Protein–RNA interactions for Protein: Q923W1

Tgs1, Trimethylguanosine synthase, mousemouse

Predictions only

Length 853 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Tgs1Q923W1 4930524B15Rik-201ENSMUST00000102829 2000 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.26■■□□□ 1.15
Tgs1Q923W1 Glrb-201ENSMUST00000029654 3029 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.26■■□□□ 1.15
Tgs1Q923W1 En2-201ENSMUST00000036177 3539 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.26■■□□□ 1.15
Tgs1Q923W1 Cacnb1-205ENSMUST00000107562 1745 ntTSL 1 (best) BASIC22.26■■□□□ 1.15
Tgs1Q923W1 Tmem120a-201ENSMUST00000043378 1559 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.26■■□□□ 1.15
Tgs1Q923W1 Trim33-201ENSMUST00000029444 8875 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC22.26■■□□□ 1.15
Tgs1Q923W1 Cdkn2d-203ENSMUST00000215619 1423 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.26■■□□□ 1.15
Tgs1Q923W1 Pth2-201ENSMUST00000042754 503 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.26■■□□□ 1.15
Tgs1Q923W1 4930524J08Rik-201ENSMUST00000046721 603 ntAPPRIS P1 BASIC22.26■■□□□ 1.15
Tgs1Q923W1 H2-Q2-201ENSMUST00000074806 1262 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.26■■□□□ 1.15
Tgs1Q923W1 Fgfrl1-201ENSMUST00000013633 2329 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.26■■□□□ 1.15
Tgs1Q923W1 Ubxn2a-201ENSMUST00000020962 2696 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.26■■□□□ 1.15
Tgs1Q923W1 Serbp1-207ENSMUST00000203436 1667 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.26■■□□□ 1.15
Tgs1Q923W1 Man2c1os-201ENSMUST00000125333 1910 ntTSL 1 (best) BASIC22.25■■□□□ 1.15
Tgs1Q923W1 Siah1b-201ENSMUST00000037928 1783 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.25■■□□□ 1.15
Tgs1Q923W1 Rab43-203ENSMUST00000078647 4605 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.25■■□□□ 1.15
Tgs1Q923W1 Stx2-202ENSMUST00000100680 2769 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.25■■□□□ 1.15
Tgs1Q923W1 Mknk2-205ENSMUST00000200082 3439 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.25■■□□□ 1.15
Tgs1Q923W1 Uqcrc1-201ENSMUST00000026743 1653 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.25■■□□□ 1.15
Tgs1Q923W1 Uba2-201ENSMUST00000102746 2579 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.25■■□□□ 1.15
Tgs1Q923W1 Gm16933-201ENSMUST00000141741 2169 ntTSL 1 (best) BASIC22.25■■□□□ 1.15
Tgs1Q923W1 Syt5-201ENSMUST00000065957 1750 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.25■■□□□ 1.15
Tgs1Q923W1 Zbtb4-203ENSMUST00000108640 4067 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.25■■□□□ 1.15
Tgs1Q923W1 Fam193b-201ENSMUST00000021957 4341 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.25■■□□□ 1.15
Tgs1Q923W1 Rasl11b-201ENSMUST00000051937 1812 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.24■■□□□ 1.15
Tgs1Q923W1 Rims1-209ENSMUST00000218140 1434 ntTSL 5 BASIC22.24■■□□□ 1.15
Tgs1Q923W1 Cdk8-201ENSMUST00000031640 2973 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22.24■■□□□ 1.15
Tgs1Q923W1 Tfpt-204ENSMUST00000155592 1091 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.24■■□□□ 1.15
Tgs1Q923W1 Prrt2-206ENSMUST00000202045 429 ntTSL 5 BASIC22.24■■□□□ 1.15
Tgs1Q923W1 2310022A10Rik-205ENSMUST00000187960 1989 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC22.24■■□□□ 1.15
Tgs1Q923W1 Mrgbp-201ENSMUST00000029085 1510 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.24■■□□□ 1.15
