Protein–RNA interactions for Protein: Q91WD4

UPF0415 protein C7orf25 homolog, mousemouse

Predictions only

Length 421 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Q91WD4 Trp53rka-201ENSMUST00000039007 1880 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.52■■□□□ 1.2
Q91WD4 Gm22238-201ENSMUST00000175222 88 ntBASIC22.52■■□□□ 1.2
Q91WD4 Dleu2-211ENSMUST00000183066 788 ntTSL 3 BASIC22.52■■□□□ 1.2
Q91WD4 Sept5-201ENSMUST00000096987 2127 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.52■■□□□ 1.2
Q91WD4 Riox1-201ENSMUST00000053744 2344 ntAPPRIS P1 BASIC22.52■■□□□ 1.2
Q91WD4 Bhlhe23-201ENSMUST00000108878 2520 ntAPPRIS P1 BASIC22.52■■□□□ 1.19
Q91WD4 Msantd3-203ENSMUST00000107704 1597 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.51■■□□□ 1.19
Q91WD4 Gnas-205ENSMUST00000109083 730 ntTSL 2 BASIC22.51■■□□□ 1.19
Q91WD4 E130307A14Rik-202ENSMUST00000133302 438 ntTSL 5 BASIC22.51■■□□□ 1.19
Q91WD4 Hoxd3os1-204ENSMUST00000156342 796 ntTSL 1 (best) BASIC22.51■■□□□ 1.19
Q91WD4 Lsr-205ENSMUST00000205961 2021 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.51■■□□□ 1.19
Q91WD4 Exoc3l2-201ENSMUST00000011407 2200 ntTSL 5 BASIC22.51■■□□□ 1.19
Q91WD4 Jkamp-202ENSMUST00000117449 1874 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.51■■□□□ 1.19
Q91WD4 Prmt1-202ENSMUST00000107843 1508 ntTSL 1 (best) BASIC22.51■■□□□ 1.19
Q91WD4 A930012O16Rik-202ENSMUST00000156418 1541 ntTSL 2 BASIC22.51■■□□□ 1.19
Q91WD4 Gm14117-201ENSMUST00000122417 843 ntBASIC22.5■■□□□ 1.19
Q91WD4 Gm2415-203ENSMUST00000149952 435 ntTSL 5 BASIC22.5■■□□□ 1.19
Q91WD4 Gm46212-201ENSMUST00000220256 1003 ntTSL 5 BASIC22.5■■□□□ 1.19
Q91WD4 Triobp-202ENSMUST00000109688 2553 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.5■■□□□ 1.19
Q91WD4 Gjc2-202ENSMUST00000108793 2187 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.5■■□□□ 1.19
Q91WD4 Chsy1-201ENSMUST00000036372 4176 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.5■■□□□ 1.19
Q91WD4 Phlpp1-201ENSMUST00000061047 6226 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.5■■□□□ 1.19
Q91WD4 Ccne1-201ENSMUST00000108023 2000 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.5■■□□□ 1.19
Q91WD4 Cav2-201ENSMUST00000000058 2733 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.5■■□□□ 1.19
Q91WD4 Hras-207ENSMUST00000168550 2272 ntTSL 5 BASIC22.5■■□□□ 1.19
Q91WD4 Gng12-202ENSMUST00000114222 1354 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.5■■□□□ 1.19
Q91WD4 Slc25a3-203ENSMUST00000164505 1483 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC22.49■■□□□ 1.19
Q91WD4 Nckap1-202ENSMUST00000111760 4597 ntTSL 1 (best) BASIC22.49■■□□□ 1.19
Q91WD4 Gm14205-201ENSMUST00000138427 739 ntTSL 3 BASIC22.49■■□□□ 1.19
Q91WD4 Gm10657-201ENSMUST00000193528 1031 ntBASIC22.49■■□□□ 1.19
Q91WD4 Psmd11-214ENSMUST00000173938 1626 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.49■■□□□ 1.19
Q91WD4 Ubtd1-201ENSMUST00000026170 1527 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.48■■□□□ 1.19
Q91WD4 2900079G21Rik-201ENSMUST00000139552 1139 ntTSL 1 (best) BASIC22.48■■□□□ 1.19
Q91WD4 Yjefn3-202ENSMUST00000152938 785 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.48■■□□□ 1.19
