Protein–RNA interactions for Protein: Q8VHJ7

Ppargc1b, Peroxisome proliferator-activated receptor gamma coactivator 1-beta, mousemouse

Predictions only

Length 1,014 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Ppargc1bQ8VHJ7 Rps24-207ENSMUST00000224568 714 ntBASIC29.17■■■□□ 2.26
Ppargc1bQ8VHJ7 mt-Rnr1-201ENSMUST00000082388 955 ntBASIC29.17■■■□□ 2.26
Ppargc1bQ8VHJ7 Faap24-201ENSMUST00000032704 1857 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.17■■■□□ 2.26
Ppargc1bQ8VHJ7 Aars-201ENSMUST00000034441 5750 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.16■■■□□ 2.26
Ppargc1bQ8VHJ7 1110032F04Rik-201ENSMUST00000054551 2578 ntAPPRIS P1 BASIC29.16■■■□□ 2.26
Ppargc1bQ8VHJ7 Vamp4-204ENSMUST00000135241 1461 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.16■■■□□ 2.26
Ppargc1bQ8VHJ7 Slc26a10-201ENSMUST00000095270 2215 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC29.16■■■□□ 2.26
Ppargc1bQ8VHJ7 Ahcyl1-201ENSMUST00000029490 3863 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.16■■■□□ 2.26
Ppargc1bQ8VHJ7 Barhl1-203ENSMUST00000113849 2102 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.15■■■□□ 2.26
Ppargc1bQ8VHJ7 Grsf1-201ENSMUST00000078945 2538 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.15■■■□□ 2.26
Ppargc1bQ8VHJ7 4930426I24Rik-202ENSMUST00000217797 1232 ntBASIC29.15■■■□□ 2.26
Ppargc1bQ8VHJ7 Gtpbp2-217ENSMUST00000172170 2587 ntTSL 5 BASIC29.15■■■□□ 2.26
Ppargc1bQ8VHJ7 Cln5-201ENSMUST00000022721 2445 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.15■■■□□ 2.26
Ppargc1bQ8VHJ7 Zc3h8-201ENSMUST00000028866 1624 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.15■■■□□ 2.26
Ppargc1bQ8VHJ7 Dirc2-201ENSMUST00000023554 5395 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.15■■■□□ 2.26
Ppargc1bQ8VHJ7 Sept5-201ENSMUST00000096987 2127 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.15■■■□□ 2.26
Ppargc1bQ8VHJ7 Becn1-217ENSMUST00000172233 1493 ntTSL 5 BASIC29.15■■■□□ 2.26
Ppargc1bQ8VHJ7 Adrb1-201ENSMUST00000038949 2491 ntAPPRIS P1 BASIC29.15■■■□□ 2.26
Ppargc1bQ8VHJ7 Gab2-202ENSMUST00000206791 2065 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC29.14■■■□□ 2.26
Ppargc1bQ8VHJ7 Nup153-201ENSMUST00000021803 6109 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.14■■■□□ 2.26
Ppargc1bQ8VHJ7 Zfp653-202ENSMUST00000179605 1888 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC29.14■■■□□ 2.26
Ppargc1bQ8VHJ7 Gdf11-201ENSMUST00000026408 4062 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.14■■■□□ 2.25
Ppargc1bQ8VHJ7 H2-Q2-201ENSMUST00000074806 1262 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.13■■■□□ 2.25
Ppargc1bQ8VHJ7 Sephs2-201ENSMUST00000082428 2177 ntAPPRIS P1 BASIC29.13■■■□□ 2.25
Ppargc1bQ8VHJ7 Rp2-203ENSMUST00000115391 1398 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.13■■■□□ 2.25
Ppargc1bQ8VHJ7 Hck-202ENSMUST00000109799 2092 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC29.13■■■□□ 2.25
Ppargc1bQ8VHJ7 Hck-203ENSMUST00000189688 2090 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC29.13■■■□□ 2.25
Ppargc1bQ8VHJ7 Hck-201ENSMUST00000003370 2092 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC29.13■■■□□ 2.25
Ppargc1bQ8VHJ7 Cbfb-201ENSMUST00000052209 2883 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC29.12■■■□□ 2.25
Ppargc1bQ8VHJ7 Fbxo24-201ENSMUST00000031732 2161 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.12■■■□□ 2.25
Ppargc1bQ8VHJ7 Gm44949-201ENSMUST00000206423 1450 ntBASIC29.12■■■□□ 2.25
Ppargc1bQ8VHJ7 Gm46212-201ENSMUST00000220256 1003 ntTSL 5 BASIC29.12■■■□□ 2.25
