Protein–RNA interactions for Protein: Q924N9

Prss28, Serine protease 28, mousemouse

Predictions only

Length 274 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Prss28Q924N9 Gm16286-205ENSMUST00000127234 1755 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.61■□□□□ 0.57
Prss28Q924N9 Pink1-203ENSMUST00000105817 1711 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC18.61■□□□□ 0.57
Prss28Q924N9 Snx21-206ENSMUST00000174070 1446 ntTSL 5 BASIC18.61■□□□□ 0.57
Prss28Q924N9 Gm26507-201ENSMUST00000181838 1410 ntTSL 1 (best) BASIC18.61■□□□□ 0.57
Prss28Q924N9 Cox18-202ENSMUST00000118816 1307 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.61■□□□□ 0.57
Prss28Q924N9 Smim27-201ENSMUST00000129758 1044 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.61■□□□□ 0.57
Prss28Q924N9 Rtl8a-201ENSMUST00000088779 1195 ntAPPRIS P1 BASIC18.61■□□□□ 0.57
Prss28Q924N9 Cops9-201ENSMUST00000097642 438 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.61■□□□□ 0.57
Prss28Q924N9 Ubp1-204ENSMUST00000214095 2320 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC18.61■□□□□ 0.57
Prss28Q924N9 Acot3-202ENSMUST00000120927 1854 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.6■□□□□ 0.57
Prss28Q924N9 Siah1b-202ENSMUST00000071667 1712 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.6■□□□□ 0.57
Prss28Q924N9 Avl9-203ENSMUST00000177249 1614 ntTSL 1 (best) BASIC18.6■□□□□ 0.57
Prss28Q924N9 Gm10830-201ENSMUST00000186379 636 ntTSL 5 BASIC18.6■□□□□ 0.57
Prss28Q924N9 Gm44732-201ENSMUST00000208055 635 ntTSL 3 BASIC18.6■□□□□ 0.57
Prss28Q924N9 Bean1-205ENSMUST00000212979 2131 ntAPPRIS P4 TSL 5 BASIC18.6■□□□□ 0.57
Prss28Q924N9 Gng5-201ENSMUST00000090031 593 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.6■□□□□ 0.57
Prss28Q924N9 Trp53rka-201ENSMUST00000039007 1880 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.6■□□□□ 0.57
Prss28Q924N9 Homer3-201ENSMUST00000003669 2323 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC18.6■□□□□ 0.57
Prss28Q924N9 Tmem260-210ENSMUST00000227440 2222 ntAPPRIS ALT2 BASIC18.59■□□□□ 0.57
Prss28Q924N9 Lmo2-208ENSMUST00000170926 1529 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC18.59■□□□□ 0.57
Prss28Q924N9 4930412F12Rik-201ENSMUST00000211700 1471 ntBASIC18.59■□□□□ 0.57
Prss28Q924N9 March11-203ENSMUST00000152841 1365 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.59■□□□□ 0.57
Prss28Q924N9 Dyrk2-201ENSMUST00000004281 6129 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.59■□□□□ 0.57
Prss28Q924N9 Mrpl12-201ENSMUST00000043627 1316 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.59■□□□□ 0.57
Prss28Q924N9 Hook1-201ENSMUST00000030306 5517 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.59■□□□□ 0.57
Prss28Q924N9 Tekt5-201ENSMUST00000043415 1803 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.59■□□□□ 0.57
Prss28Q924N9 Ankrd9-205ENSMUST00000142012 1226 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC18.59■□□□□ 0.57
Prss28Q924N9 Atp23-202ENSMUST00000168520 1043 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.59■□□□□ 0.57
Prss28Q924N9 Gm42555-201ENSMUST00000199304 1039 ntBASIC18.59■□□□□ 0.57
Prss28Q924N9 Gm11175-202ENSMUST00000211380 408 ntTSL 3 BASIC18.59■□□□□ 0.57
Prss28Q924N9 E130116L18Rik-201ENSMUST00000066954 306 ntAPPRIS P1 BASIC18.59■□□□□ 0.57
Prss28Q924N9 Podxl2-210ENSMUST00000145944 2065 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC18.59■□□□□ 0.57
Prss28Q924N9 Pdcd4-201ENSMUST00000025931 2330 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.58■□□□□ 0.57
