Protein–RNA interactions for Protein: Q91YR7

Prpf6, Pre-mRNA-processing factor 6, mousemouse

Known RBP Predictions only

Length 941 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Prpf6Q91YR7 Tead4-202ENSMUST00000112157 1909 ntTSL 1 (best) BASIC22.29■■□□□ 1.16
Prpf6Q91YR7 Pick1-204ENSMUST00000163571 2054 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.29■■□□□ 1.16
Prpf6Q91YR7 Inpp5a-203ENSMUST00000106098 2826 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.29■■□□□ 1.16
Prpf6Q91YR7 Hras-201ENSMUST00000026572 2828 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.29■■□□□ 1.16
Prpf6Q91YR7 Hccs-202ENSMUST00000112115 2473 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.29■■□□□ 1.16
Prpf6Q91YR7 E130307A14Rik-202ENSMUST00000133302 438 ntTSL 5 BASIC22.29■■□□□ 1.16
Prpf6Q91YR7 Hyal2-203ENSMUST00000193747 1532 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.29■■□□□ 1.16
Prpf6Q91YR7 Adcy9-203ENSMUST00000120080 4974 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.29■■□□□ 1.16
Prpf6Q91YR7 Nphp1-202ENSMUST00000110357 2296 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.29■■□□□ 1.16
Prpf6Q91YR7 Iqck-206ENSMUST00000208658 2891 ntBASIC22.28■■□□□ 1.16
Prpf6Q91YR7 Gm10616-201ENSMUST00000205285 2127 ntBASIC22.28■■□□□ 1.16
Prpf6Q91YR7 Slc12a8-204ENSMUST00000121925 2656 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC22.28■■□□□ 1.16
Prpf6Q91YR7 Gng12-202ENSMUST00000114222 1354 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.28■■□□□ 1.16
Prpf6Q91YR7 L3mbtl4-201ENSMUST00000093007 2445 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.28■■□□□ 1.16
Prpf6Q91YR7 Dapk1-202ENSMUST00000077453 5491 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.28■■□□□ 1.16
Prpf6Q91YR7 Cbln2-201ENSMUST00000068423 2475 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.28■■□□□ 1.16
Prpf6Q91YR7 Rps2-ps6-201ENSMUST00000095471 855 ntBASIC22.28■■□□□ 1.16
Prpf6Q91YR7 Ltk-202ENSMUST00000082130 2767 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.28■■□□□ 1.16
Prpf6Q91YR7 Ets1-202ENSMUST00000050797 1976 ntTSL 1 (best) BASIC22.28■■□□□ 1.16
Prpf6Q91YR7 Rfwd2-201ENSMUST00000076894 5116 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.28■■□□□ 1.16
Prpf6Q91YR7 Rhod-201ENSMUST00000048197 1344 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.28■■□□□ 1.16
Prpf6Q91YR7 Pkmyt1-201ENSMUST00000024701 2039 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.28■■□□□ 1.16
Prpf6Q91YR7 Acsl3-203ENSMUST00000134566 2492 ntTSL 1 (best) BASIC22.28■■□□□ 1.16
Prpf6Q91YR7 Spsb3-204ENSMUST00000119829 1955 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC22.27■■□□□ 1.16
Prpf6Q91YR7 Cav2-201ENSMUST00000000058 2733 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.27■■□□□ 1.16
Prpf6Q91YR7 Tpm1-206ENSMUST00000113686 998 ntTSL 5 BASIC22.27■■□□□ 1.16
Prpf6Q91YR7 H3f3a-207ENSMUST00000162814 724 ntAPPRIS P2 TSL 3 BASIC22.27■■□□□ 1.16
Prpf6Q91YR7 Cuta-201ENSMUST00000025027 639 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.27■■□□□ 1.16
Prpf6Q91YR7 8430432A02Rik-201ENSMUST00000039080 1248 ntBASIC22.27■■□□□ 1.16
Prpf6Q91YR7 Jak2-201ENSMUST00000025705 4947 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.27■■□□□ 1.16
Prpf6Q91YR7 Ntn5-202ENSMUST00000182750 1758 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.27■■□□□ 1.16
Prpf6Q91YR7 Inhbb-201ENSMUST00000038765 4255 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.27■■□□□ 1.16
