Protein–RNA interactions for Protein: Q922F4

Tubb6, Tubulin beta-6 chain, mousemouse

Predictions only

Length 447 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Tubb6Q922F4 Fam149b-201ENSMUST00000037698 924 ntTSL 1 (best) BASIC23.75■■□□□ 1.39
Tubb6Q922F4 Lgr4-202ENSMUST00000111037 4988 ntTSL 5 BASIC23.75■■□□□ 1.39
Tubb6Q922F4 Pdcd7-201ENSMUST00000048184 2419 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC23.75■■□□□ 1.39
Tubb6Q922F4 Gm37035-201ENSMUST00000194809 2148 ntBASIC23.75■■□□□ 1.39
Tubb6Q922F4 Cltb-202ENSMUST00000091609 2186 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC23.75■■□□□ 1.39
Tubb6Q922F4 Letm2-201ENSMUST00000079160 2126 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.74■■□□□ 1.39
Tubb6Q922F4 Cryzl1-203ENSMUST00000117644 1727 ntTSL 1 (best) BASIC23.74■■□□□ 1.39
Tubb6Q922F4 Kctd2-202ENSMUST00000106533 2649 ntTSL 1 (best) BASIC23.74■■□□□ 1.39
Tubb6Q922F4 Ssx2ip-203ENSMUST00000106151 3232 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.73■■□□□ 1.39
Tubb6Q922F4 Rem2-202ENSMUST00000164766 1884 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.73■■□□□ 1.39
Tubb6Q922F4 Syncrip-201ENSMUST00000069221 9450 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC23.73■■□□□ 1.39
Tubb6Q922F4 Gm13001-201ENSMUST00000154285 774 ntTSL 2 BASIC23.73■■□□□ 1.39
Tubb6Q922F4 Tcte2-201ENSMUST00000053376 1105 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.73■■□□□ 1.39
Tubb6Q922F4 Qtrt1-201ENSMUST00000002902 1316 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.73■■□□□ 1.39
Tubb6Q922F4 Exoc3l2-201ENSMUST00000011407 2200 ntTSL 5 BASIC23.73■■□□□ 1.39
Tubb6Q922F4 Mprip-204ENSMUST00000116371 8766 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.73■■□□□ 1.39
Tubb6Q922F4 Espn-207ENSMUST00000105653 1411 ntTSL 5 BASIC23.73■■□□□ 1.39
Tubb6Q922F4 Bfsp1-201ENSMUST00000028907 2372 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC23.73■■□□□ 1.39
Tubb6Q922F4 AA543186-201ENSMUST00000180841 1696 ntTSL 1 (best) BASIC23.73■■□□□ 1.39
Tubb6Q922F4 Rem1-201ENSMUST00000000369 1663 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.73■■□□□ 1.39
Tubb6Q922F4 Aatf-201ENSMUST00000018841 1822 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.73■■□□□ 1.39
Tubb6Q922F4 Msl3l2-201ENSMUST00000063138 2140 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.72■■□□□ 1.39
Tubb6Q922F4 Tsc22d1-203ENSMUST00000101618 1043 ntTSL 1 (best) BASIC23.72■■□□□ 1.39
Tubb6Q922F4 Gm5522-201ENSMUST00000189483 1242 ntBASIC23.72■■□□□ 1.39
Tubb6Q922F4 Gm35065-201ENSMUST00000199206 428 ntTSL 3 BASIC23.72■■□□□ 1.39
Tubb6Q922F4 Gm5812-201ENSMUST00000061073 957 ntBASIC23.72■■□□□ 1.39
Tubb6Q922F4 Bloc1s4-201ENSMUST00000071949 1273 ntAPPRIS P1 BASIC23.72■■□□□ 1.39
Tubb6Q922F4 Bcas2-201ENSMUST00000005830 1467 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.72■■□□□ 1.39
Tubb6Q922F4 Uqcrc1-201ENSMUST00000026743 1653 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.72■■□□□ 1.39
Tubb6Q922F4 Slc36a4-202ENSMUST00000115588 1745 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.72■■□□□ 1.39
Tubb6Q922F4 Dgat1-201ENSMUST00000023214 1888 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.72■■□□□ 1.39
Tubb6Q922F4 Frmd4a-201ENSMUST00000075767 6761 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.72■■□□□ 1.39