Prss28Q924N9 Vkorc1l1-201ENSMUST00000051758 3112 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.58■□□□□ 0.57
Prss28Q924N9 Heca-201ENSMUST00000037879 5098 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.58■□□□□ 0.57
Prss28Q924N9 G630030J09Rik-201ENSMUST00000181958 2135 ntTSL 1 (best) BASIC18.58■□□□□ 0.57
Prss28Q924N9 Lbp-202ENSMUST00000109491 1322 ntTSL 2 BASIC18.58■□□□□ 0.57
Prss28Q924N9 Marc1-201ENSMUST00000048462 2039 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC18.58■□□□□ 0.56
Prss28Q924N9 1700030C12Rik-201ENSMUST00000101462 858 ntTSL 5 BASIC18.58■□□□□ 0.56
Prss28Q924N9 Ntsr2-202ENSMUST00000220892 846 ntTSL 3 BASIC18.58■□□□□ 0.56
Prss28Q924N9 Rps23-201ENSMUST00000051955 937 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.58■□□□□ 0.56
Prss28Q924N9 Pold2-201ENSMUST00000102922 1646 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.58■□□□□ 0.56
Prss28Q924N9 Vapa-201ENSMUST00000024897 1640 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.58■□□□□ 0.56
Prss28Q924N9 Syndig1l-201ENSMUST00000095550 2524 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.58■□□□□ 0.56
Prss28Q924N9 Rundc3a-202ENSMUST00000107102 1837 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC18.58■□□□□ 0.56
Prss28Q924N9 Ctage5-218ENSMUST00000177162 2728 ntTSL 5 BASIC18.58■□□□□ 0.56
Prss28Q924N9 Ccdc177-201ENSMUST00000073251 5775 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.57■□□□□ 0.56
Prss28Q924N9 Med25-205ENSMUST00000207278 2287 ntTSL 1 (best) BASIC18.57■□□□□ 0.56
Prss28Q924N9 Ppt2-204ENSMUST00000168391 1342 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.57■□□□□ 0.56
Prss28Q924N9 Gm29241-201ENSMUST00000189260 1096 ntBASIC18.57■□□□□ 0.56
Prss28Q924N9 0610010K14Rik-202ENSMUST00000021181 779 ntTSL 1 (best) BASIC18.57■□□□□ 0.56
Prss28Q924N9 Hccs-201ENSMUST00000033717 2320 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.57■□□□□ 0.56
Prss28Q924N9 Slc36a1-201ENSMUST00000020499 1950 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.57■□□□□ 0.56
Prss28Q924N9 Rce1-201ENSMUST00000025823 1402 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.57■□□□□ 0.56
Prss28Q924N9 Fbxw4-201ENSMUST00000046869 2068 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.56■□□□□ 0.56
Prss28Q924N9 Rgs19-201ENSMUST00000002532 1511 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.56■□□□□ 0.56
Prss28Q924N9 Dtymk-202ENSMUST00000112890 1055 ntTSL 1 (best) BASIC18.56■□□□□ 0.56
Prss28Q924N9 Fam228b-205ENSMUST00000218575 1281 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC18.56■□□□□ 0.56
Prss28Q924N9 Sdf2l1-201ENSMUST00000023453 1108 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.56■□□□□ 0.56
Prss28Q924N9 Tnnt2-201ENSMUST00000027671 1064 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC18.56■□□□□ 0.56
Prss28Q924N9 Prkar2b-201ENSMUST00000003079 1657 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.56■□□□□ 0.56
Prss28Q924N9 Pan3-201ENSMUST00000031651 5048 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC18.56■□□□□ 0.56
Prss28Q924N9 Boll-203ENSMUST00000159398 658 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.55■□□□□ 0.56
Prss28Q924N9 Ap3s1-204ENSMUST00000225520 957 ntBASIC18.55■□□□□ 0.56
Prss28Q924N9 Tmem54-201ENSMUST00000030575 1064 ntTSL 1 (best) BASIC18.55■□□□□ 0.56
Prss28Q924N9 H2afy-201ENSMUST00000016081 2046 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.55■□□□□ 0.56
