Protein–RNA interactions for Protein: Q8VBW8

Ttc36, Tetratricopeptide repeat protein 36, mousemouse

Predictions only

Length 186 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Ttc36Q8VBW8 Lrp3-202ENSMUST00000122409 4147 ntTSL 1 (best) BASIC18.51■□□□□ 0.55
Ttc36Q8VBW8 Lsm14a-201ENSMUST00000085585 2944 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.51■□□□□ 0.55
Ttc36Q8VBW8 Hsf1-205ENSMUST00000227478 2084 ntAPPRIS P1 BASIC18.51■□□□□ 0.55
Ttc36Q8VBW8 Lgr4-201ENSMUST00000046548 5060 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC18.51■□□□□ 0.55
Ttc36Q8VBW8 Cdx1-201ENSMUST00000025521 1750 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.5■□□□□ 0.55
Ttc36Q8VBW8 A130051J06Rik-201ENSMUST00000180649 2618 ntTSL 1 (best) BASIC18.5■□□□□ 0.55
Ttc36Q8VBW8 Sephs2-201ENSMUST00000082428 2177 ntAPPRIS P1 BASIC18.5■□□□□ 0.55
Ttc36Q8VBW8 AC164424.2-201ENSMUST00000223281 725 ntTSL 3 BASIC18.5■□□□□ 0.55
Ttc36Q8VBW8 Mt2-201ENSMUST00000034214 511 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.5■□□□□ 0.55
Ttc36Q8VBW8 Nfkbib-202ENSMUST00000085851 1243 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.5■□□□□ 0.55
Ttc36Q8VBW8 Spc24-201ENSMUST00000098942 1366 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.5■□□□□ 0.55
Ttc36Q8VBW8 Qsox2-201ENSMUST00000036187 2559 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.5■□□□□ 0.55
Ttc36Q8VBW8 Sept5-201ENSMUST00000096987 2127 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.5■□□□□ 0.55
Ttc36Q8VBW8 Amh-201ENSMUST00000036016 1670 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.5■□□□□ 0.55
Ttc36Q8VBW8 Raph1-202ENSMUST00000090293 2409 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC18.5■□□□□ 0.55
Ttc36Q8VBW8 Slc25a38-201ENSMUST00000035106 1791 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.5■□□□□ 0.55
Ttc36Q8VBW8 Hnrnpd-211ENSMUST00000172361 6811 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC18.5■□□□□ 0.55
Ttc36Q8VBW8 Gm9817-201ENSMUST00000054395 2531 ntAPPRIS P1 BASIC18.5■□□□□ 0.55
Ttc36Q8VBW8 Tmem80-208ENSMUST00000145184 1805 ntTSL 5 BASIC18.49■□□□□ 0.55
Ttc36Q8VBW8 Fam20b-201ENSMUST00000086153 4414 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.49■□□□□ 0.55
Ttc36Q8VBW8 Rasgrf2-206ENSMUST00000216219 2115 ntTSL 5 BASIC18.49■□□□□ 0.55
Ttc36Q8VBW8 Whrn-204ENSMUST00000095037 2419 ntTSL 1 (best) BASIC18.49■□□□□ 0.55
Ttc36Q8VBW8 Ech1-201ENSMUST00000066264 1267 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.49■□□□□ 0.55
Ttc36Q8VBW8 Ooep-201ENSMUST00000034900 2138 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.49■□□□□ 0.55
Ttc36Q8VBW8 Kremen2-201ENSMUST00000046525 2123 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.49■□□□□ 0.55
Ttc36Q8VBW8 Ccdc61-201ENSMUST00000098780 2022 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.49■□□□□ 0.55
Ttc36Q8VBW8 Ccr10-201ENSMUST00000062759 1726 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.49■□□□□ 0.55
Ttc36Q8VBW8 Irx3-202ENSMUST00000175795 2748 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.48■□□□□ 0.55
Ttc36Q8VBW8 Cav2-201ENSMUST00000000058 2733 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.48■□□□□ 0.55
Ttc36Q8VBW8 Snrpa1-206ENSMUST00000153609 1248 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.48■□□□□ 0.55
Ttc36Q8VBW8 Zfp346-202ENSMUST00000159147 1146 ntTSL 5 BASIC18.48■□□□□ 0.55
