Protein–RNA interactions for Protein: Q91VU0

Fam3c, Protein FAM3C, mousemouse

Predictions only

Length 227 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Fam3cQ91VU0 Cops7a-201ENSMUST00000032220 1817 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.27■□□□□ 0.84
Fam3cQ91VU0 Gm32051-202ENSMUST00000197905 2385 ntBASIC20.27■□□□□ 0.84
Fam3cQ91VU0 Trim9-208ENSMUST00000221370 2393 ntTSL 1 (best) BASIC20.27■□□□□ 0.84
Fam3cQ91VU0 AC099934.2-201ENSMUST00000196389 70 ntBASIC20.27■□□□□ 0.84
Fam3cQ91VU0 AC156953.1-201ENSMUST00000196953 70 ntBASIC20.27■□□□□ 0.84
Fam3cQ91VU0 AC157822.2-201ENSMUST00000200291 70 ntBASIC20.27■□□□□ 0.84
Fam3cQ91VU0 4930519A11Rik-202ENSMUST00000221053 667 ntTSL 3 BASIC20.27■□□□□ 0.84
Fam3cQ91VU0 Cadm1-201ENSMUST00000034581 1254 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC20.27■□□□□ 0.84
Fam3cQ91VU0 Phf2-201ENSMUST00000035540 5494 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.27■□□□□ 0.84
Fam3cQ91VU0 Onecut3-201ENSMUST00000051773 4776 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.27■□□□□ 0.84
Fam3cQ91VU0 Inafm2-201ENSMUST00000149978 3053 ntAPPRIS P1 BASIC20.27■□□□□ 0.84
Fam3cQ91VU0 H2afj-201ENSMUST00000074556 1831 ntAPPRIS P2 BASIC20.27■□□□□ 0.84
Fam3cQ91VU0 Gm20431-201ENSMUST00000125544 2367 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC20.27■□□□□ 0.83
Fam3cQ91VU0 Fam60a-202ENSMUST00000081956 2737 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.26■□□□□ 0.83
Fam3cQ91VU0 Fam189a2-201ENSMUST00000096164 2547 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC20.26■□□□□ 0.83
Fam3cQ91VU0 Cacng7-201ENSMUST00000092891 2212 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.26■□□□□ 0.83
Fam3cQ91VU0 Nckap1-201ENSMUST00000028386 4469 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.26■□□□□ 0.83
Fam3cQ91VU0 Hist2h3c2-201ENSMUST00000167403 1020 ntAPPRIS P1 BASIC20.26■□□□□ 0.83
Fam3cQ91VU0 Tmem171-201ENSMUST00000064347 1161 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.26■□□□□ 0.83
Fam3cQ91VU0 Gm9970-201ENSMUST00000068997 558 ntAPPRIS P1 BASIC20.26■□□□□ 0.83
Fam3cQ91VU0 Nr2c2ap-201ENSMUST00000095273 1161 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC20.26■□□□□ 0.83
Fam3cQ91VU0 Gm21988-202ENSMUST00000176268 1621 ntAPPRIS P5 TSL 5 BASIC20.26■□□□□ 0.83
Fam3cQ91VU0 D830036C21Rik-202ENSMUST00000208263 1548 ntBASIC20.26■□□□□ 0.83
Fam3cQ91VU0 Sh3bp1-203ENSMUST00000089378 2001 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.26■□□□□ 0.83
Fam3cQ91VU0 Hoxd4-202ENSMUST00000111980 1494 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.25■□□□□ 0.83
Fam3cQ91VU0 Rfc5-202ENSMUST00000111953 772 ntTSL 1 (best) BASIC20.25■□□□□ 0.83
Fam3cQ91VU0 Gamt-201ENSMUST00000020359 979 ntTSL 1 (best) BASIC20.25■□□□□ 0.83
Fam3cQ91VU0 Gm45168-202ENSMUST00000206461 1069 ntTSL 5 BASIC20.25■□□□□ 0.83
Fam3cQ91VU0 Gm36210-201ENSMUST00000210663 1279 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC20.25■□□□□ 0.83
Fam3cQ91VU0 Vamp5-201ENSMUST00000074231 553 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.25■□□□□ 0.83
Fam3cQ91VU0 Gnl1-201ENSMUST00000087200 2848 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.25■□□□□ 0.83
Fam3cQ91VU0 Shisa6-201ENSMUST00000066679 1578 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.25■□□□□ 0.83
Fam3cQ91VU0 Parl-201ENSMUST00000048642 1348 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.25■□□□□ 0.83