Tgs1Q923W1 AI846148-201ENSMUST00000025924 3183 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.24■■□□□ 1.15
Tgs1Q923W1 Slc9a7-201ENSMUST00000072451 2512 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.24■■□□□ 1.15
Tgs1Q923W1 Ercc6l2-208ENSMUST00000144763 1820 ntTSL 1 (best) BASIC22.24■■□□□ 1.15
Tgs1Q923W1 Csf2ra-201ENSMUST00000076046 1849 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.24■■□□□ 1.15
Tgs1Q923W1 Ttc9b-201ENSMUST00000008088 2052 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.24■■□□□ 1.15
Tgs1Q923W1 Slc35d3-201ENSMUST00000059805 2630 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.24■■□□□ 1.15
Tgs1Q923W1 Prss50-201ENSMUST00000051097 1456 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.23■■□□□ 1.15
Tgs1Q923W1 Setd4-202ENSMUST00000113951 1826 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.23■■□□□ 1.15
Tgs1Q923W1 Dapk1-202ENSMUST00000077453 5491 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.23■■□□□ 1.15
Tgs1Q923W1 Pmvk-201ENSMUST00000029564 1194 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.23■■□□□ 1.15
Tgs1Q923W1 Rab3il1-201ENSMUST00000113161 2225 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC22.23■■□□□ 1.15
Tgs1Q923W1 Mreg-201ENSMUST00000048860 2284 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.23■■□□□ 1.15
Tgs1Q923W1 Rnpep-201ENSMUST00000074357 2171 ntTSL 1 (best) BASIC22.22■■□□□ 1.15
Tgs1Q923W1 Tex264-202ENSMUST00000163441 1896 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.22■■□□□ 1.15
Tgs1Q923W1 Camk2b-201ENSMUST00000002817 1872 ntTSL 5 BASIC22.22■■□□□ 1.15
Tgs1Q923W1 Wnt10b-203ENSMUST00000226610 2217 ntAPPRIS P1 BASIC22.22■■□□□ 1.15
Tgs1Q923W1 Wnt10b-201ENSMUST00000023732 2226 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.22■■□□□ 1.15
Tgs1Q923W1 Cited4-201ENSMUST00000094814 1249 ntAPPRIS P1 BASIC22.22■■□□□ 1.15
Tgs1Q923W1 Fam102b-202ENSMUST00000171143 5702 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.22■■□□□ 1.15
Tgs1Q923W1 Yy1-201ENSMUST00000021692 6178 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.22■■□□□ 1.15
Tgs1Q923W1 Schip1-205ENSMUST00000182532 2059 ntTSL 1 (best) BASIC22.22■■□□□ 1.15
Tgs1Q923W1 Ccdc149-202ENSMUST00000198008 2470 ntTSL 5 BASIC22.22■■□□□ 1.15
Tgs1Q923W1 D130058E05Rik-201ENSMUST00000173856 1372 ntTSL 2 BASIC22.22■■□□□ 1.15
Tgs1Q923W1 Cacnb1-203ENSMUST00000103144 2236 ntTSL 5 BASIC22.22■■□□□ 1.15
Tgs1Q923W1 Ak2-202ENSMUST00000102604 1781 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC22.21■■□□□ 1.15
Tgs1Q923W1 Clec3b-201ENSMUST00000026890 992 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.21■■□□□ 1.15
Tgs1Q923W1 Spg7-211ENSMUST00000153285 2481 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC22.21■■□□□ 1.15
Tgs1Q923W1 Pcf11-204ENSMUST00000208058 461 ntTSL 5 BASIC22.2■■□□□ 1.14
Tgs1Q923W1 Fam216a-201ENSMUST00000031419 1388 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.2■■□□□ 1.14
Tgs1Q923W1 H2afj-202ENSMUST00000203982 577 ntAPPRIS ALT1 TSL 3 BASIC22.19■■□□□ 1.14
Tgs1Q923W1 Bloc1s5-202ENSMUST00000224115 1020 ntBASIC22.19■■□□□ 1.14
Tgs1Q923W1 C1qtnf5-204ENSMUST00000114821 1365 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22.19■■□□□ 1.14
Tgs1Q923W1 Abhd8-201ENSMUST00000008094 1978 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.19■■□□□ 1.14
Tgs1Q923W1 Kctd20-204ENSMUST00000122163 2423 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.19■■□□□ 1.14
