Protein–RNA interactions for Protein: Q91VW3

Sh3bgrl3, SH3 domain-binding glutamic acid-rich-like protein 3, mousemouse

Predictions only

Length 93 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Sh3bgrl3Q91VW3 Pknox2-201ENSMUST00000039674 3632 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.82■□□□□ 0.12
Sh3bgrl3Q91VW3 Dbp-203ENSMUST00000211357 1252 ntTSL 5 BASIC15.82■□□□□ 0.12
Sh3bgrl3Q91VW3 Gas1-202ENSMUST00000223933 1155 ntAPPRIS P2 BASIC15.82■□□□□ 0.12
Sh3bgrl3Q91VW3 AC117769.4-201ENSMUST00000225679 685 ntBASIC15.82■□□□□ 0.12
Sh3bgrl3Q91VW3 Stmn4-204ENSMUST00000121955 1361 ntTSL 5 BASIC15.82■□□□□ 0.12
Sh3bgrl3Q91VW3 Hoxa2-201ENSMUST00000014848 1775 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.82■□□□□ 0.12
Sh3bgrl3Q91VW3 Txnrd2-213ENSMUST00000178093 1785 ntTSL 5 BASIC15.82■□□□□ 0.12
Sh3bgrl3Q91VW3 Trim71-201ENSMUST00000111816 9332 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.82■□□□□ 0.12
Sh3bgrl3Q91VW3 Gm29430-202ENSMUST00000191453 2015 ntTSL 5 BASIC15.82■□□□□ 0.12
Sh3bgrl3Q91VW3 Sh3gl1-201ENSMUST00000003268 2072 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.82■□□□□ 0.12
Sh3bgrl3Q91VW3 Syt7-203ENSMUST00000169121 6834 ntTSL 5 BASIC15.81■□□□□ 0.12
Sh3bgrl3Q91VW3 Arpc5l-202ENSMUST00000112862 1339 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.81■□□□□ 0.12
Sh3bgrl3Q91VW3 Shisa8-201ENSMUST00000179269 1804 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.81■□□□□ 0.12
Sh3bgrl3Q91VW3 A430027H14Rik-201ENSMUST00000191809 1467 ntBASIC15.81■□□□□ 0.12
Sh3bgrl3Q91VW3 Rhbdf1-201ENSMUST00000020524 2946 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.81■□□□□ 0.12
Sh3bgrl3Q91VW3 Fgf16-201ENSMUST00000033581 1645 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.81■□□□□ 0.12
Sh3bgrl3Q91VW3 Dcun1d5-201ENSMUST00000034499 1122 ntTSL 1 (best) BASIC15.81■□□□□ 0.12
Sh3bgrl3Q91VW3 Alg9-201ENSMUST00000034561 2873 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.81■□□□□ 0.12
Sh3bgrl3Q91VW3 Actrt3-201ENSMUST00000047630 1961 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.81■□□□□ 0.12
Sh3bgrl3Q91VW3 2410002F23Rik-201ENSMUST00000055858 1982 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.81■□□□□ 0.12
Sh3bgrl3Q91VW3 Zcchc24-201ENSMUST00000069180 4556 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.81■□□□□ 0.12
Sh3bgrl3Q91VW3 Runx2os1-201ENSMUST00000097320 792 ntTSL 1 (best) BASIC15.81■□□□□ 0.12
Sh3bgrl3Q91VW3 Ipmk-203ENSMUST00000121446 1492 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.8■□□□□ 0.12
Sh3bgrl3Q91VW3 Cd248-201ENSMUST00000070630 2560 ntAPPRIS P1 BASIC15.8■□□□□ 0.12
Sh3bgrl3Q91VW3 E130218I03Rik-204ENSMUST00000131447 888 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.8■□□□□ 0.12
Sh3bgrl3Q91VW3 Scarna2-201ENSMUST00000157560 414 ntBASIC15.8■□□□□ 0.12
Sh3bgrl3Q91VW3 Pdlim4-201ENSMUST00000018755 1182 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.8■□□□□ 0.12
Sh3bgrl3Q91VW3 Rnaseh2c-201ENSMUST00000025864 1126 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.8■□□□□ 0.12
Sh3bgrl3Q91VW3 Hhex-201ENSMUST00000025944 1802 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.8■□□□□ 0.12
Sh3bgrl3Q91VW3 Uqcrc1-201ENSMUST00000026743 1653 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.79■□□□□ 0.12
Sh3bgrl3Q91VW3 Spata2-202ENSMUST00000109211 1531 ntTSL 1 (best) BASIC15.79■□□□□ 0.12
Sh3bgrl3Q91VW3 Gatad2a-202ENSMUST00000116463 3363 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.79■□□□□ 0.12
Sh3bgrl3Q91VW3 Magi2-203ENSMUST00000115267 4478 ntTSL 1 (best) BASIC15.79■□□□□ 0.12
