Protein–RNA interactions for Protein: Q99JW4

Lims1, LIM and senescent cell antigen-like-containing domain protein 1, mousemouse

Predictions only

Length 325 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Lims1Q99JW4 Ddrgk1-201ENSMUST00000089559 1238 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.52■□□□□ 0.56
Lims1Q99JW4 Fgfrl1-202ENSMUST00000112560 2318 ntTSL 1 (best) BASIC18.52■□□□□ 0.56
Lims1Q99JW4 Rhbdd3-201ENSMUST00000036320 1790 ntTSL 1 (best) BASIC18.52■□□□□ 0.55
Lims1Q99JW4 Mtfmt-201ENSMUST00000074792 2042 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.52■□□□□ 0.55
Lims1Q99JW4 Ankrd33b-202ENSMUST00000076942 1641 ntTSL 1 (best) BASIC18.52■□□□□ 0.55
Lims1Q99JW4 Stau2-201ENSMUST00000027052 2763 ntTSL 1 (best) BASIC18.52■□□□□ 0.55
Lims1Q99JW4 Cryzl1-203ENSMUST00000117644 1727 ntTSL 1 (best) BASIC18.52■□□□□ 0.55
Lims1Q99JW4 1700034P13Rik-201ENSMUST00000181358 1343 ntTSL 1 (best) BASIC18.51■□□□□ 0.55
Lims1Q99JW4 Ptpmt1-203ENSMUST00000125001 3183 ntTSL 1 (best) BASIC18.51■□□□□ 0.55
Lims1Q99JW4 Prkar2b-201ENSMUST00000003079 1657 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.51■□□□□ 0.55
Lims1Q99JW4 Stx2-202ENSMUST00000100680 2769 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.51■□□□□ 0.55
Lims1Q99JW4 Nudt6-204ENSMUST00000108118 935 ntTSL 5 BASIC18.51■□□□□ 0.55
Lims1Q99JW4 Pmvk-201ENSMUST00000029564 1194 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.51■□□□□ 0.55
Lims1Q99JW4 Nudt6-201ENSMUST00000052645 1155 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.51■□□□□ 0.55
Lims1Q99JW4 Nudt6-202ENSMUST00000099130 1070 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.51■□□□□ 0.55
Lims1Q99JW4 Brd1-203ENSMUST00000109381 4886 ntTSL 5 BASIC18.51■□□□□ 0.55
Lims1Q99JW4 D030062O11Rik-201ENSMUST00000192660 2806 ntBASIC18.51■□□□□ 0.55
Lims1Q99JW4 Rhov-201ENSMUST00000037360 1703 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.51■□□□□ 0.55
Lims1Q99JW4 Atoh8-201ENSMUST00000042646 2355 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.5■□□□□ 0.55
Lims1Q99JW4 Hsf1-204ENSMUST00000226872 2104 ntBASIC18.5■□□□□ 0.55
Lims1Q99JW4 Agfg1-202ENSMUST00000113444 3142 ntTSL 1 (best) BASIC18.5■□□□□ 0.55
Lims1Q99JW4 Ssbp1-205ENSMUST00000121360 1188 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.5■□□□□ 0.55
Lims1Q99JW4 Gm12905-201ENSMUST00000153814 658 ntTSL 2 BASIC18.5■□□□□ 0.55
Lims1Q99JW4 Ccdc84-212ENSMUST00000217351 888 ntTSL 3 BASIC18.5■□□□□ 0.55
Lims1Q99JW4 Bcas2-201ENSMUST00000005830 1467 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.5■□□□□ 0.55
Lims1Q99JW4 Zfp653-202ENSMUST00000179605 1888 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.5■□□□□ 0.55
Lims1Q99JW4 Slc35d3-201ENSMUST00000059805 2630 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.5■□□□□ 0.55
Lims1Q99JW4 Whamm-201ENSMUST00000165460 3069 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.49■□□□□ 0.55
Lims1Q99JW4 Dusp26-201ENSMUST00000036631 1938 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.49■□□□□ 0.55
Lims1Q99JW4 Glrb-201ENSMUST00000029654 3029 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.49■□□□□ 0.55
Lims1Q99JW4 Cited1-202ENSMUST00000101336 1090 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.49■□□□□ 0.55
Lims1Q99JW4 Pth2-201ENSMUST00000042754 503 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.49■□□□□ 0.55
