Protein–RNA interactions for Protein: Q91WD2

Trpv6, Transient receptor potential cation channel subfamily V member 6, mousemouse

Predictions only

Length 767 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Trpv6Q91WD2 Gm26571-205ENSMUST00000223215 591 ntTSL 3 BASIC22.18■■□□□ 1.14
Trpv6Q91WD2 Cadm1-201ENSMUST00000034581 1254 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC22.18■■□□□ 1.14
Trpv6Q91WD2 Ninj1-201ENSMUST00000049022 1187 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.18■■□□□ 1.14
Trpv6Q91WD2 Sp5-201ENSMUST00000100043 2100 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.18■■□□□ 1.14
Trpv6Q91WD2 Zfp653-202ENSMUST00000179605 1888 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.17■■□□□ 1.14
Trpv6Q91WD2 Ovol2-201ENSMUST00000037423 1539 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC22.17■■□□□ 1.14
Trpv6Q91WD2 Eml4-201ENSMUST00000049503 5109 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.17■■□□□ 1.14
Trpv6Q91WD2 Yjefn3-203ENSMUST00000180068 629 ntTSL 5 BASIC22.17■■□□□ 1.14
Trpv6Q91WD2 6230400D17Rik-202ENSMUST00000224976 1019 ntBASIC22.17■■□□□ 1.14
Trpv6Q91WD2 9230116N13Rik-201ENSMUST00000181746 2097 ntTSL 1 (best) BASIC22.17■■□□□ 1.14
Trpv6Q91WD2 Bdh1-201ENSMUST00000089759 1711 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.17■■□□□ 1.14
Trpv6Q91WD2 Gm32051-202ENSMUST00000197905 2385 ntBASIC22.17■■□□□ 1.14
Trpv6Q91WD2 Tmem143-201ENSMUST00000069772 2297 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.17■■□□□ 1.14
Trpv6Q91WD2 Map2k2-202ENSMUST00000105331 1556 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC22.16■■□□□ 1.14
Trpv6Q91WD2 Agps-202ENSMUST00000111952 2589 ntTSL 2 BASIC22.16■■□□□ 1.14
Trpv6Q91WD2 Mcub-201ENSMUST00000029624 1318 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.16■■□□□ 1.14
Trpv6Q91WD2 Ssbp1-205ENSMUST00000121360 1188 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.16■■□□□ 1.14
Trpv6Q91WD2 Gm11650-201ENSMUST00000141271 1145 ntTSL 1 (best) BASIC22.16■■□□□ 1.14
Trpv6Q91WD2 Gm42642-201ENSMUST00000200683 355 ntBASIC22.16■■□□□ 1.14
Trpv6Q91WD2 Gm20163-202ENSMUST00000212288 989 ntTSL 1 (best) BASIC22.16■■□□□ 1.14
Trpv6Q91WD2 Gm40848-201ENSMUST00000221998 324 ntBASIC22.16■■□□□ 1.14
Trpv6Q91WD2 Nr2c2ap-201ENSMUST00000095273 1161 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.16■■□□□ 1.14
Trpv6Q91WD2 Fkbp8-201ENSMUST00000075491 1698 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC22.16■■□□□ 1.14
Trpv6Q91WD2 Acss2-203ENSMUST00000103142 2145 ntTSL 5 BASIC22.16■■□□□ 1.14
Trpv6Q91WD2 Wipi1-202ENSMUST00000103060 2050 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.16■■□□□ 1.14
Trpv6Q91WD2 Pycr2-201ENSMUST00000027802 1580 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.16■■□□□ 1.14
Trpv6Q91WD2 Hoxd4-202ENSMUST00000111980 1494 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.15■■□□□ 1.14
Trpv6Q91WD2 Trp53rka-201ENSMUST00000039007 1880 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.15■■□□□ 1.14
Trpv6Q91WD2 Maf1-211ENSMUST00000161527 1743 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC22.15■■□□□ 1.14
Trpv6Q91WD2 Dhps-201ENSMUST00000078665 1333 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.15■■□□□ 1.14
Trpv6Q91WD2 Zfp125-203ENSMUST00000208744 928 ntTSL 5 BASIC22.15■■□□□ 1.14
