Protein–RNA interactions for Protein: Q920Q4

Vps16, Vacuolar protein sorting-associated protein 16 homolog, mousemouse

Predictions only

Length 839 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Vps16Q920Q4 AC093043.1-201ENSMUST00000226700 898 ntBASIC22.93■■□□□ 1.26
Vps16Q920Q4 Ntn5-202ENSMUST00000182750 1758 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.93■■□□□ 1.26
Vps16Q920Q4 Socs2-201ENSMUST00000020215 2222 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.93■■□□□ 1.26
Vps16Q920Q4 Krt79-201ENSMUST00000023799 2097 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.93■■□□□ 1.26
Vps16Q920Q4 Cotl1-202ENSMUST00000168698 1520 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.92■■□□□ 1.26
Vps16Q920Q4 Mcmbp-202ENSMUST00000119081 2347 ntTSL 1 (best) BASIC22.92■■□□□ 1.26
Vps16Q920Q4 Gm572-201ENSMUST00000105698 1385 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.92■■□□□ 1.26
Vps16Q920Q4 Nphp1-202ENSMUST00000110357 2296 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.92■■□□□ 1.26
Vps16Q920Q4 Mprip-204ENSMUST00000116371 8766 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.92■■□□□ 1.26
Vps16Q920Q4 Strn3-201ENSMUST00000013130 3046 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.92■■□□□ 1.26
Vps16Q920Q4 Gm7417-201ENSMUST00000192950 473 ntBASIC22.92■■□□□ 1.26
Vps16Q920Q4 Tcte2-201ENSMUST00000053376 1105 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.92■■□□□ 1.26
Vps16Q920Q4 Rasa1-201ENSMUST00000109552 4563 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.92■■□□□ 1.26
Vps16Q920Q4 Map2k1-201ENSMUST00000005066 2436 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.92■■□□□ 1.26
Vps16Q920Q4 Ccng2-201ENSMUST00000031331 2810 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.92■■□□□ 1.26
Vps16Q920Q4 Tead1-204ENSMUST00000106638 3047 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC22.92■■□□□ 1.26
Vps16Q920Q4 Mum1-201ENSMUST00000020365 2640 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.92■■□□□ 1.26
Vps16Q920Q4 Eml2-202ENSMUST00000117338 2765 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC22.91■■□□□ 1.26
Vps16Q920Q4 Rp2-203ENSMUST00000115391 1398 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.91■■□□□ 1.26
Vps16Q920Q4 Fam207a-201ENSMUST00000045454 2394 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.91■■□□□ 1.26
Vps16Q920Q4 Pth1r-201ENSMUST00000006005 2307 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.91■■□□□ 1.26
Vps16Q920Q4 Gm9959-201ENSMUST00000068277 390 ntBASIC22.91■■□□□ 1.26
Vps16Q920Q4 Kifc3-201ENSMUST00000034240 3277 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC22.91■■□□□ 1.26
Vps16Q920Q4 AC152827.1-201ENSMUST00000221143 2189 ntBASIC22.9■■□□□ 1.26
Vps16Q920Q4 Aplf-201ENSMUST00000032130 1889 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.9■■□□□ 1.26
Vps16Q920Q4 Qtrt1-201ENSMUST00000002902 1316 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.9■■□□□ 1.26
Vps16Q920Q4 Celf6-202ENSMUST00000118164 1583 ntTSL 1 (best) BASIC22.9■■□□□ 1.26
Vps16Q920Q4 Rxrb-201ENSMUST00000044858 2623 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC22.9■■□□□ 1.26
Vps16Q920Q4 Setd4-202ENSMUST00000113951 1826 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.9■■□□□ 1.26
Vps16Q920Q4 Hist2h2ab-201ENSMUST00000073115 444 ntAPPRIS P1 BASIC22.9■■□□□ 1.26
Vps16Q920Q4 Efr3a-203ENSMUST00000172756 1411 ntTSL 1 (best) BASIC22.9■■□□□ 1.26
Vps16Q920Q4 Timm8a1-201ENSMUST00000054213 1421 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.9■■□□□ 1.26
