Protein–RNA interactions for Protein: Q8VE42

Ankrd49, Ankyrin repeat domain-containing protein 49, mousemouse

Predictions only

Length 238 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Ankrd49Q8VE42 Wnt10b-203ENSMUST00000226610 2217 ntAPPRIS P1 BASIC20.21■□□□□ 0.83
Ankrd49Q8VE42 Wnt10b-201ENSMUST00000023732 2226 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC20.21■□□□□ 0.83
Ankrd49Q8VE42 Ltb-203ENSMUST00000173600 905 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC20.21■□□□□ 0.83
Ankrd49Q8VE42 Gpx7-202ENSMUST00000184609 331 ntTSL 3 BASIC20.21■□□□□ 0.83
Ankrd49Q8VE42 Gm35065-201ENSMUST00000199206 428 ntTSL 3 BASIC20.21■□□□□ 0.83
Ankrd49Q8VE42 Pxdc1-202ENSMUST00000053459 2684 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.21■□□□□ 0.83
Ankrd49Q8VE42 Atp11a-202ENSMUST00000091237 7443 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC20.21■□□□□ 0.83
Ankrd49Q8VE42 Brsk1-201ENSMUST00000048248 2996 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.21■□□□□ 0.83
Ankrd49Q8VE42 Ints11-201ENSMUST00000030901 2368 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.21■□□□□ 0.83
Ankrd49Q8VE42 Gm43403-201ENSMUST00000198011 1786 ntBASIC20.21■□□□□ 0.83
Ankrd49Q8VE42 Htr6-201ENSMUST00000068036 1362 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.21■□□□□ 0.83
Ankrd49Q8VE42 Nkx2-2-201ENSMUST00000067075 2120 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.2■□□□□ 0.82
Ankrd49Q8VE42 Rnf169-201ENSMUST00000080817 7147 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC20.2■□□□□ 0.82
Ankrd49Q8VE42 Ssbp4-201ENSMUST00000049908 1475 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.2■□□□□ 0.82
Ankrd49Q8VE42 Astn2-202ENSMUST00000084496 4675 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC20.2■□□□□ 0.82
Ankrd49Q8VE42 Rgs10-205ENSMUST00000145739 564 ntTSL 1 (best) BASIC20.2■□□□□ 0.82
Ankrd49Q8VE42 Sarnp-203ENSMUST00000219512 953 ntTSL 3 BASIC20.2■□□□□ 0.82
Ankrd49Q8VE42 Pbx1-201ENSMUST00000064438 1020 ntTSL 1 (best) BASIC20.2■□□□□ 0.82
Ankrd49Q8VE42 Ech1-201ENSMUST00000066264 1267 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.2■□□□□ 0.82
Ankrd49Q8VE42 Cblc-202ENSMUST00000108449 1514 ntTSL 1 (best) BASIC20.2■□□□□ 0.82
Ankrd49Q8VE42 Tmem132d-201ENSMUST00000044441 6139 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.2■□□□□ 0.82
Ankrd49Q8VE42 Ppm1h-201ENSMUST00000067918 6369 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.2■□□□□ 0.82
Ankrd49Q8VE42 AC123857.1-201ENSMUST00000181053 2312 ntTSL 1 (best) BASIC20.2■□□□□ 0.82
Ankrd49Q8VE42 Gpr162-201ENSMUST00000046893 2676 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.2■□□□□ 0.82
Ankrd49Q8VE42 Rbfox3-206ENSMUST00000120061 2150 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC20.19■□□□□ 0.82
Ankrd49Q8VE42 Dus1l-209ENSMUST00000167023 1909 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC20.19■□□□□ 0.82
Ankrd49Q8VE42 Dus1l-201ENSMUST00000026151 1930 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC20.19■□□□□ 0.82
Ankrd49Q8VE42 Htra2-201ENSMUST00000089645 1725 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC20.19■□□□□ 0.82
Ankrd49Q8VE42 Prdm13-202ENSMUST00000095141 3173 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC20.19■□□□□ 0.82
Ankrd49Q8VE42 9230116N13Rik-201ENSMUST00000181746 2097 ntTSL 1 (best) BASIC20.19■□□□□ 0.82
Ankrd49Q8VE42 Casd1-204ENSMUST00000181734 1063 ntTSL 5 BASIC20.19■□□□□ 0.82
Ankrd49Q8VE42 Inpp5a-201ENSMUST00000026550 2774 ntTSL 1 (best) BASIC20.19■□□□□ 0.82
Ankrd49Q8VE42 Dap3-201ENSMUST00000090938 4760 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC20.19■□□□□ 0.82
