Protein–RNA interactions for Protein: Q8VHC3

Selenom, Selenoprotein M, mousemouse

Predictions only

Length 145 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
SelenomQ8VHC3 Gm43573-201ENSMUST00000196445 570 ntTSL 5 BASIC19.03■□□□□ 0.64
SelenomQ8VHC3 Btbd6-206ENSMUST00000222209 644 ntTSL 3 BASIC19.03■□□□□ 0.64
SelenomQ8VHC3 Serbp1-207ENSMUST00000203436 1667 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC19.03■□□□□ 0.64
SelenomQ8VHC3 Prr7-201ENSMUST00000046533 1359 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.03■□□□□ 0.64
SelenomQ8VHC3 Cradd-205ENSMUST00000220279 1613 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.03■□□□□ 0.64
SelenomQ8VHC3 Cnp-201ENSMUST00000103120 2357 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.03■□□□□ 0.64
SelenomQ8VHC3 Six3os1-206ENSMUST00000175921 2737 ntTSL 1 (best) BASIC19.02■□□□□ 0.64
SelenomQ8VHC3 Zbed3-202ENSMUST00000221807 1945 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.02■□□□□ 0.64
SelenomQ8VHC3 Fbxw8-201ENSMUST00000049474 5000 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.02■□□□□ 0.64
SelenomQ8VHC3 Btf3l4-203ENSMUST00000102741 1033 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.02■□□□□ 0.64
SelenomQ8VHC3 Zbtb7a-202ENSMUST00000117956 1863 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.02■□□□□ 0.64
SelenomQ8VHC3 Aktip-202ENSMUST00000120213 2200 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.02■□□□□ 0.64
SelenomQ8VHC3 Tsen54-201ENSMUST00000021134 1979 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC19.02■□□□□ 0.64
SelenomQ8VHC3 Scube1-202ENSMUST00000043634 5161 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC19.02■□□□□ 0.63
SelenomQ8VHC3 Dcbld1-201ENSMUST00000069004 3024 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.02■□□□□ 0.63
SelenomQ8VHC3 Ppm1b-201ENSMUST00000080217 2753 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC19.02■□□□□ 0.63
SelenomQ8VHC3 Gm15441-202ENSMUST00000107095 1653 ntTSL 1 (best) BASIC19.01■□□□□ 0.63
SelenomQ8VHC3 C1qtnf5-203ENSMUST00000114818 1337 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC19.01■□□□□ 0.63
SelenomQ8VHC3 Tex264-202ENSMUST00000163441 1896 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.01■□□□□ 0.63
SelenomQ8VHC3 Ccdc34-201ENSMUST00000028580 2070 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.01■□□□□ 0.63
SelenomQ8VHC3 Pelo-201ENSMUST00000109226 1600 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.01■□□□□ 0.63
SelenomQ8VHC3 Utp11-201ENSMUST00000030738 1603 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.01■□□□□ 0.63
SelenomQ8VHC3 Hoxd3-201ENSMUST00000047830 2292 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC19.01■□□□□ 0.63
SelenomQ8VHC3 Wipi1-203ENSMUST00000106689 1220 ntTSL 1 (best) BASIC19.01■□□□□ 0.63
SelenomQ8VHC3 Ccng2-201ENSMUST00000031331 2810 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.01■□□□□ 0.63
SelenomQ8VHC3 Nectin1-201ENSMUST00000034510 5653 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.01■□□□□ 0.63
SelenomQ8VHC3 Tmem74b-202ENSMUST00000109872 1399 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.01■□□□□ 0.63
SelenomQ8VHC3 Gab1-201ENSMUST00000034150 4870 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.01■□□□□ 0.63
SelenomQ8VHC3 Fam105a-201ENSMUST00000100739 2867 ntTSL 1 (best) BASIC19.01■□□□□ 0.63
SelenomQ8VHC3 Hoxb6-202ENSMUST00000173432 1964 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC19.01■□□□□ 0.63
SelenomQ8VHC3 Ube2k-204ENSMUST00000201292 1529 ntTSL 1 (best) BASIC19■□□□□ 0.63
SelenomQ8VHC3 Klf1-201ENSMUST00000067060 1530 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19■□□□□ 0.63
