Protein–RNA interactions for Protein: Q99J56

Derl1, Derlin-1, mousemouse

Predictions only

Length 251 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Derl1Q99J56 Rhbdf1-201ENSMUST00000020524 2946 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.68■□□□□ 0.1
Derl1Q99J56 Fzd2-201ENSMUST00000057893 3663 ntAPPRIS P1 BASIC15.68■□□□□ 0.1
Derl1Q99J56 Zfp287-205ENSMUST00000150336 1605 ntTSL 1 (best) BASIC15.68■□□□□ 0.1
Derl1Q99J56 Cd248-201ENSMUST00000070630 2560 ntAPPRIS P1 BASIC15.68■□□□□ 0.1
Derl1Q99J56 Hr-203ENSMUST00000161069 5607 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.68■□□□□ 0.1
Derl1Q99J56 Rcan3-201ENSMUST00000030606 5111 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.68■□□□□ 0.1
Derl1Q99J56 Aplf-201ENSMUST00000032130 1889 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.67■□□□□ 0.1
Derl1Q99J56 Anapc5-205ENSMUST00000197074 2413 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.67■□□□□ 0.1
Derl1Q99J56 Anapc5-212ENSMUST00000199406 2413 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.67■□□□□ 0.1
Derl1Q99J56 Tk2-201ENSMUST00000050211 2406 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.67■□□□□ 0.1
Derl1Q99J56 Traf3-203ENSMUST00000117269 6972 ntTSL 1 (best) BASIC15.67■□□□□ 0.1
Derl1Q99J56 Gm39157-201ENSMUST00000212322 1180 ntTSL 5 BASIC15.67■□□□□ 0.1
Derl1Q99J56 Nsd1-206ENSMUST00000224918 1001 ntBASIC15.67■□□□□ 0.1
Derl1Q99J56 Anapc11-202ENSMUST00000093140 962 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.67■□□□□ 0.1
Derl1Q99J56 Avl9-203ENSMUST00000177249 1614 ntTSL 1 (best) BASIC15.67■□□□□ 0.1
Derl1Q99J56 Trmt61a-201ENSMUST00000084947 2433 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.67■□□□□ 0.1
Derl1Q99J56 Pafah1b1-201ENSMUST00000021091 5803 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.67■□□□□ 0.1
Derl1Q99J56 2310035C23Rik-202ENSMUST00000086721 5414 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.67■□□□□ 0.1
Derl1Q99J56 Cep57-209ENSMUST00000148086 2467 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.67■□□□□ 0.1
Derl1Q99J56 Vav3-201ENSMUST00000046864 5019 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.67■□□□□ 0.1
Derl1Q99J56 Rapgef1-203ENSMUST00000102872 6402 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.67■□□□□ 0.1
Derl1Q99J56 Klhl15-205ENSMUST00000113916 2363 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.67■□□□□ 0.1
Derl1Q99J56 Chd5-202ENSMUST00000030775 9486 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC15.66■□□□□ 0.1
Derl1Q99J56 Kcnn4-202ENSMUST00000205428 1945 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.66■□□□□ 0.1
Derl1Q99J56 St3gal3-201ENSMUST00000030263 2549 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.66■□□□□ 0.1
Derl1Q99J56 Usp2-206ENSMUST00000176416 1486 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.66■□□□□ 0.1
Derl1Q99J56 Baiap2-205ENSMUST00000106233 2442 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.66■□□□□ 0.1
Derl1Q99J56 Auh-204ENSMUST00000120535 1647 ntTSL 1 (best) BASIC15.66■□□□□ 0.1
Derl1Q99J56 Map4k4-202ENSMUST00000168431 5632 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.66■□□□□ 0.1
Derl1Q99J56 4932443I19Rik-201ENSMUST00000166277 799 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.66■□□□□ 0.1
Derl1Q99J56 Lsm4-204ENSMUST00000210071 575 ntTSL 5 BASIC15.66■□□□□ 0.1
Derl1Q99J56 Gm10612-201ENSMUST00000162198 1681 ntTSL 1 (best) BASIC15.66■□□□□ 0.1
Derl1Q99J56 Sh3bp1-204ENSMUST00000109698 1923 ntTSL 1 (best) BASIC15.66■□□□□ 0.1