Ppargc1bQ8VHJ7 Snx21-204ENSMUST00000172577 1825 ntTSL 2 BASIC29.12■■■□□ 2.25
Ppargc1bQ8VHJ7 Mapk11-201ENSMUST00000088823 2440 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.12■■■□□ 2.25
Ppargc1bQ8VHJ7 Mmp24-201ENSMUST00000029141 4306 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.12■■■□□ 2.25
Ppargc1bQ8VHJ7 Pnrc1-201ENSMUST00000049357 1648 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.12■■■□□ 2.25
Ppargc1bQ8VHJ7 3110053B16Rik-202ENSMUST00000140360 2004 ntTSL 1 (best) BASIC29.11■■■□□ 2.25
Ppargc1bQ8VHJ7 Cnp-201ENSMUST00000103120 2357 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.11■■■□□ 2.25
Ppargc1bQ8VHJ7 Nr2f1-201ENSMUST00000091458 3207 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.11■■■□□ 2.25
Ppargc1bQ8VHJ7 Ankrd40-203ENSMUST00000107818 3487 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC29.11■■■□□ 2.25
Ppargc1bQ8VHJ7 Ctdsp1-201ENSMUST00000027367 2876 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.11■■■□□ 2.25
Ppargc1bQ8VHJ7 Trak1-208ENSMUST00000210636 2197 ntTSL 1 (best) BASIC29.11■■■□□ 2.25
Ppargc1bQ8VHJ7 Klhdc10-202ENSMUST00000068259 5901 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.1■■■□□ 2.25
Ppargc1bQ8VHJ7 Slc9a7-201ENSMUST00000072451 2512 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC29.1■■■□□ 2.25
Ppargc1bQ8VHJ7 Gm11837-201ENSMUST00000136992 876 ntTSL 2 BASIC29.1■■■□□ 2.25
Ppargc1bQ8VHJ7 Mt2-201ENSMUST00000034214 511 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.1■■■□□ 2.25
Ppargc1bQ8VHJ7 Kremen2-201ENSMUST00000046525 2123 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.1■■■□□ 2.25
Ppargc1bQ8VHJ7 Srm-201ENSMUST00000006611 1338 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.1■■■□□ 2.25
Ppargc1bQ8VHJ7 Fance-202ENSMUST00000114801 1751 ntTSL 1 (best) BASIC29.1■■■□□ 2.25
Ppargc1bQ8VHJ7 Hras-207ENSMUST00000168550 2272 ntTSL 5 BASIC29.1■■■□□ 2.25
Ppargc1bQ8VHJ7 Cacna2d2-205ENSMUST00000168532 5807 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC29.1■■■□□ 2.25
Ppargc1bQ8VHJ7 Ccr10-201ENSMUST00000062759 1726 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.09■■■□□ 2.25
Ppargc1bQ8VHJ7 Magi2-202ENSMUST00000101558 6530 ntTSL 1 (best) BASIC29.09■■■□□ 2.25
Ppargc1bQ8VHJ7 Fam207a-201ENSMUST00000045454 2394 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.09■■■□□ 2.25
Ppargc1bQ8VHJ7 Sec61a2-201ENSMUST00000026926 756 ntTSL 5 BASIC29.09■■■□□ 2.25
Ppargc1bQ8VHJ7 D030062O11Rik-201ENSMUST00000192660 2806 ntBASIC29.09■■■□□ 2.25
Ppargc1bQ8VHJ7 Rims1-209ENSMUST00000218140 1434 ntTSL 5 BASIC29.09■■■□□ 2.25
Ppargc1bQ8VHJ7 Vgf-202ENSMUST00000186451 2277 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC29.09■■■□□ 2.25
Ppargc1bQ8VHJ7 Fbxw2-202ENSMUST00000091020 1838 ntTSL 1 (best) BASIC29.08■■■□□ 2.25
Ppargc1bQ8VHJ7 Camk2b-201ENSMUST00000002817 1872 ntTSL 5 BASIC29.08■■■□□ 2.25
Ppargc1bQ8VHJ7 Cnpy3-201ENSMUST00000059844 1908 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.08■■■□□ 2.25
Ppargc1bQ8VHJ7 Gm7417-201ENSMUST00000192950 473 ntBASIC29.08■■■□□ 2.25
Ppargc1bQ8VHJ7 Ptms-201ENSMUST00000032216 1149 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.08■■■□□ 2.25
Ppargc1bQ8VHJ7 Cdc42ep5-201ENSMUST00000076831 1025 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.08■■■□□ 2.25
Ppargc1bQ8VHJ7 Scand1-201ENSMUST00000079125 759 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.08■■■□□ 2.25
Ppargc1bQ8VHJ7 Qtrt1-201ENSMUST00000002902 1316 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.08■■■□□ 2.25
Ppargc1bQ8VHJ7 Kazald1-202ENSMUST00000111948 1625 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.08■■■□□ 2.25