Ttc36Q8VBW8 Etf1-202ENSMUST00000180351 108 ntBASIC18.48■□□□□ 0.55
Ttc36Q8VBW8 Camk2n2-201ENSMUST00000052939 1291 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.48■□□□□ 0.55
Ttc36Q8VBW8 Rims1-209ENSMUST00000218140 1434 ntTSL 5 BASIC18.48■□□□□ 0.55
Ttc36Q8VBW8 Agfg1-202ENSMUST00000113444 3142 ntTSL 1 (best) BASIC18.47■□□□□ 0.55
Ttc36Q8VBW8 Plk5-201ENSMUST00000039836 2112 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC18.47■□□□□ 0.55
Ttc36Q8VBW8 Kdm3b-204ENSMUST00000224715 2032 ntBASIC18.47■□□□□ 0.55
Ttc36Q8VBW8 Morf4l1-202ENSMUST00000169860 1824 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.47■□□□□ 0.55
Ttc36Q8VBW8 Supv3l1-201ENSMUST00000020273 2604 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.47■□□□□ 0.55
Ttc36Q8VBW8 Maml1-201ENSMUST00000059458 5528 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.47■□□□□ 0.55
Ttc36Q8VBW8 Srsf6-202ENSMUST00000126163 515 ntTSL 5 BASIC18.47■□□□□ 0.55
Ttc36Q8VBW8 Gm43653-201ENSMUST00000198136 1608 ntTSL 3 BASIC18.47■□□□□ 0.55
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Ttc36Q8VBW8 Nol4l-201ENSMUST00000035346 6399 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.47■□□□□ 0.55
Ttc36Q8VBW8 Espn-207ENSMUST00000105653 1411 ntTSL 5 BASIC18.47■□□□□ 0.55
Ttc36Q8VBW8 Galr2-201ENSMUST00000055872 1940 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.47■□□□□ 0.55
Ttc36Q8VBW8 Cacnb1-205ENSMUST00000107562 1745 ntTSL 1 (best) BASIC18.46■□□□□ 0.55
Ttc36Q8VBW8 Shc4-202ENSMUST00000110477 1988 ntTSL 1 (best) BASIC18.46■□□□□ 0.55
Ttc36Q8VBW8 Fbxw8-201ENSMUST00000049474 5000 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.46■□□□□ 0.55
Ttc36Q8VBW8 Tcf7l1-201ENSMUST00000069536 3042 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.46■□□□□ 0.55
Ttc36Q8VBW8 Hoxa2-201ENSMUST00000014848 1775 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.46■□□□□ 0.55
Ttc36Q8VBW8 Hoxd3os1-204ENSMUST00000156342 796 ntTSL 1 (best) BASIC18.46■□□□□ 0.55
Ttc36Q8VBW8 1700018A14Rik-201ENSMUST00000195587 711 ntBASIC18.46■□□□□ 0.55
Ttc36Q8VBW8 Celf6-203ENSMUST00000118549 2973 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC18.46■□□□□ 0.55
Ttc36Q8VBW8 Zfp623-201ENSMUST00000037260 2463 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.46■□□□□ 0.55
Ttc36Q8VBW8 Mvb12b-201ENSMUST00000041555 4998 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.46■□□□□ 0.55
Ttc36Q8VBW8 Chml-203ENSMUST00000210367 1324 ntTSL 5 BASIC18.46■□□□□ 0.55
Ttc36Q8VBW8 Gga2-201ENSMUST00000033160 4915 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.46■□□□□ 0.55
Ttc36Q8VBW8 Tbxa2r-201ENSMUST00000105325 1765 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.45■□□□□ 0.54
Ttc36Q8VBW8 Hccs-202ENSMUST00000112115 2473 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.45■□□□□ 0.54
Ttc36Q8VBW8 Nsmf-213ENSMUST00000140737 862 ntTSL 5 BASIC18.45■□□□□ 0.54
Ttc36Q8VBW8 Rgs10-205ENSMUST00000145739 564 ntTSL 1 (best) BASIC18.45■□□□□ 0.54
Ttc36Q8VBW8 Gm10685-201ENSMUST00000196120 433 ntTSL 3 BASIC18.45■□□□□ 0.54
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Ttc36Q8VBW8 Efr3a-203ENSMUST00000172756 1411 ntTSL 1 (best) BASIC18.45■□□□□ 0.54
Ttc36Q8VBW8 Cers1-202ENSMUST00000140239 2711 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.45■□□□□ 0.54
Ttc36Q8VBW8 Kansl1-205ENSMUST00000106977 5510 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC18.45■□□□□ 0.54