Prpf6Q91YR7 Dbf4-201ENSMUST00000002368 2401 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.27■■□□□ 1.16
Prpf6Q91YR7 Tinagl1-202ENSMUST00000105998 1976 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.27■■□□□ 1.15
Prpf6Q91YR7 Stk3-202ENSMUST00000067033 2471 ntTSL 1 (best) BASIC22.26■■□□□ 1.15
Prpf6Q91YR7 Socs2-214ENSMUST00000172070 2153 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22.26■■□□□ 1.15
Prpf6Q91YR7 Cep78-201ENSMUST00000047704 2548 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.26■■□□□ 1.15
Prpf6Q91YR7 Slc9a7-201ENSMUST00000072451 2512 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.26■■□□□ 1.15
Prpf6Q91YR7 1700030C10Rik-203ENSMUST00000189625 1735 ntTSL 1 (best) BASIC22.26■■□□□ 1.15
Prpf6Q91YR7 Aktip-202ENSMUST00000120213 2200 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.26■■□□□ 1.15
Prpf6Q91YR7 Pcgf6-201ENSMUST00000026032 2098 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.26■■□□□ 1.15
Prpf6Q91YR7 Krt1-201ENSMUST00000023790 2445 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.26■■□□□ 1.15
Prpf6Q91YR7 Ache-209ENSMUST00000196208 1911 ntTSL 5 BASIC22.26■■□□□ 1.15
Prpf6Q91YR7 Gm14207-203ENSMUST00000156538 988 ntTSL 2 BASIC22.26■■□□□ 1.15
Prpf6Q91YR7 Rfx8-202ENSMUST00000151913 2008 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.26■■□□□ 1.15
Prpf6Q91YR7 Serbp1-207ENSMUST00000203436 1667 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.26■■□□□ 1.15
Prpf6Q91YR7 Naxd-202ENSMUST00000177955 1307 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.26■■□□□ 1.15
Prpf6Q91YR7 Meg3-207ENSMUST00000143836 1896 ntTSL 1 (best) BASIC22.26■■□□□ 1.15
Prpf6Q91YR7 AC124392.1-201ENSMUST00000225172 5324 ntBASIC22.26■■□□□ 1.15
Prpf6Q91YR7 Shox2-201ENSMUST00000029422 3079 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.25■■□□□ 1.15
Prpf6Q91YR7 Olfm1-204ENSMUST00000113920 2513 ntTSL 1 (best) BASIC22.25■■□□□ 1.15
Prpf6Q91YR7 Gm9817-201ENSMUST00000054395 2531 ntAPPRIS P1 BASIC22.25■■□□□ 1.15
Prpf6Q91YR7 Grsf1-201ENSMUST00000078945 2538 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.25■■□□□ 1.15
Prpf6Q91YR7 Akt1s1-204ENSMUST00000107885 1812 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.25■■□□□ 1.15
Prpf6Q91YR7 Gemin7-203ENSMUST00000119912 653 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC22.25■■□□□ 1.15
Prpf6Q91YR7 Thra-201ENSMUST00000064187 2452 ntTSL 1 (best) BASIC22.25■■□□□ 1.15
Prpf6Q91YR7 Celf6-202ENSMUST00000118164 1583 ntTSL 1 (best) BASIC22.25■■□□□ 1.15
Prpf6Q91YR7 Lrp3-202ENSMUST00000122409 4147 ntTSL 1 (best) BASIC22.25■■□□□ 1.15
Prpf6Q91YR7 Ubl3-202ENSMUST00000164904 2001 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.24■■□□□ 1.15
Prpf6Q91YR7 Aatf-201ENSMUST00000018841 1822 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.24■■□□□ 1.15
Prpf6Q91YR7 Prkab1-201ENSMUST00000031486 2089 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.24■■□□□ 1.15
Prpf6Q91YR7 Cryzl1-203ENSMUST00000117644 1727 ntTSL 1 (best) BASIC22.24■■□□□ 1.15
Prpf6Q91YR7 Usf2-203ENSMUST00000162228 960 ntTSL 5 BASIC22.24■■□□□ 1.15
Prpf6Q91YR7 Endod1-203ENSMUST00000214236 419 ntAPPRIS ALT2 TSL 3 BASIC22.24■■□□□ 1.15
Prpf6Q91YR7 Ssr2-201ENSMUST00000035785 1189 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.24■■□□□ 1.15
Prpf6Q91YR7 Stn1-201ENSMUST00000049369 1992 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.23■■□□□ 1.15
Prpf6Q91YR7 A930032L01Rik-201ENSMUST00000195845 957 ntBASIC22.23■■□□□ 1.15
