Protein–RNA interactions for Protein: Q99388

Csprs, Component of Sp100-rs, mousemouse

Predictions only

Length 208 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
CsprsQ99388 Lyar-201ENSMUST00000087514 1563 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.42■□□□□ 0.38
CsprsQ99388 Btf3l4-203ENSMUST00000102741 1033 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.42■□□□□ 0.38
CsprsQ99388 Gm43592-201ENSMUST00000196922 1165 ntBASIC17.42■□□□□ 0.38
CsprsQ99388 Gm5131-201ENSMUST00000212776 1238 ntBASIC17.42■□□□□ 0.38
CsprsQ99388 Ndfip1-201ENSMUST00000025293 930 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.42■□□□□ 0.38
CsprsQ99388 Mmp15-201ENSMUST00000034243 5135 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.42■□□□□ 0.38
CsprsQ99388 Ddost-201ENSMUST00000030538 2120 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.42■□□□□ 0.38
CsprsQ99388 Ythdf1-201ENSMUST00000037299 3184 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.42■□□□□ 0.38
CsprsQ99388 Rbfox3-204ENSMUST00000106278 1542 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.42■□□□□ 0.38
CsprsQ99388 2310035C23Rik-202ENSMUST00000086721 5414 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC17.42■□□□□ 0.38
CsprsQ99388 Gapvd1-201ENSMUST00000028224 5695 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC17.41■□□□□ 0.38
CsprsQ99388 Glrb-201ENSMUST00000029654 3029 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.41■□□□□ 0.38
CsprsQ99388 Lgals3-201ENSMUST00000142734 1419 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.41■□□□□ 0.38
CsprsQ99388 Gm5067-201ENSMUST00000170449 1009 ntBASIC17.41■□□□□ 0.38
CsprsQ99388 Becn1-216ENSMUST00000170502 725 ntTSL 1 (best) BASIC17.41■□□□□ 0.38
CsprsQ99388 Ppp2r3d-202ENSMUST00000180270 450 ntTSL 1 (best) BASIC17.41■□□□□ 0.38
CsprsQ99388 Vcpkmt-201ENSMUST00000058639 1027 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.41■□□□□ 0.38
CsprsQ99388 Mtfr1l-201ENSMUST00000102550 2025 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.41■□□□□ 0.38
CsprsQ99388 Rab1a-203ENSMUST00000109602 2626 ntTSL 5 BASIC17.41■□□□□ 0.38
CsprsQ99388 Cbx3-201ENSMUST00000031862 1889 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.41■□□□□ 0.38
CsprsQ99388 2810474O19Rik-201ENSMUST00000046689 6066 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC17.41■□□□□ 0.38
CsprsQ99388 Mpnd-204ENSMUST00000149441 1701 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC17.41■□□□□ 0.38
CsprsQ99388 Il17re-205ENSMUST00000203661 2118 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.41■□□□□ 0.38
CsprsQ99388 Zdhhc14-201ENSMUST00000089185 3115 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.41■□□□□ 0.38
CsprsQ99388 9130213A22Rik-201ENSMUST00000180487 1581 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.4■□□□□ 0.38
CsprsQ99388 Gm43545-201ENSMUST00000196765 2779 ntBASIC17.4■□□□□ 0.38
CsprsQ99388 Ppcs-201ENSMUST00000030385 1443 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.4■□□□□ 0.38
CsprsQ99388 Atp11a-202ENSMUST00000091237 7443 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.4■□□□□ 0.38
CsprsQ99388 9230116N13Rik-201ENSMUST00000181746 2097 ntTSL 1 (best) BASIC17.4■□□□□ 0.38
CsprsQ99388 Tfap2e-201ENSMUST00000048194 2085 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.4■□□□□ 0.38
CsprsQ99388 Jkamp-202ENSMUST00000117449 1874 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.4■□□□□ 0.38
CsprsQ99388 Paxip1-201ENSMUST00000002291 5850 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.4■□□□□ 0.38