Q91WD4 Gm28417-201ENSMUST00000185218 785 ntTSL 3 BASIC22.48■■□□□ 1.19
Q91WD4 1700097N02Rik-201ENSMUST00000188852 845 ntTSL 3 BASIC22.48■■□□□ 1.19
Q91WD4 5930403N24Rik-204ENSMUST00000217338 337 ntTSL 2 BASIC22.48■■□□□ 1.19
Q91WD4 Shisa5-202ENSMUST00000112059 1910 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.48■■□□□ 1.19
Q91WD4 Kremen2-201ENSMUST00000046525 2123 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.48■■□□□ 1.19
Q91WD4 Wnt11-205ENSMUST00000167303 1792 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.48■■□□□ 1.19
Q91WD4 Rbm38-201ENSMUST00000029014 1768 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.48■■□□□ 1.19
Q91WD4 AC166356.1-201ENSMUST00000228236 1426 ntBASIC22.48■■□□□ 1.19
Q91WD4 Cdc42bpb-201ENSMUST00000041965 6714 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.47■■□□□ 1.19
Q91WD4 Dpf1-201ENSMUST00000049977 2309 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.47■■□□□ 1.19
Q91WD4 Ubtf-213ENSMUST00000178839 4580 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.47■■□□□ 1.19
Q91WD4 Rps24-207ENSMUST00000224568 714 ntBASIC22.47■■□□□ 1.19
Q91WD4 Rhbdd3-201ENSMUST00000036320 1790 ntTSL 1 (best) BASIC22.47■■□□□ 1.19
Q91WD4 Spock1-204ENSMUST00000186271 2005 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.47■■□□□ 1.19
Q91WD4 Tshz1-201ENSMUST00000060303 5656 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.46■■□□□ 1.19
Q91WD4 Map2k2-202ENSMUST00000105331 1556 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC22.46■■□□□ 1.19
Q91WD4 Creb1-204ENSMUST00000185594 1569 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.46■■□□□ 1.19
Q91WD4 Fgfrl1-202ENSMUST00000112560 2318 ntTSL 1 (best) BASIC22.46■■□□□ 1.19
Q91WD4 Runx2-207ENSMUST00000160673 1791 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.46■■□□□ 1.19
Q91WD4 Myo1b-202ENSMUST00000046390 5052 ntTSL 1 (best) BASIC22.46■■□□□ 1.19
Q91WD4 Zfp821-201ENSMUST00000034163 2127 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.46■■□□□ 1.19
Q91WD4 Gm20634-201ENSMUST00000090779 2956 ntBASIC22.46■■□□□ 1.19
Q91WD4 Ppp2r5a-201ENSMUST00000067976 3088 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.46■■□□□ 1.19
Q91WD4 Stac3-202ENSMUST00000160019 1581 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.46■■□□□ 1.19
Q91WD4 Tbc1d24-201ENSMUST00000024931 4894 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.46■■□□□ 1.19
Q91WD4 Dtnb-210ENSMUST00000173199 2820 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC22.45■■□□□ 1.18
Q91WD4 Ptger3-202ENSMUST00000173533 2097 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.45■■□□□ 1.18
Q91WD4 Lrrc38-201ENSMUST00000052458 2324 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.45■■□□□ 1.18
Q91WD4 Ccdc149-202ENSMUST00000198008 2470 ntTSL 5 BASIC22.45■■□□□ 1.18
Q91WD4 Endod1-203ENSMUST00000214236 419 ntAPPRIS ALT2 TSL 3 BASIC22.45■■□□□ 1.18
Q91WD4 1110032F04Rik-201ENSMUST00000054551 2578 ntAPPRIS P1 BASIC22.45■■□□□ 1.18
Q91WD4 Rhod-201ENSMUST00000048197 1344 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.45■■□□□ 1.18
Q91WD4 Mal2-201ENSMUST00000025356 2950 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.45■■□□□ 1.18
