Protein–RNA interactions for Protein: Q91VF6

Col26a1, Collagen alpha-1(XXVI) chain, mousemouse

Predictions only

Length 440 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Col26a1Q91VF6 Zfp422-201ENSMUST00000057540 2375 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.28■■□□□ 1.16
Col26a1Q91VF6 5031425E22Rik-201ENSMUST00000101522 2110 ntBASIC22.28■■□□□ 1.16
Col26a1Q91VF6 Henmt1-202ENSMUST00000098680 1466 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.28■■□□□ 1.16
Col26a1Q91VF6 Sdf2l1-201ENSMUST00000023453 1108 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.27■■□□□ 1.16
Col26a1Q91VF6 Mfap4-201ENSMUST00000040522 939 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC22.27■■□□□ 1.16
Col26a1Q91VF6 Gm8909-202ENSMUST00000097335 1182 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC22.27■■□□□ 1.16
Col26a1Q91VF6 Tusc2-201ENSMUST00000010198 1665 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.26■■□□□ 1.15
Col26a1Q91VF6 Ankrd9-205ENSMUST00000142012 1226 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC22.26■■□□□ 1.15
Col26a1Q91VF6 2210408F21Rik-213ENSMUST00000153057 652 ntTSL 3 BASIC22.26■■□□□ 1.15
Col26a1Q91VF6 Stmn1-201ENSMUST00000030636 1060 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.26■■□□□ 1.15
Col26a1Q91VF6 Lrrfip2-205ENSMUST00000196981 1839 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC22.26■■□□□ 1.15
Col26a1Q91VF6 Glrx3-201ENSMUST00000064404 1685 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.26■■□□□ 1.15
Col26a1Q91VF6 Rxrb-203ENSMUST00000173354 1743 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.26■■□□□ 1.15
Col26a1Q91VF6 Dennd5a-202ENSMUST00000106722 4862 ntTSL 1 (best) BASIC22.25■■□□□ 1.15
Col26a1Q91VF6 Fam168b-201ENSMUST00000047534 5030 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.25■■□□□ 1.15
Col26a1Q91VF6 Ciapin1-201ENSMUST00000034233 1807 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.25■■□□□ 1.15
Col26a1Q91VF6 Map1lc3b-203ENSMUST00000181521 775 ntTSL 3 BASIC22.25■■□□□ 1.15
Col26a1Q91VF6 Rnf32-204ENSMUST00000160246 1565 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.25■■□□□ 1.15
Col26a1Q91VF6 4930526A20Rik-202ENSMUST00000142461 1628 ntBASIC22.24■■□□□ 1.15
Col26a1Q91VF6 Nrg3-203ENSMUST00000173780 2137 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC22.24■■□□□ 1.15
Col26a1Q91VF6 Tekt5-202ENSMUST00000115831 1277 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.24■■□□□ 1.15
Col26a1Q91VF6 Gm37055-201ENSMUST00000191866 133 ntBASIC22.24■■□□□ 1.15
Col26a1Q91VF6 Cited2-201ENSMUST00000038107 1979 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.24■■□□□ 1.15
Col26a1Q91VF6 Adra1d-201ENSMUST00000103184 1899 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.24■■□□□ 1.15
Col26a1Q91VF6 Dusp12-201ENSMUST00000027970 1374 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.24■■□□□ 1.15
Col26a1Q91VF6 Llph-202ENSMUST00000130198 1463 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC22.23■■□□□ 1.15
Col26a1Q91VF6 Cys1-207ENSMUST00000186602 1757 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.22■■□□□ 1.15
Col26a1Q91VF6 Stx18-202ENSMUST00000042146 1473 ntTSL 1 (best) BASIC22.22■■□□□ 1.15
Col26a1Q91VF6 Amigo1-201ENSMUST00000050909 5030 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.22■■□□□ 1.15
Col26a1Q91VF6 Ube2b-202ENSMUST00000109086 585 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22.22■■□□□ 1.15
Col26a1Q91VF6 Nudt8-203ENSMUST00000122924 1082 ntTSL 2 BASIC22.22■■□□□ 1.15
