Protein–RNA interactions for Protein: Q8VEM9

Klhdc3, Kelch domain-containing protein 3, mousemouse

Predictions only

Length 382 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Klhdc3Q8VEM9 Bcl2l10-201ENSMUST00000034709 1220 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.36■□□□□ 0.37
Klhdc3Q8VEM9 Spsb3-204ENSMUST00000119829 1955 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC17.36■□□□□ 0.37
Klhdc3Q8VEM9 Ubl3-202ENSMUST00000164904 2001 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.36■□□□□ 0.37
Klhdc3Q8VEM9 Lmo2-208ENSMUST00000170926 1529 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC17.36■□□□□ 0.37
Klhdc3Q8VEM9 Krt1-201ENSMUST00000023790 2445 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.36■□□□□ 0.37
Klhdc3Q8VEM9 Trp53rka-201ENSMUST00000039007 1880 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.35■□□□□ 0.37
Klhdc3Q8VEM9 Tinagl1-202ENSMUST00000105998 1976 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC17.35■□□□□ 0.37
Klhdc3Q8VEM9 Rhno1-203ENSMUST00000112152 2015 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.35■□□□□ 0.37
Klhdc3Q8VEM9 3110053B16Rik-202ENSMUST00000140360 2004 ntTSL 1 (best) BASIC17.35■□□□□ 0.37
Klhdc3Q8VEM9 Rfx8-202ENSMUST00000151913 2008 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.35■□□□□ 0.37
Klhdc3Q8VEM9 Ankrd33b-203ENSMUST00000110410 2070 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.35■□□□□ 0.37
Klhdc3Q8VEM9 Prkab1-201ENSMUST00000031486 2089 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.35■□□□□ 0.37
Klhdc3Q8VEM9 Gm9817-201ENSMUST00000054395 2531 ntAPPRIS P1 BASIC17.35■□□□□ 0.37
Klhdc3Q8VEM9 C1qtnf4-201ENSMUST00000111466 1290 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.35■□□□□ 0.37
Klhdc3Q8VEM9 Serbp1-212ENSMUST00000204294 717 ntTSL 5 BASIC17.35■□□□□ 0.37
Klhdc3Q8VEM9 AC166356.1-201ENSMUST00000228236 1426 ntBASIC17.35■□□□□ 0.37
Klhdc3Q8VEM9 Acot3-203ENSMUST00000223080 1545 ntTSL 1 (best) BASIC17.35■□□□□ 0.37
Klhdc3Q8VEM9 Faap24-201ENSMUST00000032704 1857 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.35■□□□□ 0.37
Klhdc3Q8VEM9 Whrn-204ENSMUST00000095037 2419 ntTSL 1 (best) BASIC17.35■□□□□ 0.37
Klhdc3Q8VEM9 2010300C02Rik-203ENSMUST00000162875 4634 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.34■□□□□ 0.37
Klhdc3Q8VEM9 Jagn1-201ENSMUST00000101070 1201 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.34■□□□□ 0.37
Klhdc3Q8VEM9 Fgfrl1-202ENSMUST00000112560 2318 ntTSL 1 (best) BASIC17.34■□□□□ 0.37
Klhdc3Q8VEM9 Gm8770-201ENSMUST00000121113 1109 ntBASIC17.34■□□□□ 0.37
Klhdc3Q8VEM9 Dda1-202ENSMUST00000124745 1933 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.34■□□□□ 0.37
Klhdc3Q8VEM9 6330403K07Rik-201ENSMUST00000156068 1494 ntTSL 1 (best) BASIC17.34■□□□□ 0.37
Klhdc3Q8VEM9 Mrpl16-201ENSMUST00000167199 1122 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.34■□□□□ 0.37
Klhdc3Q8VEM9 D630002J18Rik-201ENSMUST00000181854 1115 ntBASIC17.34■□□□□ 0.37
Klhdc3Q8VEM9 Cox5b-204ENSMUST00000193210 865 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.34■□□□□ 0.37
Klhdc3Q8VEM9 Hyi-205ENSMUST00000194248 936 ntTSL 1 (best) BASIC17.34■□□□□ 0.37
Klhdc3Q8VEM9 Rabgap1l-216ENSMUST00000195442 1877 ntTSL 1 (best) BASIC17.34■□□□□ 0.37
Klhdc3Q8VEM9 Slc9a3r2-201ENSMUST00000002572 2118 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.34■□□□□ 0.37
Klhdc3Q8VEM9 Pcgf6-201ENSMUST00000026032 2098 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.34■□□□□ 0.37
