Protein–RNA interactions for Protein: Q91YH5

Atl3, Atlastin-3, mousemouse

Predictions only

Length 541 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Atl3Q91YH5 Hrh3-205ENSMUST00000165762 1368 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC25.1■■□□□ 1.61
Atl3Q91YH5 Uba5-201ENSMUST00000035166 2404 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.1■■□□□ 1.61
Atl3Q91YH5 Gm7143-201ENSMUST00000222811 859 ntBASIC25.1■■□□□ 1.61
Atl3Q91YH5 Arnt2-201ENSMUST00000085077 6151 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC25.1■■□□□ 1.61
Atl3Q91YH5 AC166356.1-201ENSMUST00000228236 1426 ntBASIC25.1■■□□□ 1.61
Atl3Q91YH5 Tpst2-201ENSMUST00000031287 1835 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.09■■□□□ 1.61
Atl3Q91YH5 Inhbb-201ENSMUST00000038765 4255 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.09■■□□□ 1.61
Atl3Q91YH5 Bcas2-201ENSMUST00000005830 1467 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.09■■□□□ 1.61
Atl3Q91YH5 Pbx1-202ENSMUST00000072863 1709 ntTSL 1 (best) BASIC25.09■■□□□ 1.61
Atl3Q91YH5 Fgfr2-217ENSMUST00000124096 2425 ntTSL 5 BASIC25.09■■□□□ 1.61
Atl3Q91YH5 Zdhhc5-201ENSMUST00000035840 4706 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.09■■□□□ 1.61
Atl3Q91YH5 Stn1-201ENSMUST00000049369 1992 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.09■■□□□ 1.61
Atl3Q91YH5 Spns2-201ENSMUST00000045303 3241 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.08■■□□□ 1.61
Atl3Q91YH5 Vmn1r17-205ENSMUST00000228342 2230 ntAPPRIS P2 BASIC25.08■■□□□ 1.61
Atl3Q91YH5 Ddrgk1-201ENSMUST00000089559 1238 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.08■■□□□ 1.61
Atl3Q91YH5 Hras-202ENSMUST00000097957 1199 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC25.08■■□□□ 1.61
Atl3Q91YH5 Htra3-201ENSMUST00000087629 2750 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.08■■□□□ 1.61
Atl3Q91YH5 Catsper2-201ENSMUST00000038073 2247 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.08■■□□□ 1.6
Atl3Q91YH5 Ccdc149-202ENSMUST00000198008 2470 ntTSL 5 BASIC25.07■■□□□ 1.6
Atl3Q91YH5 Dlg3-201ENSMUST00000000901 4885 ntTSL 1 (best) BASIC25.07■■□□□ 1.6
Atl3Q91YH5 Zfp346-202ENSMUST00000159147 1146 ntTSL 5 BASIC25.07■■□□□ 1.6
Atl3Q91YH5 Eif5a-213ENSMUST00000164359 1281 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC25.07■■□□□ 1.6
Atl3Q91YH5 Mpv17l2-201ENSMUST00000038626 980 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.07■■□□□ 1.6
Atl3Q91YH5 Tlx2-201ENSMUST00000089641 1236 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.07■■□□□ 1.6
Atl3Q91YH5 Ppp6r2-202ENSMUST00000226221 2559 ntBASIC25.07■■□□□ 1.6
Atl3Q91YH5 Spock1-204ENSMUST00000186271 2005 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC25.07■■□□□ 1.6
Atl3Q91YH5 Ttc9b-201ENSMUST00000008088 2052 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.06■■□□□ 1.6
Atl3Q91YH5 Gadd45a-207ENSMUST00000204369 716 ntTSL 5 BASIC25.06■■□□□ 1.6
Atl3Q91YH5 Galnt11-201ENSMUST00000045737 2552 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.06■■□□□ 1.6
Atl3Q91YH5 Vamp4-204ENSMUST00000135241 1461 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.06■■□□□ 1.6
Atl3Q91YH5 Shisa5-202ENSMUST00000112059 1910 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC25.06■■□□□ 1.6
Atl3Q91YH5 Cep78-201ENSMUST00000047704 2548 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.06■■□□□ 1.6
Atl3Q91YH5 Hpdl-201ENSMUST00000055436 1804 ntAPPRIS P1 BASIC25.05■■□□□ 1.6