Col26a1Q91VF6 Pthlh-202ENSMUST00000204197 1281 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.22■■□□□ 1.15
Col26a1Q91VF6 2310033P09Rik-201ENSMUST00000020719 1285 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.22■■□□□ 1.15
Col26a1Q91VF6 AC153881.2-201ENSMUST00000214877 204 ntBASIC22.22■■□□□ 1.15
Col26a1Q91VF6 Fam50b-201ENSMUST00000039605 1229 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.22■■□□□ 1.15
Col26a1Q91VF6 Six3-201ENSMUST00000162695 2838 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC22.22■■□□□ 1.15
Col26a1Q91VF6 Stmn4-201ENSMUST00000074523 1303 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.22■■□□□ 1.15
Col26a1Q91VF6 Snx21-206ENSMUST00000174070 1446 ntTSL 5 BASIC22.22■■□□□ 1.15
Col26a1Q91VF6 E2f6-201ENSMUST00000020908 2418 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.21■■□□□ 1.15
Col26a1Q91VF6 Efna2-201ENSMUST00000003154 2131 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.21■■□□□ 1.15
Col26a1Q91VF6 Atp6v0b-208ENSMUST00000150204 935 ntTSL 5 BASIC22.21■■□□□ 1.15
Col26a1Q91VF6 Fus-201ENSMUST00000077609 1831 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.21■■□□□ 1.15
Col26a1Q91VF6 Csrp2-201ENSMUST00000020403 1384 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.21■■□□□ 1.15
Col26a1Q91VF6 Dxo-211ENSMUST00000180043 1447 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.21■■□□□ 1.15
Col26a1Q91VF6 Stac3-202ENSMUST00000160019 1581 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.21■■□□□ 1.15
Col26a1Q91VF6 Zfp637-201ENSMUST00000112858 650 ntTSL 2 BASIC22.2■■□□□ 1.14
Col26a1Q91VF6 Zfp637-203ENSMUST00000112860 1231 ntTSL 1 (best) BASIC22.2■■□□□ 1.14
Col26a1Q91VF6 Gm14464-201ENSMUST00000119658 1254 ntBASIC22.2■■□□□ 1.14
Col26a1Q91VF6 Stmn4-204ENSMUST00000121955 1361 ntTSL 5 BASIC22.2■■□□□ 1.14
Col26a1Q91VF6 Tssk2-201ENSMUST00000055374 1387 ntAPPRIS P1 BASIC22.2■■□□□ 1.14
Col26a1Q91VF6 Slc39a13-201ENSMUST00000073575 2469 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.2■■□□□ 1.14
Col26a1Q91VF6 St7-207ENSMUST00000115418 1678 ntTSL 5 BASIC22.2■■□□□ 1.14
Col26a1Q91VF6 Shisa8-201ENSMUST00000179269 1804 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.2■■□□□ 1.14
Col26a1Q91VF6 Upf3a-201ENSMUST00000043767 2057 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.19■■□□□ 1.14
Col26a1Q91VF6 Cpe-201ENSMUST00000048967 2117 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.19■■□□□ 1.14
Col26a1Q91VF6 0610010K14Rik-202ENSMUST00000021181 779 ntTSL 1 (best) BASIC22.19■■□□□ 1.14
Col26a1Q91VF6 4930554C24Rik-202ENSMUST00000216019 1159 ntTSL 5 BASIC22.19■■□□□ 1.14
Col26a1Q91VF6 Manbal-201ENSMUST00000081202 1107 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.19■■□□□ 1.14
Col26a1Q91VF6 Scamp3-201ENSMUST00000029684 1489 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.19■■□□□ 1.14
Col26a1Q91VF6 Gng12-204ENSMUST00000114225 1876 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.18■■□□□ 1.14
Col26a1Q91VF6 Gm14281-201ENSMUST00000121700 1294 ntBASIC22.18■■□□□ 1.14
Col26a1Q91VF6 Mcl1-202ENSMUST00000178686 858 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.18■■□□□ 1.14
Col26a1Q91VF6 Calml4-206ENSMUST00000215870 803 ntTSL 1 (best) BASIC22.18■■□□□ 1.14
Col26a1Q91VF6 Rpl21-202ENSMUST00000075453 899 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.18■■□□□ 1.14
Col26a1Q91VF6 Selenom-201ENSMUST00000094469 707 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.18■■□□□ 1.14