Klhdc3Q8VEM9 Snx5-201ENSMUST00000028909 2419 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.34■□□□□ 0.37
Klhdc3Q8VEM9 Polr1d-201ENSMUST00000050970 1196 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.34■□□□□ 0.37
Klhdc3Q8VEM9 Homer1-206ENSMUST00000109493 2580 ntTSL 5 BASIC17.34■□□□□ 0.37
Klhdc3Q8VEM9 Slc35b2-201ENSMUST00000041353 2326 ntTSL 1 (best) BASIC17.33■□□□□ 0.37
Klhdc3Q8VEM9 Trp73os-201ENSMUST00000143429 2192 ntTSL 1 (best) BASIC17.33■□□□□ 0.37
Klhdc3Q8VEM9 Pold2-201ENSMUST00000102922 1646 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.33■□□□□ 0.37
Klhdc3Q8VEM9 Ripply3-201ENSMUST00000023660 1531 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.33■□□□□ 0.37
Klhdc3Q8VEM9 Mapkapk3-208ENSMUST00000192054 944 ntTSL 1 (best) BASIC17.33■□□□□ 0.36
Klhdc3Q8VEM9 Kiss1-205ENSMUST00000195286 656 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.33■□□□□ 0.36
Klhdc3Q8VEM9 Zfp36l1-204ENSMUST00000219642 545 ntTSL 3 BASIC17.33■□□□□ 0.36
Klhdc3Q8VEM9 Pth1r-201ENSMUST00000006005 2307 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.33■□□□□ 0.36
Klhdc3Q8VEM9 Nipsnap2-201ENSMUST00000086046 2112 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.33■□□□□ 0.36
Klhdc3Q8VEM9 Rufy1-201ENSMUST00000020643 2688 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.33■□□□□ 0.36
Klhdc3Q8VEM9 Wnt11-205ENSMUST00000167303 1792 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.33■□□□□ 0.36
Klhdc3Q8VEM9 Gm5475-201ENSMUST00000132119 2608 ntAPPRIS P5 TSL 1 (best) BASIC17.33■□□□□ 0.36
Klhdc3Q8VEM9 Tmprss5-205ENSMUST00000170246 1491 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.32■□□□□ 0.36
Klhdc3Q8VEM9 Htra2-202ENSMUST00000113962 1305 ntTSL 5 BASIC17.32■□□□□ 0.36
Klhdc3Q8VEM9 3110082J24Rik-202ENSMUST00000199573 767 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.32■□□□□ 0.36
Klhdc3Q8VEM9 AC138214.1-201ENSMUST00000223838 420 ntAPPRIS P1 BASIC17.32■□□□□ 0.36
Klhdc3Q8VEM9 Proca1-201ENSMUST00000060539 960 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC17.32■□□□□ 0.36
Klhdc3Q8VEM9 Hccs-202ENSMUST00000112115 2473 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.32■□□□□ 0.36
Klhdc3Q8VEM9 AA543186-201ENSMUST00000180841 1696 ntTSL 1 (best) BASIC17.32■□□□□ 0.36
Klhdc3Q8VEM9 Cadps-203ENSMUST00000112658 5458 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.32■□□□□ 0.36
Klhdc3Q8VEM9 Ankrd33b-202ENSMUST00000076942 1641 ntTSL 1 (best) BASIC17.32■□□□□ 0.36
Klhdc3Q8VEM9 Cdkl3-202ENSMUST00000063321 2008 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.31■□□□□ 0.36
Klhdc3Q8VEM9 Ppm1b-201ENSMUST00000080217 2753 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.31■□□□□ 0.36
Klhdc3Q8VEM9 Foxo3-202ENSMUST00000105501 1316 ntTSL 1 (best) BASIC17.31■□□□□ 0.36
Klhdc3Q8VEM9 Ccdc85c-201ENSMUST00000136175 1302 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC17.31■□□□□ 0.36
Klhdc3Q8VEM9 Twist2-201ENSMUST00000007949 1329 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.31■□□□□ 0.36
Klhdc3Q8VEM9 B630019K06Rik-201ENSMUST00000064196 2583 ntAPPRIS P1 BASIC17.31■□□□□ 0.36
Klhdc3Q8VEM9 Tusc2-203ENSMUST00000193418 410 ntTSL 3 BASIC17.31■□□□□ 0.36
Klhdc3Q8VEM9 Spata33-201ENSMUST00000060133 491 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC17.31■□□□□ 0.36
Klhdc3Q8VEM9 Gramd1a-202ENSMUST00000085636 2543 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC17.31■□□□□ 0.36
Klhdc3Q8VEM9 Lsm14a-201ENSMUST00000085585 2944 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.31■□□□□ 0.36
Klhdc3Q8VEM9 Fezf2-203ENSMUST00000224714 2429 ntAPPRIS P1 BASIC17.31■□□□□ 0.36