Trpv6Q91WD2 Hspb1-201ENSMUST00000005077 903 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.15■■□□□ 1.14
Trpv6Q91WD2 Tmem171-201ENSMUST00000064347 1161 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.15■■□□□ 1.14
Trpv6Q91WD2 Tspan17-202ENSMUST00000099503 822 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC22.15■■□□□ 1.14
Trpv6Q91WD2 Ubac1-201ENSMUST00000036509 1852 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.15■■□□□ 1.14
Trpv6Q91WD2 Fam149b-204ENSMUST00000090503 2053 ntTSL 1 (best) BASIC22.15■■□□□ 1.14
Trpv6Q91WD2 Ccdc9-201ENSMUST00000041010 2379 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.14■■□□□ 1.14
Trpv6Q91WD2 Ccne1-201ENSMUST00000108023 2000 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.14■■□□□ 1.14
Trpv6Q91WD2 Zranb1-202ENSMUST00000106157 5008 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC22.14■■□□□ 1.14
Trpv6Q91WD2 Arl5a-201ENSMUST00000036541 5239 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.14■■□□□ 1.14
Trpv6Q91WD2 Rfc5-202ENSMUST00000111953 772 ntTSL 1 (best) BASIC22.14■■□□□ 1.13
Trpv6Q91WD2 Gm15270-201ENSMUST00000125158 870 ntTSL 3 BASIC22.14■■□□□ 1.13
Trpv6Q91WD2 Gm12063-201ENSMUST00000148087 715 ntTSL 2 BASIC22.14■■□□□ 1.13
Trpv6Q91WD2 Rnf39-202ENSMUST00000173072 631 ntTSL 2 BASIC22.14■■□□□ 1.13
Trpv6Q91WD2 AC099934.2-201ENSMUST00000196389 70 ntBASIC22.14■■□□□ 1.13
Trpv6Q91WD2 AC156953.1-201ENSMUST00000196953 70 ntBASIC22.14■■□□□ 1.13
Trpv6Q91WD2 AC157822.2-201ENSMUST00000200291 70 ntBASIC22.14■■□□□ 1.13
Trpv6Q91WD2 Gm45890-202ENSMUST00000212188 1052 ntTSL 1 (best) BASIC22.14■■□□□ 1.13
Trpv6Q91WD2 Rps7-203ENSMUST00000221871 820 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.14■■□□□ 1.13
Trpv6Q91WD2 Gm26617-201ENSMUST00000180381 4429 ntTSL 3 BASIC22.14■■□□□ 1.13
Trpv6Q91WD2 Amn-201ENSMUST00000021707 1701 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.14■■□□□ 1.13
Trpv6Q91WD2 Rnaset2b-202ENSMUST00000179728 2448 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.14■■□□□ 1.13
Trpv6Q91WD2 Fam189a2-201ENSMUST00000096164 2547 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.13■■□□□ 1.13
Trpv6Q91WD2 Hist2h3c2-201ENSMUST00000167403 1020 ntAPPRIS P1 BASIC22.13■■□□□ 1.13
Trpv6Q91WD2 Gfra4-201ENSMUST00000028787 909 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.13■■□□□ 1.13
Trpv6Q91WD2 Sh3bp1-203ENSMUST00000089378 2001 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.13■■□□□ 1.13
Trpv6Q91WD2 D830036C21Rik-202ENSMUST00000208263 1548 ntBASIC22.12■■□□□ 1.13
Trpv6Q91WD2 E130208F15Rik-201ENSMUST00000098585 1733 ntAPPRIS P1 BASIC22.12■■□□□ 1.13
Trpv6Q91WD2 P2rx2-203ENSMUST00000195985 2096 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC22.12■■□□□ 1.13
Trpv6Q91WD2 Gm6916-201ENSMUST00000205277 828 ntTSL 3 BASIC22.12■■□□□ 1.13
Trpv6Q91WD2 Gm36210-201ENSMUST00000210663 1279 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.12■■□□□ 1.13
Trpv6Q91WD2 Gtsf1-201ENSMUST00000023129 819 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.12■■□□□ 1.13
Trpv6Q91WD2 Tpm1-212ENSMUST00000113696 1714 ntTSL 2 BASIC22.11■■□□□ 1.13
Trpv6Q91WD2 Hmbox1-204ENSMUST00000175905 1715 ntTSL 5 BASIC22.11■■□□□ 1.13
Trpv6Q91WD2 Chrna7-201ENSMUST00000032738 2078 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.11■■□□□ 1.13