Ankrd49Q8VE42 Ccdc61-201ENSMUST00000098780 2022 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.19■□□□□ 0.82
Ankrd49Q8VE42 Ago4-201ENSMUST00000084289 6537 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.19■□□□□ 0.82
Ankrd49Q8VE42 Cxadr-201ENSMUST00000023572 5734 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC20.18■□□□□ 0.82
Ankrd49Q8VE42 Gimap1-201ENSMUST00000054368 1493 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.18■□□□□ 0.82
Ankrd49Q8VE42 Letm2-209ENSMUST00000210810 1538 ntTSL 1 (best) BASIC20.18■□□□□ 0.82
Ankrd49Q8VE42 Tarbp2-201ENSMUST00000023813 1523 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.18■□□□□ 0.82
Ankrd49Q8VE42 Sort1-201ENSMUST00000102632 6796 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC20.18■□□□□ 0.82
Ankrd49Q8VE42 Pou2f2-205ENSMUST00000108417 1937 ntTSL 1 (best) BASIC20.18■□□□□ 0.82
Ankrd49Q8VE42 Abhd12-201ENSMUST00000056149 1999 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.18■□□□□ 0.82
Ankrd49Q8VE42 Gm17324-201ENSMUST00000165499 922 ntAPPRIS P1 BASIC20.18■□□□□ 0.82
Ankrd49Q8VE42 Ttc36-201ENSMUST00000044694 888 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.18■□□□□ 0.82
Ankrd49Q8VE42 Unc119-201ENSMUST00000002127 1329 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.18■□□□□ 0.82
Ankrd49Q8VE42 Timmdc1-201ENSMUST00000002925 1573 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.17■□□□□ 0.82
Ankrd49Q8VE42 Ppp1cb-201ENSMUST00000015100 5962 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.17■□□□□ 0.82
Ankrd49Q8VE42 Gm28417-201ENSMUST00000185218 785 ntTSL 3 BASIC20.17■□□□□ 0.82
Ankrd49Q8VE42 Prdm11-205ENSMUST00000178666 1870 ntTSL 5 BASIC20.17■□□□□ 0.82
Ankrd49Q8VE42 Hmgxb3-201ENSMUST00000091884 5101 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.17■□□□□ 0.82
Ankrd49Q8VE42 Dhx36-201ENSMUST00000029336 5620 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.16■□□□□ 0.82
Ankrd49Q8VE42 Whamm-201ENSMUST00000165460 3069 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.16■□□□□ 0.82
Ankrd49Q8VE42 Gm11532-201ENSMUST00000128111 5272 ntTSL 1 (best) BASIC20.16■□□□□ 0.82
Ankrd49Q8VE42 Carm1-202ENSMUST00000115394 3320 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC20.16■□□□□ 0.82
Ankrd49Q8VE42 Nin-203ENSMUST00000095666 7183 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC20.16■□□□□ 0.82
Ankrd49Q8VE42 Gm14117-201ENSMUST00000122417 843 ntBASIC20.16■□□□□ 0.82
Ankrd49Q8VE42 Srsf6-202ENSMUST00000126163 515 ntTSL 5 BASIC20.16■□□□□ 0.82
Ankrd49Q8VE42 Gm10685-201ENSMUST00000196120 433 ntTSL 3 BASIC20.16■□□□□ 0.82
Ankrd49Q8VE42 Ell3-201ENSMUST00000028679 2115 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.16■□□□□ 0.82
Ankrd49Q8VE42 Ntn1-201ENSMUST00000021284 5738 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC20.16■□□□□ 0.82
Ankrd49Q8VE42 Rp2-203ENSMUST00000115391 1398 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.16■□□□□ 0.82
Ankrd49Q8VE42 Ccnjl-201ENSMUST00000050574 2672 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.16■□□□□ 0.82
Ankrd49Q8VE42 Uap1-201ENSMUST00000027981 2283 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC20.15■□□□□ 0.82
Ankrd49Q8VE42 Slk-201ENSMUST00000026043 7278 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.15■□□□□ 0.82
Ankrd49Q8VE42 Wasf3-201ENSMUST00000016143 5196 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.15■□□□□ 0.82
Ankrd49Q8VE42 Spc24-201ENSMUST00000098942 1366 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.15■□□□□ 0.82
