Protein–RNA interactions for Protein: Q8VCE4

Uncharacterized protein C9orf40 homolog, mousemouse

Predictions only

Length 163 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Q8VCE4 Maz-203ENSMUST00000205568 2650 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.75■□□□□ 0.27
Q8VCE4 Camk2b-201ENSMUST00000002817 1872 ntTSL 5 BASIC16.75■□□□□ 0.27
Q8VCE4 Kdm3b-201ENSMUST00000043775 6363 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.75■□□□□ 0.27
Q8VCE4 Pacsin2-201ENSMUST00000056177 2795 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.75■□□□□ 0.27
Q8VCE4 Prr7-201ENSMUST00000046533 1359 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.75■□□□□ 0.27
Q8VCE4 Ercc6l2-208ENSMUST00000144763 1820 ntTSL 1 (best) BASIC16.75■□□□□ 0.27
Q8VCE4 Asph-217ENSMUST00000146441 2576 ntTSL 1 (best) BASIC16.75■□□□□ 0.27
Q8VCE4 Klhl8-201ENSMUST00000031254 3193 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.75■□□□□ 0.27
Q8VCE4 Rnf8-201ENSMUST00000024817 2077 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.74■□□□□ 0.27
Q8VCE4 Cacnb1-205ENSMUST00000107562 1745 ntTSL 1 (best) BASIC16.74■□□□□ 0.27
Q8VCE4 Fbxo4-201ENSMUST00000022791 1565 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.74■□□□□ 0.27
Q8VCE4 Uba5-201ENSMUST00000035166 2404 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.74■□□□□ 0.27
Q8VCE4 Wipi1-203ENSMUST00000106689 1220 ntTSL 1 (best) BASIC16.74■□□□□ 0.27
Q8VCE4 Vegfb-202ENSMUST00000130048 1158 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.74■□□□□ 0.27
Q8VCE4 Ak2-201ENSMUST00000030583 986 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC16.74■□□□□ 0.27
Q8VCE4 4833418N17Rik-201ENSMUST00000064826 615 ntBASIC16.74■□□□□ 0.27
Q8VCE4 Pink1-201ENSMUST00000030536 2375 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.74■□□□□ 0.27
Q8VCE4 Exoc3l2-201ENSMUST00000011407 2200 ntTSL 5 BASIC16.74■□□□□ 0.27
Q8VCE4 Tmem79-202ENSMUST00000107552 2063 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.74■□□□□ 0.27
Q8VCE4 Vstm2b-201ENSMUST00000044705 2627 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.74■□□□□ 0.27
Q8VCE4 Tmem74b-202ENSMUST00000109872 1399 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.74■□□□□ 0.27
Q8VCE4 Unc5b-201ENSMUST00000077925 5869 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.74■□□□□ 0.27
Q8VCE4 D11Wsu47e-201ENSMUST00000042227 2196 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.74■□□□□ 0.27
Q8VCE4 Utp11-201ENSMUST00000030738 1603 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.74■□□□□ 0.27
Q8VCE4 AI846148-201ENSMUST00000025924 3183 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.73■□□□□ 0.27
Q8VCE4 Rab5c-201ENSMUST00000019317 1967 ntTSL 1 (best) BASIC16.73■□□□□ 0.27
Q8VCE4 Ache-209ENSMUST00000196208 1911 ntTSL 5 BASIC16.73■□□□□ 0.27
Q8VCE4 Erf-202ENSMUST00000116343 690 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC16.73■□□□□ 0.27
Q8VCE4 Snx21-203ENSMUST00000152471 1243 ntTSL 1 (best) BASIC16.73■□□□□ 0.27
Q8VCE4 Zfp346-203ENSMUST00000159278 1253 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.73■□□□□ 0.27
Q8VCE4 Rcor1-201ENSMUST00000084968 5684 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.73■□□□□ 0.27
Q8VCE4 Usp2-202ENSMUST00000065461 2057 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.73■□□□□ 0.27
Q8VCE4 Gm13448-201ENSMUST00000143469 1847 ntTSL 1 (best) BASIC16.73■□□□□ 0.27