Derl1Q99J56 Foxf1-201ENSMUST00000181504 2415 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.66■□□□□ 0.1
Derl1Q99J56 Lfng-201ENSMUST00000031555 2305 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.66■□□□□ 0.1
Derl1Q99J56 Aplp1-201ENSMUST00000006828 2343 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.66■□□□□ 0.1
Derl1Q99J56 Setd4-202ENSMUST00000113951 1826 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.66■□□□□ 0.1
Derl1Q99J56 E130208F15Rik-201ENSMUST00000098585 1733 ntAPPRIS P1 BASIC15.65■□□□□ 0.1
Derl1Q99J56 Tex264-202ENSMUST00000163441 1896 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.65■□□□□ 0.1
Derl1Q99J56 Pstpip1-201ENSMUST00000059206 1863 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.65■□□□□ 0.1
Derl1Q99J56 Cbln2-202ENSMUST00000122079 2549 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.65■□□□□ 0.1
Derl1Q99J56 Qdpr-201ENSMUST00000015950 1380 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.65■□□□□ 0.1
Derl1Q99J56 Pknox2-201ENSMUST00000039674 3632 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.65■□□□□ 0.1
Derl1Q99J56 Adpgk-201ENSMUST00000026266 2464 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC15.65■□□□□ 0.1
Derl1Q99J56 Agtpbp1-222ENSMUST00000171606 3037 ntTSL 1 (best) BASIC15.65■□□□□ 0.1
Derl1Q99J56 Pus1-203ENSMUST00000086643 1868 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC15.65■□□□□ 0.1
Derl1Q99J56 Arl4c-203ENSMUST00000187810 2740 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.65■□□□□ 0.1
Derl1Q99J56 Wipi1-202ENSMUST00000103060 2050 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.64■□□□□ 0.09
Derl1Q99J56 AU022751-201ENSMUST00000101698 1838 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.64■□□□□ 0.09
Derl1Q99J56 Srsf4-202ENSMUST00000053819 2257 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.64■□□□□ 0.09
Derl1Q99J56 Zfyve9-202ENSMUST00000106657 6459 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC15.64■□□□□ 0.09
Derl1Q99J56 Nudt3-203ENSMUST00000114886 996 ntTSL 2 BASIC15.64■□□□□ 0.09
Derl1Q99J56 Gtf2a2-203ENSMUST00000119413 1034 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.64■□□□□ 0.09
Derl1Q99J56 Gm13889-202ENSMUST00000148314 1240 ntAPPRIS P1 BASIC15.64■□□□□ 0.09
Derl1Q99J56 Creb3l1-201ENSMUST00000028663 2603 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.64■□□□□ 0.09
Derl1Q99J56 Zfp282-201ENSMUST00000061890 5573 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.64■□□□□ 0.09
Derl1Q99J56 Rbm7-201ENSMUST00000170000 1773 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.64■□□□□ 0.09
Derl1Q99J56 Pkm-201ENSMUST00000034834 2432 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.64■□□□□ 0.09
Derl1Q99J56 Clint1-202ENSMUST00000109261 3365 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.64■□□□□ 0.09
Derl1Q99J56 Enah-203ENSMUST00000111025 3385 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.64■□□□□ 0.09
Derl1Q99J56 Gfi1-203ENSMUST00000159164 2648 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.64■□□□□ 0.09
Derl1Q99J56 Gramd1a-201ENSMUST00000001280 2713 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.63■□□□□ 0.09
Derl1Q99J56 Usf2-201ENSMUST00000058860 2419 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.63■□□□□ 0.09
Derl1Q99J56 Lgals3-201ENSMUST00000142734 1419 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.63■□□□□ 0.09
Derl1Q99J56 March11-201ENSMUST00000126304 2146 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.63■□□□□ 0.09