Atl3Q91YH5 Timm8a1-201ENSMUST00000054213 1421 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.05■■□□□ 1.6
Atl3Q91YH5 Lrp3-202ENSMUST00000122409 4147 ntTSL 1 (best) BASIC25.05■■□□□ 1.6
Atl3Q91YH5 Srcap-202ENSMUST00000098025 1257 ntTSL 5 BASIC25.05■■□□□ 1.6
Atl3Q91YH5 Ccng2-201ENSMUST00000031331 2810 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.05■■□□□ 1.6
Atl3Q91YH5 Aatf-201ENSMUST00000018841 1822 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.05■■□□□ 1.6
Atl3Q91YH5 Stau2-217ENSMUST00000162751 3030 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.04■■□□□ 1.6
Atl3Q91YH5 Rbm7-201ENSMUST00000170000 1773 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.04■■□□□ 1.6
Atl3Q91YH5 Rbm38-201ENSMUST00000029014 1768 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.04■■□□□ 1.6
Atl3Q91YH5 Rhbdd3-201ENSMUST00000036320 1790 ntTSL 1 (best) BASIC25.04■■□□□ 1.6
Atl3Q91YH5 Vegfa-211ENSMUST00000167860 975 ntTSL 1 (best) BASIC25.04■■□□□ 1.6
Atl3Q91YH5 AC102554.1-201ENSMUST00000216236 537 ntTSL 5 BASIC25.04■■□□□ 1.6
Atl3Q91YH5 Vegfa-213ENSMUST00000217017 1179 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC25.04■■□□□ 1.6
Atl3Q91YH5 Gm9767-201ENSMUST00000041011 1193 ntAPPRIS P1 BASIC25.04■■□□□ 1.6
Atl3Q91YH5 Klhl15-205ENSMUST00000113916 2363 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.04■■□□□ 1.6
Atl3Q91YH5 Mras-201ENSMUST00000035045 4701 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.04■■□□□ 1.6
Atl3Q91YH5 Stx18-202ENSMUST00000042146 1473 ntTSL 1 (best) BASIC25.03■■□□□ 1.6
Atl3Q91YH5 Gm29735-201ENSMUST00000209599 660 ntAPPRIS P1 BASIC25.03■■□□□ 1.6
Atl3Q91YH5 Rabac1-201ENSMUST00000076961 899 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.03■■□□□ 1.6
Atl3Q91YH5 Tmem164-206ENSMUST00000112896 5224 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.03■■□□□ 1.6
Atl3Q91YH5 Htr6-201ENSMUST00000068036 1362 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.03■■□□□ 1.6
Atl3Q91YH5 Slc36a4-202ENSMUST00000115588 1745 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC25.03■■□□□ 1.6
Atl3Q91YH5 Cyp4f15-201ENSMUST00000008801 2095 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC25.03■■□□□ 1.6
Atl3Q91YH5 Gpatch3-201ENSMUST00000030662 2004 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.02■■□□□ 1.6
Atl3Q91YH5 Txnrd2-201ENSMUST00000115604 1235 ntTSL 1 (best) BASIC25.02■■□□□ 1.6
Atl3Q91YH5 Ltb-203ENSMUST00000173600 905 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC25.02■■□□□ 1.6
Atl3Q91YH5 Gm40881-201ENSMUST00000223397 166 ntBASIC25.02■■□□□ 1.6
Atl3Q91YH5 Asph-217ENSMUST00000146441 2576 ntTSL 1 (best) BASIC25.02■■□□□ 1.6
Atl3Q91YH5 Tmem230-206ENSMUST00000180286 1531 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC25.02■■□□□ 1.6
Atl3Q91YH5 Fam102b-202ENSMUST00000171143 5702 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.01■■□□□ 1.59
Atl3Q91YH5 Ppp3ca-202ENSMUST00000070198 4758 ntTSL 1 (best) BASIC25.01■■□□□ 1.59
Atl3Q91YH5 Spint1-203ENSMUST00000110817 2323 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.01■■□□□ 1.59
Atl3Q91YH5 Shox2-201ENSMUST00000029422 3079 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.01■■□□□ 1.59
Atl3Q91YH5 Nsmf-213ENSMUST00000140737 862 ntTSL 5 BASIC25.01■■□□□ 1.59
Atl3Q91YH5 Zfp629-208ENSMUST00000151107 583 ntTSL 3 BASIC25.01■■□□□ 1.59
Atl3Q91YH5 Pbx1-201ENSMUST00000064438 1020 ntTSL 1 (best) BASIC25.01■■□□□ 1.59
