Protein–RNA interactions for Protein: Q99JX7

Nxf1, Nuclear RNA export factor 1, mousemouse

Known RBP Predictions only

Length 618 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Nxf1Q99JX7 Tusc2-203ENSMUST00000193418 410 ntTSL 3 BASIC22.63■■□□□ 1.21
Nxf1Q99JX7 Cox6a1-201ENSMUST00000040154 571 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.63■■□□□ 1.21
Nxf1Q99JX7 Fbxo2-201ENSMUST00000047951 1288 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.63■■□□□ 1.21
Nxf1Q99JX7 Kdelr3-201ENSMUST00000010974 1414 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.63■■□□□ 1.21
Nxf1Q99JX7 Fam189a2-201ENSMUST00000096164 2547 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.63■■□□□ 1.21
Nxf1Q99JX7 Prmt1-202ENSMUST00000107843 1508 ntTSL 1 (best) BASIC22.62■■□□□ 1.21
Nxf1Q99JX7 Rdh14-201ENSMUST00000020947 1480 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.62■■□□□ 1.21
Nxf1Q99JX7 Eif2ak4-207ENSMUST00000110877 2134 ntTSL 1 (best) BASIC22.62■■□□□ 1.21
Nxf1Q99JX7 Capn10-202ENSMUST00000117814 1268 ntTSL 1 (best) BASIC22.62■■□□□ 1.21
Nxf1Q99JX7 Gon7-201ENSMUST00000173969 1152 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.62■■□□□ 1.21
Nxf1Q99JX7 Gm27151-202ENSMUST00000185015 1145 ntTSL 5 BASIC22.62■■□□□ 1.21
Nxf1Q99JX7 Gm7160-202ENSMUST00000188519 1027 ntBASIC22.62■■□□□ 1.21
Nxf1Q99JX7 Pop7-201ENSMUST00000031728 881 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.62■■□□□ 1.21
Nxf1Q99JX7 Kctd17-201ENSMUST00000089414 1180 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC22.62■■□□□ 1.21
Nxf1Q99JX7 Ankrd54-201ENSMUST00000040676 1904 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.62■■□□□ 1.21
Nxf1Q99JX7 Fam60a-202ENSMUST00000081956 2737 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.62■■□□□ 1.21
Nxf1Q99JX7 Rgs19-201ENSMUST00000002532 1511 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.62■■□□□ 1.21
Nxf1Q99JX7 Cdan1-201ENSMUST00000110700 5996 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC22.62■■□□□ 1.21
Nxf1Q99JX7 Ltk-206ENSMUST00000182203 2232 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.61■■□□□ 1.21
Nxf1Q99JX7 Prodh-206ENSMUST00000139861 677 ntTSL 1 (best) BASIC22.61■■□□□ 1.21
Nxf1Q99JX7 Gm13790-201ENSMUST00000156209 473 ntTSL 3 BASIC22.61■■□□□ 1.21
Nxf1Q99JX7 Gm21168-201ENSMUST00000199646 1096 ntBASIC22.61■■□□□ 1.21
Nxf1Q99JX7 D830025C05Rik-201ENSMUST00000059474 976 ntBASIC22.61■■□□□ 1.21
Nxf1Q99JX7 Gm9922-201ENSMUST00000066461 435 ntAPPRIS P1 BASIC22.61■■□□□ 1.21
Nxf1Q99JX7 Cdc16-201ENSMUST00000043962 2301 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.6■■□□□ 1.21
Nxf1Q99JX7 Gm32051-202ENSMUST00000197905 2385 ntBASIC22.6■■□□□ 1.21
Nxf1Q99JX7 0610010K14Rik-208ENSMUST00000108578 880 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.6■■□□□ 1.21
Nxf1Q99JX7 Gm15867-201ENSMUST00000159407 388 ntTSL 1 (best) BASIC22.6■■□□□ 1.21
Nxf1Q99JX7 Slc25a41-201ENSMUST00000058661 1225 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.6■■□□□ 1.21
Nxf1Q99JX7 Zranb1-202ENSMUST00000106157 5008 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC22.6■■□□□ 1.21
Nxf1Q99JX7 Hif1a-203ENSMUST00000110464 1759 ntTSL 1 (best) BASIC22.6■■□□□ 1.21
Nxf1Q99JX7 Sh3bp1-203ENSMUST00000089378 2001 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.6■■□□□ 1.21
Nxf1Q99JX7 Fam193a-202ENSMUST00000180376 5536 ntAPPRIS P5 TSL 5 BASIC22.6■■□□□ 1.21
