Protein–RNA interactions for Protein: Q8VI88

Odf4, Outer dense fiber protein 4, mousemouse

Predictions only

Length 290 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Odf4Q8VI88 Gm43034-201ENSMUST00000198678 1364 ntBASIC17.91■□□□□ 0.46
Odf4Q8VI88 Tbc1d25-204ENSMUST00000172020 2441 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.9■□□□□ 0.46
Odf4Q8VI88 Ltbp3-201ENSMUST00000081496 5190 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.9■□□□□ 0.46
Odf4Q8VI88 Ipmk-201ENSMUST00000079252 5447 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.9■□□□□ 0.46
Odf4Q8VI88 Btbd6-201ENSMUST00000002880 2057 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC17.9■□□□□ 0.46
Odf4Q8VI88 Tcte2-210ENSMUST00000148430 1839 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC17.9■□□□□ 0.46
Odf4Q8VI88 Smc6-201ENSMUST00000020931 5603 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.9■□□□□ 0.46
Odf4Q8VI88 Hpca-209ENSMUST00000164649 1626 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC17.9■□□□□ 0.46
Odf4Q8VI88 Gpn2-202ENSMUST00000105899 996 ntTSL 5 BASIC17.89■□□□□ 0.45
Odf4Q8VI88 Gm10685-201ENSMUST00000196120 433 ntTSL 3 BASIC17.89■□□□□ 0.45
Odf4Q8VI88 Gse1-202ENSMUST00000118136 4492 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.89■□□□□ 0.45
Odf4Q8VI88 Fam83d-201ENSMUST00000029183 2266 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.89■□□□□ 0.45
Odf4Q8VI88 Eif5a-210ENSMUST00000108613 1343 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.89■□□□□ 0.45
Odf4Q8VI88 Scamp3-202ENSMUST00000098941 1338 ntTSL 1 (best) BASIC17.89■□□□□ 0.45
Odf4Q8VI88 Slc35f3-201ENSMUST00000108759 2309 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.89■□□□□ 0.45
Odf4Q8VI88 Bfsp1-202ENSMUST00000099296 2160 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.89■□□□□ 0.45
Odf4Q8VI88 Ssbp4-201ENSMUST00000049908 1475 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.88■□□□□ 0.45
Odf4Q8VI88 Fbxw2-201ENSMUST00000028220 2030 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.88■□□□□ 0.45
Odf4Q8VI88 Cep97-205ENSMUST00000121703 609 ntTSL 1 (best) BASIC17.88■□□□□ 0.45
Odf4Q8VI88 Ramp1-202ENSMUST00000165855 852 ntTSL 2 BASIC17.88■□□□□ 0.45
Odf4Q8VI88 Nenf-201ENSMUST00000046770 742 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.88■□□□□ 0.45
Odf4Q8VI88 Hoxb7-201ENSMUST00000049352 1291 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.88■□□□□ 0.45
Odf4Q8VI88 Bag5-201ENSMUST00000054636 2139 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.88■□□□□ 0.45
Odf4Q8VI88 Pde1b-201ENSMUST00000023132 3218 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC17.88■□□□□ 0.45
Odf4Q8VI88 Dgat1-201ENSMUST00000023214 1888 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.88■□□□□ 0.45
Odf4Q8VI88 Mau2-206ENSMUST00000212451 1931 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.88■□□□□ 0.45
Odf4Q8VI88 Cln5-201ENSMUST00000022721 2445 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.88■□□□□ 0.45
Odf4Q8VI88 Slc30a4-201ENSMUST00000005952 5458 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.88■□□□□ 0.45
Odf4Q8VI88 Ccdc61-201ENSMUST00000098780 2022 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.88■□□□□ 0.45
Odf4Q8VI88 Trmt61a-202ENSMUST00000168338 2131 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.87■□□□□ 0.45
Odf4Q8VI88 Tal1-204ENSMUST00000162489 2894 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.87■□□□□ 0.45
Odf4Q8VI88 Nkx6-2-202ENSMUST00000106095 1299 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.87■□□□□ 0.45