Sh3bgrl3Q91VW3 Gm39157-201ENSMUST00000212322 1180 ntTSL 5 BASIC15.79■□□□□ 0.12
Sh3bgrl3Q91VW3 Ascl1-201ENSMUST00000020243 2481 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.79■□□□□ 0.12
Sh3bgrl3Q91VW3 Setd6-201ENSMUST00000034096 1707 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.79■□□□□ 0.12
Sh3bgrl3Q91VW3 Sco1-202ENSMUST00000108690 2186 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.79■□□□□ 0.12
Sh3bgrl3Q91VW3 Nlgn2-201ENSMUST00000056484 5003 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.78■□□□□ 0.12
Sh3bgrl3Q91VW3 Pank2-204ENSMUST00000150843 4266 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.78■□□□□ 0.12
Sh3bgrl3Q91VW3 Gfi1-203ENSMUST00000159164 2648 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.78■□□□□ 0.12
Sh3bgrl3Q91VW3 Vamp4-206ENSMUST00000150040 901 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.78■□□□□ 0.12
Sh3bgrl3Q91VW3 Rasef-203ENSMUST00000222414 2127 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.78■□□□□ 0.12
Sh3bgrl3Q91VW3 Fam105a-202ENSMUST00000226145 2950 ntAPPRIS P1 BASIC15.78■□□□□ 0.12
Sh3bgrl3Q91VW3 Card19-201ENSMUST00000048946 804 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.78■□□□□ 0.12
Sh3bgrl3Q91VW3 Gjd3-201ENSMUST00000062931 837 ntAPPRIS P1 BASIC15.78■□□□□ 0.12
Sh3bgrl3Q91VW3 Tk2-201ENSMUST00000050211 2406 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.78■□□□□ 0.12
Sh3bgrl3Q91VW3 Zfp746-203ENSMUST00000203609 3648 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.78■□□□□ 0.12
Sh3bgrl3Q91VW3 Bmp6-201ENSMUST00000171970 3593 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.78■□□□□ 0.12
Sh3bgrl3Q91VW3 Hmg20b-203ENSMUST00000105324 1540 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.78■□□□□ 0.12
Sh3bgrl3Q91VW3 Srsf4-202ENSMUST00000053819 2257 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.78■□□□□ 0.12
Sh3bgrl3Q91VW3 Creb3l1-201ENSMUST00000028663 2603 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.78■□□□□ 0.12
Sh3bgrl3Q91VW3 1700034H15Rik-201ENSMUST00000069573 1461 ntTSL 1 (best) BASIC15.78■□□□□ 0.12
Sh3bgrl3Q91VW3 Ercc6l2-208ENSMUST00000144763 1820 ntTSL 1 (best) BASIC15.78■□□□□ 0.12
Sh3bgrl3Q91VW3 Mycl-202ENSMUST00000106252 3293 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.78■□□□□ 0.12
Sh3bgrl3Q91VW3 Adpgk-201ENSMUST00000026266 2464 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC15.77■□□□□ 0.12
Sh3bgrl3Q91VW3 Arfrp1-203ENSMUST00000127988 2447 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.77■□□□□ 0.12
Sh3bgrl3Q91VW3 Hmox2-202ENSMUST00000118885 1392 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.77■□□□□ 0.12
Sh3bgrl3Q91VW3 Sntb1-202ENSMUST00000110200 1225 ntTSL 1 (best) BASIC15.77■□□□□ 0.12
Sh3bgrl3Q91VW3 Anapc5-205ENSMUST00000197074 2413 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.77■□□□□ 0.11
Sh3bgrl3Q91VW3 Anapc5-212ENSMUST00000199406 2413 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.77■□□□□ 0.11
Sh3bgrl3Q91VW3 Usp2-206ENSMUST00000176416 1486 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.77■□□□□ 0.11
Sh3bgrl3Q91VW3 Aplp1-201ENSMUST00000006828 2343 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.77■□□□□ 0.11
Sh3bgrl3Q91VW3 Sept7-202ENSMUST00000165594 2516 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC15.76■□□□□ 0.11
Sh3bgrl3Q91VW3 Pelo-201ENSMUST00000109226 1600 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.76■□□□□ 0.11
Sh3bgrl3Q91VW3 Dusp2-201ENSMUST00000028846 1617 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.76■□□□□ 0.11
Sh3bgrl3Q91VW3 Nadk2-201ENSMUST00000067760 3731 ntAPPRIS P5 TSL 5 BASIC15.76■□□□□ 0.11
