Protein–RNA interactions for Protein: Q99KF1

Tmed9, Transmembrane emp24 domain-containing protein 9, mousemouse

Known RBP Predictions only

Length 235 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Tmed9Q99KF1 Soga1-201ENSMUST00000069098 7864 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.11■□□□□ 0.49
Tmed9Q99KF1 Mex3d-201ENSMUST00000105350 3266 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.11■□□□□ 0.49
Tmed9Q99KF1 Gm27253-201ENSMUST00000183670 367 ntTSL 1 (best) BASIC18.11■□□□□ 0.49
Tmed9Q99KF1 Pdlim4-201ENSMUST00000018755 1182 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.11■□□□□ 0.49
Tmed9Q99KF1 Actr3b-201ENSMUST00000088244 1712 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.11■□□□□ 0.49
Tmed9Q99KF1 Shisa5-201ENSMUST00000026737 1834 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.11■□□□□ 0.49
Tmed9Q99KF1 Kctd20-204ENSMUST00000122163 2423 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.11■□□□□ 0.49
Tmed9Q99KF1 Rasgef1a-201ENSMUST00000164960 3284 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC18.11■□□□□ 0.49
Tmed9Q99KF1 Cep78-201ENSMUST00000047704 2548 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.1■□□□□ 0.49
Tmed9Q99KF1 Mreg-201ENSMUST00000048860 2284 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.1■□□□□ 0.49
Tmed9Q99KF1 Gm7276-201ENSMUST00000097520 1252 ntAPPRIS P1 BASIC18.1■□□□□ 0.49
Tmed9Q99KF1 Atrn-201ENSMUST00000028781 8745 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.1■□□□□ 0.49
Tmed9Q99KF1 Gm9725-202ENSMUST00000166229 2326 ntTSL 5 BASIC18.1■□□□□ 0.49
Tmed9Q99KF1 Rnpep-201ENSMUST00000074357 2171 ntTSL 1 (best) BASIC18.1■□□□□ 0.49
Tmed9Q99KF1 Ercc6l2-208ENSMUST00000144763 1820 ntTSL 1 (best) BASIC18.09■□□□□ 0.49
Tmed9Q99KF1 Siah1b-201ENSMUST00000037928 1783 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.09■□□□□ 0.49
Tmed9Q99KF1 Patz1-203ENSMUST00000094471 2930 ntTSL 1 (best) BASIC18.09■□□□□ 0.49
Tmed9Q99KF1 Smim10l2a-201ENSMUST00000068106 2393 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.09■□□□□ 0.49
Tmed9Q99KF1 Tceal6-201ENSMUST00000033783 1114 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.09■□□□□ 0.49
Tmed9Q99KF1 Stk35-201ENSMUST00000165413 2882 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.09■□□□□ 0.49
Tmed9Q99KF1 4930524B15Rik-201ENSMUST00000102829 2000 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.09■□□□□ 0.49
Tmed9Q99KF1 Uqcrc1-201ENSMUST00000026743 1653 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.09■□□□□ 0.49
Tmed9Q99KF1 Psmd7-201ENSMUST00000044106 1581 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.08■□□□□ 0.49
Tmed9Q99KF1 Schip1-205ENSMUST00000182532 2059 ntTSL 1 (best) BASIC18.08■□□□□ 0.49
Tmed9Q99KF1 Cog1-202ENSMUST00000063776 1476 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.08■□□□□ 0.49
Tmed9Q99KF1 Dok6-201ENSMUST00000097495 1441 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.08■□□□□ 0.49
Tmed9Q99KF1 Fyn-204ENSMUST00000126486 2495 ntTSL 1 (best) BASIC18.08■□□□□ 0.49
Tmed9Q99KF1 Kmt2b-201ENSMUST00000006470 8469 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC18.08■□□□□ 0.48
Tmed9Q99KF1 Kiss1-201ENSMUST00000007433 779 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC18.08■□□□□ 0.48
Tmed9Q99KF1 Syt5-201ENSMUST00000065957 1750 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.08■□□□□ 0.48
Tmed9Q99KF1 Sugct-201ENSMUST00000068545 1701 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.08■□□□□ 0.48
Tmed9Q99KF1 Il17re-205ENSMUST00000203661 2118 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.08■□□□□ 0.48