Tubb6Q922F4 Fam207a-201ENSMUST00000045454 2394 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.72■■□□□ 1.39
Tubb6Q922F4 Rell2-202ENSMUST00000091932 1995 ntTSL 2 BASIC23.71■■□□□ 1.39
Tubb6Q922F4 Cradd-205ENSMUST00000220279 1613 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.71■■□□□ 1.39
Tubb6Q922F4 Hyal2-203ENSMUST00000193747 1532 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.71■■□□□ 1.39
Tubb6Q922F4 Selenof-201ENSMUST00000082437 1514 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.71■■□□□ 1.39
Tubb6Q922F4 Efr3a-203ENSMUST00000172756 1411 ntTSL 1 (best) BASIC23.71■■□□□ 1.39
Tubb6Q922F4 Pdf-201ENSMUST00000055316 1306 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.71■■□□□ 1.39
Tubb6Q922F4 Bex4-201ENSMUST00000116527 837 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.71■■□□□ 1.39
Tubb6Q922F4 Cep97-205ENSMUST00000121703 609 ntTSL 1 (best) BASIC23.71■■□□□ 1.39
Tubb6Q922F4 Gm10685-201ENSMUST00000196120 433 ntTSL 3 BASIC23.71■■□□□ 1.39
Tubb6Q922F4 Slc9a7-201ENSMUST00000072451 2512 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC23.71■■□□□ 1.39
Tubb6Q922F4 Znrf3-201ENSMUST00000109867 6311 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC23.71■■□□□ 1.39
Tubb6Q922F4 1700018A14Rik-201ENSMUST00000195587 711 ntBASIC23.7■■□□□ 1.38
Tubb6Q922F4 Ptger3-202ENSMUST00000173533 2097 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.69■■□□□ 1.38
Tubb6Q922F4 Kctd9-201ENSMUST00000078053 3157 ntTSL 1 (best) BASIC23.69■■□□□ 1.38
Tubb6Q922F4 Hrh3-203ENSMUST00000164442 1242 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC23.69■■□□□ 1.38
Tubb6Q922F4 Sec24d-208ENSMUST00000200333 307 ntTSL 1 (best) BASIC23.69■■□□□ 1.38
Tubb6Q922F4 Ankrd11-207ENSMUST00000212937 943 ntTSL 1 (best) BASIC23.69■■□□□ 1.38
Tubb6Q922F4 Cacnb1-203ENSMUST00000103144 2236 ntTSL 5 BASIC23.69■■□□□ 1.38
Tubb6Q922F4 Zfp821-201ENSMUST00000034163 2127 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.68■■□□□ 1.38
Tubb6Q922F4 Cuta-201ENSMUST00000025027 639 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC23.68■■□□□ 1.38
Tubb6Q922F4 Cenpb-201ENSMUST00000089510 4886 ntAPPRIS P1 BASIC23.68■■□□□ 1.38
Tubb6Q922F4 Triobp-202ENSMUST00000109688 2553 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.68■■□□□ 1.38
Tubb6Q922F4 Bhlhe23-201ENSMUST00000108878 2520 ntAPPRIS P1 BASIC23.68■■□□□ 1.38
Tubb6Q922F4 Hcn4-201ENSMUST00000034889 6118 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.68■■□□□ 1.38
Tubb6Q922F4 Cpne2-202ENSMUST00000109537 2121 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.68■■□□□ 1.38
Tubb6Q922F4 Gt(ROSA)26Sor-201ENSMUST00000124246 1181 ntTSL 1 (best) BASIC23.67■■□□□ 1.38
Tubb6Q922F4 Gm15820-201ENSMUST00000201566 728 ntBASIC23.67■■□□□ 1.38
Tubb6Q922F4 1700020G03Rik-201ENSMUST00000211264 889 ntBASIC23.67■■□□□ 1.38
Tubb6Q922F4 Pgk1-201ENSMUST00000081593 1825 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.67■■□□□ 1.38
Tubb6Q922F4 Dus1l-203ENSMUST00000106135 1863 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC23.66■■□□□ 1.38
Tubb6Q922F4 Mum1-201ENSMUST00000020365 2640 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.66■■□□□ 1.38
Tubb6Q922F4 Riox1-201ENSMUST00000053744 2344 ntAPPRIS P1 BASIC23.66■■□□□ 1.38
Tubb6Q922F4 Mvb12b-201ENSMUST00000041555 4998 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.66■■□□□ 1.38