Nxf1Q99JX7 Raph1-201ENSMUST00000027168 2241 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC22.59■■□□□ 1.21
Nxf1Q99JX7 Trim33-201ENSMUST00000029444 8875 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC22.59■■□□□ 1.21
Nxf1Q99JX7 Aktip-201ENSMUST00000109609 1171 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.59■■□□□ 1.21
Nxf1Q99JX7 Gm29394-204ENSMUST00000177504 448 ntAPPRIS ALT2 TSL 3 BASIC22.59■■□□□ 1.21
Nxf1Q99JX7 Gm43173-201ENSMUST00000202246 593 ntBASIC22.59■■□□□ 1.21
Nxf1Q99JX7 1700012B09Rik-201ENSMUST00000060330 688 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.59■■□□□ 1.21
Nxf1Q99JX7 Nrarp-201ENSMUST00000104999 2582 ntAPPRIS P1 BASIC22.59■■□□□ 1.21
Nxf1Q99JX7 Nabp2-202ENSMUST00000164199 1371 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.59■■□□□ 1.21
Nxf1Q99JX7 Dnajb2-206ENSMUST00000187058 1732 ntTSL 1 (best) BASIC22.59■■□□□ 1.21
Nxf1Q99JX7 Gm6085-201ENSMUST00000182774 1470 ntBASIC22.59■■□□□ 1.21
Nxf1Q99JX7 Pitx2-202ENSMUST00000042587 2271 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC22.59■■□□□ 1.21
Nxf1Q99JX7 Ell3-201ENSMUST00000028679 2115 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.58■■□□□ 1.21
Nxf1Q99JX7 Nkx2-2-201ENSMUST00000067075 2120 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.58■■□□□ 1.21
Nxf1Q99JX7 Bag5-202ENSMUST00000160576 1852 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.58■■□□□ 1.21
Nxf1Q99JX7 Retreg2-208ENSMUST00000190240 2438 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.58■■□□□ 1.21
Nxf1Q99JX7 Olig3-201ENSMUST00000053225 2072 ntAPPRIS P1 BASIC22.58■■□□□ 1.21
Nxf1Q99JX7 Gsc-201ENSMUST00000021513 1268 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.58■■□□□ 1.21
Nxf1Q99JX7 Ppp3ca-202ENSMUST00000070198 4758 ntTSL 1 (best) BASIC22.58■■□□□ 1.21
Nxf1Q99JX7 Pycr2-201ENSMUST00000027802 1580 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.58■■□□□ 1.2
Nxf1Q99JX7 Cdc20-201ENSMUST00000006565 1793 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.58■■□□□ 1.2
Nxf1Q99JX7 Abhd17b-201ENSMUST00000052556 2475 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.57■■□□□ 1.2
Nxf1Q99JX7 1700001C19Rik-201ENSMUST00000061885 1622 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.57■■□□□ 1.2
Nxf1Q99JX7 Cryzl1-203ENSMUST00000117644 1727 ntTSL 1 (best) BASIC22.57■■□□□ 1.2
Nxf1Q99JX7 Trip10-207ENSMUST00000224947 2016 ntAPPRIS P2 BASIC22.57■■□□□ 1.2
Nxf1Q99JX7 Paip2-204ENSMUST00000115736 857 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC22.57■■□□□ 1.2
Nxf1Q99JX7 Rps2-208ENSMUST00000170715 998 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.57■■□□□ 1.2
Nxf1Q99JX7 Spcs1-204ENSMUST00000226782 949 ntBASIC22.57■■□□□ 1.2
Nxf1Q99JX7 1700086O06Rik-202ENSMUST00000181871 1564 ntTSL 1 (best) BASIC22.57■■□□□ 1.2
Nxf1Q99JX7 Jak2-201ENSMUST00000025705 4947 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.57■■□□□ 1.2
Nxf1Q99JX7 Klf15-201ENSMUST00000032174 2373 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.57■■□□□ 1.2
Nxf1Q99JX7 Grin2c-202ENSMUST00000106554 4895 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.57■■□□□ 1.2
Nxf1Q99JX7 Slc12a2-201ENSMUST00000115366 6520 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.57■■□□□ 1.2
Nxf1Q99JX7 Cobll1-204ENSMUST00000112430 4917 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.57■■□□□ 1.2
Nxf1Q99JX7 Sox1-201ENSMUST00000180353 4832 ntAPPRIS P1 BASIC22.57■■□□□ 1.2
Nxf1Q99JX7 Ccr10-201ENSMUST00000062759 1726 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.57■■□□□ 1.2
