Protein–RNA interactions for Protein: Q99K46

Usp11, Ubiquitin carboxyl-terminal hydrolase 11, mousemouse

Predictions only

Length 921 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Usp11Q99K46 Smad2-205ENSMUST00000168423 2857 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC21.14■□□□□ 0.97
Usp11Q99K46 Socs1-201ENSMUST00000038099 1220 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.14■□□□□ 0.97
Usp11Q99K46 Gm10645-201ENSMUST00000098605 1090 ntAPPRIS P1 BASIC21.14■□□□□ 0.97
Usp11Q99K46 Gm43403-201ENSMUST00000198011 1786 ntBASIC21.14■□□□□ 0.97
Usp11Q99K46 Purb-201ENSMUST00000179343 8319 ntAPPRIS P1 BASIC21.14■□□□□ 0.97
Usp11Q99K46 Ankle2-201ENSMUST00000031474 5215 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.14■□□□□ 0.97
Usp11Q99K46 Pithd1-201ENSMUST00000105851 1700 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.14■□□□□ 0.97
Usp11Q99K46 Cblc-202ENSMUST00000108449 1514 ntTSL 1 (best) BASIC21.14■□□□□ 0.97
Usp11Q99K46 Slbp-201ENSMUST00000057551 1906 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC21.14■□□□□ 0.97
Usp11Q99K46 Bola3-207ENSMUST00000136501 2312 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.13■□□□□ 0.97
Usp11Q99K46 Galnt11-201ENSMUST00000045737 2552 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.13■□□□□ 0.97
Usp11Q99K46 Soga1-201ENSMUST00000069098 7864 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.13■□□□□ 0.97
Usp11Q99K46 Hccs-202ENSMUST00000112115 2473 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.13■□□□□ 0.97
Usp11Q99K46 Arhgap23-201ENSMUST00000093940 2409 ntTSL 1 (best) BASIC21.13■□□□□ 0.97
Usp11Q99K46 Rgs10-205ENSMUST00000145739 564 ntTSL 1 (best) BASIC21.13■□□□□ 0.97
Usp11Q99K46 Rem2-201ENSMUST00000164697 1194 ntTSL 5 BASIC21.13■□□□□ 0.97
Usp11Q99K46 1700020G03Rik-201ENSMUST00000211264 889 ntBASIC21.13■□□□□ 0.97
Usp11Q99K46 Pi4kb-207ENSMUST00000167008 1962 ntTSL 1 (best) BASIC21.13■□□□□ 0.97
Usp11Q99K46 AC164883.3-201ENSMUST00000227396 1774 ntBASIC21.13■□□□□ 0.97
Usp11Q99K46 9230116N13Rik-201ENSMUST00000181746 2097 ntTSL 1 (best) BASIC21.13■□□□□ 0.97
Usp11Q99K46 Phox2b-201ENSMUST00000012664 3013 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.13■□□□□ 0.97
Usp11Q99K46 Akt1-201ENSMUST00000001780 2690 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.12■□□□□ 0.97
Usp11Q99K46 Mgat1-213ENSMUST00000167400 3151 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC21.12■□□□□ 0.97
Usp11Q99K46 Sumf1-203ENSMUST00000167338 1044 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC21.12■□□□□ 0.97
Usp11Q99K46 Gm10685-201ENSMUST00000196120 433 ntTSL 3 BASIC21.12■□□□□ 0.97
Usp11Q99K46 Ooep-201ENSMUST00000034900 2138 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.12■□□□□ 0.97
Usp11Q99K46 Fance-204ENSMUST00000114804 1842 ntTSL 1 (best) BASIC21.12■□□□□ 0.97
Usp11Q99K46 Kmt2b-201ENSMUST00000006470 8469 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC21.11■□□□□ 0.97
Usp11Q99K46 Sema6d-203ENSMUST00000077847 6444 ntTSL 5 BASIC21.11■□□□□ 0.97
Usp11Q99K46 Rp2-203ENSMUST00000115391 1398 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.11■□□□□ 0.97
Usp11Q99K46 Ppp6r2-202ENSMUST00000226221 2559 ntBASIC21.11■□□□□ 0.97
Usp11Q99K46 Shisa8-201ENSMUST00000179269 1804 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.11■□□□□ 0.97
Usp11Q99K46 Slc35a2-201ENSMUST00000096514 1757 ntTSL 5 BASIC21.11■□□□□ 0.97