CsprsQ99388 Gm45051-201ENSMUST00000206838 963 ntTSL 1 (best) BASIC17.4■□□□□ 0.38
CsprsQ99388 Ppp1cb-201ENSMUST00000015100 5962 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.4■□□□□ 0.38
CsprsQ99388 Parp12-201ENSMUST00000038398 3231 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.4■□□□□ 0.38
CsprsQ99388 Adgrl1-207ENSMUST00000141158 8181 ntTSL 1 (best) BASIC17.4■□□□□ 0.38
CsprsQ99388 Rfx8-202ENSMUST00000151913 2008 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.4■□□□□ 0.38
CsprsQ99388 Mrpl48-207ENSMUST00000146003 1625 ntTSL 1 (best) BASIC17.39■□□□□ 0.38
CsprsQ99388 Alx3-201ENSMUST00000014747 1874 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.39■□□□□ 0.38
CsprsQ99388 D030062O11Rik-201ENSMUST00000192660 2806 ntBASIC17.39■□□□□ 0.38
CsprsQ99388 Mtx1-202ENSMUST00000118964 1445 ntTSL 5 BASIC17.39■□□□□ 0.38
CsprsQ99388 Notch4-201ENSMUST00000015612 6591 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.39■□□□□ 0.37
CsprsQ99388 Crocc-211ENSMUST00000168157 6244 ntTSL 1 (best) BASIC17.39■□□□□ 0.37
CsprsQ99388 Crocc-201ENSMUST00000040222 6248 ntTSL 5 BASIC17.39■□□□□ 0.37
CsprsQ99388 Psmd7-201ENSMUST00000044106 1581 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.39■□□□□ 0.37
CsprsQ99388 3830408C21Rik-205ENSMUST00000225426 1898 ntBASIC17.39■□□□□ 0.37
CsprsQ99388 D11Wsu47e-201ENSMUST00000042227 2196 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.39■□□□□ 0.37
CsprsQ99388 Stmn4-204ENSMUST00000121955 1361 ntTSL 5 BASIC17.39■□□□□ 0.37
CsprsQ99388 Sdhaf1-201ENSMUST00000098586 2490 ntAPPRIS P1 BASIC17.39■□□□□ 0.37
CsprsQ99388 Vstm2b-201ENSMUST00000044705 2627 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.38■□□□□ 0.37
CsprsQ99388 Cdk8-201ENSMUST00000031640 2973 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC17.38■□□□□ 0.37
CsprsQ99388 Zcchc24-201ENSMUST00000069180 4556 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.38■□□□□ 0.37
CsprsQ99388 Kndc1-202ENSMUST00000121839 2210 ntTSL 2 BASIC17.38■□□□□ 0.37
CsprsQ99388 Sft2d1-210ENSMUST00000154553 1049 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.38■□□□□ 0.37
CsprsQ99388 Arhgap39-204ENSMUST00000176219 542 ntTSL 5 BASIC17.38■□□□□ 0.37
CsprsQ99388 Slc35d3-201ENSMUST00000059805 2630 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.38■□□□□ 0.37
CsprsQ99388 Tmem263-201ENSMUST00000095383 3616 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.38■□□□□ 0.37
CsprsQ99388 Ppp1r16a-201ENSMUST00000037551 2692 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.38■□□□□ 0.37
CsprsQ99388 Pou2f2-210ENSMUST00000176408 1697 ntTSL 5 BASIC17.38■□□□□ 0.37
CsprsQ99388 Ak2-202ENSMUST00000102604 1781 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC17.38■□□□□ 0.37
CsprsQ99388 Atrnl1-201ENSMUST00000077282 6581 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.37■□□□□ 0.37
CsprsQ99388 Psip1-202ENSMUST00000107214 1973 ntTSL 5 BASIC17.37■□□□□ 0.37
CsprsQ99388 Erf-202ENSMUST00000116343 690 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC17.37■□□□□ 0.37
CsprsQ99388 Gm26837-201ENSMUST00000180821 2110 ntTSL 5 BASIC17.37■□□□□ 0.37
CsprsQ99388 Aldoa-214ENSMUST00000207534 741 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.37■□□□□ 0.37
CsprsQ99388 Pank2-204ENSMUST00000150843 4266 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.37■□□□□ 0.37
CsprsQ99388 Stau2-217ENSMUST00000162751 3030 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.37■□□□□ 0.37