SelenomQ8VHC3 Plppr3-201ENSMUST00000092325 2766 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC19■□□□□ 0.63
SelenomQ8VHC3 Dedd-203ENSMUST00000111299 2322 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19■□□□□ 0.63
SelenomQ8VHC3 Gm5067-201ENSMUST00000170449 1009 ntBASIC19■□□□□ 0.63
SelenomQ8VHC3 Vegfb-201ENSMUST00000025914 1281 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC19■□□□□ 0.63
SelenomQ8VHC3 Fbxo4-201ENSMUST00000022791 1565 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19■□□□□ 0.63
SelenomQ8VHC3 Tmem120a-201ENSMUST00000043378 1559 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19■□□□□ 0.63
SelenomQ8VHC3 Porcn-203ENSMUST00000089402 1839 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC19■□□□□ 0.63
SelenomQ8VHC3 Slc35a3-201ENSMUST00000029569 5725 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.99■□□□□ 0.63
SelenomQ8VHC3 Maf-202ENSMUST00000109104 6360 ntAPPRIS P2 BASIC18.99■□□□□ 0.63
SelenomQ8VHC3 Tram1-201ENSMUST00000027068 2938 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.99■□□□□ 0.63
SelenomQ8VHC3 Tedc1-201ENSMUST00000049271 2441 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.99■□□□□ 0.63
SelenomQ8VHC3 Sh3bp1-204ENSMUST00000109698 1923 ntTSL 1 (best) BASIC18.99■□□□□ 0.63
SelenomQ8VHC3 Ercc6l2-208ENSMUST00000144763 1820 ntTSL 1 (best) BASIC18.99■□□□□ 0.63
SelenomQ8VHC3 Mmp24-201ENSMUST00000029141 4306 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.99■□□□□ 0.63
SelenomQ8VHC3 Tmem64-201ENSMUST00000062684 4670 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.99■□□□□ 0.63
SelenomQ8VHC3 Cbfb-204ENSMUST00000109395 2709 ntTSL 1 (best) BASIC18.99■□□□□ 0.63
SelenomQ8VHC3 Ptger3-202ENSMUST00000173533 2097 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.99■□□□□ 0.63
SelenomQ8VHC3 Rims1-209ENSMUST00000218140 1434 ntTSL 5 BASIC18.99■□□□□ 0.63
SelenomQ8VHC3 Camk2b-201ENSMUST00000002817 1872 ntTSL 5 BASIC18.99■□□□□ 0.63
SelenomQ8VHC3 Aplf-201ENSMUST00000032130 1889 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.99■□□□□ 0.63
SelenomQ8VHC3 Tal1-204ENSMUST00000162489 2894 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.99■□□□□ 0.63
SelenomQ8VHC3 Tspan17-201ENSMUST00000026993 1585 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC18.98■□□□□ 0.63
SelenomQ8VHC3 Pithd1-201ENSMUST00000105851 1700 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.98■□□□□ 0.63
SelenomQ8VHC3 Rps19-202ENSMUST00000108429 633 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC18.98■□□□□ 0.63
SelenomQ8VHC3 Lrfn4-202ENSMUST00000113822 2918 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.98■□□□□ 0.63
SelenomQ8VHC3 Klhl8-201ENSMUST00000031254 3193 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.98■□□□□ 0.63
SelenomQ8VHC3 Tatdn2-201ENSMUST00000089018 3096 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.98■□□□□ 0.63
SelenomQ8VHC3 Mex3d-201ENSMUST00000105350 3266 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.98■□□□□ 0.63
SelenomQ8VHC3 Rab5c-201ENSMUST00000019317 1967 ntTSL 1 (best) BASIC18.97■□□□□ 0.63
SelenomQ8VHC3 Fn1-208ENSMUST00000186940 1350 ntTSL 1 (best) BASIC18.97■□□□□ 0.63
SelenomQ8VHC3 Gm37035-201ENSMUST00000194809 2148 ntBASIC18.97■□□□□ 0.63
SelenomQ8VHC3 Fndc4-201ENSMUST00000041266 1375 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.97■□□□□ 0.63
SelenomQ8VHC3 Smim10l2a-201ENSMUST00000068106 2393 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.97■□□□□ 0.63
SelenomQ8VHC3 Erf-202ENSMUST00000116343 690 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC18.97■□□□□ 0.63