Lims1Q99JW4 Dyrk2-201ENSMUST00000004281 6129 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.49■□□□□ 0.55
Lims1Q99JW4 Arfrp1-203ENSMUST00000127988 2447 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.49■□□□□ 0.55
Lims1Q99JW4 Kcnn4-202ENSMUST00000205428 1945 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.49■□□□□ 0.55
Lims1Q99JW4 Dhx33-204ENSMUST00000124464 1835 ntTSL 5 BASIC18.49■□□□□ 0.55
Lims1Q99JW4 2700081O15Rik-202ENSMUST00000159348 4989 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.49■□□□□ 0.55
Lims1Q99JW4 Tmem230-206ENSMUST00000180286 1531 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC18.49■□□□□ 0.55
Lims1Q99JW4 Laptm4a-201ENSMUST00000020909 1773 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.48■□□□□ 0.55
Lims1Q99JW4 Gm43566-201ENSMUST00000196851 808 ntBASIC18.48■□□□□ 0.55
Lims1Q99JW4 Prrt2-206ENSMUST00000202045 429 ntTSL 5 BASIC18.48■□□□□ 0.55
Lims1Q99JW4 Tesmin-204ENSMUST00000151341 2013 ntTSL 1 (best) BASIC18.48■□□□□ 0.55
Lims1Q99JW4 Man1a-201ENSMUST00000003843 5137 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.48■□□□□ 0.55
Lims1Q99JW4 Gm43909-201ENSMUST00000203443 1876 ntBASIC18.48■□□□□ 0.55
Lims1Q99JW4 B130046B21Rik-201ENSMUST00000181510 2216 ntTSL 1 (best) BASIC18.47■□□□□ 0.55
Lims1Q99JW4 Noa1-201ENSMUST00000047860 2288 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.47■□□□□ 0.55
Lims1Q99JW4 1700030C10Rik-203ENSMUST00000189625 1735 ntTSL 1 (best) BASIC18.47■□□□□ 0.55
Lims1Q99JW4 Gm20684-201ENSMUST00000176744 380 ntTSL 3 BASIC18.47■□□□□ 0.55
Lims1Q99JW4 4930524J08Rik-201ENSMUST00000046721 603 ntAPPRIS P1 BASIC18.47■□□□□ 0.55
Lims1Q99JW4 Bloc1s2-201ENSMUST00000079033 878 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.47■□□□□ 0.55
Lims1Q99JW4 Rbm38-201ENSMUST00000029014 1768 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.47■□□□□ 0.55
Lims1Q99JW4 Cyb561-201ENSMUST00000019734 2741 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.47■□□□□ 0.55
Lims1Q99JW4 Neurl4-202ENSMUST00000108617 4892 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC18.47■□□□□ 0.55
Lims1Q99JW4 Pou2f2-210ENSMUST00000176408 1697 ntTSL 5 BASIC18.47■□□□□ 0.55
Lims1Q99JW4 Rab28-203ENSMUST00000201422 1697 ntTSL 5 BASIC18.47■□□□□ 0.55
Lims1Q99JW4 Scarb1-201ENSMUST00000086075 2521 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.47■□□□□ 0.55
Lims1Q99JW4 Lmbr1l-201ENSMUST00000023736 2300 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.46■□□□□ 0.55
Lims1Q99JW4 Slc35b2-201ENSMUST00000041353 2326 ntTSL 1 (best) BASIC18.46■□□□□ 0.55
Lims1Q99JW4 Gm572-201ENSMUST00000105698 1385 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.46■□□□□ 0.55
Lims1Q99JW4 Sac3d1-201ENSMUST00000113533 1374 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.46■□□□□ 0.55
Lims1Q99JW4 Vwc2-201ENSMUST00000056344 1350 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.46■□□□□ 0.55
Lims1Q99JW4 Clec3b-201ENSMUST00000026890 992 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.46■□□□□ 0.55
Lims1Q99JW4 Ppp4r2-201ENSMUST00000063854 4874 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.46■□□□□ 0.55
Lims1Q99JW4 Smim19-202ENSMUST00000163774 1435 ntTSL 1 (best) BASIC18.46■□□□□ 0.55
Lims1Q99JW4 Smim10l2a-201ENSMUST00000068106 2393 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.46■□□□□ 0.55
Lims1Q99JW4 Prss50-201ENSMUST00000051097 1456 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.46■□□□□ 0.54