Derl1Q99J56 Rab42-201ENSMUST00000040411 761 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.63■□□□□ 0.09
Derl1Q99J56 Sept7-202ENSMUST00000165594 2516 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC15.63■□□□□ 0.09
Derl1Q99J56 Chtf8-201ENSMUST00000169312 2730 ntTSL 1 (best) BASIC15.63■□□□□ 0.09
Derl1Q99J56 Serbp1-207ENSMUST00000203436 1667 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.63■□□□□ 0.09
Derl1Q99J56 Gas2-203ENSMUST00000107591 2232 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.63■□□□□ 0.09
Derl1Q99J56 Pdss1-207ENSMUST00000152170 1538 ntTSL 1 (best) BASIC15.63■□□□□ 0.09
Derl1Q99J56 Syt17-203ENSMUST00000203485 1932 ntTSL 1 (best) BASIC15.62■□□□□ 0.09
Derl1Q99J56 Dtx4-201ENSMUST00000045521 5765 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.62■□□□□ 0.09
Derl1Q99J56 Wnt10a-201ENSMUST00000006718 2468 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.62■□□□□ 0.09
Derl1Q99J56 Nol4l-201ENSMUST00000035346 6399 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.62■□□□□ 0.09
Derl1Q99J56 Cep170b-202ENSMUST00000101018 6641 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.62■□□□□ 0.09
Derl1Q99J56 Slc35f4-202ENSMUST00000123534 2748 ntTSL 1 (best) BASIC15.62■□□□□ 0.09
Derl1Q99J56 Lpcat2-205ENSMUST00000210099 2179 ntTSL 1 (best) BASIC15.62■□□□□ 0.09
Derl1Q99J56 Fam105a-202ENSMUST00000226145 2950 ntAPPRIS P1 BASIC15.62■□□□□ 0.09
Derl1Q99J56 Egln1-201ENSMUST00000034469 3594 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.62■□□□□ 0.09
Derl1Q99J56 Myef2-209ENSMUST00000152367 2071 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC15.62■□□□□ 0.09
Derl1Q99J56 Pknox1-203ENSMUST00000175806 2272 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.62■□□□□ 0.09
Derl1Q99J56 Shisa7-203ENSMUST00000119433 3481 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.62■□□□□ 0.09
Derl1Q99J56 Astn2-202ENSMUST00000084496 4675 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.62■□□□□ 0.09
Derl1Q99J56 Dlg3-204ENSMUST00000113736 4940 ntTSL 1 (best) BASIC15.62■□□□□ 0.09
Derl1Q99J56 Adgrl1-207ENSMUST00000141158 8181 ntTSL 1 (best) BASIC15.62■□□□□ 0.09
Derl1Q99J56 Golph3-205ENSMUST00000228671 2842 ntBASIC15.62■□□□□ 0.09
Derl1Q99J56 Tesmin-204ENSMUST00000151341 2013 ntTSL 1 (best) BASIC15.61■□□□□ 0.09
Derl1Q99J56 Gm43653-201ENSMUST00000198136 1608 ntTSL 3 BASIC15.61■□□□□ 0.09
Derl1Q99J56 Rbm38-204ENSMUST00000173393 2071 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.61■□□□□ 0.09
Derl1Q99J56 Nova2-202ENSMUST00000220302 8372 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.61■□□□□ 0.09
Derl1Q99J56 Nova2-201ENSMUST00000032571 8372 ntTSL 5 BASIC15.61■□□□□ 0.09
Derl1Q99J56 Lipt2-201ENSMUST00000032967 1663 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.61■□□□□ 0.09
Derl1Q99J56 Sumf1-201ENSMUST00000032191 2593 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.61■□□□□ 0.09
Derl1Q99J56 Wbp1-208ENSMUST00000151393 837 ntTSL 3 BASIC15.61■□□□□ 0.09
Derl1Q99J56 Kras-207ENSMUST00000203147 817 ntTSL 5 BASIC15.61■□□□□ 0.09
Derl1Q99J56 Ntn1-201ENSMUST00000021284 5738 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.61■□□□□ 0.09
Derl1Q99J56 6330420H09Rik-201ENSMUST00000211371 1316 ntTSL 1 (best) BASIC15.61■□□□□ 0.09
Derl1Q99J56 Fkbp9-201ENSMUST00000031795 3009 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.6■□□□□ 0.09
Derl1Q99J56 Plppr3-201ENSMUST00000092325 2766 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.6■□□□□ 0.09
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 14.9 ms