CsprsQ99388 Gp1bb-202ENSMUST00000167388 1847 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC17.36■□□□□ 0.37
CsprsQ99388 Agfg1-202ENSMUST00000113444 3142 ntTSL 1 (best) BASIC17.36■□□□□ 0.37
CsprsQ99388 Tmem240-202ENSMUST00000147721 817 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.36■□□□□ 0.37
CsprsQ99388 Tarbp1-201ENSMUST00000170518 6383 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.36■□□□□ 0.37
CsprsQ99388 Man2c1os-201ENSMUST00000125333 1910 ntTSL 1 (best) BASIC17.36■□□□□ 0.37
CsprsQ99388 Ago4-201ENSMUST00000084289 6537 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.36■□□□□ 0.37
CsprsQ99388 Tram1-201ENSMUST00000027068 2938 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.36■□□□□ 0.37
CsprsQ99388 Spata5l1-202ENSMUST00000152813 1526 ntTSL 1 (best) BASIC17.36■□□□□ 0.37
CsprsQ99388 Mad2l2-201ENSMUST00000030860 1535 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.36■□□□□ 0.37
CsprsQ99388 Thoc6-201ENSMUST00000047436 1504 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.36■□□□□ 0.37
CsprsQ99388 Pnrc1-201ENSMUST00000049357 1648 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.36■□□□□ 0.37
CsprsQ99388 Cdk11b-202ENSMUST00000105598 2673 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.35■□□□□ 0.37
CsprsQ99388 Mal2-201ENSMUST00000025356 2950 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.35■□□□□ 0.37
CsprsQ99388 Ptpmt1-203ENSMUST00000125001 3183 ntTSL 1 (best) BASIC17.35■□□□□ 0.37
CsprsQ99388 Pdzd3-201ENSMUST00000034618 2193 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.35■□□□□ 0.37
CsprsQ99388 Cdc14b-201ENSMUST00000039318 5859 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.35■□□□□ 0.37
CsprsQ99388 Gm27040-201ENSMUST00000181984 504 ntTSL 2 BASIC17.35■□□□□ 0.37
CsprsQ99388 Dcbld1-203ENSMUST00000218582 2795 ntTSL 1 (best) BASIC17.35■□□□□ 0.37
CsprsQ99388 Tmie-201ENSMUST00000050958 2802 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.35■□□□□ 0.37
CsprsQ99388 Mpnd-209ENSMUST00000162883 1400 ntTSL 5 BASIC17.35■□□□□ 0.37
CsprsQ99388 Ubl7-208ENSMUST00000216841 1426 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.35■□□□□ 0.37
CsprsQ99388 Sptbn4-201ENSMUST00000011895 8747 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC17.35■□□□□ 0.37
CsprsQ99388 Tmem86a-201ENSMUST00000010451 1831 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.35■□□□□ 0.37
CsprsQ99388 Slc30a9-204ENSMUST00000162372 5711 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.35■□□□□ 0.37
CsprsQ99388 Ptger3-202ENSMUST00000173533 2097 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.35■□□□□ 0.37
CsprsQ99388 Catsper2-201ENSMUST00000038073 2247 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.35■□□□□ 0.37
CsprsQ99388 Adgra2-202ENSMUST00000178514 5129 ntTSL 5 BASIC17.35■□□□□ 0.37
CsprsQ99388 Zfp213-201ENSMUST00000095606 2672 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.34■□□□□ 0.37
CsprsQ99388 Fndc5-201ENSMUST00000102600 2763 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.34■□□□□ 0.37
CsprsQ99388 Fzd8-201ENSMUST00000041080 3346 ntAPPRIS P1 BASIC17.34■□□□□ 0.37
CsprsQ99388 Astn2-202ENSMUST00000084496 4675 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC17.34■□□□□ 0.37
CsprsQ99388 Slk-201ENSMUST00000026043 7278 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.34■□□□□ 0.37
CsprsQ99388 Dynll1-202ENSMUST00000112090 729 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC17.34■□□□□ 0.37
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 52.2 ms