Protein–RNA interactions for Protein: Q91XD6

Vps36, Vacuolar protein-sorting-associated protein 36, mousemouse

Predictions only

Length 386 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Vps36Q91XD6 Dedd-203ENSMUST00000111299 2322 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.81■■□□□ 1.08
Vps36Q91XD6 Tmprss5-205ENSMUST00000170246 1491 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.81■■□□□ 1.08
Vps36Q91XD6 1700105P06Rik-201ENSMUST00000186160 1772 ntBASIC21.81■■□□□ 1.08
Vps36Q91XD6 Brsk1-201ENSMUST00000048248 2996 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.81■■□□□ 1.08
Vps36Q91XD6 Tmem150b-201ENSMUST00000086363 1341 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.8■■□□□ 1.08
Vps36Q91XD6 Efr3a-203ENSMUST00000172756 1411 ntTSL 1 (best) BASIC21.8■■□□□ 1.08
Vps36Q91XD6 Krt1-201ENSMUST00000023790 2445 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.8■■□□□ 1.08
Vps36Q91XD6 Vav3-201ENSMUST00000046864 5019 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.8■■□□□ 1.08
Vps36Q91XD6 AC152827.1-201ENSMUST00000221143 2189 ntBASIC21.8■■□□□ 1.08
Vps36Q91XD6 Meg3-207ENSMUST00000143836 1896 ntTSL 1 (best) BASIC21.8■■□□□ 1.08
Vps36Q91XD6 Maml1-201ENSMUST00000059458 5528 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.8■■□□□ 1.08
Vps36Q91XD6 Rem1-201ENSMUST00000000369 1663 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.8■■□□□ 1.08
Vps36Q91XD6 Gm9780-202ENSMUST00000184915 1394 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.8■■□□□ 1.08
Vps36Q91XD6 Homer1-206ENSMUST00000109493 2580 ntTSL 5 BASIC21.8■■□□□ 1.08
Vps36Q91XD6 Tmtc1-201ENSMUST00000060095 8383 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.8■■□□□ 1.08
Vps36Q91XD6 Ache-209ENSMUST00000196208 1911 ntTSL 5 BASIC21.79■■□□□ 1.08
Vps36Q91XD6 Cnp-201ENSMUST00000103120 2357 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.79■■□□□ 1.08
Vps36Q91XD6 Fkbp1b-201ENSMUST00000020964 976 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.79■■□□□ 1.08
Vps36Q91XD6 Ech1-201ENSMUST00000066264 1267 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.79■■□□□ 1.08
Vps36Q91XD6 Tysnd1-201ENSMUST00000020284 2286 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.79■■□□□ 1.08
Vps36Q91XD6 1700030C10Rik-203ENSMUST00000189625 1735 ntTSL 1 (best) BASIC21.79■■□□□ 1.08
Vps36Q91XD6 Ankrd33b-203ENSMUST00000110410 2070 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC21.79■■□□□ 1.08
Vps36Q91XD6 Tmem64-201ENSMUST00000062684 4670 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.79■■□□□ 1.08
Vps36Q91XD6 Tex264-202ENSMUST00000163441 1896 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.79■■□□□ 1.08
Vps36Q91XD6 3830408C21Rik-205ENSMUST00000225426 1898 ntBASIC21.79■■□□□ 1.08
Vps36Q91XD6 Timm8a1-201ENSMUST00000054213 1421 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.79■■□□□ 1.08
Vps36Q91XD6 Aktip-202ENSMUST00000120213 2200 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.79■■□□□ 1.08
Vps36Q91XD6 Qtrt1-201ENSMUST00000002902 1316 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.79■■□□□ 1.08
Vps36Q91XD6 Cdkl3-202ENSMUST00000063321 2008 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.79■■□□□ 1.08
Vps36Q91XD6 Rp2-203ENSMUST00000115391 1398 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.78■■□□□ 1.08
Vps36Q91XD6 Stx3-202ENSMUST00000069285 2810 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.78■■□□□ 1.08
Vps36Q91XD6 Ankrd33b-202ENSMUST00000076942 1641 ntTSL 1 (best) BASIC21.78■■□□□ 1.08