Lims1Q99JW4 Map2k2-207ENSMUST00000143517 2405 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.45■□□□□ 0.54
Lims1Q99JW4 Bspry-202ENSMUST00000107449 2167 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.45■□□□□ 0.54
Lims1Q99JW4 Tab2-204ENSMUST00000146444 4380 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.45■□□□□ 0.54
Lims1Q99JW4 Fgfrl1-201ENSMUST00000013633 2329 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.45■□□□□ 0.54
Lims1Q99JW4 Fam216a-201ENSMUST00000031419 1388 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.45■□□□□ 0.54
Lims1Q99JW4 Mgat2-201ENSMUST00000060579 2614 ntAPPRIS P1 BASIC18.45■□□□□ 0.54
Lims1Q99JW4 Ncoa5-202ENSMUST00000121377 2930 ntTSL 1 (best) BASIC18.45■□□□□ 0.54
Lims1Q99JW4 Ubxn2a-201ENSMUST00000020962 2696 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.45■□□□□ 0.54
Lims1Q99JW4 Matr3-209ENSMUST00000188275 1951 ntTSL 5 BASIC18.45■□□□□ 0.54
Lims1Q99JW4 Dleu2-209ENSMUST00000182957 352 ntTSL 2 BASIC18.45■□□□□ 0.54
Lims1Q99JW4 Gm9725-202ENSMUST00000166229 2326 ntTSL 5 BASIC18.45■□□□□ 0.54
Lims1Q99JW4 6330403K07Rik-201ENSMUST00000156068 1494 ntTSL 1 (best) BASIC18.45■□□□□ 0.54
Lims1Q99JW4 Stat5b-201ENSMUST00000004143 5062 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.45■□□□□ 0.54
Lims1Q99JW4 Abhd8-201ENSMUST00000008094 1978 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.44■□□□□ 0.54
Lims1Q99JW4 Mrgbp-201ENSMUST00000029085 1510 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.44■□□□□ 0.54
Lims1Q99JW4 Fyn-204ENSMUST00000126486 2495 ntTSL 1 (best) BASIC18.44■□□□□ 0.54
Lims1Q99JW4 Cdk8-201ENSMUST00000031640 2973 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC18.44■□□□□ 0.54
Lims1Q99JW4 Tfpt-204ENSMUST00000155592 1091 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.44■□□□□ 0.54
Lims1Q99JW4 Gm5921-201ENSMUST00000075898 882 ntBASIC18.44■□□□□ 0.54
Lims1Q99JW4 Rbm38-204ENSMUST00000173393 2071 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.44■□□□□ 0.54
Lims1Q99JW4 Fam20b-202ENSMUST00000122424 4532 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.44■□□□□ 0.54
Lims1Q99JW4 Hpse-202ENSMUST00000112908 1958 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.44■□□□□ 0.54
Lims1Q99JW4 Kcnq5-201ENSMUST00000029667 6562 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.44■□□□□ 0.54
Lims1Q99JW4 Gpatch3-201ENSMUST00000030662 2004 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.44■□□□□ 0.54
Lims1Q99JW4 Whrn-204ENSMUST00000095037 2419 ntTSL 1 (best) BASIC18.43■□□□□ 0.54
Lims1Q99JW4 Wdr41-202ENSMUST00000159647 2289 ntTSL 5 BASIC18.43■□□□□ 0.54
Lims1Q99JW4 Wdr41-206ENSMUST00000167155 2289 ntTSL 1 (best) BASIC18.43■□□□□ 0.54
Lims1Q99JW4 Cpsf4-202ENSMUST00000160422 1756 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC18.43■□□□□ 0.54
Lims1Q99JW4 AC166356.1-201ENSMUST00000228236 1426 ntBASIC18.43■□□□□ 0.54
Lims1Q99JW4 Ccdc177-201ENSMUST00000073251 5775 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.43■□□□□ 0.54
Lims1Q99JW4 Gm6217-201ENSMUST00000222182 829 ntAPPRIS P1 BASIC18.43■□□□□ 0.54
Lims1Q99JW4 Bloc1s5-202ENSMUST00000224115 1020 ntBASIC18.43■□□□□ 0.54
Lims1Q99JW4 Chkb-201ENSMUST00000023289 1707 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.43■□□□□ 0.54
Lims1Q99JW4 Zmym3-202ENSMUST00000117637 1593 ntTSL 1 (best) BASIC18.42■□□□□ 0.54
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 49.1 ms