Protein–RNA interactions for Protein: Q8VHH5

Agap3, Arf-GAP with GTPase, ANK repeat and PH domain-containing protein 3, mousemouse

Predictions only

Length 910 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Agap3Q8VHH5 Chkb-201ENSMUST00000023289 1707 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.64■□□□□ 0.9
Agap3Q8VHH5 Ppp2r5a-201ENSMUST00000067976 3088 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.64■□□□□ 0.89
Agap3Q8VHH5 Sumf1-203ENSMUST00000167338 1044 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC20.64■□□□□ 0.89
Agap3Q8VHH5 1700020G03Rik-201ENSMUST00000211264 889 ntBASIC20.64■□□□□ 0.89
Agap3Q8VHH5 Smad6-201ENSMUST00000041029 2971 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.64■□□□□ 0.89
Agap3Q8VHH5 Elf2-212ENSMUST00000194641 5919 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC20.64■□□□□ 0.89
Agap3Q8VHH5 Fam91a1-201ENSMUST00000037270 5560 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.64■□□□□ 0.89
Agap3Q8VHH5 Lsm14a-201ENSMUST00000085585 2944 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.64■□□□□ 0.89
Agap3Q8VHH5 Crlf3-203ENSMUST00000103233 2230 ntTSL 1 (best) BASIC20.63■□□□□ 0.89
Agap3Q8VHH5 Aktip-202ENSMUST00000120213 2200 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.63■□□□□ 0.89
Agap3Q8VHH5 Olig1-201ENSMUST00000056882 2162 ntAPPRIS P1 BASIC20.63■□□□□ 0.89
Agap3Q8VHH5 Hmg20b-202ENSMUST00000105323 1463 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.63■□□□□ 0.89
Agap3Q8VHH5 Rfx8-202ENSMUST00000151913 2008 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.63■□□□□ 0.89
Agap3Q8VHH5 Cacna2d2-201ENSMUST00000010210 5783 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.63■□□□□ 0.89
Agap3Q8VHH5 Fndc4-201ENSMUST00000041266 1375 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.63■□□□□ 0.89
Agap3Q8VHH5 Ssbp1-205ENSMUST00000121360 1188 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.63■□□□□ 0.89
Agap3Q8VHH5 Pgls-205ENSMUST00000143441 1062 ntTSL 3 BASIC20.63■□□□□ 0.89
Agap3Q8VHH5 Snrpa1-206ENSMUST00000153609 1248 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.63■□□□□ 0.89
Agap3Q8VHH5 Gm7417-201ENSMUST00000192950 473 ntBASIC20.63■□□□□ 0.89
Agap3Q8VHH5 Gm2464-202ENSMUST00000194841 877 ntTSL 1 (best) BASIC20.63■□□□□ 0.89
Agap3Q8VHH5 Plekhj1-201ENSMUST00000036805 1260 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.63■□□□□ 0.89
Agap3Q8VHH5 Prkar2b-201ENSMUST00000003079 1657 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.63■□□□□ 0.89
Agap3Q8VHH5 Utp11-201ENSMUST00000030738 1603 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.63■□□□□ 0.89
Agap3Q8VHH5 Vamp4-204ENSMUST00000135241 1461 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.62■□□□□ 0.89
Agap3Q8VHH5 Meg3-207ENSMUST00000143836 1896 ntTSL 1 (best) BASIC20.62■□□□□ 0.89
Agap3Q8VHH5 Serpinh1-202ENSMUST00000169437 2274 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.62■□□□□ 0.89
Agap3Q8VHH5 Tpst2-201ENSMUST00000031287 1835 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.62■□□□□ 0.89
Agap3Q8VHH5 Rp2-203ENSMUST00000115391 1398 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.62■□□□□ 0.89
Agap3Q8VHH5 Mmp24-201ENSMUST00000029141 4306 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.62■□□□□ 0.89
Agap3Q8VHH5 Tsc22d1-203ENSMUST00000101618 1043 ntTSL 1 (best) BASIC20.62■□□□□ 0.89
Agap3Q8VHH5 Gm9959-201ENSMUST00000068277 390 ntBASIC20.62■□□□□ 0.89
Agap3Q8VHH5 Zbtb4-203ENSMUST00000108640 4067 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.62■□□□□ 0.89
Agap3Q8VHH5 Kcnk15-202ENSMUST00000109396 1921 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.62■□□□□ 0.89