SelenomQ8VHC3 Zfp346-203ENSMUST00000159278 1253 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC18.97■□□□□ 0.63
SelenomQ8VHC3 Cox4i1-205ENSMUST00000181586 765 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.97■□□□□ 0.63
SelenomQ8VHC3 Azi2-205ENSMUST00000133580 2156 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.97■□□□□ 0.63
SelenomQ8VHC3 Atmin-201ENSMUST00000109099 4877 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.97■□□□□ 0.63
SelenomQ8VHC3 Cdk8-201ENSMUST00000031640 2973 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC18.97■□□□□ 0.63
SelenomQ8VHC3 Kcnip2-209ENSMUST00000162528 2395 ntTSL 1 (best) BASIC18.97■□□□□ 0.63
SelenomQ8VHC3 Cd37-204ENSMUST00000209779 2541 ntTSL 1 (best) BASIC18.97■□□□□ 0.63
SelenomQ8VHC3 Gm29430-202ENSMUST00000191453 2015 ntTSL 5 BASIC18.96■□□□□ 0.63
SelenomQ8VHC3 Tead1-204ENSMUST00000106638 3047 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC18.96■□□□□ 0.63
SelenomQ8VHC3 Adrb1-201ENSMUST00000038949 2491 ntAPPRIS P1 BASIC18.96■□□□□ 0.63
SelenomQ8VHC3 Igf2bp2-201ENSMUST00000100052 3899 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.96■□□□□ 0.63
SelenomQ8VHC3 Uqcrc1-201ENSMUST00000026743 1653 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.96■□□□□ 0.63
SelenomQ8VHC3 Setd4-202ENSMUST00000113951 1826 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.96■□□□□ 0.63
SelenomQ8VHC3 Lrrfip2-205ENSMUST00000196981 1839 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC18.96■□□□□ 0.63
SelenomQ8VHC3 Vegfb-202ENSMUST00000130048 1158 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.96■□□□□ 0.63
SelenomQ8VHC3 Ybx2-205ENSMUST00000149194 1235 ntTSL 5 BASIC18.96■□□□□ 0.63
SelenomQ8VHC3 4833418N17Rik-201ENSMUST00000064826 615 ntBASIC18.96■□□□□ 0.63
SelenomQ8VHC3 H2-Q2-201ENSMUST00000074806 1262 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.96■□□□□ 0.63
SelenomQ8VHC3 Ssbp4-201ENSMUST00000049908 1475 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.96■□□□□ 0.63
SelenomQ8VHC3 Exoc3l2-201ENSMUST00000011407 2200 ntTSL 5 BASIC18.96■□□□□ 0.63
SelenomQ8VHC3 Foxf1-201ENSMUST00000181504 2415 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.95■□□□□ 0.62
SelenomQ8VHC3 Adamts18-201ENSMUST00000093113 5642 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.95■□□□□ 0.62
SelenomQ8VHC3 Gm13448-201ENSMUST00000143469 1847 ntTSL 1 (best) BASIC18.95■□□□□ 0.62
SelenomQ8VHC3 Sys1-202ENSMUST00000109352 2001 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.95■□□□□ 0.62
SelenomQ8VHC3 Gm10653-201ENSMUST00000132250 1232 ntTSL 1 (best) BASIC18.95■□□□□ 0.62
SelenomQ8VHC3 Gm10653-203ENSMUST00000156423 1232 ntTSL 5 BASIC18.95■□□□□ 0.62
SelenomQ8VHC3 Tmem185a-201ENSMUST00000101506 2429 ntTSL 1 (best) BASIC18.95■□□□□ 0.62
SelenomQ8VHC3 Glp1r-201ENSMUST00000114574 1480 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.95■□□□□ 0.62
SelenomQ8VHC3 Csnk1a1-201ENSMUST00000115246 1484 ntTSL 5 BASIC18.95■□□□□ 0.62
SelenomQ8VHC3 2310022A10Rik-205ENSMUST00000187960 1989 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC18.95■□□□□ 0.62
SelenomQ8VHC3 Crhr1-201ENSMUST00000093925 2460 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.95■□□□□ 0.62
SelenomQ8VHC3 Csf2ra-201ENSMUST00000076046 1849 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.95■□□□□ 0.62
SelenomQ8VHC3 D030062O11Rik-201ENSMUST00000192660 2806 ntBASIC18.95■□□□□ 0.62
SelenomQ8VHC3 Fbxl6-201ENSMUST00000023219 1712 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.94■□□□□ 0.62
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 16.7 ms