Ankrd49Q8VE42 Smim19-202ENSMUST00000163774 1435 ntTSL 1 (best) BASIC20.15■□□□□ 0.82
Ankrd49Q8VE42 Bcas2-201ENSMUST00000005830 1467 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.15■□□□□ 0.82
Ankrd49Q8VE42 AC164883.3-201ENSMUST00000227396 1774 ntBASIC20.15■□□□□ 0.82
Ankrd49Q8VE42 H2afj-201ENSMUST00000074556 1831 ntAPPRIS P2 BASIC20.15■□□□□ 0.82
Ankrd49Q8VE42 Gm42900-201ENSMUST00000197184 2167 ntBASIC20.15■□□□□ 0.82
Ankrd49Q8VE42 Tarbp1-201ENSMUST00000170518 6383 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC20.15■□□□□ 0.82
Ankrd49Q8VE42 Chd5-202ENSMUST00000030775 9486 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC20.15■□□□□ 0.82
Ankrd49Q8VE42 Ewsr1-205ENSMUST00000102930 2174 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC20.14■□□□□ 0.81
Ankrd49Q8VE42 Spsb3-209ENSMUST00000168265 1953 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.14■□□□□ 0.81
Ankrd49Q8VE42 Gm26795-201ENSMUST00000180993 1952 ntTSL 1 (best) BASIC20.14■□□□□ 0.81
Ankrd49Q8VE42 Hmg20b-202ENSMUST00000105323 1463 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.14■□□□□ 0.81
Ankrd49Q8VE42 Fam89b-201ENSMUST00000099955 1197 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.14■□□□□ 0.81
Ankrd49Q8VE42 Zcchc24-201ENSMUST00000069180 4556 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.14■□□□□ 0.81
Ankrd49Q8VE42 Fance-204ENSMUST00000114804 1842 ntTSL 1 (best) BASIC20.13■□□□□ 0.81
Ankrd49Q8VE42 Porcn-203ENSMUST00000089402 1839 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC20.13■□□□□ 0.81
Ankrd49Q8VE42 Notch4-201ENSMUST00000015612 6591 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.13■□□□□ 0.81
Ankrd49Q8VE42 Btbd17-201ENSMUST00000000206 1717 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.13■□□□□ 0.81
Ankrd49Q8VE42 Tmub1-202ENSMUST00000115033 1598 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC20.13■□□□□ 0.81
Ankrd49Q8VE42 Cebpg-202ENSMUST00000130491 4709 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.13■□□□□ 0.81
Ankrd49Q8VE42 Espn-207ENSMUST00000105653 1411 ntTSL 5 BASIC20.13■□□□□ 0.81
Ankrd49Q8VE42 Gpr160-204ENSMUST00000108261 2213 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.13■□□□□ 0.81
Ankrd49Q8VE42 Gorasp2-201ENSMUST00000028509 2238 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC20.13■□□□□ 0.81
Ankrd49Q8VE42 Scamp3-202ENSMUST00000098941 1338 ntTSL 1 (best) BASIC20.13■□□□□ 0.81
Ankrd49Q8VE42 Atrnl1-201ENSMUST00000077282 6581 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.13■□□□□ 0.81
Ankrd49Q8VE42 Ankrd11-207ENSMUST00000212937 943 ntTSL 1 (best) BASIC20.13■□□□□ 0.81
Ankrd49Q8VE42 Smad6-201ENSMUST00000041029 2971 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.13■□□□□ 0.81
Ankrd49Q8VE42 Nfkbib-202ENSMUST00000085851 1243 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.13■□□□□ 0.81
Ankrd49Q8VE42 Rps2-ps6-201ENSMUST00000095471 855 ntBASIC20.13■□□□□ 0.81
Ankrd49Q8VE42 Tram1-201ENSMUST00000027068 2938 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.13■□□□□ 0.81
Ankrd49Q8VE42 Kdm3b-204ENSMUST00000224715 2032 ntBASIC20.13■□□□□ 0.81
Ankrd49Q8VE42 Frat1-201ENSMUST00000087155 2614 ntAPPRIS P1 BASIC20.13■□□□□ 0.81
Ankrd49Q8VE42 Gtf2e2-202ENSMUST00000170705 1634 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.13■□□□□ 0.81
Ankrd49Q8VE42 Pnrc1-201ENSMUST00000049357 1648 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.13■□□□□ 0.81
Ankrd49Q8VE42 Cacul1-203ENSMUST00000166712 5700 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC20.12■□□□□ 0.81
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 14.9 ms