Klhdc3Q8VEM9 Noc2l-201ENSMUST00000179543 2785 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC17.31■□□□□ 0.36
Klhdc3Q8VEM9 Celf6-201ENSMUST00000034840 2765 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC17.31■□□□□ 0.36
Klhdc3Q8VEM9 Gnb2-201ENSMUST00000031726 1860 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.31■□□□□ 0.36
Klhdc3Q8VEM9 Hoxd1-201ENSMUST00000047793 1862 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.31■□□□□ 0.36
Klhdc3Q8VEM9 Retreg2-201ENSMUST00000097694 2561 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.31■□□□□ 0.36
Klhdc3Q8VEM9 Trim3-203ENSMUST00000106791 2466 ntTSL 1 (best) BASIC17.3■□□□□ 0.36
Klhdc3Q8VEM9 Ctdsp1-201ENSMUST00000027367 2876 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.3■□□□□ 0.36
Klhdc3Q8VEM9 1700016H13Rik-205ENSMUST00000134926 1104 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.3■□□□□ 0.36
Klhdc3Q8VEM9 Fuz-214ENSMUST00000209132 853 ntTSL 1 (best) BASIC17.3■□□□□ 0.36
Klhdc3Q8VEM9 Crtc2-201ENSMUST00000029545 2747 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.3■□□□□ 0.36
Klhdc3Q8VEM9 Rhbdd3-201ENSMUST00000036320 1790 ntTSL 1 (best) BASIC17.3■□□□□ 0.36
Klhdc3Q8VEM9 Ptpre-202ENSMUST00000209256 2593 ntTSL 1 (best) BASIC17.3■□□□□ 0.36
Klhdc3Q8VEM9 Shisa5-202ENSMUST00000112059 1910 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.29■□□□□ 0.36
Klhdc3Q8VEM9 Dynll2-201ENSMUST00000020775 2476 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.29■□□□□ 0.36
Klhdc3Q8VEM9 Bfsp1-201ENSMUST00000028907 2372 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.29■□□□□ 0.36
Klhdc3Q8VEM9 Dvl1-201ENSMUST00000030948 3358 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.29■□□□□ 0.36
Klhdc3Q8VEM9 Cadps-201ENSMUST00000067491 5421 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC17.29■□□□□ 0.36
Klhdc3Q8VEM9 Gm6569-201ENSMUST00000154520 811 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC17.29■□□□□ 0.36
Klhdc3Q8VEM9 N4bp2os-203ENSMUST00000202673 699 ntTSL 1 (best) BASIC17.29■□□□□ 0.36
Klhdc3Q8VEM9 Pth2-202ENSMUST00000210086 481 ntTSL 2 BASIC17.29■□□□□ 0.36
Klhdc3Q8VEM9 Cyc1-201ENSMUST00000023210 1194 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.29■□□□□ 0.36
Klhdc3Q8VEM9 Rhov-201ENSMUST00000037360 1703 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.29■□□□□ 0.36
Klhdc3Q8VEM9 Hook1-201ENSMUST00000030306 5517 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.29■□□□□ 0.36
Klhdc3Q8VEM9 Taf4-204ENSMUST00000227325 4380 ntAPPRIS ALT2 BASIC17.28■□□□□ 0.36
Klhdc3Q8VEM9 Slc35a2-209ENSMUST00000208397 1374 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC17.28■□□□□ 0.36
Klhdc3Q8VEM9 Glrx5-201ENSMUST00000021522 2925 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.28■□□□□ 0.36
Klhdc3Q8VEM9 Gm10382-201ENSMUST00000100700 1233 ntAPPRIS P1 BASIC17.28■□□□□ 0.36
Klhdc3Q8VEM9 Sox8-202ENSMUST00000173447 928 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.28■□□□□ 0.36
Klhdc3Q8VEM9 Gm3448-203ENSMUST00000179539 787 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.28■□□□□ 0.36
Klhdc3Q8VEM9 0610039K10Rik-202ENSMUST00000184724 952 ntBASIC17.28■□□□□ 0.36
Klhdc3Q8VEM9 Gm3448-201ENSMUST00000097399 787 ntAPPRIS P5 TSL 1 (best) BASIC17.28■□□□□ 0.36
Klhdc3Q8VEM9 Bag5-202ENSMUST00000160576 1852 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.28■□□□□ 0.36
Klhdc3Q8VEM9 Gtpbp2-217ENSMUST00000172170 2587 ntTSL 5 BASIC17.28■□□□□ 0.36
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 15.1 ms