Atl3Q91YH5 Mroh6-201ENSMUST00000184858 2216 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC25.01■■□□□ 1.59
Atl3Q91YH5 Hoxd13-201ENSMUST00000001872 2483 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.01■■□□□ 1.59
Atl3Q91YH5 Rhov-201ENSMUST00000037360 1703 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25■■□□□ 1.59
Atl3Q91YH5 Hoxc11-201ENSMUST00000001701 2021 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25■■□□□ 1.59
Atl3Q91YH5 Aplp1-201ENSMUST00000006828 2343 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25■■□□□ 1.59
Atl3Q91YH5 Kctd20-204ENSMUST00000122163 2423 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC25■■□□□ 1.59
Atl3Q91YH5 Gm35161-201ENSMUST00000221765 941 ntTSL 5 BASIC25■■□□□ 1.59
Atl3Q91YH5 Laptm4a-201ENSMUST00000020909 1773 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25■■□□□ 1.59
Atl3Q91YH5 Exosc4-201ENSMUST00000059045 1796 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25■■□□□ 1.59
Atl3Q91YH5 Donson-203ENSMUST00000117159 2215 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC25■■□□□ 1.59
Atl3Q91YH5 Fgfrl1-202ENSMUST00000112560 2318 ntTSL 1 (best) BASIC25■■□□□ 1.59
Atl3Q91YH5 Doc2a-201ENSMUST00000064110 2538 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25■■□□□ 1.59
Atl3Q91YH5 Tsc22d1-203ENSMUST00000101618 1043 ntTSL 1 (best) BASIC24.99■■□□□ 1.59
Atl3Q91YH5 Hmg20b-203ENSMUST00000105324 1540 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.99■■□□□ 1.59
Atl3Q91YH5 Foxj3-206ENSMUST00000138845 1530 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.99■■□□□ 1.59
Atl3Q91YH5 Kcnip2-208ENSMUST00000161886 693 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC24.99■■□□□ 1.59
Atl3Q91YH5 Hnrnpf-202ENSMUST00000163168 2401 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.99■■□□□ 1.59
Atl3Q91YH5 Gpx7-202ENSMUST00000184609 331 ntTSL 3 BASIC24.99■■□□□ 1.59
Atl3Q91YH5 Rem1-201ENSMUST00000000369 1663 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.99■■□□□ 1.59
Atl3Q91YH5 Ung-202ENSMUST00000102584 2136 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC24.98■■□□□ 1.59
Atl3Q91YH5 Dedd2-201ENSMUST00000058702 1828 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.98■■□□□ 1.59
Atl3Q91YH5 Siah1b-201ENSMUST00000037928 1783 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.98■■□□□ 1.59
Atl3Q91YH5 Tead1-204ENSMUST00000106638 3047 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC24.98■■□□□ 1.59
Atl3Q91YH5 Ammecr1-201ENSMUST00000041317 5437 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.98■■□□□ 1.59
Atl3Q91YH5 Gtpbp2-217ENSMUST00000172170 2587 ntTSL 5 BASIC24.98■■□□□ 1.59
Atl3Q91YH5 Rasef-203ENSMUST00000222414 2127 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC24.98■■□□□ 1.59
Atl3Q91YH5 Schip1-205ENSMUST00000182532 2059 ntTSL 1 (best) BASIC24.98■■□□□ 1.59
Atl3Q91YH5 Pbx1-206ENSMUST00000176790 1828 ntTSL 1 (best) BASIC24.98■■□□□ 1.59
Atl3Q91YH5 Gabra5-201ENSMUST00000068456 2671 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.98■■□□□ 1.59
Atl3Q91YH5 Stac-201ENSMUST00000035083 2644 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.98■■□□□ 1.59
Atl3Q91YH5 Mtfmt-201ENSMUST00000074792 2042 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.97■■□□□ 1.59
Atl3Q91YH5 Pdgfa-204ENSMUST00000110897 1287 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC24.97■■□□□ 1.59
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 11.1 ms