Agap3Q8VHH5 Celf6-201ENSMUST00000034840 2765 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC20.62■□□□□ 0.89
Agap3Q8VHH5 Uqcrfs1-201ENSMUST00000042834 1363 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.61■□□□□ 0.89
Agap3Q8VHH5 Rexo5-201ENSMUST00000033218 1966 ntTSL 1 (best) BASIC20.61■□□□□ 0.89
Agap3Q8VHH5 Bcl10-201ENSMUST00000029842 1949 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.61■□□□□ 0.89
Agap3Q8VHH5 Socs2-202ENSMUST00000119917 948 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.61■□□□□ 0.89
Agap3Q8VHH5 AC164424.2-201ENSMUST00000223281 725 ntTSL 3 BASIC20.61■□□□□ 0.89
Agap3Q8VHH5 Bfsp1-201ENSMUST00000028907 2372 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC20.61■□□□□ 0.89
Agap3Q8VHH5 5031439G07Rik-201ENSMUST00000047144 6845 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.61■□□□□ 0.89
Agap3Q8VHH5 Kdm3b-201ENSMUST00000043775 6363 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.61■□□□□ 0.89
Agap3Q8VHH5 Dusp26-201ENSMUST00000036631 1938 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.61■□□□□ 0.89
Agap3Q8VHH5 Kmt2b-202ENSMUST00000108154 8454 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC20.6■□□□□ 0.89
Agap3Q8VHH5 Tcte2-201ENSMUST00000053376 1105 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.6■□□□□ 0.89
Agap3Q8VHH5 Ache-209ENSMUST00000196208 1911 ntTSL 5 BASIC20.6■□□□□ 0.89
Agap3Q8VHH5 Eif2ak4-207ENSMUST00000110877 2134 ntTSL 1 (best) BASIC20.6■□□□□ 0.89
Agap3Q8VHH5 Gbx2-201ENSMUST00000036954 2135 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.6■□□□□ 0.89
Agap3Q8VHH5 Gm9780-202ENSMUST00000184915 1394 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.59■□□□□ 0.89
Agap3Q8VHH5 Trp73os-201ENSMUST00000143429 2192 ntTSL 1 (best) BASIC20.59■□□□□ 0.89
Agap3Q8VHH5 Smarcad1-201ENSMUST00000031984 5168 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.59■□□□□ 0.89
Agap3Q8VHH5 Ctdsp1-201ENSMUST00000027367 2876 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.59■□□□□ 0.89
Agap3Q8VHH5 Serbp1-207ENSMUST00000203436 1667 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.59■□□□□ 0.89
Agap3Q8VHH5 Socs1-201ENSMUST00000038099 1220 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.59■□□□□ 0.89
Agap3Q8VHH5 Efr3a-203ENSMUST00000172756 1411 ntTSL 1 (best) BASIC20.59■□□□□ 0.89
Agap3Q8VHH5 Gm572-201ENSMUST00000105698 1385 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC20.59■□□□□ 0.89
Agap3Q8VHH5 Eml2-202ENSMUST00000117338 2765 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC20.58■□□□□ 0.89
Agap3Q8VHH5 Qtrt1-201ENSMUST00000002902 1316 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.58■□□□□ 0.89
Agap3Q8VHH5 Cdkl3-202ENSMUST00000063321 2008 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.58■□□□□ 0.89
Agap3Q8VHH5 Rgs10-205ENSMUST00000145739 564 ntTSL 1 (best) BASIC20.58■□□□□ 0.89
Agap3Q8VHH5 Casd1-204ENSMUST00000181734 1063 ntTSL 5 BASIC20.58■□□□□ 0.89
Agap3Q8VHH5 Dda1-202ENSMUST00000124745 1933 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.58■□□□□ 0.88
Agap3Q8VHH5 Rapgefl1-202ENSMUST00000107479 4855 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC20.58■□□□□ 0.88
Agap3Q8VHH5 Nab2-201ENSMUST00000026469 2582 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.57■□□□□ 0.88
Agap3Q8VHH5 Ntn5-202ENSMUST00000182750 1758 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.57■□□□□ 0.88
Agap3Q8VHH5 Suz12-201ENSMUST00000017692 4373 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC20.57■□□□□ 0.88
Agap3Q8VHH5 Selenoo-201ENSMUST00000082439 2383 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.57■□□□□ 0.88