Vps36Q91XD6 Gnas-205ENSMUST00000109083 730 ntTSL 2 BASIC21.78■■□□□ 1.08
Vps36Q91XD6 Ankrd11-207ENSMUST00000212937 943 ntTSL 1 (best) BASIC21.78■■□□□ 1.08
Vps36Q91XD6 1700016K19Rik-201ENSMUST00000066408 921 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.78■■□□□ 1.08
Vps36Q91XD6 Hfe2-201ENSMUST00000049208 2028 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.78■■□□□ 1.08
Vps36Q91XD6 Fbxw2-203ENSMUST00000113075 2260 ntTSL 1 (best) BASIC21.78■■□□□ 1.08
Vps36Q91XD6 Socs2-214ENSMUST00000172070 2153 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC21.78■■□□□ 1.08
Vps36Q91XD6 Hmg20b-202ENSMUST00000105323 1463 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.77■■□□□ 1.08
Vps36Q91XD6 Ntn5-202ENSMUST00000182750 1758 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.77■■□□□ 1.08
Vps36Q91XD6 Pgls-205ENSMUST00000143441 1062 ntTSL 3 BASIC21.77■■□□□ 1.08
Vps36Q91XD6 Gm10685-201ENSMUST00000196120 433 ntTSL 3 BASIC21.77■■□□□ 1.08
Vps36Q91XD6 Eif2ak4-207ENSMUST00000110877 2134 ntTSL 1 (best) BASIC21.77■■□□□ 1.08
Vps36Q91XD6 6330403K07Rik-201ENSMUST00000156068 1494 ntTSL 1 (best) BASIC21.77■■□□□ 1.07
Vps36Q91XD6 Bcas2-201ENSMUST00000005830 1467 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.77■■□□□ 1.07
Vps36Q91XD6 Tpst2-201ENSMUST00000031287 1835 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.76■■□□□ 1.07
Vps36Q91XD6 Efcc1-201ENSMUST00000032132 2729 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC21.76■■□□□ 1.07
Vps36Q91XD6 Tsc22d1-203ENSMUST00000101618 1043 ntTSL 1 (best) BASIC21.76■■□□□ 1.07
Vps36Q91XD6 Bex4-201ENSMUST00000116527 837 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.76■■□□□ 1.07
Vps36Q91XD6 Rgs10-205ENSMUST00000145739 564 ntTSL 1 (best) BASIC21.76■■□□□ 1.07
Vps36Q91XD6 Neurl4-213ENSMUST00000177476 4952 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.76■■□□□ 1.07
Vps36Q91XD6 Tmtc1-202ENSMUST00000100772 8269 ntTSL 2 BASIC21.76■■□□□ 1.07
Vps36Q91XD6 Akt1s1-204ENSMUST00000107885 1812 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.76■■□□□ 1.07
Vps36Q91XD6 Olfm1-204ENSMUST00000113920 2513 ntTSL 1 (best) BASIC21.75■■□□□ 1.07
Vps36Q91XD6 Fam49b-202ENSMUST00000164532 1770 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.75■■□□□ 1.07
Vps36Q91XD6 Hrh3-203ENSMUST00000164442 1242 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC21.75■■□□□ 1.07
Vps36Q91XD6 Etf1-202ENSMUST00000180351 108 ntBASIC21.75■■□□□ 1.07
Vps36Q91XD6 Acsl3-203ENSMUST00000134566 2492 ntTSL 1 (best) BASIC21.75■■□□□ 1.07
Vps36Q91XD6 Setd4-202ENSMUST00000113951 1826 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC21.75■■□□□ 1.07
Vps36Q91XD6 K230010J24Rik-204ENSMUST00000187868 1810 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC21.75■■□□□ 1.07
Vps36Q91XD6 Cbx6-203ENSMUST00000109627 5806 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC21.75■■□□□ 1.07
Vps36Q91XD6 Hdgfl3-202ENSMUST00000107305 5887 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC21.75■■□□□ 1.07
Vps36Q91XD6 Scamp3-202ENSMUST00000098941 1338 ntTSL 1 (best) BASIC21.75■■□□□ 1.07
Vps36Q91XD6 Socs2-201ENSMUST00000020215 2222 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.75■■□□□ 1.07
Vps36Q91XD6 Slc36a4-202ENSMUST00000115588 1745 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.75■■□□□ 1.07
Vps36Q91XD6 Dusp26-201ENSMUST00000036631 1938 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.74■■□□□ 1.07
Vps36Q91XD6 Trp73os-201ENSMUST00000143429 2192 ntTSL 1 (best) BASIC21.74■■□□□ 1.07
Vps36Q91XD6 Suz12-201ENSMUST00000017692 4373 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC21.74■■□□□ 1.07