Q91WD4 Smad6-201ENSMUST00000041029 2971 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.45■■□□□ 1.18
Q91WD4 Acot3-203ENSMUST00000223080 1545 ntTSL 1 (best) BASIC22.45■■□□□ 1.18
Q91WD4 Lmtk3-202ENSMUST00000120005 4997 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.45■■□□□ 1.18
Q91WD4 Rhov-201ENSMUST00000037360 1703 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.45■■□□□ 1.18
Q91WD4 Pus1-203ENSMUST00000086643 1868 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC22.45■■□□□ 1.18
Q91WD4 Kras-202ENSMUST00000111710 1194 ntTSL 5 BASIC22.44■■□□□ 1.18
Q91WD4 Tpm1-206ENSMUST00000113686 998 ntTSL 5 BASIC22.44■■□□□ 1.18
Q91WD4 Ankrd9-207ENSMUST00000148765 1431 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC22.44■■□□□ 1.18
Q91WD4 Ppp2r2c-203ENSMUST00000201156 461 ntTSL 5 BASIC22.44■■□□□ 1.18
Q91WD4 Sarnp-203ENSMUST00000219512 953 ntTSL 3 BASIC22.44■■□□□ 1.18
Q91WD4 A030005L19Rik-201ENSMUST00000220768 806 ntAPPRIS P1 BASIC22.44■■□□□ 1.18
Q91WD4 Gnb2-201ENSMUST00000031726 1860 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.44■■□□□ 1.18
Q91WD4 1700056E22Rik-201ENSMUST00000050306 967 ntAPPRIS P1 BASIC22.44■■□□□ 1.18
Q91WD4 Mpz-201ENSMUST00000070758 2002 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.44■■□□□ 1.18
Q91WD4 Phc2-202ENSMUST00000106079 2535 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.43■■□□□ 1.18
Q91WD4 Neurl4-202ENSMUST00000108617 4892 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC22.43■■□□□ 1.18
Q91WD4 Dus1l-203ENSMUST00000106135 1863 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC22.43■■□□□ 1.18
Q91WD4 Sc5d-202ENSMUST00000169609 1677 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.43■■□□□ 1.18
Q91WD4 A030001D20Rik-201ENSMUST00000211533 1542 ntTSL 1 (best) BASIC22.43■■□□□ 1.18
Q91WD4 Srm-201ENSMUST00000006611 1338 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.43■■□□□ 1.18
Q91WD4 Gm43530-201ENSMUST00000195920 274 ntBASIC22.43■■□□□ 1.18
Q91WD4 Trim3-203ENSMUST00000106791 2466 ntTSL 1 (best) BASIC22.43■■□□□ 1.18
Q91WD4 Ube2d2a-202ENSMUST00000170693 2483 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.43■■□□□ 1.18
Q91WD4 Ptov1-201ENSMUST00000046575 1883 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.43■■□□□ 1.18
Q91WD4 Rxrb-201ENSMUST00000044858 2623 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC22.43■■□□□ 1.18
Q91WD4 Slc35b2-201ENSMUST00000041353 2326 ntTSL 1 (best) BASIC22.42■■□□□ 1.18
Q91WD4 Cacnb1-203ENSMUST00000103144 2236 ntTSL 5 BASIC22.42■■□□□ 1.18
Q91WD4 Rell2-202ENSMUST00000091932 1995 ntTSL 2 BASIC22.42■■□□□ 1.18
Q91WD4 Gm11837-201ENSMUST00000136992 876 ntTSL 2 BASIC22.42■■□□□ 1.18
Q91WD4 Pxmp2-201ENSMUST00000031472 1041 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.42■■□□□ 1.18
Q91WD4 Ssr2-201ENSMUST00000035785 1189 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.42■■□□□ 1.18
Q91WD4 Whrn-204ENSMUST00000095037 2419 ntTSL 1 (best) BASIC22.42■■□□□ 1.18
Q91WD4 Smad4-201ENSMUST00000025393 3384 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.41■■□□□ 1.18
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 31.4 ms