Vps16Q920Q4 Stau2-217ENSMUST00000162751 3030 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.9■■□□□ 1.26
Vps16Q920Q4 Gm9780-202ENSMUST00000184915 1394 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.89■■□□□ 1.26
Vps16Q920Q4 Gm10685-201ENSMUST00000196120 433 ntTSL 3 BASIC22.89■■□□□ 1.25
Vps16Q920Q4 Socs1-201ENSMUST00000038099 1220 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.89■■□□□ 1.25
Vps16Q920Q4 Bhlhe23-201ENSMUST00000108878 2520 ntAPPRIS P1 BASIC22.89■■□□□ 1.25
Vps16Q920Q4 Maf-202ENSMUST00000109104 6360 ntAPPRIS P2 BASIC22.88■■□□□ 1.25
Vps16Q920Q4 Letm2-201ENSMUST00000079160 2126 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.88■■□□□ 1.25
Vps16Q920Q4 Hcn4-201ENSMUST00000034889 6118 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.88■■□□□ 1.25
Vps16Q920Q4 Akt1s1-204ENSMUST00000107885 1812 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.88■■□□□ 1.25
Vps16Q920Q4 Socs2-202ENSMUST00000119917 948 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.88■■□□□ 1.25
Vps16Q920Q4 Hrh3-203ENSMUST00000164442 1242 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC22.88■■□□□ 1.25
Vps16Q920Q4 Gm7143-201ENSMUST00000222811 859 ntBASIC22.88■■□□□ 1.25
Vps16Q920Q4 AC164424.2-201ENSMUST00000223281 725 ntTSL 3 BASIC22.88■■□□□ 1.25
Vps16Q920Q4 Zc3h8-201ENSMUST00000028866 1624 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.88■■□□□ 1.25
Vps16Q920Q4 Mvb12b-201ENSMUST00000041555 4998 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.88■■□□□ 1.25
Vps16Q920Q4 Stk3-202ENSMUST00000067033 2471 ntTSL 1 (best) BASIC22.87■■□□□ 1.25
Vps16Q920Q4 Fam49b-202ENSMUST00000164532 1770 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.87■■□□□ 1.25
Vps16Q920Q4 1700105P06Rik-201ENSMUST00000186160 1772 ntBASIC22.87■■□□□ 1.25
Vps16Q920Q4 Hsf1-205ENSMUST00000227478 2084 ntAPPRIS P1 BASIC22.87■■□□□ 1.25
Vps16Q920Q4 Wrap73-201ENSMUST00000030895 1598 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.87■■□□□ 1.25
Vps16Q920Q4 Pkmyt1-201ENSMUST00000024701 2039 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.87■■□□□ 1.25
Vps16Q920Q4 Rell2-210ENSMUST00000176104 2150 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.87■■□□□ 1.25
Vps16Q920Q4 Foxd1-201ENSMUST00000105098 5064 ntAPPRIS P1 BASIC22.86■■□□□ 1.25
Vps16Q920Q4 E130311K13Rik-201ENSMUST00000061706 1640 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.86■■□□□ 1.25
Vps16Q920Q4 1700030C10Rik-203ENSMUST00000189625 1735 ntTSL 1 (best) BASIC22.86■■□□□ 1.25
Vps16Q920Q4 Rgs10-205ENSMUST00000145739 564 ntTSL 1 (best) BASIC22.86■■□□□ 1.25
Vps16Q920Q4 Gm14207-203ENSMUST00000156538 988 ntTSL 2 BASIC22.86■■□□□ 1.25
Vps16Q920Q4 Gm37035-201ENSMUST00000194809 2148 ntBASIC22.86■■□□□ 1.25
Vps16Q920Q4 Ccdc74a-201ENSMUST00000056962 1273 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.86■■□□□ 1.25
Vps16Q920Q4 Msl3l2-201ENSMUST00000063138 2140 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.86■■□□□ 1.25
Vps16Q920Q4 Stn1-201ENSMUST00000049369 1992 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.86■■□□□ 1.25
Vps16Q920Q4 Riox1-201ENSMUST00000053744 2344 ntAPPRIS P1 BASIC22.86■■□□□ 1.25
Vps16Q920Q4 Zbtb7a-202ENSMUST00000117956 1863 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.85■■□□□ 1.25
Vps16Q920Q4 Barhl1-203ENSMUST00000113849 2102 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.85■■□□□ 1.25
Vps16Q920Q4 Tfap2e-201ENSMUST00000048194 2085 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.85■■□□□ 1.25