Nxf1Q99JX7 Arnt2-201ENSMUST00000085077 6151 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.56■■□□□ 1.2
Nxf1Q99JX7 Rfx5-205ENSMUST00000107260 2355 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.56■■□□□ 1.2
Nxf1Q99JX7 Prkar1b-201ENSMUST00000026973 2637 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.56■■□□□ 1.2
Nxf1Q99JX7 Pla2g12a-201ENSMUST00000029629 1561 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.56■■□□□ 1.2
Nxf1Q99JX7 Lrfn1-201ENSMUST00000055110 1479 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC22.56■■□□□ 1.2
Nxf1Q99JX7 Arhgap9-204ENSMUST00000219511 2217 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.56■■□□□ 1.2
Nxf1Q99JX7 Gm26881-201ENSMUST00000180426 593 ntTSL 1 (best) BASIC22.56■■□□□ 1.2
Nxf1Q99JX7 Krtap5-4-201ENSMUST00000061403 1046 ntAPPRIS P1 BASIC22.56■■□□□ 1.2
Nxf1Q99JX7 Tfg-201ENSMUST00000065515 1945 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.56■■□□□ 1.2
Nxf1Q99JX7 Dedd2-201ENSMUST00000058702 1828 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.56■■□□□ 1.2
Nxf1Q99JX7 Msl1-203ENSMUST00000107485 2091 ntTSL 1 (best) BASIC22.56■■□□□ 1.2
Nxf1Q99JX7 Tmem114-201ENSMUST00000023400 1406 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.56■■□□□ 1.2
Nxf1Q99JX7 Ltb4r2-201ENSMUST00000044554 1439 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.56■■□□□ 1.2
Nxf1Q99JX7 Paip2-205ENSMUST00000115737 713 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC22.55■■□□□ 1.2
Nxf1Q99JX7 Ppp4r1l-ps-204ENSMUST00000140992 367 ntTSL 3 BASIC22.55■■□□□ 1.2
Nxf1Q99JX7 Apoe-205ENSMUST00000173739 1221 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.55■■□□□ 1.2
Nxf1Q99JX7 Apoe-209ENSMUST00000174355 1104 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.55■■□□□ 1.2
Nxf1Q99JX7 Apoe-201ENSMUST00000003066 1128 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.55■■□□□ 1.2
Nxf1Q99JX7 Arl6ip4-201ENSMUST00000031351 1192 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.55■■□□□ 1.2
Nxf1Q99JX7 Nr2c2ap-201ENSMUST00000095273 1161 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.55■■□□□ 1.2
Nxf1Q99JX7 Gpatch3-201ENSMUST00000030662 2004 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.55■■□□□ 1.2
Nxf1Q99JX7 Mau2-206ENSMUST00000212451 1931 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.55■■□□□ 1.2
Nxf1Q99JX7 4430402I18Rik-201ENSMUST00000025872 2152 ntTSL 1 (best) BASIC22.55■■□□□ 1.2
Nxf1Q99JX7 Akt1s1-204ENSMUST00000107885 1812 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.54■■□□□ 1.2
Nxf1Q99JX7 Gmds-201ENSMUST00000041859 1713 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.54■■□□□ 1.2
Nxf1Q99JX7 Exosc4-201ENSMUST00000059045 1796 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.54■■□□□ 1.2
Nxf1Q99JX7 Fdx1-201ENSMUST00000034552 875 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.54■■□□□ 1.2
Nxf1Q99JX7 Jak2-202ENSMUST00000065796 5030 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.54■■□□□ 1.2
Nxf1Q99JX7 Lrrc1-205ENSMUST00000183873 3121 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.54■■□□□ 1.2
Nxf1Q99JX7 Gm10209-201ENSMUST00000203397 1607 ntBASIC22.53■■□□□ 1.2
Nxf1Q99JX7 Adad2-201ENSMUST00000098361 1926 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.53■■□□□ 1.2
Nxf1Q99JX7 Gm17641-201ENSMUST00000166328 2350 ntBASIC22.53■■□□□ 1.2
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 15.1 ms