Usp11Q99K46 Setd6-201ENSMUST00000034096 1707 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.11■□□□□ 0.97
Usp11Q99K46 Zmiz2-201ENSMUST00000012612 4199 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC21.11■□□□□ 0.97
Usp11Q99K46 Rora-202ENSMUST00000113624 2591 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.11■□□□□ 0.97
Usp11Q99K46 Uchl5-206ENSMUST00000189936 1696 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC21.11■□□□□ 0.97
Usp11Q99K46 Crtc2-201ENSMUST00000029545 2747 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.11■□□□□ 0.97
Usp11Q99K46 Pkmyt1-201ENSMUST00000024701 2039 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.11■□□□□ 0.97
Usp11Q99K46 Desi2-204ENSMUST00000161075 2590 ntTSL 1 (best) BASIC21.1■□□□□ 0.97
Usp11Q99K46 Zfp777-202ENSMUST00000114583 3111 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC21.1■□□□□ 0.97
Usp11Q99K46 Gm28417-201ENSMUST00000185218 785 ntTSL 3 BASIC21.1■□□□□ 0.97
Usp11Q99K46 Rab42-201ENSMUST00000040411 761 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.1■□□□□ 0.97
Usp11Q99K46 Trim47-201ENSMUST00000021120 2204 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC21.1■□□□□ 0.97
Usp11Q99K46 Iqsec1-210ENSMUST00000212100 3500 ntTSL 5 BASIC21.1■□□□□ 0.97
Usp11Q99K46 Rps6ka3-201ENSMUST00000033671 7244 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.1■□□□□ 0.97
Usp11Q99K46 Hes7-201ENSMUST00000024543 1809 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.09■□□□□ 0.97
Usp11Q99K46 Hoxd3os1-204ENSMUST00000156342 796 ntTSL 1 (best) BASIC21.09■□□□□ 0.97
Usp11Q99K46 Cdc42ep5-201ENSMUST00000076831 1025 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.09■□□□□ 0.97
Usp11Q99K46 Uap1-203ENSMUST00000111351 2287 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.09■□□□□ 0.97
Usp11Q99K46 Snap91-203ENSMUST00000074501 2577 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.09■□□□□ 0.97
Usp11Q99K46 Gm13448-201ENSMUST00000143469 1847 ntTSL 1 (best) BASIC21.08■□□□□ 0.97
Usp11Q99K46 Gimap1-201ENSMUST00000054368 1493 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.08■□□□□ 0.97
Usp11Q99K46 Xylt1-201ENSMUST00000032892 9020 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.08■□□□□ 0.97
Usp11Q99K46 Nsmf-213ENSMUST00000140737 862 ntTSL 5 BASIC21.08■□□□□ 0.97
Usp11Q99K46 Efr3a-203ENSMUST00000172756 1411 ntTSL 1 (best) BASIC21.08■□□□□ 0.97
Usp11Q99K46 Lzts2-202ENSMUST00000178087 2773 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.08■□□□□ 0.97
Usp11Q99K46 Pbx1-201ENSMUST00000064438 1020 ntTSL 1 (best) BASIC21.08■□□□□ 0.97
Usp11Q99K46 Letm2-209ENSMUST00000210810 1538 ntTSL 1 (best) BASIC21.08■□□□□ 0.96
Usp11Q99K46 Prr7-201ENSMUST00000046533 1359 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.08■□□□□ 0.96
Usp11Q99K46 Hoxd13-201ENSMUST00000001872 2483 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.07■□□□□ 0.96
Usp11Q99K46 Iqck-206ENSMUST00000208658 2891 ntBASIC21.07■□□□□ 0.96
Usp11Q99K46 Qtrt1-201ENSMUST00000002902 1316 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.07■□□□□ 0.96
Usp11Q99K46 Kctd8-202ENSMUST00000087231 1860 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.07■□□□□ 0.96
Usp11Q99K46 Fbxl6-201ENSMUST00000023219 1712 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.07■□□□□ 0.96
Usp11Q99K46 Grsf1-201ENSMUST00000078945 2538 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.07■□□□□ 0.96