Odf4Q8VI88 Ttc36-201ENSMUST00000044694 888 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.87■□□□□ 0.45
Odf4Q8VI88 Ankrd54-201ENSMUST00000040676 1904 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.87■□□□□ 0.45
Odf4Q8VI88 Zfand2b-201ENSMUST00000027394 1316 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.87■□□□□ 0.45
Odf4Q8VI88 Tex30-208ENSMUST00000147571 1360 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.87■□□□□ 0.45
Odf4Q8VI88 Gm5112-201ENSMUST00000204407 2368 ntBASIC17.87■□□□□ 0.45
Odf4Q8VI88 Znrf1-204ENSMUST00000171182 5466 ntTSL 3 BASIC17.86■□□□□ 0.45
Odf4Q8VI88 Ubp1-201ENSMUST00000009885 3742 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC17.86■□□□□ 0.45
Odf4Q8VI88 Mpz-201ENSMUST00000070758 2002 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.86■□□□□ 0.45
Odf4Q8VI88 Gabra5-201ENSMUST00000068456 2671 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.86■□□□□ 0.45
Odf4Q8VI88 Efr3a-203ENSMUST00000172756 1411 ntTSL 1 (best) BASIC17.86■□□□□ 0.45
Odf4Q8VI88 Syap1-201ENSMUST00000033723 2087 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.86■□□□□ 0.45
Odf4Q8VI88 0610010K14Rik-209ENSMUST00000108579 667 ntTSL 1 (best) BASIC17.85■□□□□ 0.45
Odf4Q8VI88 Gjc2-202ENSMUST00000108793 2187 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.85■□□□□ 0.45
Odf4Q8VI88 Dtnb-216ENSMUST00000173736 2175 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC17.85■□□□□ 0.45
Odf4Q8VI88 Elf2-212ENSMUST00000194641 5919 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC17.85■□□□□ 0.45
Odf4Q8VI88 Zfpm1-201ENSMUST00000054052 3390 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.85■□□□□ 0.45
Odf4Q8VI88 Unc5b-201ENSMUST00000077925 5869 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.85■□□□□ 0.45
Odf4Q8VI88 Dleu2-201ENSMUST00000180377 1165 ntTSL 1 (best) BASIC17.84■□□□□ 0.45
Odf4Q8VI88 Dleu2-209ENSMUST00000182957 352 ntTSL 2 BASIC17.84■□□□□ 0.45
Odf4Q8VI88 Srsf1-201ENSMUST00000079866 2948 ntTSL 1 (best) BASIC17.84■□□□□ 0.45
Odf4Q8VI88 Ttc14-206ENSMUST00000196975 1711 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.84■□□□□ 0.45
Odf4Q8VI88 Trak1-208ENSMUST00000210636 2197 ntTSL 1 (best) BASIC17.83■□□□□ 0.45
Odf4Q8VI88 Nkx2-2-201ENSMUST00000067075 2120 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.83■□□□□ 0.45
Odf4Q8VI88 Arhgap23-202ENSMUST00000107601 5450 ntTSL 5 BASIC17.83■□□□□ 0.45
Odf4Q8VI88 Dusp15-202ENSMUST00000109811 753 ntTSL 1 (best) BASIC17.83■□□□□ 0.44
Odf4Q8VI88 Ost4-202ENSMUST00000132253 1144 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.83■□□□□ 0.44
Odf4Q8VI88 Gm26558-201ENSMUST00000180559 861 ntAPPRIS P1 BASIC17.83■□□□□ 0.44
Odf4Q8VI88 Tmem196-202ENSMUST00000183694 845 ntTSL 3 BASIC17.83■□□□□ 0.44
Odf4Q8VI88 Slc9a2-201ENSMUST00000027231 5019 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.83■□□□□ 0.44
Odf4Q8VI88 Cbln2-201ENSMUST00000068423 2475 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.83■□□□□ 0.44
Odf4Q8VI88 Grin2c-202ENSMUST00000106554 4895 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.83■□□□□ 0.44
Odf4Q8VI88 Anapc5-208ENSMUST00000197719 2383 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.83■□□□□ 0.44
Odf4Q8VI88 Smim10l2a-201ENSMUST00000068106 2393 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.83■□□□□ 0.44
Odf4Q8VI88 Pink1-203ENSMUST00000105817 1711 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC17.83■□□□□ 0.44
Odf4Q8VI88 Htra2-201ENSMUST00000089645 1725 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC17.83■□□□□ 0.44