Q8VCE4 Csf2ra-201ENSMUST00000076046 1849 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.73■□□□□ 0.27
Q8VCE4 Mtfr1l-201ENSMUST00000102550 2025 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.72■□□□□ 0.27
Q8VCE4 Klf1-201ENSMUST00000067060 1530 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.72■□□□□ 0.27
Q8VCE4 Sae1-201ENSMUST00000094815 1875 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.72■□□□□ 0.27
Q8VCE4 2310022A10Rik-205ENSMUST00000187960 1989 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.72■□□□□ 0.27
Q8VCE4 Btbd6-206ENSMUST00000222209 644 ntTSL 3 BASIC16.72■□□□□ 0.27
Q8VCE4 Stk19-201ENSMUST00000077477 1120 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.72■□□□□ 0.27
Q8VCE4 Cers1-203ENSMUST00000165819 2728 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC16.72■□□□□ 0.27
Q8VCE4 Cog1-202ENSMUST00000063776 1476 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.72■□□□□ 0.27
Q8VCE4 Atmin-201ENSMUST00000109099 4877 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.72■□□□□ 0.27
Q8VCE4 Klc3-201ENSMUST00000047170 1901 ntTSL 1 (best) BASIC16.72■□□□□ 0.27
Q8VCE4 Clasp2-211ENSMUST00000216817 2234 ntTSL 1 (best) BASIC16.72■□□□□ 0.27
Q8VCE4 Catsper2-201ENSMUST00000038073 2247 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.72■□□□□ 0.27
Q8VCE4 Tex264-202ENSMUST00000163441 1896 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.71■□□□□ 0.27
Q8VCE4 Amdhd1-201ENSMUST00000016034 2421 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.71■□□□□ 0.27
Q8VCE4 Tatdn2-201ENSMUST00000089018 3096 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.71■□□□□ 0.27
Q8VCE4 Rfk-201ENSMUST00000025617 2482 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.71■□□□□ 0.27
Q8VCE4 Thra-201ENSMUST00000064187 2452 ntTSL 1 (best) BASIC16.71■□□□□ 0.27
Q8VCE4 Sh3bp1-204ENSMUST00000109698 1923 ntTSL 1 (best) BASIC16.71■□□□□ 0.27
Q8VCE4 Rps19-202ENSMUST00000108429 633 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.71■□□□□ 0.27
Q8VCE4 Shox2-204ENSMUST00000162439 1081 ntTSL 1 (best) BASIC16.71■□□□□ 0.27
Q8VCE4 Gm28040-202ENSMUST00000184603 890 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.71■□□□□ 0.27
Q8VCE4 Donson-203ENSMUST00000117159 2215 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.71■□□□□ 0.27
Q8VCE4 Znrf1-204ENSMUST00000171182 5466 ntTSL 3 BASIC16.71■□□□□ 0.27
Q8VCE4 Tmem120a-201ENSMUST00000043378 1559 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.71■□□□□ 0.27
Q8VCE4 Fam3c-205ENSMUST00000165576 2826 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.71■□□□□ 0.27
Q8VCE4 Mark2-202ENSMUST00000032557 4488 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.71■□□□□ 0.27
Q8VCE4 Lrp8-204ENSMUST00000106733 3332 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.71■□□□□ 0.27
Q8VCE4 Mrps16-201ENSMUST00000061444 2572 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.71■□□□□ 0.26
Q8VCE4 Pelo-201ENSMUST00000109226 1600 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.7■□□□□ 0.26
Q8VCE4 Fbxl6-201ENSMUST00000023219 1712 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.7■□□□□ 0.26
Q8VCE4 Cnpy3-201ENSMUST00000059844 1908 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.7■□□□□ 0.26
Q8VCE4 Kctd20-204ENSMUST00000122163 2423 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.7■□□□□ 0.26
