Protein–RNA interactions for Protein: Q91W18

Tdrd3, Tudor domain-containing protein 3, mousemouse

Known RBP Predictions only

Length 743 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Tdrd3Q91W18 Abhd17b-201ENSMUST00000052556 2475 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC23.07■■□□□ 1.28
Tdrd3Q91W18 Fez1-201ENSMUST00000034630 1794 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.07■■□□□ 1.28
Tdrd3Q91W18 Gm15908-201ENSMUST00000154345 1091 ntTSL 1 (best) BASIC23.07■■□□□ 1.28
Tdrd3Q91W18 Krtap5-3-201ENSMUST00000084414 1074 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC23.07■■□□□ 1.28
Tdrd3Q91W18 Ttc7b-201ENSMUST00000062957 3446 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.07■■□□□ 1.28
Tdrd3Q91W18 Mfsd4a-202ENSMUST00000112365 1536 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC23.07■■□□□ 1.28
Tdrd3Q91W18 Rnaseh1-201ENSMUST00000020959 1455 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.06■■□□□ 1.28
Tdrd3Q91W18 Prcd-201ENSMUST00000106381 724 ntTSL 3 BASIC23.06■■□□□ 1.28
Tdrd3Q91W18 Fabp3-201ENSMUST00000070532 823 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.06■■□□□ 1.28
Tdrd3Q91W18 Gm27045-201ENSMUST00000182145 1402 ntBASIC23.06■■□□□ 1.28
Tdrd3Q91W18 Ankrd54-201ENSMUST00000040676 1904 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.06■■□□□ 1.28
Tdrd3Q91W18 Smox-202ENSMUST00000110179 1320 ntTSL 1 (best) BASIC23.06■■□□□ 1.28
Tdrd3Q91W18 Arhgap27-202ENSMUST00000092557 1504 ntTSL 2 BASIC23.05■■□□□ 1.28
Tdrd3Q91W18 Gm20621-202ENSMUST00000176618 1234 ntTSL 1 (best) BASIC23.05■■□□□ 1.28
Tdrd3Q91W18 Gm43060-201ENSMUST00000200621 289 ntBASIC23.05■■□□□ 1.28
Tdrd3Q91W18 Gins3-202ENSMUST00000212434 654 ntTSL 2 BASIC23.05■■□□□ 1.28
Tdrd3Q91W18 Gtsf1-201ENSMUST00000023129 819 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.05■■□□□ 1.28
Tdrd3Q91W18 Tomm40-202ENSMUST00000093552 1577 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.05■■□□□ 1.28
Tdrd3Q91W18 Parl-201ENSMUST00000048642 1348 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.05■■□□□ 1.28
Tdrd3Q91W18 Fam189a2-201ENSMUST00000096164 2547 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC23.05■■□□□ 1.28
Tdrd3Q91W18 Gm27027-201ENSMUST00000183110 547 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC23.04■■□□□ 1.28
Tdrd3Q91W18 Lmo1-202ENSMUST00000207178 912 ntAPPRIS ALT1 TSL 2 BASIC23.04■■□□□ 1.28
Tdrd3Q91W18 Tmem234-201ENSMUST00000102591 1437 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.04■■□□□ 1.28
Tdrd3Q91W18 Sh3bp1-203ENSMUST00000089378 2001 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.04■■□□□ 1.28
Tdrd3Q91W18 Eml4-202ENSMUST00000096766 5445 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.04■■□□□ 1.28
Tdrd3Q91W18 Mgll-202ENSMUST00000113581 1308 ntTSL 5 BASIC23.04■■□□□ 1.28
Tdrd3Q91W18 Gm26617-201ENSMUST00000180381 4429 ntTSL 3 BASIC23.04■■□□□ 1.28
Tdrd3Q91W18 Tmem45b-201ENSMUST00000048050 1799 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.04■■□□□ 1.28
Tdrd3Q91W18 Tekt5-201ENSMUST00000043415 1803 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.03■■□□□ 1.28
Tdrd3Q91W18 Evi5l-209ENSMUST00000177053 1542 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC23.03■■□□□ 1.28
Tdrd3Q91W18 Klhl22-201ENSMUST00000117192 2754 ntTSL 5 BASIC23.03■■□□□ 1.28
Tdrd3Q91W18 Cdc16-201ENSMUST00000043962 2301 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.03■■□□□ 1.28