Prpf6Q91YR7 Smco4-203ENSMUST00000215907 994 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.23■■□□□ 1.15
Prpf6Q91YR7 Mfn1-201ENSMUST00000091257 4562 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.23■■□□□ 1.15
Prpf6Q91YR7 Emc10-201ENSMUST00000118515 1662 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.23■■□□□ 1.15
Prpf6Q91YR7 Ankrd33b-203ENSMUST00000110410 2070 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.22■■□□□ 1.15
Prpf6Q91YR7 Tab2-204ENSMUST00000146444 4380 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.22■■□□□ 1.15
Prpf6Q91YR7 Arnt2-201ENSMUST00000085077 6151 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.22■■□□□ 1.15
Prpf6Q91YR7 Phox2b-201ENSMUST00000012664 3013 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.22■■□□□ 1.15
Prpf6Q91YR7 AC161180.2-201ENSMUST00000222567 1015 ntAPPRIS P1 BASIC22.22■■□□□ 1.15
Prpf6Q91YR7 Cdkl3-210ENSMUST00000121591 2387 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.22■■□□□ 1.15
Prpf6Q91YR7 Sc5d-202ENSMUST00000169609 1677 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.22■■□□□ 1.15
Prpf6Q91YR7 Dgcr6-209ENSMUST00000155387 1415 ntTSL 3 BASIC22.22■■□□□ 1.15
Prpf6Q91YR7 Ube2d2a-202ENSMUST00000170693 2483 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.21■■□□□ 1.15
Prpf6Q91YR7 Kcnc3-207ENSMUST00000209177 2960 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC22.21■■□□□ 1.15
Prpf6Q91YR7 Magi3-202ENSMUST00000121198 5912 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC22.21■■□□□ 1.15
Prpf6Q91YR7 Arpp19-206ENSMUST00000168301 599 ntTSL 5 BASIC22.21■■□□□ 1.15
Prpf6Q91YR7 AC117245.1-201ENSMUST00000215481 566 ntTSL 3 BASIC22.21■■□□□ 1.15
Prpf6Q91YR7 Rnf111-204ENSMUST00000213647 4961 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.21■■□□□ 1.15
Prpf6Q91YR7 Arhgap27os2-201ENSMUST00000123812 1390 ntTSL 1 (best) BASIC22.21■■□□□ 1.15
Prpf6Q91YR7 Mrpl38-201ENSMUST00000106439 1411 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.21■■□□□ 1.15
Prpf6Q91YR7 Ankrd9-207ENSMUST00000148765 1431 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC22.21■■□□□ 1.15
Prpf6Q91YR7 Art1-201ENSMUST00000033300 1425 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.21■■□□□ 1.15
Prpf6Q91YR7 Slc25a3-203ENSMUST00000164505 1483 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC22.21■■□□□ 1.15
Prpf6Q91YR7 A030001D20Rik-201ENSMUST00000211533 1542 ntTSL 1 (best) BASIC22.21■■□□□ 1.15
Prpf6Q91YR7 Lsm14a-201ENSMUST00000085585 2944 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.2■■□□□ 1.15
Prpf6Q91YR7 Erc1-202ENSMUST00000079582 2304 ntTSL 1 (best) BASIC22.2■■□□□ 1.15
Prpf6Q91YR7 Med25-201ENSMUST00000003049 2619 ntTSL 1 (best) BASIC22.2■■□□□ 1.14
Prpf6Q91YR7 Aplf-201ENSMUST00000032130 1889 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.2■■□□□ 1.14
Prpf6Q91YR7 Dda1-202ENSMUST00000124745 1933 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.2■■□□□ 1.14
Prpf6Q91YR7 Gm34220-201ENSMUST00000223001 2709 ntBASIC22.2■■□□□ 1.14
Prpf6Q91YR7 Ccne1-201ENSMUST00000108023 2000 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.2■■□□□ 1.14
Prpf6Q91YR7 Pptc7-201ENSMUST00000053426 4644 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.2■■□□□ 1.14
Prpf6Q91YR7 Smox-206ENSMUST00000110183 1159 ntTSL 1 (best) BASIC22.2■■□□□ 1.14
Prpf6Q91YR7 Gm10657-201ENSMUST00000193528 1031 ntBASIC22.2■■□□□ 1.14
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 23.2 ms