Vps36Q91XD6 Hoxa9-202ENSMUST00000114425 851 ntTSL 2 BASIC21.74■■□□□ 1.07
Vps36Q91XD6 Hoxd3os1-204ENSMUST00000156342 796 ntTSL 1 (best) BASIC21.74■■□□□ 1.07
Vps36Q91XD6 1700020G03Rik-201ENSMUST00000211264 889 ntBASIC21.74■■□□□ 1.07
Vps36Q91XD6 Camk2n2-201ENSMUST00000052939 1291 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.74■■□□□ 1.07
Vps36Q91XD6 Hyal2-203ENSMUST00000193747 1532 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.74■■□□□ 1.07
Vps36Q91XD6 Stn1-201ENSMUST00000049369 1992 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.74■■□□□ 1.07
Vps36Q91XD6 Zfp105-201ENSMUST00000051667 2010 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.73■■□□□ 1.07
Vps36Q91XD6 Ercc6l2-208ENSMUST00000144763 1820 ntTSL 1 (best) BASIC21.73■■□□□ 1.07
Vps36Q91XD6 Aplf-201ENSMUST00000032130 1889 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.73■■□□□ 1.07
Vps36Q91XD6 Sh3bp1-204ENSMUST00000109698 1923 ntTSL 1 (best) BASIC21.73■■□□□ 1.07
Vps36Q91XD6 L3mbtl4-201ENSMUST00000093007 2445 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC21.73■■□□□ 1.07
Vps36Q91XD6 Gm16253-201ENSMUST00000148290 550 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.73■■□□□ 1.07
Vps36Q91XD6 Lmtk3-201ENSMUST00000072580 4807 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC21.73■■□□□ 1.07
Vps36Q91XD6 Kcng2-201ENSMUST00000077962 2813 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC21.73■■□□□ 1.07
Vps36Q91XD6 Prrt1-201ENSMUST00000015620 1940 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC21.72■■□□□ 1.07
Vps36Q91XD6 Slc35f5-201ENSMUST00000027580 2733 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.72■■□□□ 1.07
Vps36Q91XD6 Mmp24-201ENSMUST00000029141 4306 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.72■■□□□ 1.07
Vps36Q91XD6 Plekhh1-201ENSMUST00000039928 6439 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.72■■□□□ 1.07
Vps36Q91XD6 Ube2h-202ENSMUST00000102993 4657 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.72■■□□□ 1.07
Vps36Q91XD6 Nipsnap2-201ENSMUST00000086046 2112 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.72■■□□□ 1.07
Vps36Q91XD6 Chn2-201ENSMUST00000046856 2418 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.72■■□□□ 1.07
Vps36Q91XD6 Ajap1-201ENSMUST00000105646 3048 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC21.72■■□□□ 1.07
Vps36Q91XD6 E130311K13Rik-201ENSMUST00000061706 1640 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.72■■□□□ 1.07
Vps36Q91XD6 Smc6-201ENSMUST00000020931 5603 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.72■■□□□ 1.07
Vps36Q91XD6 Art5-204ENSMUST00000106937 1713 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.72■■□□□ 1.07
Vps36Q91XD6 AC166356.1-201ENSMUST00000228236 1426 ntBASIC21.72■■□□□ 1.07
Vps36Q91XD6 Trp73-204ENSMUST00000105644 5042 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC21.71■■□□□ 1.07
Vps36Q91XD6 Aatf-201ENSMUST00000018841 1822 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.71■■□□□ 1.07
Vps36Q91XD6 Purb-201ENSMUST00000179343 8319 ntAPPRIS P1 BASIC21.71■■□□□ 1.07
Vps36Q91XD6 Chst12-201ENSMUST00000043050 2331 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.71■■□□□ 1.07
Vps36Q91XD6 Fam89b-201ENSMUST00000099955 1197 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.71■■□□□ 1.07
Vps36Q91XD6 Nlgn2-201ENSMUST00000056484 5003 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.71■■□□□ 1.07
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 17.2 ms