Tmed9Q99KF1 Gatad1-201ENSMUST00000007559 2545 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC18.08■□□□□ 0.48
Tmed9Q99KF1 Med16-204ENSMUST00000165684 2950 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.08■□□□□ 0.48
Tmed9Q99KF1 Nsmce4a-202ENSMUST00000160289 1435 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.07■□□□□ 0.48
Tmed9Q99KF1 Ung-202ENSMUST00000102584 2136 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.07■□□□□ 0.48
Tmed9Q99KF1 Tmem164-204ENSMUST00000112889 1742 ntTSL 1 (best) BASIC18.07■□□□□ 0.48
Tmed9Q99KF1 Exosc8-201ENSMUST00000029316 1300 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.07■□□□□ 0.48
Tmed9Q99KF1 Atoh8-201ENSMUST00000042646 2355 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.07■□□□□ 0.48
Tmed9Q99KF1 Kiss1-202ENSMUST00000178033 496 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.07■□□□□ 0.48
Tmed9Q99KF1 Lsm4-201ENSMUST00000034311 925 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.07■□□□□ 0.48
Tmed9Q99KF1 Pelo-201ENSMUST00000109226 1600 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.07■□□□□ 0.48
Tmed9Q99KF1 Tpm1-211ENSMUST00000113695 1607 ntTSL 3 BASIC18.07■□□□□ 0.48
Tmed9Q99KF1 Cdk11b-202ENSMUST00000105598 2673 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.07■□□□□ 0.48
Tmed9Q99KF1 Map4k4-201ENSMUST00000163854 5782 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC18.07■□□□□ 0.48
Tmed9Q99KF1 Tex264-202ENSMUST00000163441 1896 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.07■□□□□ 0.48
Tmed9Q99KF1 Phf14-201ENSMUST00000090632 3985 ntTSL 1 (best) BASIC18.06■□□□□ 0.48
Tmed9Q99KF1 Plpp1-201ENSMUST00000016144 1598 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC18.06■□□□□ 0.48
Tmed9Q99KF1 Zfp668-202ENSMUST00000106261 2410 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.06■□□□□ 0.48
Tmed9Q99KF1 Gm11614-201ENSMUST00000137598 736 ntTSL 5 BASIC18.06■□□□□ 0.48
Tmed9Q99KF1 Gm45095-201ENSMUST00000206736 254 ntTSL 5 BASIC18.06■□□□□ 0.48
Tmed9Q99KF1 Tusc2-201ENSMUST00000010198 1665 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.06■□□□□ 0.48
Tmed9Q99KF1 Fgfr1-215ENSMUST00000179592 5041 ntTSL 5 BASIC18.06■□□□□ 0.48
Tmed9Q99KF1 Dennd3-201ENSMUST00000043414 5299 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.06■□□□□ 0.48
Tmed9Q99KF1 Man2c1os-201ENSMUST00000125333 1910 ntTSL 1 (best) BASIC18.06■□□□□ 0.48
Tmed9Q99KF1 March8-204ENSMUST00000123405 2102 ntTSL 5 BASIC18.05■□□□□ 0.48
Tmed9Q99KF1 Aplf-201ENSMUST00000032130 1889 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.05■□□□□ 0.48
Tmed9Q99KF1 Setd4-202ENSMUST00000113951 1826 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.05■□□□□ 0.48
Tmed9Q99KF1 Snx21-204ENSMUST00000172577 1825 ntTSL 2 BASIC18.05■□□□□ 0.48
Tmed9Q99KF1 Arpc5l-202ENSMUST00000112862 1339 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.05■□□□□ 0.48
Tmed9Q99KF1 Paxip1-201ENSMUST00000002291 5850 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.05■□□□□ 0.48
Tmed9Q99KF1 Rps6ka3-201ENSMUST00000033671 7244 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.05■□□□□ 0.48
Tmed9Q99KF1 Lrfn4-201ENSMUST00000053597 3194 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.05■□□□□ 0.48
Tmed9Q99KF1 Spata5l1-202ENSMUST00000152813 1526 ntTSL 1 (best) BASIC18.05■□□□□ 0.48
Tmed9Q99KF1 Agpat3-201ENSMUST00000001240 5980 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.05■□□□□ 0.48
Tmed9Q99KF1 Abhd8-201ENSMUST00000008094 1978 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.05■□□□□ 0.48