Tgs1Q923W1 Tram1-201ENSMUST00000027068 2938 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.19■■□□□ 1.14
Tgs1Q923W1 Smim10l2a-201ENSMUST00000068106 2393 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.18■■□□□ 1.14
Tgs1Q923W1 Pus1-203ENSMUST00000086643 1868 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC22.18■■□□□ 1.14
Tgs1Q923W1 Cbx4-201ENSMUST00000026665 5179 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.18■■□□□ 1.14
Tgs1Q923W1 Pbx1-202ENSMUST00000072863 1709 ntTSL 1 (best) BASIC22.18■■□□□ 1.14
Tgs1Q923W1 Amh-201ENSMUST00000036016 1670 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.18■■□□□ 1.14
Tgs1Q923W1 Dcbld1-203ENSMUST00000218582 2795 ntTSL 1 (best) BASIC22.18■■□□□ 1.14
Tgs1Q923W1 Pptc7-201ENSMUST00000053426 4644 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.18■■□□□ 1.14
Tgs1Q923W1 Lrp8-204ENSMUST00000106733 3332 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC22.18■■□□□ 1.14
Tgs1Q923W1 Cnpy3-201ENSMUST00000059844 1908 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.18■■□□□ 1.14
Tgs1Q923W1 Fam3c-205ENSMUST00000165576 2826 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.17■■□□□ 1.14
Tgs1Q923W1 Gtpbp2-217ENSMUST00000172170 2587 ntTSL 5 BASIC22.17■■□□□ 1.14
Tgs1Q923W1 Gp1bb-202ENSMUST00000167388 1847 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC22.17■■□□□ 1.14
Tgs1Q923W1 Parp12-201ENSMUST00000038398 3231 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.16■■□□□ 1.14
Tgs1Q923W1 Ache-209ENSMUST00000196208 1911 ntTSL 5 BASIC22.16■■□□□ 1.14
Tgs1Q923W1 Whrn-204ENSMUST00000095037 2419 ntTSL 1 (best) BASIC22.16■■□□□ 1.14
Tgs1Q923W1 Gm9725-202ENSMUST00000166229 2326 ntTSL 5 BASIC22.16■■□□□ 1.14
Tgs1Q923W1 Dleu2-209ENSMUST00000182957 352 ntTSL 2 BASIC22.16■■□□□ 1.14
Tgs1Q923W1 Hsf1-204ENSMUST00000226872 2104 ntBASIC22.16■■□□□ 1.14
Tgs1Q923W1 Utp11-201ENSMUST00000030738 1603 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.16■■□□□ 1.14
Tgs1Q923W1 Zdhhc5-201ENSMUST00000035840 4706 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.16■■□□□ 1.14
Tgs1Q923W1 Lrp3-202ENSMUST00000122409 4147 ntTSL 1 (best) BASIC22.16■■□□□ 1.14
Tgs1Q923W1 Cobll1-204ENSMUST00000112430 4917 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.15■■□□□ 1.14
Tgs1Q923W1 Htra2-201ENSMUST00000089645 1725 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.15■■□□□ 1.14
Tgs1Q923W1 Suz12-206ENSMUST00000163272 4303 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC22.15■■□□□ 1.14
Tgs1Q923W1 Psmg1-202ENSMUST00000117044 807 ntTSL 5 BASIC22.15■■□□□ 1.14
Tgs1Q923W1 Ung-202ENSMUST00000102584 2136 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.15■■□□□ 1.14
Tgs1Q923W1 Syap1-201ENSMUST00000033723 2087 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.15■■□□□ 1.14
Tgs1Q923W1 Smim19-202ENSMUST00000163774 1435 ntTSL 1 (best) BASIC22.14■■□□□ 1.14
Tgs1Q923W1 Mras-201ENSMUST00000035045 4701 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.14■■□□□ 1.14
Tgs1Q923W1 Klc3-201ENSMUST00000047170 1901 ntTSL 1 (best) BASIC22.14■■□□□ 1.14
Tgs1Q923W1 Gm10399-202ENSMUST00000202768 748 ntBASIC22.14■■□□□ 1.13
Tgs1Q923W1 Rbm7-201ENSMUST00000170000 1773 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.14■■□□□ 1.13
Tgs1Q923W1 Il17re-205ENSMUST00000203661 2118 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.13■■□□□ 1.13
Tgs1Q923W1 Fndc4-201ENSMUST00000041266 1375 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.13■■□□□ 1.13
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 26.8 ms