Fam3cQ91VU0 Abhd12-201ENSMUST00000056149 1999 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.25■□□□□ 0.83
Fam3cQ91VU0 Tpm1-212ENSMUST00000113696 1714 ntTSL 2 BASIC20.24■□□□□ 0.83
Fam3cQ91VU0 Zfp653-202ENSMUST00000179605 1888 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.24■□□□□ 0.83
Fam3cQ91VU0 Slc27a3-201ENSMUST00000029541 2259 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.24■□□□□ 0.83
Fam3cQ91VU0 Ccne1-201ENSMUST00000108023 2000 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.24■□□□□ 0.83
Fam3cQ91VU0 Gm16286-205ENSMUST00000127234 1755 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.24■□□□□ 0.83
Fam3cQ91VU0 Nrl-203ENSMUST00000178694 1928 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.24■□□□□ 0.83
Fam3cQ91VU0 Anapc1-202ENSMUST00000110332 1214 ntTSL 1 (best) BASIC20.24■□□□□ 0.83
Fam3cQ91VU0 Gm6916-201ENSMUST00000205277 828 ntTSL 3 BASIC20.24■□□□□ 0.83
Fam3cQ91VU0 AC133650.2-201ENSMUST00000217036 607 ntTSL 3 BASIC20.24■□□□□ 0.83
Fam3cQ91VU0 Gtsf1-201ENSMUST00000023129 819 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.24■□□□□ 0.83
Fam3cQ91VU0 Gfra4-201ENSMUST00000028787 909 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC20.24■□□□□ 0.83
Fam3cQ91VU0 AW121686-201ENSMUST00000181049 2200 ntTSL 1 (best) BASIC20.24■□□□□ 0.83
Fam3cQ91VU0 9130213A22Rik-201ENSMUST00000180487 1581 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.24■□□□□ 0.83
Fam3cQ91VU0 Pycr2-201ENSMUST00000027802 1580 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.24■□□□□ 0.83
Fam3cQ91VU0 Msto1-201ENSMUST00000107494 2093 ntTSL 1 (best) BASIC20.23■□□□□ 0.83
Fam3cQ91VU0 Cers5-201ENSMUST00000023762 2096 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC20.23■□□□□ 0.83
Fam3cQ91VU0 Grap-201ENSMUST00000004959 1662 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.23■□□□□ 0.83
Fam3cQ91VU0 Sp5-201ENSMUST00000100043 2100 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.23■□□□□ 0.83
Fam3cQ91VU0 Habp4-201ENSMUST00000021929 2564 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.23■□□□□ 0.83
Fam3cQ91VU0 Fcho2-201ENSMUST00000040340 5122 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.23■□□□□ 0.83
Fam3cQ91VU0 Gm12063-201ENSMUST00000148087 715 ntTSL 2 BASIC20.23■□□□□ 0.83
Fam3cQ91VU0 Sumo3-209ENSMUST00000174113 512 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC20.23■□□□□ 0.83
Fam3cQ91VU0 Gm45890-202ENSMUST00000212188 1052 ntTSL 1 (best) BASIC20.23■□□□□ 0.83
Fam3cQ91VU0 Trip10-207ENSMUST00000224947 2016 ntAPPRIS P2 BASIC20.23■□□□□ 0.83
Fam3cQ91VU0 Slc22a17-208ENSMUST00000228119 2348 ntAPPRIS P1 BASIC20.23■□□□□ 0.83
Fam3cQ91VU0 Dhps-201ENSMUST00000078665 1333 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.23■□□□□ 0.83
Fam3cQ91VU0 Neurl4-211ENSMUST00000177138 4886 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.22■□□□□ 0.83
Fam3cQ91VU0 Tmem234-201ENSMUST00000102591 1437 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.22■□□□□ 0.83
Fam3cQ91VU0 Hacd1-203ENSMUST00000114753 993 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.22■□□□□ 0.83
Fam3cQ91VU0 Gm13063-201ENSMUST00000132247 669 ntTSL 3 BASIC20.22■□□□□ 0.83
Fam3cQ91VU0 Gm38165-201ENSMUST00000191654 486 ntTSL 1 (best) BASIC20.22■□□□□ 0.83
Fam3cQ91VU0 Hspb1-201ENSMUST00000005077 903 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.22■□□□□ 0.83