Tdrd3Q91W18 Phf12-202ENSMUST00000108360 3047 ntTSL 1 (best) BASIC23.03■■□□□ 1.28
Tdrd3Q91W18 Sap18b-201ENSMUST00000074053 789 ntAPPRIS P1 BASIC23.03■■□□□ 1.28
Tdrd3Q91W18 Arhgap9-204ENSMUST00000219511 2217 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.02■■□□□ 1.28
Tdrd3Q91W18 Raph1-201ENSMUST00000027168 2241 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC23.02■■□□□ 1.28
Tdrd3Q91W18 Impdh1-201ENSMUST00000078155 2437 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.02■■□□□ 1.28
Tdrd3Q91W18 Fbxl3-204ENSMUST00000132004 2534 ntTSL 1 (best) BASIC23.02■■□□□ 1.28
Tdrd3Q91W18 4430402I18Rik-201ENSMUST00000025872 2152 ntTSL 1 (best) BASIC23.02■■□□□ 1.28
Tdrd3Q91W18 1700016H13Rik-203ENSMUST00000120108 797 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC23.02■■□□□ 1.28
Tdrd3Q91W18 Smad6-203ENSMUST00000179458 273 ntBASIC23.02■■□□□ 1.28
Tdrd3Q91W18 Ctf1-204ENSMUST00000206506 784 ntTSL 2 BASIC23.02■■□□□ 1.28
Tdrd3Q91W18 6330403K07Rik-201ENSMUST00000156068 1494 ntTSL 1 (best) BASIC23.02■■□□□ 1.28
Tdrd3Q91W18 Bcl3-201ENSMUST00000120537 1850 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.02■■□□□ 1.28
Tdrd3Q91W18 Dcaf15-201ENSMUST00000041367 2312 ntTSL 1 (best) BASIC23.02■■□□□ 1.28
Tdrd3Q91W18 Rer1-201ENSMUST00000030914 1596 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.01■■□□□ 1.27
Tdrd3Q91W18 Rnf19b-206ENSMUST00000168461 2532 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC23.01■■□□□ 1.27
Tdrd3Q91W18 4930444P10Rik-203ENSMUST00000151004 1001 ntAPPRIS P2 TSL 3 BASIC23.01■■□□□ 1.27
Tdrd3Q91W18 Sirpa-209ENSMUST00000160276 876 ntTSL 1 (best) BASIC23.01■■□□□ 1.27
Tdrd3Q91W18 Ube2q1-201ENSMUST00000038356 3077 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.01■■□□□ 1.27
Tdrd3Q91W18 Nkx2-2-201ENSMUST00000067075 2120 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23■■□□□ 1.27
Tdrd3Q91W18 Adad2-201ENSMUST00000098361 1926 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23■■□□□ 1.27
Tdrd3Q91W18 Ccr10-201ENSMUST00000062759 1726 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23■■□□□ 1.27
Tdrd3Q91W18 AC165080.2-201ENSMUST00000217491 1530 ntBASIC23■■□□□ 1.27
Tdrd3Q91W18 Adrm1-201ENSMUST00000061437 1535 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23■■□□□ 1.27
Tdrd3Q91W18 Hacd1-203ENSMUST00000114753 993 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23■■□□□ 1.27
Tdrd3Q91W18 B630019K06Rik-201ENSMUST00000064196 2583 ntAPPRIS P1 BASIC23■■□□□ 1.27
Tdrd3Q91W18 Rnf8-201ENSMUST00000024817 2077 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23■■□□□ 1.27
Tdrd3Q91W18 Espn-210ENSMUST00000105656 1593 ntTSL 5 BASIC23■■□□□ 1.27
Tdrd3Q91W18 Gm32051-202ENSMUST00000197905 2385 ntBASIC23■■□□□ 1.27
Tdrd3Q91W18 Ell3-201ENSMUST00000028679 2115 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23■■□□□ 1.27
Tdrd3Q91W18 Dnajb11-205ENSMUST00000178320 1628 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC23■■□□□ 1.27
Tdrd3Q91W18 Lrrc1-205ENSMUST00000183873 3121 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.99■■□□□ 1.27
Tdrd3Q91W18 Camsap1-212ENSMUST00000183461 5090 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC22.99■■□□□ 1.27
Tdrd3Q91W18 Mrgbp-206ENSMUST00000169630 1192 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.99■■□□□ 1.27
Tdrd3Q91W18 Trip10-207ENSMUST00000224947 2016 ntAPPRIS P2 BASIC22.99■■□□□ 1.27
Tdrd3Q91W18 Fam60a-202ENSMUST00000081956 2737 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.99■■□□□ 1.27