Agap3Q8VHH5 Hist2h2ab-201ENSMUST00000073115 444 ntAPPRIS P1 BASIC20.57■□□□□ 0.88
Agap3Q8VHH5 Sox12-202ENSMUST00000182625 4453 ntAPPRIS P1 BASIC20.57■□□□□ 0.88
Agap3Q8VHH5 Nipsnap2-201ENSMUST00000086046 2112 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.57■□□□□ 0.88
Agap3Q8VHH5 Inpp5a-203ENSMUST00000106098 2826 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.57■□□□□ 0.88
Agap3Q8VHH5 Gramd1a-202ENSMUST00000085636 2543 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC20.57■□□□□ 0.88
Agap3Q8VHH5 Zc3h8-201ENSMUST00000028866 1624 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.56■□□□□ 0.88
Agap3Q8VHH5 Fezf2-201ENSMUST00000022262 2188 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.56■□□□□ 0.88
Agap3Q8VHH5 Wrap73-201ENSMUST00000030895 1598 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.56■□□□□ 0.88
Agap3Q8VHH5 Hrh3-203ENSMUST00000164442 1242 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC20.56■□□□□ 0.88
Agap3Q8VHH5 Gm10685-201ENSMUST00000196120 433 ntTSL 3 BASIC20.56■□□□□ 0.88
Agap3Q8VHH5 Mt2-201ENSMUST00000034214 511 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.56■□□□□ 0.88
Agap3Q8VHH5 Ccng2-201ENSMUST00000031331 2810 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.56■□□□□ 0.88
Agap3Q8VHH5 Tead1-204ENSMUST00000106638 3047 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC20.56■□□□□ 0.88
Agap3Q8VHH5 N4bp1-201ENSMUST00000034074 6469 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.56■□□□□ 0.88
Agap3Q8VHH5 Celf6-202ENSMUST00000118164 1583 ntTSL 1 (best) BASIC20.55■□□□□ 0.88
Agap3Q8VHH5 Timm8a1-201ENSMUST00000054213 1421 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.55■□□□□ 0.88
Agap3Q8VHH5 Cotl1-202ENSMUST00000168698 1520 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.55■□□□□ 0.88
Agap3Q8VHH5 Gm15039-201ENSMUST00000118914 875 ntBASIC20.55■□□□□ 0.88
Agap3Q8VHH5 Gm7143-201ENSMUST00000222811 859 ntBASIC20.55■□□□□ 0.88
Agap3Q8VHH5 Ccdc74a-201ENSMUST00000056962 1273 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC20.55■□□□□ 0.88
Agap3Q8VHH5 Cav2-201ENSMUST00000000058 2733 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.55■□□□□ 0.88
Agap3Q8VHH5 E130311K13Rik-201ENSMUST00000061706 1640 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.55■□□□□ 0.88
Agap3Q8VHH5 Pth1r-201ENSMUST00000006005 2307 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.55■□□□□ 0.88
Agap3Q8VHH5 Bcas2-201ENSMUST00000005830 1467 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.55■□□□□ 0.88
Agap3Q8VHH5 Setd4-202ENSMUST00000113951 1826 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC20.55■□□□□ 0.88
Agap3Q8VHH5 Hfe2-201ENSMUST00000049208 2028 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.54■□□□□ 0.88
Agap3Q8VHH5 Stk3-202ENSMUST00000067033 2471 ntTSL 1 (best) BASIC20.54■□□□□ 0.88
Agap3Q8VHH5 Slc35f3-201ENSMUST00000108759 2309 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.54■□□□□ 0.88
Agap3Q8VHH5 Slc30a4-201ENSMUST00000005952 5458 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.54■□□□□ 0.88
Agap3Q8VHH5 Rnaset2b-201ENSMUST00000089119 1013 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.54■□□□□ 0.88
Agap3Q8VHH5 Pds5a-209ENSMUST00000201948 8934 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC20.54■□□□□ 0.88
Agap3Q8VHH5 Stau2-217ENSMUST00000162751 3030 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.53■□□□□ 0.88
Agap3Q8VHH5 Akt1s1-204ENSMUST00000107885 1812 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.53■□□□□ 0.88
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 17.8 ms