSMUST00000029521 718 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.6■□□□□ 0.25
PpifQ99KR7 AC122428.2-201ENSMUST00000216321 1832 ntBASIC16.6■□□□□ 0.25
PpifQ99KR7 Dmwd-202ENSMUST00000108479 2388 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.6■□□□□ 0.25
PpifQ99KR7 Snx4-201ENSMUST00000023502 2442 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.6■□□□□ 0.25
PpifQ99KR7 Slc30a4-202ENSMUST00000099457 3170 ntTSL 1 (best) BASIC16.6■□□□□ 0.25
PpifQ99KR7 Nrxn2-201ENSMUST00000077182 6059 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.6■□□□□ 0.25
PpifQ99KR7 Usp2-206ENSMUST00000176416 1486 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.6■□□□□ 0.25
PpifQ99KR7 Tmem230-202ENSMUST00000110163 1551 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC16.6■□□□□ 0.25
PpifQ99KR7 Zfp623-201ENSMUST00000037260 2463 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.59■□□□□ 0.25
PpifQ99KR7 5031439G07Rik-201ENSMUST00000047144 6845 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.59■□□□□ 0.25
PpifQ99KR7 Cyb5r4-201ENSMUST00000168529 2644 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.59■□□□□ 0.25
PpifQ99KR7 Sstr1-201ENSMUST00000044299 2014 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.59■□□□□ 0.25
PpifQ99KR7 Gspt1-201ENSMUST00000080030 2898 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.59■□□□□ 0.25
PpifQ99KR7 Aebp2-202ENSMUST00000087614 3727 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC16.59■□□□□ 0.25
PpifQ99KR7 Cox11-201ENSMUST00000020851 1224 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.59■□□□□ 0.25
PpifQ99KR7 Gm9806-201ENSMUST00000051080 552 ntBASIC16.59■□□□□ 0.25
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 34.5 ms