Tubb6Q922F4 Hoxb6-202ENSMUST00000173432 1964 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC23.66■■□□□ 1.38
Tubb6Q922F4 Ipmk-201ENSMUST00000079252 5447 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC23.66■■□□□ 1.38
Tubb6Q922F4 Dedd2-201ENSMUST00000058702 1828 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.66■■□□□ 1.38
Tubb6Q922F4 Vmn1r17-205ENSMUST00000228342 2230 ntAPPRIS P2 BASIC23.65■■□□□ 1.38
Tubb6Q922F4 Gm34220-201ENSMUST00000223001 2709 ntBASIC23.65■■□□□ 1.38
Tubb6Q922F4 Slc30a2-203ENSMUST00000105873 1224 ntTSL 5 BASIC23.65■■□□□ 1.38
Tubb6Q922F4 Gm16253-201ENSMUST00000148290 550 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.65■■□□□ 1.38
Tubb6Q922F4 Gm7417-201ENSMUST00000192950 473 ntBASIC23.65■■□□□ 1.38
Tubb6Q922F4 Kcnip3-202ENSMUST00000088538 1296 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.65■■□□□ 1.38
Tubb6Q922F4 Gjc2-202ENSMUST00000108793 2187 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.65■■□□□ 1.38
Tubb6Q922F4 Glrx5-201ENSMUST00000021522 2925 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.65■■□□□ 1.38
Tubb6Q922F4 Mgrn1-201ENSMUST00000023159 3293 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.65■■□□□ 1.38
Tubb6Q922F4 Gm9780-202ENSMUST00000184915 1394 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.65■■□□□ 1.38
Tubb6Q922F4 Npr3-205ENSMUST00000228603 2437 ntAPPRIS ALT2 BASIC23.64■■□□□ 1.38
Tubb6Q922F4 A930012O16Rik-202ENSMUST00000156418 1541 ntTSL 2 BASIC23.64■■□□□ 1.38
Tubb6Q922F4 Slc16a10-201ENSMUST00000092566 5397 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.64■■□□□ 1.37
Tubb6Q922F4 Gm15546-201ENSMUST00000122095 826 ntBASIC23.64■■□□□ 1.37
Tubb6Q922F4 Gm27151-202ENSMUST00000185015 1145 ntTSL 5 BASIC23.64■■□□□ 1.37
Tubb6Q922F4 Ech1-201ENSMUST00000066264 1267 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.64■■□□□ 1.37
Tubb6Q922F4 4930527J03Rik-201ENSMUST00000094270 543 ntBASIC23.64■■□□□ 1.37
Tubb6Q922F4 Rbm38-201ENSMUST00000029014 1768 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.64■■□□□ 1.37
Tubb6Q922F4 Fam19a5-201ENSMUST00000068088 2575 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.64■■□□□ 1.37
Tubb6Q922F4 Gm20634-201ENSMUST00000090779 2956 ntBASIC23.64■■□□□ 1.37
Tubb6Q922F4 Lrrc38-201ENSMUST00000052458 2324 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.64■■□□□ 1.37
Tubb6Q922F4 Nab2-202ENSMUST00000099157 2311 ntTSL 1 (best) BASIC23.64■■□□□ 1.37
Tubb6Q922F4 Rasgrp2-206ENSMUST00000113472 2124 ntTSL 1 (best) BASIC23.63■■□□□ 1.37
Tubb6Q922F4 Hras-207ENSMUST00000168550 2272 ntTSL 5 BASIC23.63■■□□□ 1.37
Tubb6Q922F4 Stx18-202ENSMUST00000042146 1473 ntTSL 1 (best) BASIC23.63■■□□□ 1.37
Tubb6Q922F4 E130311K13Rik-201ENSMUST00000061706 1640 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.63■■□□□ 1.37
Tubb6Q922F4 Syt5-201ENSMUST00000065957 1750 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.63■■□□□ 1.37
Tubb6Q922F4 Zbed3-202ENSMUST00000221807 1945 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.63■■□□□ 1.37
Tubb6Q922F4 Aars-201ENSMUST00000034441 5750 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.63■■□□□ 1.37
Tubb6Q922F4 Gm9870-201ENSMUST00000063874 645 ntBASIC23.63■■□□□ 1.37
Tubb6Q922F4 Rab5c-201ENSMUST00000019317 1967 ntTSL 1 (best) BASIC23.63■■□□□ 1.37
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 22.9 ms