Sh3bgrl3Q91VW3 Astn2-202ENSMUST00000084496 4675 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.76■□□□□ 0.11
Sh3bgrl3Q91VW3 Zfp703-201ENSMUST00000127097 587 ntTSL 2 BASIC15.76■□□□□ 0.11
Sh3bgrl3Q91VW3 Wbp1-208ENSMUST00000151393 837 ntTSL 3 BASIC15.76■□□□□ 0.11
Sh3bgrl3Q91VW3 Dctpp1-201ENSMUST00000035276 676 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.76■□□□□ 0.11
Sh3bgrl3Q91VW3 Cbln2-202ENSMUST00000122079 2549 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.76■□□□□ 0.11
Sh3bgrl3Q91VW3 St3gal3-201ENSMUST00000030263 2549 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.76■□□□□ 0.11
Sh3bgrl3Q91VW3 Cacnb1-203ENSMUST00000103144 2236 ntTSL 5 BASIC15.76■□□□□ 0.11
Sh3bgrl3Q91VW3 Pbx1-202ENSMUST00000072863 1709 ntTSL 1 (best) BASIC15.76■□□□□ 0.11
Sh3bgrl3Q91VW3 Wnk2-210ENSMUST00000162403 6147 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.76■□□□□ 0.11
Sh3bgrl3Q91VW3 Mcu-202ENSMUST00000020312 2872 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.76■□□□□ 0.11
Sh3bgrl3Q91VW3 Sumf1-201ENSMUST00000032191 2593 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.76■□□□□ 0.11
Sh3bgrl3Q91VW3 Fkbp9-201ENSMUST00000031795 3009 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.76■□□□□ 0.11
Sh3bgrl3Q91VW3 Lfng-201ENSMUST00000031555 2305 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.76■□□□□ 0.11
Sh3bgrl3Q91VW3 Hnrnpd-211ENSMUST00000172361 6811 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC15.75■□□□□ 0.11
Sh3bgrl3Q91VW3 Plekhh1-201ENSMUST00000039928 6439 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.75■□□□□ 0.11
Sh3bgrl3Q91VW3 Pstpip1-201ENSMUST00000059206 1863 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.75■□□□□ 0.11
Sh3bgrl3Q91VW3 Arhgef1-204ENSMUST00000117796 3508 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.75■□□□□ 0.11
Sh3bgrl3Q91VW3 Rcan3-201ENSMUST00000030606 5111 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.75■□□□□ 0.11
Sh3bgrl3Q91VW3 Zfp287-205ENSMUST00000150336 1605 ntTSL 1 (best) BASIC15.75■□□□□ 0.11
Sh3bgrl3Q91VW3 Golph3-205ENSMUST00000228671 2842 ntBASIC15.75■□□□□ 0.11
Sh3bgrl3Q91VW3 Klhl15-205ENSMUST00000113916 2363 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.75■□□□□ 0.11
Sh3bgrl3Q91VW3 Stx2-201ENSMUST00000031378 2939 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.74■□□□□ 0.11
Sh3bgrl3Q91VW3 Slc35f4-202ENSMUST00000123534 2748 ntTSL 1 (best) BASIC15.74■□□□□ 0.11
Sh3bgrl3Q91VW3 Bend3-202ENSMUST00000167488 6337 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.74■□□□□ 0.11
Sh3bgrl3Q91VW3 Wipi1-202ENSMUST00000103060 2050 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.74■□□□□ 0.11
Sh3bgrl3Q91VW3 Aplf-201ENSMUST00000032130 1889 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.74■□□□□ 0.11
Sh3bgrl3Q91VW3 Hcn2-202ENSMUST00000099513 3195 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.74■□□□□ 0.11
Sh3bgrl3Q91VW3 Nudt3-203ENSMUST00000114886 996 ntTSL 2 BASIC15.74■□□□□ 0.11
Sh3bgrl3Q91VW3 Nsd1-206ENSMUST00000224918 1001 ntBASIC15.74■□□□□ 0.11
Sh3bgrl3Q91VW3 Gm16437-201ENSMUST00000025669 507 ntBASIC15.74■□□□□ 0.11
Sh3bgrl3Q91VW3 Id3-201ENSMUST00000008016 1278 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.74■□□□□ 0.11
Sh3bgrl3Q91VW3 Auh-204ENSMUST00000120535 1647 ntTSL 1 (best) BASIC15.74■□□□□ 0.11
Sh3bgrl3Q91VW3 Wnk2-211ENSMUST00000162581 6628 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.74■□□□□ 0.11
Sh3bgrl3Q91VW3 Ehmt2-203ENSMUST00000097342 3934 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.74■□□□□ 0.11
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