Usp11Q99K46 Cep97-205ENSMUST00000121703 609 ntTSL 1 (best) BASIC21.07■□□□□ 0.96
Usp11Q99K46 Gm2415-203ENSMUST00000149952 435 ntTSL 5 BASIC21.07■□□□□ 0.96
Usp11Q99K46 Zfp346-202ENSMUST00000159147 1146 ntTSL 5 BASIC21.07■□□□□ 0.96
Usp11Q99K46 Fam89b-201ENSMUST00000099955 1197 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.07■□□□□ 0.96
Usp11Q99K46 5730488B01Rik-201ENSMUST00000192889 2311 ntBASIC21.07■□□□□ 0.96
Usp11Q99K46 Rell2-210ENSMUST00000176104 2150 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC21.07■□□□□ 0.96
Usp11Q99K46 Trak1-208ENSMUST00000210636 2197 ntTSL 1 (best) BASIC21.07■□□□□ 0.96
Usp11Q99K46 Rusc2-201ENSMUST00000035645 5300 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.07■□□□□ 0.96
Usp11Q99K46 Bcas2-201ENSMUST00000005830 1467 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.07■□□□□ 0.96
Usp11Q99K46 Crocc-202ENSMUST00000097816 6273 ntTSL 5 BASIC21.06■□□□□ 0.96
Usp11Q99K46 Chml-203ENSMUST00000210367 1324 ntTSL 5 BASIC21.06■□□□□ 0.96
Usp11Q99K46 H2afj-201ENSMUST00000074556 1831 ntAPPRIS P2 BASIC21.06■□□□□ 0.96
Usp11Q99K46 Adad2-201ENSMUST00000098361 1926 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.06■□□□□ 0.96
Usp11Q99K46 Map1lc3a-201ENSMUST00000029128 1112 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.06■□□□□ 0.96
Usp11Q99K46 Nphp3-201ENSMUST00000035167 5899 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC21.06■□□□□ 0.96
Usp11Q99K46 Itsn2-201ENSMUST00000062580 5987 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC21.06■□□□□ 0.96
Usp11Q99K46 Pnrc1-201ENSMUST00000049357 1648 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.06■□□□□ 0.96
Usp11Q99K46 Itga9-201ENSMUST00000044165 7020 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.06■□□□□ 0.96
Usp11Q99K46 Abhd13-202ENSMUST00000139793 5191 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC21.05■□□□□ 0.96
Usp11Q99K46 Smox-205ENSMUST00000110182 985 ntTSL 1 (best) BASIC21.05■□□□□ 0.96
Usp11Q99K46 Snrpa1-206ENSMUST00000153609 1248 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.05■□□□□ 0.96
Usp11Q99K46 Usf2-203ENSMUST00000162228 960 ntTSL 5 BASIC21.05■□□□□ 0.96
Usp11Q99K46 Xpa-202ENSMUST00000058232 1241 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.05■□□□□ 0.96
Usp11Q99K46 Rps2-ps6-201ENSMUST00000095471 855 ntBASIC21.05■□□□□ 0.96
Usp11Q99K46 Tmub1-202ENSMUST00000115033 1598 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC21.05■□□□□ 0.96
Usp11Q99K46 Prdm11-205ENSMUST00000178666 1870 ntTSL 5 BASIC21.05■□□□□ 0.96
Usp11Q99K46 Gm10125-201ENSMUST00000074702 2286 ntTSL 1 (best) BASIC21.04■□□□□ 0.96
Usp11Q99K46 Zcchc24-201ENSMUST00000069180 4556 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.04■□□□□ 0.96
Usp11Q99K46 E130208F15Rik-201ENSMUST00000098585 1733 ntAPPRIS P1 BASIC21.04■□□□□ 0.96
Usp11Q99K46 Pgam1-201ENSMUST00000011896 1831 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.04■□□□□ 0.96
Usp11Q99K46 Otud1-201ENSMUST00000052168 2832 ntAPPRIS P1 BASIC21.04■□□□□ 0.96
Usp11Q99K46 Ift57-201ENSMUST00000046777 2601 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.04■□□□□ 0.96
Usp11Q99K46 3110053B16Rik-202ENSMUST00000140360 2004 ntTSL 1 (best) BASIC21.04■□□□□ 0.96
Usp11Q99K46 Scamp3-202ENSMUST00000098941 1338 ntTSL 1 (best) BASIC21.04■□□□□ 0.96
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 33.3 ms