Fam3cQ91VU0 Gm10209-201ENSMUST00000203397 1607 ntBASIC20.22■□□□□ 0.83
Fam3cQ91VU0 Gm10612-201ENSMUST00000162198 1681 ntTSL 1 (best) BASIC20.22■□□□□ 0.83
Fam3cQ91VU0 Tmem45b-201ENSMUST00000048050 1799 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.21■□□□□ 0.83
Fam3cQ91VU0 Drd4-201ENSMUST00000026569 2799 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.21■□□□□ 0.83
Fam3cQ91VU0 Rell2-204ENSMUST00000163591 1057 ntTSL 5 BASIC20.21■□□□□ 0.83
Fam3cQ91VU0 Tmbim4-201ENSMUST00000020446 904 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.21■□□□□ 0.83
Fam3cQ91VU0 Kcnj12-202ENSMUST00000089184 2291 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC20.21■□□□□ 0.83
Fam3cQ91VU0 Kat2b-201ENSMUST00000000724 4653 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.21■□□□□ 0.83
Fam3cQ91VU0 Yy1-201ENSMUST00000021692 6178 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.21■□□□□ 0.83
Fam3cQ91VU0 Rbfox3-204ENSMUST00000106278 1542 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.21■□□□□ 0.83
Fam3cQ91VU0 Gm10129-202ENSMUST00000193100 1316 ntBASIC20.21■□□□□ 0.83
Fam3cQ91VU0 Hoxa2-201ENSMUST00000014848 1775 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.21■□□□□ 0.83
Fam3cQ91VU0 Acss2-203ENSMUST00000103142 2145 ntTSL 5 BASIC20.2■□□□□ 0.82
Fam3cQ91VU0 Gpx4-202ENSMUST00000105372 959 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.2■□□□□ 0.82
Fam3cQ91VU0 Cnpy3-202ENSMUST00000121671 561 ntTSL 2 BASIC20.2■□□□□ 0.82
Fam3cQ91VU0 Mpig6b-202ENSMUST00000174190 729 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.2■□□□□ 0.82
Fam3cQ91VU0 Wdr41-208ENSMUST00000222995 1112 ntTSL 5 BASIC20.2■□□□□ 0.82
Fam3cQ91VU0 Sap18b-201ENSMUST00000074053 789 ntAPPRIS P1 BASIC20.2■□□□□ 0.82
Fam3cQ91VU0 Rgs19-201ENSMUST00000002532 1511 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.2■□□□□ 0.82
Fam3cQ91VU0 Ndrg2-202ENSMUST00000111632 2103 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC20.2■□□□□ 0.82
Fam3cQ91VU0 Tmem80-208ENSMUST00000145184 1805 ntTSL 5 BASIC20.19■□□□□ 0.82
Fam3cQ91VU0 Gm10849-201ENSMUST00000100397 618 ntBASIC20.19■□□□□ 0.82
Fam3cQ91VU0 Pan3-209ENSMUST00000176600 5541 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC20.19■□□□□ 0.82
Fam3cQ91VU0 Smad6-203ENSMUST00000179458 273 ntBASIC20.19■□□□□ 0.82
Fam3cQ91VU0 Akr7a5-201ENSMUST00000073787 1288 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.19■□□□□ 0.82
Fam3cQ91VU0 Otud5-204ENSMUST00000115667 2708 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC20.19■□□□□ 0.82
Fam3cQ91VU0 Cdc16-201ENSMUST00000043962 2301 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.19■□□□□ 0.82
Fam3cQ91VU0 Hnrnpab-201ENSMUST00000074669 2370 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC20.19■□□□□ 0.82
Fam3cQ91VU0 Krtap5-2-202ENSMUST00000190456 1471 ntAPPRIS P2 BASIC20.18■□□□□ 0.82
Fam3cQ91VU0 Fance-204ENSMUST00000114804 1842 ntTSL 1 (best) BASIC20.18■□□□□ 0.82
Fam3cQ91VU0 Snapin-203ENSMUST00000149884 1928 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.18■□□□□ 0.82
Fam3cQ91VU0 Atn1-201ENSMUST00000088357 4433 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.18■□□□□ 0.82
Fam3cQ91VU0 Ctf1-204ENSMUST00000206506 784 ntTSL 2 BASIC20.18■□□□□ 0.82
Fam3cQ91VU0 AC122828.1-201ENSMUST00000220785 489 ntTSL 3 BASIC20.18■□□□□ 0.82
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 21.3 ms