Col26a1Q91VF6 4930500M09Rik-202ENSMUST00000194988 1563 ntBASIC22.17■■□□□ 1.14
Col26a1Q91VF6 Utf1-201ENSMUST00000168457 1227 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.17■■□□□ 1.14
Col26a1Q91VF6 Cldn14-205ENSMUST00000177648 1266 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22.17■■□□□ 1.14
Col26a1Q91VF6 Sec11c-201ENSMUST00000025394 807 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.17■■□□□ 1.14
Col26a1Q91VF6 Cox7c-202ENSMUST00000078764 433 ntTSL 2 BASIC22.17■■□□□ 1.14
Col26a1Q91VF6 Jag2-201ENSMUST00000075827 5106 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.17■■□□□ 1.14
Col26a1Q91VF6 Ctbp1-211ENSMUST00000202868 2436 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC22.17■■□□□ 1.14
Col26a1Q91VF6 Xkr7-201ENSMUST00000037235 2711 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.16■■□□□ 1.14
Col26a1Q91VF6 Pcyt2-203ENSMUST00000106188 1486 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.16■■□□□ 1.14
Col26a1Q91VF6 Tsc22d1-204ENSMUST00000110888 4999 ntTSL 1 (best) BASIC22.16■■□□□ 1.14
Col26a1Q91VF6 Cul4a-202ENSMUST00000121426 1044 ntTSL 1 (best) BASIC22.16■■□□□ 1.14
Col26a1Q91VF6 Cyyr1-204ENSMUST00000175700 1294 ntTSL 1 (best) BASIC22.16■■□□□ 1.14
Col26a1Q91VF6 Gm43799-201ENSMUST00000201845 579 ntBASIC22.16■■□□□ 1.14
Col26a1Q91VF6 Bex2-201ENSMUST00000049130 903 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.16■■□□□ 1.14
Col26a1Q91VF6 Arhgap9-201ENSMUST00000069548 1782 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.16■■□□□ 1.14
Col26a1Q91VF6 Rnf115-201ENSMUST00000029740 2209 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.16■■□□□ 1.14
Col26a1Q91VF6 Htra4-201ENSMUST00000084031 2180 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.16■■□□□ 1.14
Col26a1Q91VF6 Vmac-201ENSMUST00000067931 2174 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.15■■□□□ 1.14
Col26a1Q91VF6 Deptor-203ENSMUST00000100660 1377 ntTSL 1 (best) BASIC22.15■■□□□ 1.14
Col26a1Q91VF6 2810002D19Rik-201ENSMUST00000152313 2040 ntTSL 1 (best) BASIC22.15■■□□□ 1.14
Col26a1Q91VF6 Gm53-201ENSMUST00000129907 1172 ntTSL 2 BASIC22.15■■□□□ 1.14
Col26a1Q91VF6 Gm9484-201ENSMUST00000195892 1159 ntBASIC22.15■■□□□ 1.14
Col26a1Q91VF6 4732471J01Rik-202ENSMUST00000205787 991 ntTSL 1 (best) BASIC22.15■■□□□ 1.14
Col26a1Q91VF6 Cenps-201ENSMUST00000030813 1110 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.15■■□□□ 1.14
Col26a1Q91VF6 Gng10-201ENSMUST00000041160 1192 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.15■■□□□ 1.14
Col26a1Q91VF6 Crim1-201ENSMUST00000112498 5995 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.15■■□□□ 1.14
Col26a1Q91VF6 Auh-204ENSMUST00000120535 1647 ntTSL 1 (best) BASIC22.15■■□□□ 1.14
Col26a1Q91VF6 Cenps-202ENSMUST00000105695 544 ntTSL 1 (best) BASIC22.14■■□□□ 1.13
Col26a1Q91VF6 Mras-203ENSMUST00000122384 1122 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.14■■□□□ 1.13
Col26a1Q91VF6 Gas5-217ENSMUST00000161005 430 ntTSL 5 BASIC22.14■■□□□ 1.13
Col26a1Q91VF6 B230208B08Rik-201ENSMUST00000173049 404 ntTSL 3 BASIC22.14■■□□□ 1.13
Col26a1Q91VF6 Npas1-201ENSMUST00000002053 2091 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.14■■□□□ 1.13
Col26a1Q91VF6 1300014J16Rik-201ENSMUST00000219015 1337 ntBASIC22.13■■□□□ 1.13
Col26a1Q91VF6 Spata3-208ENSMUST00000149469 1110 ntTSL 5 BASIC22.13■■□□□ 1.13
Col26a1Q91VF6 Cpne1-217ENSMUST00000184265 871 ntTSL 5 BASIC22.13■■□□□ 1.13
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 177.2 ms