Q8VCE4 Kirrel3-202ENSMUST00000115148 2851 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC16.7■□□□□ 0.26
Q8VCE4 Ttc9b-201ENSMUST00000008088 2052 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.7■□□□□ 0.26
Q8VCE4 Ssbp4-201ENSMUST00000049908 1475 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.7■□□□□ 0.26
Q8VCE4 Fndc4-201ENSMUST00000041266 1375 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.7■□□□□ 0.26
Q8VCE4 Atp5j-202ENSMUST00000114191 742 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.7■□□□□ 0.26
Q8VCE4 Scube1-202ENSMUST00000043634 5161 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.7■□□□□ 0.26
Q8VCE4 Fgfr2-217ENSMUST00000124096 2425 ntTSL 5 BASIC16.7■□□□□ 0.26
Q8VCE4 Ptpmt1-203ENSMUST00000125001 3183 ntTSL 1 (best) BASIC16.7■□□□□ 0.26
Q8VCE4 Lrrfip2-205ENSMUST00000196981 1839 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.7■□□□□ 0.26
Q8VCE4 Lgr4-201ENSMUST00000046548 5060 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.7■□□□□ 0.26
Q8VCE4 Csnk1a1-201ENSMUST00000115246 1484 ntTSL 5 BASIC16.69■□□□□ 0.26
Q8VCE4 Fn1-208ENSMUST00000186940 1350 ntTSL 1 (best) BASIC16.69■□□□□ 0.26
Q8VCE4 Gm10653-201ENSMUST00000132250 1232 ntTSL 1 (best) BASIC16.69■□□□□ 0.26
Q8VCE4 Gm10653-203ENSMUST00000156423 1232 ntTSL 5 BASIC16.69■□□□□ 0.26
Q8VCE4 Parp12-201ENSMUST00000038398 3231 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.69■□□□□ 0.26
Q8VCE4 Nrxn2-201ENSMUST00000077182 6059 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.69■□□□□ 0.26
Q8VCE4 Tmem55b-206ENSMUST00000161166 1445 ntTSL 1 (best) BASIC16.69■□□□□ 0.26
Q8VCE4 Rims1-209ENSMUST00000218140 1434 ntTSL 5 BASIC16.69■□□□□ 0.26
Q8VCE4 Pias2-202ENSMUST00000114777 4968 ntTSL 1 (best) BASIC16.69■□□□□ 0.26
Q8VCE4 Gp1bb-202ENSMUST00000167388 1847 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC16.68■□□□□ 0.26
Q8VCE4 Gdf11-201ENSMUST00000026408 4062 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.68■□□□□ 0.26
Q8VCE4 Ppp1r16a-201ENSMUST00000037551 2692 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.68■□□□□ 0.26
Q8VCE4 Ccdc112-201ENSMUST00000072835 2801 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.68■□□□□ 0.26
Q8VCE4 4930524B15Rik-201ENSMUST00000102829 2000 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.68■□□□□ 0.26
Q8VCE4 Krt76-201ENSMUST00000100179 2312 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.68■□□□□ 0.26
Q8VCE4 Bmpr1a-201ENSMUST00000049005 5956 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.68■□□□□ 0.26
Q8VCE4 Timmdc1-201ENSMUST00000002925 1573 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.68■□□□□ 0.26
Q8VCE4 Nrxn2-205ENSMUST00000113462 6667 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC16.67■□□□□ 0.26
Q8VCE4 D030062O11Rik-201ENSMUST00000192660 2806 ntBASIC16.67■□□□□ 0.26
Q8VCE4 Ntn5-202ENSMUST00000182750 1758 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.67■□□□□ 0.26
Q8VCE4 Cdk8-201ENSMUST00000031640 2973 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.67■□□□□ 0.26
Q8VCE4 Pou2f2-210ENSMUST00000176408 1697 ntTSL 5 BASIC16.67■□□□□ 0.26
Q8VCE4 Vax1-201ENSMUST00000172821 1044 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.67■□□□□ 0.26
Q8VCE4 Vegfb-201ENSMUST00000025914 1281 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.67■□□□□ 0.26
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 22.1 ms