Vps16Q920Q4 Chst12-201ENSMUST00000043050 2331 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.85■■□□□ 1.25
Vps16Q920Q4 Triobp-202ENSMUST00000109688 2553 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.85■■□□□ 1.25
Vps16Q920Q4 Mprip-202ENSMUST00000072031 8718 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC22.85■■□□□ 1.25
Vps16Q920Q4 Zbtb7a-203ENSMUST00000119606 1841 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.85■■□□□ 1.25
Vps16Q920Q4 Sephs2-201ENSMUST00000082428 2177 ntAPPRIS P1 BASIC22.84■■□□□ 1.25
Vps16Q920Q4 Cryzl1-203ENSMUST00000117644 1727 ntTSL 1 (best) BASIC22.84■■□□□ 1.25
Vps16Q920Q4 Phc2-202ENSMUST00000106079 2535 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.84■■□□□ 1.25
Vps16Q920Q4 K230010J24Rik-204ENSMUST00000187868 1810 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.84■■□□□ 1.25
Vps16Q920Q4 Tmed10-201ENSMUST00000040766 1482 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.84■■□□□ 1.25
Vps16Q920Q4 Bcas2-201ENSMUST00000005830 1467 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.84■■□□□ 1.25
Vps16Q920Q4 Ccdc149-202ENSMUST00000198008 2470 ntTSL 5 BASIC22.84■■□□□ 1.25
Vps16Q920Q4 Cpne2-202ENSMUST00000109537 2121 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.84■■□□□ 1.25
Vps16Q920Q4 Zbtb4-203ENSMUST00000108640 4067 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.83■■□□□ 1.25
Vps16Q920Q4 Tsen54-201ENSMUST00000021134 1979 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.83■■□□□ 1.25
Vps16Q920Q4 Krt5-201ENSMUST00000023709 2190 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.83■■□□□ 1.25
Vps16Q920Q4 Six5-201ENSMUST00000049454 3007 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.83■■□□□ 1.25
Vps16Q920Q4 Xpa-202ENSMUST00000058232 1241 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.83■■□□□ 1.25
Vps16Q920Q4 Clip1-205ENSMUST00000111566 6133 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.83■■□□□ 1.25
Vps16Q920Q4 Aatf-201ENSMUST00000018841 1822 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.82■■□□□ 1.24
Vps16Q920Q4 Prrt1-201ENSMUST00000015620 1940 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.82■■□□□ 1.24
Vps16Q920Q4 3830408C21Rik-205ENSMUST00000225426 1898 ntBASIC22.82■■□□□ 1.24
Vps16Q920Q4 Lrrc38-201ENSMUST00000052458 2324 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.82■■□□□ 1.24
Vps16Q920Q4 Slc26a10-201ENSMUST00000095270 2215 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC22.82■■□□□ 1.24
Vps16Q920Q4 Gpatch3-201ENSMUST00000030662 2004 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.82■■□□□ 1.24
Vps16Q920Q4 Gtpbp2-217ENSMUST00000172170 2587 ntTSL 5 BASIC22.82■■□□□ 1.24
Vps16Q920Q4 Hras-207ENSMUST00000168550 2272 ntTSL 5 BASIC22.82■■□□□ 1.24
Vps16Q920Q4 Gjc2-202ENSMUST00000108793 2187 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.82■■□□□ 1.24
Vps16Q920Q4 Tmem51-201ENSMUST00000036572 1875 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.81■■□□□ 1.24
Vps16Q920Q4 1110032F04Rik-201ENSMUST00000054551 2578 ntAPPRIS P1 BASIC22.81■■□□□ 1.24
Vps16Q920Q4 Ercc6l2-208ENSMUST00000144763 1820 ntTSL 1 (best) BASIC22.81■■□□□ 1.24
Vps16Q920Q4 Gm13001-201ENSMUST00000154285 774 ntTSL 2 BASIC22.81■■□□□ 1.24
Vps16Q920Q4 Anp32e-210ENSMUST00000171368 878 ntTSL 3 BASIC22.81■■□□□ 1.24
Vps16Q920Q4 Sec61a2-201ENSMUST00000026926 756 ntTSL 5 BASIC22.81■■□□□ 1.24
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 17.3 ms