Prss28Q924N9 Smarcc1-201ENSMUST00000088716 5717 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC18.55■□□□□ 0.56
Prss28Q924N9 Ptbp3-208ENSMUST00000172768 2147 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC18.55■□□□□ 0.56
Prss28Q924N9 Foxj3-209ENSMUST00000162267 1391 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.55■□□□□ 0.56
Prss28Q924N9 Uchl5-206ENSMUST00000189936 1696 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.54■□□□□ 0.56
Prss28Q924N9 Dusp7-201ENSMUST00000172306 3213 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.54■□□□□ 0.56
Prss28Q924N9 Atraid-201ENSMUST00000013766 966 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC18.54■□□□□ 0.56
Prss28Q924N9 E130307A14Rik-208ENSMUST00000145971 830 ntTSL 3 BASIC18.54■□□□□ 0.56
Prss28Q924N9 AC137127.1-201ENSMUST00000213466 1078 ntBASIC18.54■□□□□ 0.56
Prss28Q924N9 Mfap4-201ENSMUST00000040522 939 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC18.54■□□□□ 0.56
Prss28Q924N9 Eml4-202ENSMUST00000096766 5445 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.53■□□□□ 0.56
Prss28Q924N9 Rell2-201ENSMUST00000070709 1767 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.53■□□□□ 0.56
Prss28Q924N9 Zfp513-201ENSMUST00000031562 2213 ntTSL 1 (best) BASIC18.53■□□□□ 0.56
Prss28Q924N9 Tmem54-203ENSMUST00000106064 1066 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.53■□□□□ 0.56
Prss28Q924N9 1700023F06Rik-202ENSMUST00000107026 1127 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.53■□□□□ 0.56
Prss28Q924N9 Msantd3-203ENSMUST00000107704 1597 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.53■□□□□ 0.56
Prss28Q924N9 Atp8a1-204ENSMUST00000113652 854 ntTSL 1 (best) BASIC18.53■□□□□ 0.56
Prss28Q924N9 Gm16076-201ENSMUST00000140116 480 ntTSL 3 BASIC18.53■□□□□ 0.56
Prss28Q924N9 Tpsg1-204ENSMUST00000160920 867 ntTSL 3 BASIC18.53■□□□□ 0.56
Prss28Q924N9 Reep4-203ENSMUST00000226563 1444 ntBASIC18.53■□□□□ 0.56
Prss28Q924N9 AC135637.1-201ENSMUST00000227750 365 ntBASIC18.53■□□□□ 0.56
Prss28Q924N9 Cldn5-201ENSMUST00000043577 1414 ntAPPRIS P1 BASIC18.53■□□□□ 0.56
Prss28Q924N9 Hoxb9-201ENSMUST00000000010 2574 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.53■□□□□ 0.56
Prss28Q924N9 Uap1-203ENSMUST00000111351 2287 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.53■□□□□ 0.56
Prss28Q924N9 Btbd6-201ENSMUST00000002880 2057 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC18.53■□□□□ 0.56
Prss28Q924N9 Fnta-201ENSMUST00000016138 1930 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.53■□□□□ 0.56
Prss28Q924N9 Hoxb6-201ENSMUST00000000704 1321 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.52■□□□□ 0.56
Prss28Q924N9 Phlpp1-201ENSMUST00000061047 6226 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.52■□□□□ 0.56
Prss28Q924N9 Psip1-202ENSMUST00000107214 1973 ntTSL 5 BASIC18.52■□□□□ 0.56
Prss28Q924N9 Shisa8-201ENSMUST00000179269 1804 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.52■□□□□ 0.56
Prss28Q924N9 Emc6-202ENSMUST00000108480 563 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC18.52■□□□□ 0.56
Prss28Q924N9 Gm12473-201ENSMUST00000137535 579 ntTSL 5 BASIC18.52■□□□□ 0.56
Prss28Q924N9 Cyp4f13-204ENSMUST00000139353 1389 ntTSL 1 (best) BASIC18.52■□□□□ 0.55
Prss28Q924N9 Ntn5-201ENSMUST00000107742 1574 ntTSL 1 (best) BASIC18.51■□□□□ 0.55
Prss28Q924N9 Rnf32-204ENSMUST00000160246 1565 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.51■□□□□ 0.55
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 33.9 ms