Trpv6Q91WD2 Maf1-201ENSMUST00000023212 1686 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.11■■□□□ 1.13
Trpv6Q91WD2 Ptpn4-203ENSMUST00000163435 2365 ntTSL 1 (best) BASIC22.11■■□□□ 1.13
Trpv6Q91WD2 Dcaf15-201ENSMUST00000041367 2312 ntTSL 1 (best) BASIC22.11■■□□□ 1.13
Trpv6Q91WD2 Sumo3-209ENSMUST00000174113 512 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22.11■■□□□ 1.13
Trpv6Q91WD2 Gamt-201ENSMUST00000020359 979 ntTSL 1 (best) BASIC22.11■■□□□ 1.13
Trpv6Q91WD2 Akr7a5-201ENSMUST00000073787 1288 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.11■■□□□ 1.13
Trpv6Q91WD2 Whrn-208ENSMUST00000119294 2632 ntTSL 1 (best) BASIC22.1■■□□□ 1.13
Trpv6Q91WD2 Qk-201ENSMUST00000042296 6718 ntTSL 1 (best) BASIC22.1■■□□□ 1.13
Trpv6Q91WD2 Gm10849-201ENSMUST00000100397 618 ntBASIC22.1■■□□□ 1.13
Trpv6Q91WD2 Vamp5-201ENSMUST00000074231 553 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.1■■□□□ 1.13
Trpv6Q91WD2 Fance-204ENSMUST00000114804 1842 ntTSL 1 (best) BASIC22.1■■□□□ 1.13
Trpv6Q91WD2 Zfp287-205ENSMUST00000150336 1605 ntTSL 1 (best) BASIC22.09■■□□□ 1.13
Trpv6Q91WD2 Parl-201ENSMUST00000048642 1348 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.09■■□□□ 1.13
Trpv6Q91WD2 Tmem234-201ENSMUST00000102591 1437 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.09■■□□□ 1.13
Trpv6Q91WD2 1810026B05Rik-203ENSMUST00000184587 5738 ntTSL 1 (best) BASIC22.09■■□□□ 1.13
Trpv6Q91WD2 Hacd1-203ENSMUST00000114753 993 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.09■■□□□ 1.13
Trpv6Q91WD2 Gm45168-202ENSMUST00000206461 1069 ntTSL 5 BASIC22.09■■□□□ 1.13
Trpv6Q91WD2 AC133650.2-201ENSMUST00000217036 607 ntTSL 3 BASIC22.09■■□□□ 1.13
Trpv6Q91WD2 Wdr41-208ENSMUST00000222995 1112 ntTSL 5 BASIC22.09■■□□□ 1.13
Trpv6Q91WD2 Kctd20-201ENSMUST00000057174 2368 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.09■■□□□ 1.13
Trpv6Q91WD2 Gm10129-202ENSMUST00000193100 1316 ntBASIC22.08■■□□□ 1.13
Trpv6Q91WD2 Cacnb3-202ENSMUST00000109150 2670 ntTSL 5 BASIC22.08■■□□□ 1.13
Trpv6Q91WD2 Rgs19-201ENSMUST00000002532 1511 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.08■■□□□ 1.13
Trpv6Q91WD2 Gm13063-201ENSMUST00000132247 669 ntTSL 3 BASIC22.08■■□□□ 1.13
Trpv6Q91WD2 Rell2-204ENSMUST00000163591 1057 ntTSL 5 BASIC22.08■■□□□ 1.13
Trpv6Q91WD2 Gm9970-201ENSMUST00000068997 558 ntAPPRIS P1 BASIC22.08■■□□□ 1.13
Trpv6Q91WD2 Sap18b-201ENSMUST00000074053 789 ntAPPRIS P1 BASIC22.08■■□□□ 1.13
Trpv6Q91WD2 Atn1-201ENSMUST00000088357 4433 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.08■■□□□ 1.13
Trpv6Q91WD2 Syncrip-201ENSMUST00000069221 9450 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.08■■□□□ 1.13
Trpv6Q91WD2 Rabgap1l-216ENSMUST00000195442 1877 ntTSL 1 (best) BASIC22.07■■□□□ 1.12
Trpv6Q91WD2 Syde2-201ENSMUST00000039517 5495 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.07■■□□□ 1.12
Trpv6Q91WD2 Gm8773-201ENSMUST00000101627 1268 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.07■■□□□ 1.12
Trpv6Q91WD2 Mpig6b-202ENSMUST00000174190 729 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.07■■□□□ 1.12
Trpv6Q91WD2 Smad6-203ENSMUST00000179458 273 ntBASIC22.07■■□□□ 1.12
Trpv6Q91WD2 Tmbim4-201ENSMUST00000020446 904 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.07■■□□□ 1.12
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 410.2 ms