Ppargc1bQ8VHJ7 Socs2-214ENSMUST00000172070 2153 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC29.08■■■□□ 2.25
Ppargc1bQ8VHJ7 L3mbtl4-201ENSMUST00000093007 2445 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC29.08■■■□□ 2.25
Ppargc1bQ8VHJ7 Neo1-202ENSMUST00000214547 5414 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC29.07■■■□□ 2.24
Ppargc1bQ8VHJ7 Ezh2-201ENSMUST00000081721 2787 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC29.07■■■□□ 2.24
Ppargc1bQ8VHJ7 Tcf7l1-201ENSMUST00000069536 3042 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC29.07■■■□□ 2.24
Ppargc1bQ8VHJ7 Clta-204ENSMUST00000107849 1099 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC29.07■■■□□ 2.24
Ppargc1bQ8VHJ7 Ncoa7-206ENSMUST00000215725 1445 ntTSL 1 (best) BASIC29.07■■■□□ 2.24
Ppargc1bQ8VHJ7 Tpst2-201ENSMUST00000031287 1835 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.07■■■□□ 2.24
Ppargc1bQ8VHJ7 Msl3l2-201ENSMUST00000063138 2140 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.07■■■□□ 2.24
Ppargc1bQ8VHJ7 Hp1bp3-205ENSMUST00000105827 5155 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC29.07■■■□□ 2.24
Ppargc1bQ8VHJ7 Ccdc149-202ENSMUST00000198008 2470 ntTSL 5 BASIC29.06■■■□□ 2.24
Ppargc1bQ8VHJ7 Trim47-201ENSMUST00000021120 2204 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC29.06■■■□□ 2.24
Ppargc1bQ8VHJ7 Ubtd1-201ENSMUST00000026170 1527 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.06■■■□□ 2.24
Ppargc1bQ8VHJ7 Tmed10-201ENSMUST00000040766 1482 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.06■■■□□ 2.24
Ppargc1bQ8VHJ7 Kiss1-203ENSMUST00000193888 624 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC29.06■■■□□ 2.24
Ppargc1bQ8VHJ7 Alyref2-201ENSMUST00000081527 1273 ntAPPRIS P1 BASIC29.06■■■□□ 2.24
Ppargc1bQ8VHJ7 Thap11-201ENSMUST00000040445 1819 ntAPPRIS P1 BASIC29.06■■■□□ 2.24
Ppargc1bQ8VHJ7 Triobp-202ENSMUST00000109688 2553 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC29.05■■■□□ 2.24
Ppargc1bQ8VHJ7 Gm10685-201ENSMUST00000196120 433 ntTSL 3 BASIC29.05■■■□□ 2.24
Ppargc1bQ8VHJ7 Bcl3-201ENSMUST00000120537 1850 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.05■■■□□ 2.24
Ppargc1bQ8VHJ7 Slc30a1-201ENSMUST00000044954 5244 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.05■■■□□ 2.24
Ppargc1bQ8VHJ7 Maz-203ENSMUST00000205568 2650 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC29.05■■■□□ 2.24
Ppargc1bQ8VHJ7 Krt79-201ENSMUST00000023799 2097 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.05■■■□□ 2.24
Ppargc1bQ8VHJ7 4930507D05Rik-201ENSMUST00000181110 1834 ntAPPRIS P1 BASIC29.04■■■□□ 2.24
Ppargc1bQ8VHJ7 Ubxn2a-203ENSMUST00000142867 2146 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.04■■■□□ 2.24
Ppargc1bQ8VHJ7 Rgs10-205ENSMUST00000145739 564 ntTSL 1 (best) BASIC29.04■■■□□ 2.24
Ppargc1bQ8VHJ7 Crlf3-203ENSMUST00000103233 2230 ntTSL 1 (best) BASIC29.04■■■□□ 2.24
Ppargc1bQ8VHJ7 Pkm-201ENSMUST00000034834 2432 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC29.03■■■□□ 2.24
Ppargc1bQ8VHJ7 Ets1-202ENSMUST00000050797 1976 ntTSL 1 (best) BASIC29.03■■■□□ 2.24
Ppargc1bQ8VHJ7 E130311K13Rik-201ENSMUST00000061706 1640 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.03■■■□□ 2.24
Ppargc1bQ8VHJ7 Tcte2-201ENSMUST00000053376 1105 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC29.03■■■□□ 2.24
Ppargc1bQ8VHJ7 Gjc2-202ENSMUST00000108793 2187 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.03■■■□□ 2.24
Ppargc1bQ8VHJ7 Rasl11b-201ENSMUST00000051937 1812 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.03■■■□□ 2.24
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 87.3 ms