Ttc36Q8VBW8 Ltk-202ENSMUST00000082130 2767 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.45■□□□□ 0.54
Ttc36Q8VBW8 Dedd2-202ENSMUST00000205271 1942 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.45■□□□□ 0.54
Ttc36Q8VBW8 Olfm1-204ENSMUST00000113920 2513 ntTSL 1 (best) BASIC18.45■□□□□ 0.54
Ttc36Q8VBW8 Nphp1-202ENSMUST00000110357 2296 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.44■□□□□ 0.54
Ttc36Q8VBW8 Nlgn2-201ENSMUST00000056484 5003 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.44■□□□□ 0.54
Ttc36Q8VBW8 Rp2-203ENSMUST00000115391 1398 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.44■□□□□ 0.54
Ttc36Q8VBW8 Cep97-205ENSMUST00000121703 609 ntTSL 1 (best) BASIC18.44■□□□□ 0.54
Ttc36Q8VBW8 Hmg20b-202ENSMUST00000105323 1463 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.44■□□□□ 0.54
Ttc36Q8VBW8 Bcas2-201ENSMUST00000005830 1467 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.44■□□□□ 0.54
Ttc36Q8VBW8 Hnrnpa3-204ENSMUST00000111964 1654 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.44■□□□□ 0.54
Ttc36Q8VBW8 Gorasp2-201ENSMUST00000028509 2238 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC18.43■□□□□ 0.54
Ttc36Q8VBW8 Arrb1-210ENSMUST00000179755 7135 ntTSL 5 BASIC18.43■□□□□ 0.54
Ttc36Q8VBW8 Arrb1-202ENSMUST00000098266 7132 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.43■□□□□ 0.54
Ttc36Q8VBW8 Fgfbp3-201ENSMUST00000057337 1772 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.43■□□□□ 0.54
Ttc36Q8VBW8 Ankrd11-207ENSMUST00000212937 943 ntTSL 1 (best) BASIC18.43■□□□□ 0.54
Ttc36Q8VBW8 Gm9959-201ENSMUST00000068277 390 ntBASIC18.43■□□□□ 0.54
Ttc36Q8VBW8 Acbd6-203ENSMUST00000097529 1255 ntTSL 1 (best) BASIC18.43■□□□□ 0.54
Ttc36Q8VBW8 B430319F04Rik-201ENSMUST00000209731 2669 ntBASIC18.43■□□□□ 0.54
Ttc36Q8VBW8 Kcnn2-203ENSMUST00000169783 1625 ntTSL 1 (best) BASIC18.42■□□□□ 0.54
Ttc36Q8VBW8 Gm21988-202ENSMUST00000176268 1621 ntAPPRIS P5 TSL 5 BASIC18.42■□□□□ 0.54
Ttc36Q8VBW8 Faap24-201ENSMUST00000032704 1857 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.42■□□□□ 0.54
Ttc36Q8VBW8 Chst12-201ENSMUST00000043050 2331 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.42■□□□□ 0.54
Ttc36Q8VBW8 Rps24-207ENSMUST00000224568 714 ntBASIC18.42■□□□□ 0.54
Ttc36Q8VBW8 Nrl-203ENSMUST00000178694 1928 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.42■□□□□ 0.54
Ttc36Q8VBW8 2310022A10Rik-205ENSMUST00000187960 1989 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC18.42■□□□□ 0.54
Ttc36Q8VBW8 Qtrt1-201ENSMUST00000002902 1316 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.42■□□□□ 0.54
Ttc36Q8VBW8 Fez1-201ENSMUST00000034630 1794 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.42■□□□□ 0.54
Ttc36Q8VBW8 Ank1-202ENSMUST00000084038 8147 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.42■□□□□ 0.54
Ttc36Q8VBW8 Chkb-201ENSMUST00000023289 1707 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.41■□□□□ 0.54
Ttc36Q8VBW8 Tada1-201ENSMUST00000027846 2215 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.41■□□□□ 0.54
Ttc36Q8VBW8 Socs2-202ENSMUST00000119917 948 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.41■□□□□ 0.54
Ttc36Q8VBW8 Pxmp2-201ENSMUST00000031472 1041 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.41■□□□□ 0.54
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 51.1 ms