Odf4Q8VI88 Zfp105-201ENSMUST00000051667 2010 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.82■□□□□ 0.44
Odf4Q8VI88 Tinagl1-202ENSMUST00000105998 1976 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC17.82■□□□□ 0.44
Odf4Q8VI88 Pou2f2-206ENSMUST00000108418 1934 ntTSL 1 (best) BASIC17.82■□□□□ 0.44
Odf4Q8VI88 Prr7-201ENSMUST00000046533 1359 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.82■□□□□ 0.44
Odf4Q8VI88 Dll3-201ENSMUST00000108315 2618 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.82■□□□□ 0.44
Odf4Q8VI88 Ssbp1-203ENSMUST00000117411 933 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.82■□□□□ 0.44
Odf4Q8VI88 8430432A02Rik-201ENSMUST00000039080 1248 ntBASIC17.82■□□□□ 0.44
Odf4Q8VI88 Lsr-205ENSMUST00000205961 2021 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.82■□□□□ 0.44
Odf4Q8VI88 Pkm-201ENSMUST00000034834 2432 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.82■□□□□ 0.44
Odf4Q8VI88 Mettl9-201ENSMUST00000033163 1823 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.82■□□□□ 0.44
Odf4Q8VI88 Amn-201ENSMUST00000021707 1701 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.81■□□□□ 0.44
Odf4Q8VI88 Galr2-201ENSMUST00000055872 1940 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.81■□□□□ 0.44
Odf4Q8VI88 Gm17324-201ENSMUST00000165499 922 ntAPPRIS P1 BASIC17.81■□□□□ 0.44
Odf4Q8VI88 A730098A19Rik-201ENSMUST00000188193 978 ntTSL 1 (best) BASIC17.81■□□□□ 0.44
Odf4Q8VI88 Cltb-202ENSMUST00000091609 2186 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.81■□□□□ 0.44
Odf4Q8VI88 Celf6-201ENSMUST00000034840 2765 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC17.81■□□□□ 0.44
Odf4Q8VI88 Tmem45b-201ENSMUST00000048050 1799 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.81■□□□□ 0.44
Odf4Q8VI88 Gprc5b-204ENSMUST00000208394 1416 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.81■□□□□ 0.44
Odf4Q8VI88 Tmem132b-201ENSMUST00000031446 7995 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.8■□□□□ 0.44
Odf4Q8VI88 Ikbip-202ENSMUST00000020150 1328 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.8■□□□□ 0.44
Odf4Q8VI88 Gm10620-201ENSMUST00000098379 1332 ntBASIC17.8■□□□□ 0.44
Odf4Q8VI88 E530011L22Rik-202ENSMUST00000216791 2007 ntTSL 1 (best) BASIC17.8■□□□□ 0.44
Odf4Q8VI88 Snx5-202ENSMUST00000110030 2512 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.8■□□□□ 0.44
Odf4Q8VI88 Gm9780-202ENSMUST00000184915 1394 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.79■□□□□ 0.44
Odf4Q8VI88 Letm2-209ENSMUST00000210810 1538 ntTSL 1 (best) BASIC17.79■□□□□ 0.44
Odf4Q8VI88 Dctn3-203ENSMUST00000171641 885 ntTSL 3 BASIC17.79■□□□□ 0.44
Odf4Q8VI88 Trir-201ENSMUST00000047281 902 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.79■□□□□ 0.44
Odf4Q8VI88 Spg7-209ENSMUST00000149248 2896 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC17.79■□□□□ 0.44
Odf4Q8VI88 Cpeb3-202ENSMUST00000123727 2411 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.79■□□□□ 0.44
Odf4Q8VI88 Mum1-201ENSMUST00000020365 2640 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.79■□□□□ 0.44
Odf4Q8VI88 Fndc4-201ENSMUST00000041266 1375 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.79■□□□□ 0.44
Odf4Q8VI88 Snapin-203ENSMUST00000149884 1928 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.78■□□□□ 0.44
Odf4Q8VI88 Ntsr2-201ENSMUST00000111064 1524 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.78■□□□□ 0.44
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 20.7 ms