Tdrd3Q91W18 Pth1r-201ENSMUST00000006005 2307 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.98■■□□□ 1.27
Tdrd3Q91W18 Klf15-201ENSMUST00000032174 2373 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.98■■□□□ 1.27
Tdrd3Q91W18 Ccdc61-201ENSMUST00000098780 2022 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.98■■□□□ 1.27
Tdrd3Q91W18 Gm13063-201ENSMUST00000132247 669 ntTSL 3 BASIC22.98■■□□□ 1.27
Tdrd3Q91W18 Art5-204ENSMUST00000106937 1713 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.98■■□□□ 1.27
Tdrd3Q91W18 Nckap1-201ENSMUST00000028386 4469 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.98■■□□□ 1.27
Tdrd3Q91W18 Nat14-204ENSMUST00000207687 1415 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.98■■□□□ 1.27
Tdrd3Q91W18 4930412F12Rik-201ENSMUST00000211700 1471 ntBASIC22.98■■□□□ 1.27
Tdrd3Q91W18 Utp11-201ENSMUST00000030738 1603 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.97■■□□□ 1.27
Tdrd3Q91W18 Deptor-203ENSMUST00000100660 1377 ntTSL 1 (best) BASIC22.97■■□□□ 1.27
Tdrd3Q91W18 Olig3-201ENSMUST00000053225 2072 ntAPPRIS P1 BASIC22.97■■□□□ 1.27
Tdrd3Q91W18 Retreg2-208ENSMUST00000190240 2438 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.97■■□□□ 1.27
Tdrd3Q91W18 Ankrd9-201ENSMUST00000043459 1706 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.96■■□□□ 1.27
Tdrd3Q91W18 Ntn5-202ENSMUST00000182750 1758 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.96■■□□□ 1.27
Tdrd3Q91W18 Heca-201ENSMUST00000037879 5098 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.96■■□□□ 1.27
Tdrd3Q91W18 Inafm2-201ENSMUST00000149978 3053 ntAPPRIS P1 BASIC22.96■■□□□ 1.27
Tdrd3Q91W18 Ndrg2-202ENSMUST00000111632 2103 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC22.96■■□□□ 1.27
Tdrd3Q91W18 Ltk-206ENSMUST00000182203 2232 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.96■■□□□ 1.27
Tdrd3Q91W18 Gm26796-201ENSMUST00000181092 2276 ntTSL 1 (best) BASIC22.96■■□□□ 1.27
Tdrd3Q91W18 Mfsd4b2-201ENSMUST00000045526 2285 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.96■■□□□ 1.27
Tdrd3Q91W18 Ninj1-201ENSMUST00000049022 1187 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.96■■□□□ 1.27
Tdrd3Q91W18 Tspan17-202ENSMUST00000099503 822 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC22.96■■□□□ 1.27
Tdrd3Q91W18 Snap91-203ENSMUST00000074501 2577 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.96■■□□□ 1.27
Tdrd3Q91W18 Dhps-201ENSMUST00000078665 1333 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.96■■□□□ 1.27
Tdrd3Q91W18 Akt1-201ENSMUST00000001780 2690 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.96■■□□□ 1.27
Tdrd3Q91W18 Celf6-202ENSMUST00000118164 1583 ntTSL 1 (best) BASIC22.96■■□□□ 1.27
Tdrd3Q91W18 AC122428.2-201ENSMUST00000216321 1832 ntBASIC22.96■■□□□ 1.27
Tdrd3Q91W18 Tfg-201ENSMUST00000065515 1945 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.96■■□□□ 1.27
Tdrd3Q91W18 Trim3-203ENSMUST00000106791 2466 ntTSL 1 (best) BASIC22.96■■□□□ 1.27
Tdrd3Q91W18 Mms22l-205ENSMUST00000138567 1350 ntTSL 2 BASIC22.95■■□□□ 1.26
Tdrd3Q91W18 Sumo3-209ENSMUST00000174113 512 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22.95■■□□□ 1.26
Tdrd3Q91W18 1700012B09Rik-204ENSMUST00000191047 654 ntAPPRIS ALT2 TSL 3 BASIC22.95■■□□□ 1.26
Tdrd3Q91W18 Morf4l1-211ENSMUST00000191189 1223 ntTSL 5 BASIC22.95■■□□□ 1.26
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 15.8 ms