Tmed9Q99KF1 Trappc6b-207ENSMUST00000218686 785 ntTSL 3 BASIC18.05■□□□□ 0.48
Tmed9Q99KF1 Card19-201ENSMUST00000048946 804 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.05■□□□□ 0.48
Tmed9Q99KF1 Gjd3-201ENSMUST00000062931 837 ntAPPRIS P1 BASIC18.05■□□□□ 0.48
Tmed9Q99KF1 5730507C01Rik-201ENSMUST00000063216 2431 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.05■□□□□ 0.48
Tmed9Q99KF1 Ahsa2-201ENSMUST00000020529 3023 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.05■□□□□ 0.48
Tmed9Q99KF1 Serbp1-207ENSMUST00000203436 1667 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.05■□□□□ 0.48
Tmed9Q99KF1 Mtx1-202ENSMUST00000118964 1445 ntTSL 5 BASIC18.05■□□□□ 0.48
Tmed9Q99KF1 Fam83d-201ENSMUST00000029183 2266 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.05■□□□□ 0.48
Tmed9Q99KF1 Podxl-201ENSMUST00000026698 5379 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.04■□□□□ 0.48
Tmed9Q99KF1 Itsn2-201ENSMUST00000062580 5987 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC18.04■□□□□ 0.48
Tmed9Q99KF1 Srxn1-201ENSMUST00000041500 2812 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.04■□□□□ 0.48
Tmed9Q99KF1 Prkar1b-201ENSMUST00000026973 2637 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.04■□□□□ 0.48
Tmed9Q99KF1 Cacul1-203ENSMUST00000166712 5700 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC18.04■□□□□ 0.48
Tmed9Q99KF1 Pkm-201ENSMUST00000034834 2432 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.04■□□□□ 0.48
Tmed9Q99KF1 Cacnb1-203ENSMUST00000103144 2236 ntTSL 5 BASIC18.04■□□□□ 0.48
Tmed9Q99KF1 Rab3il1-201ENSMUST00000113161 2225 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC18.04■□□□□ 0.48
Tmed9Q99KF1 Rela-201ENSMUST00000025867 2716 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.04■□□□□ 0.48
Tmed9Q99KF1 Tarbp2-201ENSMUST00000023813 1523 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.03■□□□□ 0.48
Tmed9Q99KF1 Ipmk-202ENSMUST00000118381 1323 ntTSL 1 (best) BASIC18.03■□□□□ 0.48
Tmed9Q99KF1 Bag1-203ENSMUST00000191273 1348 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.03■□□□□ 0.48
Tmed9Q99KF1 Pou2f2-210ENSMUST00000176408 1697 ntTSL 5 BASIC18.03■□□□□ 0.48
Tmed9Q99KF1 Hsf1-204ENSMUST00000226872 2104 ntBASIC18.03■□□□□ 0.48
Tmed9Q99KF1 Sh3bp1-204ENSMUST00000109698 1923 ntTSL 1 (best) BASIC18.03■□□□□ 0.48
Tmed9Q99KF1 Sybu-208ENSMUST00000228057 3026 ntAPPRIS ALT2 BASIC18.03■□□□□ 0.48
Tmed9Q99KF1 Tmie-201ENSMUST00000050958 2802 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.03■□□□□ 0.48
Tmed9Q99KF1 Ntsr2-201ENSMUST00000111064 1524 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.03■□□□□ 0.48
Tmed9Q99KF1 Alkal2-201ENSMUST00000067087 1509 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.03■□□□□ 0.48
Tmed9Q99KF1 Tbc1d25-201ENSMUST00000039892 2648 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.02■□□□□ 0.48
Tmed9Q99KF1 Trim71-201ENSMUST00000111816 9332 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.02■□□□□ 0.48
Tmed9Q99KF1 Map2k2-207ENSMUST00000143517 2405 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.02■□□□□ 0.48
Tmed9Q99KF1 B130046B21Rik-201ENSMUST00000181510 2216 ntTSL 1 (best) BASIC18.02■□□□□ 0.48
Tmed9Q99KF1 Cd37-204ENSMUST00000209779 2541 ntTSL 1 (best) BASIC18.02■□□□□ 0.48
Tmed9Q99KF1 Bspry-202ENSMUST00000107449 2167 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.02■□□□□ 0.48
Tmed9Q99KF1 Tmbim4-204ENSMUST00000134797 486 ntTSL 1 (best) BASIC18.02■□□□□ 0.48
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 32.2 ms